View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11345_low_1 (Length: 659)

Name: NF11345_low_1
Description: NF11345
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11345_low_1
NF11345_low_1
[»] chr3 (220 HSPs)
chr3 (152-646)||(14966228-14966718)
chr3 (212-620)||(43550073-43550477)
chr3 (212-633)||(16643244-16643661)
chr3 (212-620)||(50242985-50243389)
chr3 (350-646)||(52989492-52989783)
chr3 (212-642)||(10833735-10834160)
chr3 (212-646)||(14763357-14763787)
chr3 (212-646)||(23371103-23371533)
chr3 (212-510)||(24152840-24153138)
chr3 (212-646)||(51300621-51301051)
chr3 (216-639)||(8928065-8928483)
chr3 (216-442)||(53646460-53646686)
chr3 (216-477)||(6158789-6159049)
chr3 (446-646)||(324294-324490)
chr3 (212-470)||(2248366-2248624)
chr3 (212-442)||(33564555-33564785)
chr3 (212-457)||(14641946-14642191)
chr3 (212-465)||(35961283-35961536)
chr3 (212-465)||(41930-42183)
chr3 (212-585)||(9533416-9533785)
chr3 (212-444)||(11192505-11192736)
chr3 (212-444)||(40807420-40807652)
chr3 (212-470)||(11913119-11913377)
chr3 (212-444)||(50351396-50351628)
chr3 (212-444)||(54875879-54876111)
chr3 (212-471)||(6819507-6819765)
chr3 (212-470)||(1988628-1988885)
chr3 (316-646)||(15465134-15465453)
chr3 (212-477)||(12275941-12276205)
chr3 (212-460)||(37038226-37038475)
chr3 (212-508)||(10989200-10989495)
chr3 (212-444)||(14441592-14441824)
chr3 (212-492)||(16979287-16979566)
chr3 (212-444)||(35064977-35065208)
chr3 (212-443)||(40812258-40812489)
chr3 (316-646)||(5223363-5223682)
chr3 (212-477)||(3394398-3394662)
chr3 (440-646)||(21837484-21837685)
chr3 (212-444)||(3803259-3803491)
chr3 (213-465)||(6805358-6805610)
chr3 (212-444)||(14508272-14508503)
chr3 (182-444)||(17693492-17693754)
chr3 (212-477)||(179103-179367)
chr3 (212-437)||(10541854-10542079)
chr3 (212-437)||(43889195-43889420)
chr3 (212-444)||(5206050-5206282)
chr3 (212-444)||(17538531-17538762)
chr3 (212-444)||(22306979-22307211)
chr3 (213-457)||(42324618-42324862)
chr3 (212-442)||(17044392-17044622)
chr3 (212-457)||(18367154-18367399)
chr3 (212-444)||(35354023-35354258)
chr3 (212-440)||(20248380-20248608)
chr3 (212-467)||(10554668-10554923)
chr3 (212-467)||(55292037-55292292)
chr3 (212-437)||(12511279-12511504)
chr3 (212-440)||(38311399-38311628)
chr3 (212-444)||(2841859-2842090)
chr3 (213-437)||(14671255-14671479)
chr3 (256-444)||(44273898-44274086)
chr3 (254-465)||(13029714-13029925)
chr3 (212-444)||(15931903-15932135)
chr3 (212-444)||(17519269-17519501)
chr3 (212-444)||(17534131-17534363)
chr3 (254-465)||(13026122-13026333)
chr3 (223-444)||(13519706-13519928)
chr3 (212-477)||(13522806-13523071)
chr3 (212-441)||(17670105-17670334)
chr3 (212-441)||(17685239-17685468)
chr3 (212-437)||(18699869-18700094)
chr3 (212-444)||(14519687-14519918)
chr3 (212-438)||(17513010-17513236)
chr3 (212-457)||(10563120-10563365)
chr3 (213-444)||(41172767-41172999)
chr3 (212-444)||(43928775-43929007)
chr3 (212-470)||(31224349-31224608)
chr3 (212-438)||(19443941-19444167)
chr3 (212-443)||(49900153-49900392)
chr3 (215-483)||(18889749-18890017)
chr3 (216-444)||(50348426-50348654)
chr3 (440-628)||(13919408-13919591)
chr3 (256-437)||(12470233-12470414)
chr3 (215-465)||(16324940-16325190)
chr3 (212-444)||(14152795-14153027)
chr3 (212-444)||(15565938-15566169)
chr3 (213-444)||(9511563-9511793)
chr3 (213-444)||(9519538-9519768)
chr3 (223-444)||(6156130-6156350)
chr3 (516-646)||(54876322-54876448)
chr3 (212-444)||(50755778-50756009)
chr3 (212-444)||(24546261-24546496)
chr3 (215-425)||(18893067-18893277)
chr3 (537-646)||(14179430-14179539)
chr3 (537-646)||(14670982-14671091)
chr3 (537-646)||(43889578-43889687)
chr3 (440-626)||(12378003-12378184)
chr3 (537-646)||(12469960-12470069)
chr3 (537-646)||(14682481-14682590)
chr3 (537-646)||(16796545-16796654)
chr3 (212-444)||(54330702-54330933)
chr3 (212-363)||(17046631-17046782)
chr3 (537-646)||(12339765-12339874)
chr3 (516-646)||(17691644-17691769)
chr3 (212-369)||(17938025-17938182)
chr3 (537-646)||(18700259-18700368)
chr3 (537-633)||(10542384-10542480)
chr3 (255-406)||(14567651-14567802)
chr3 (212-343)||(51602996-51603127)
chr3 (440-622)||(316202-316381)
chr3 (212-322)||(14647499-14647609)
chr3 (442-628)||(9577700-9577882)
chr3 (212-344)||(19568807-19568939)
chr3 (212-359)||(5215156-5215303)
chr3 (152-246)||(52989397-52989491)
chr3 (212-369)||(18739394-18739551)
chr3 (212-444)||(17207766-17207996)
chr3 (212-331)||(12305599-12305718)
chr3 (212-339)||(46723022-46723149)
chr3 (212-444)||(25104600-25104829)
chr3 (212-444)||(12952466-12952697)
chr3 (535-646)||(28194751-28194863)
chr3 (349-444)||(11258891-11258986)
chr3 (212-331)||(13436776-13436894)
chr3 (212-331)||(15465631-15465750)
chr3 (535-610)||(44494901-44494976)
chr3 (440-646)||(15246078-15246281)
chr3 (535-648)||(37427772-37427885)
chr3 (212-331)||(26054831-26054950)
chr3 (290-464)||(22652236-22652409)
chr3 (212-326)||(54521304-54521418)
chr3 (480-625)||(23318615-23318754)
chr3 (212-331)||(5223860-5223979)
chr3 (215-345)||(8631265-8631395)
chr3 (572-646)||(11914003-11914077)
chr3 (440-610)||(15207032-15207199)
chr3 (440-646)||(15265199-15265402)
chr3 (316-432)||(26055128-26055244)
chr3 (567-646)||(3264997-3265076)
chr3 (212-331)||(22764026-22764145)
chr3 (212-331)||(29544408-29544527)
chr3 (440-627)||(32402819-32403002)
chr3 (567-646)||(36527803-36527882)
chr3 (350-437)||(14682754-14682841)
chr3 (212-331)||(28848188-28848307)
chr3 (212-291)||(34159842-34159921)
chr3 (212-306)||(11258992-11259086)
chr3 (213-331)||(15978009-15978127)
chr3 (546-639)||(34852617-34852710)
chr3 (212-291)||(17463694-17463773)
chr3 (212-291)||(55477007-55477086)
chr3 (213-331)||(7780914-7781032)
chr3 (213-327)||(16453847-16453961)
chr3 (212-369)||(8023721-8023878)
chr3 (215-324)||(36528061-36528170)
chr3 (562-623)||(38311759-38311820)
chr3 (395-483)||(18892975-18893063)
chr3 (212-331)||(10247290-10247409)
chr3 (212-291)||(15412947-15413026)
chr3 (212-286)||(13151357-13151431)
chr3 (545-631)||(14568921-14569007)
chr3 (212-286)||(45606473-45606547)
chr3 (447-621)||(52523593-52523763)
chr3 (152-324)||(3264646-3264818)
chr3 (388-444)||(19568940-19568996)
chr3 (361-444)||(42353218-42353302)
chr3 (587-646)||(15964936-15964995)
chr3 (587-646)||(15968860-15968919)
chr3 (587-646)||(15972784-15972843)
chr3 (562-623)||(20248741-20248803)
chr3 (212-369)||(6002446-6002603)
chr3 (254-322)||(11986844-11986912)
chr3 (212-291)||(6468701-6468780)
chr3 (587-646)||(11854700-11854759)
chr3 (587-634)||(19775744-19775791)
chr3 (212-286)||(13153823-13153896)
chr3 (212-306)||(17759054-17759148)
chr3 (212-306)||(19060374-19060468)
chr3 (445-576)||(29172491-29172618)
chr3 (212-298)||(40039740-40039826)
chr3 (587-648)||(15617339-15617400)
chr3 (587-648)||(30065911-30065972)
chr3 (484-621)||(2051102-2051235)
chr3 (587-646)||(4107480-4107539)
chr3 (587-646)||(4111332-4111391)
chr3 (587-646)||(7109665-7109724)
chr3 (587-646)||(7113600-7113659)
chr3 (587-646)||(11070035-11070094)
chr3 (587-646)||(11165612-11165671)
chr3 (587-646)||(22321631-22321690)
chr3 (587-646)||(22336686-22336745)
chr3 (587-646)||(27409727-27409786)
chr3 (587-646)||(28949691-28949750)
chr3 (587-646)||(37439719-37439778)
chr3 (587-646)||(55022834-55022893)
chr3 (212-302)||(8269382-8269472)
chr3 (212-302)||(8276493-8276583)
chr3 (593-646)||(4588862-4588915)
chr3 (212-261)||(17956848-17956897)
chr3 (445-510)||(21618627-21618692)
chr3 (212-261)||(27840500-27840549)
chr3 (445-510)||(36166776-36166841)
chr3 (591-628)||(54520977-54521014)
chr3 (552-632)||(43926034-43926114)
chr3 (588-643)||(14568804-14568859)
chr3 (212-259)||(16820505-16820552)
chr3 (557-639)||(14647688-14647769)
chr3 (440-486)||(37427930-37427976)
chr3 (591-620)||(12567723-12567752)
chr3 (591-620)||(13544188-13544217)
chr3 (440-477)||(16059622-16059659)
chr3 (591-628)||(29544812-29544849)
chr3 (212-293)||(54039146-54039227)
chr3 (212-248)||(1468633-1468669)
chr3 (606-646)||(11300532-11300572)
chr3 (212-248)||(12808559-12808595)
chr3 (212-276)||(14528644-14528708)
chr3 (212-276)||(16934830-16934894)
chr3 (480-508)||(23274882-23274910)
chr3 (212-276)||(25058324-25058388)
chr3 (212-276)||(49231794-49231858)
[»] chr8 (161 HSPs)
chr8 (152-646)||(19807933-19808423)
chr8 (152-637)||(22237590-22238071)
chr8 (223-646)||(17460694-17461113)
chr8 (212-620)||(25483870-25484274)
chr8 (212-477)||(15635576-15635840)
chr8 (212-477)||(39694924-39695188)
chr8 (212-477)||(41680530-41680795)
chr8 (212-508)||(364148-364444)
chr8 (212-465)||(19882371-19882624)
chr8 (212-508)||(44522822-44523118)
chr8 (212-465)||(11775125-11775378)
chr8 (152-444)||(21321676-21321968)
chr8 (212-492)||(26454087-26454367)
chr8 (316-646)||(14397604-14397923)
chr8 (212-444)||(18024091-18024323)
chr8 (212-470)||(20454638-20454895)
chr8 (212-442)||(22207693-22207923)
chr8 (212-441)||(18833898-18834127)
chr8 (212-508)||(44432221-44432518)
chr8 (212-444)||(20178917-20179149)
chr8 (212-442)||(6573453-6573682)
chr8 (212-470)||(23478478-23478736)
chr8 (212-586)||(27941285-27941655)
chr8 (212-508)||(17795592-17795888)
chr8 (152-444)||(21326274-21326566)
chr8 (212-444)||(21861016-21861248)
chr8 (212-436)||(38185482-38185706)
chr8 (212-470)||(42559924-42560181)
chr8 (212-437)||(39363955-39364180)
chr8 (212-444)||(5760957-5761189)
chr8 (216-444)||(6102153-6102381)
chr8 (212-444)||(19140189-19140421)
chr8 (212-470)||(20455395-20455652)
chr8 (212-470)||(20460373-20460630)
chr8 (212-442)||(42818303-42818533)
chr8 (212-444)||(39936407-39936638)
chr8 (212-440)||(44476851-44477080)
chr8 (212-440)||(44480113-44480342)
chr8 (212-492)||(19880205-19880484)
chr8 (212-443)||(17437714-17437945)
chr8 (212-440)||(8728333-8728561)
chr8 (212-444)||(20084034-20084266)
chr8 (212-457)||(21579603-21579848)
chr8 (215-477)||(42265994-42266252)
chr8 (212-442)||(5082608-5082838)
chr8 (212-448)||(23914344-23914579)
chr8 (464-646)||(23943876-23944054)
chr8 (440-646)||(37515765-37515967)
chr8 (212-448)||(22258700-22258935)
chr8 (212-444)||(22483171-22483402)
chr8 (440-632)||(20533267-20533455)
chr8 (442-631)||(16799561-16799748)
chr8 (440-632)||(19154744-19154932)
chr8 (507-646)||(23659467-23659602)
chr8 (279-444)||(361675-361840)
chr8 (212-444)||(32950025-32950241)
chr8 (443-621)||(17439367-17439541)
chr8 (212-457)||(29763265-29763510)
chr8 (440-623)||(14103083-14103262)
chr8 (212-443)||(17501350-17501581)
chr8 (212-395)||(23660688-23660871)
chr8 (223-444)||(20517525-20517745)
chr8 (212-369)||(36732920-36733077)
chr8 (212-444)||(4381189-4381420)
chr8 (212-444)||(22344466-22344697)
chr8 (212-444)||(22356126-22356357)
chr8 (216-448)||(23670069-23670300)
chr8 (212-448)||(38988886-38989121)
chr8 (212-448)||(39019983-39020218)
chr8 (442-646)||(20501962-20502162)
chr8 (537-637)||(25363154-25363254)
chr8 (212-444)||(36305083-36305314)
chr8 (440-621)||(40492711-40492887)
chr8 (212-369)||(21399209-21399366)
chr8 (212-369)||(21793702-21793859)
chr8 (440-645)||(17086012-17086213)
chr8 (346-464)||(8414240-8414358)
chr8 (254-444)||(18816898-18817089)
chr8 (212-444)||(17978813-17979044)
chr8 (212-444)||(22474176-22474407)
chr8 (212-448)||(36405456-36405691)
chr8 (440-642)||(23667872-23668071)
chr8 (212-365)||(21513823-21513975)
chr8 (440-646)||(22253024-22253226)
chr8 (272-444)||(18815279-18815450)
chr8 (571-646)||(23409855-23409930)
chr8 (535-646)||(5083103-5083215)
chr8 (535-646)||(17438166-17438278)
chr8 (535-646)||(18833622-18833733)
chr8 (442-622)||(22995927-22996104)
chr8 (212-331)||(16198371-16198490)
chr8 (212-441)||(24907203-24907430)
chr8 (213-331)||(14397308-14397426)
chr8 (213-331)||(18677632-18677750)
chr8 (537-646)||(22963364-22963474)
chr8 (561-646)||(23914097-23914183)
chr8 (213-331)||(4541941-4542059)
chr8 (212-306)||(8414145-8414239)
chr8 (213-331)||(24485611-24485729)
chr8 (212-291)||(1484918-1484997)
chr8 (212-291)||(20045762-20045841)
chr8 (212-303)||(45290114-45290205)
chr8 (440-563)||(22525659-22525778)
chr8 (572-646)||(16401983-16402063)
chr8 (213-321)||(22002239-22002347)
chr8 (212-444)||(25757577-25757808)
chr8 (212-291)||(5852859-5852938)
chr8 (212-291)||(14409011-14409090)
chr8 (255-444)||(18118603-18118792)
chr8 (537-591)||(21346185-21346239)
chr8 (562-623)||(44476753-44476814)
chr8 (562-623)||(44480015-44480076)
chr8 (212-444)||(25295557-25295788)
chr8 (212-291)||(14824291-14824370)
chr8 (362-437)||(21345945-21346020)
chr8 (211-298)||(22313401-22313488)
chr8 (254-365)||(24624171-24624282)
chr8 (442-620)||(28397635-28397809)
chr8 (572-620)||(19936956-19937004)
chr8 (587-646)||(18862728-18862787)
chr8 (215-369)||(19331976-19332128)
chr8 (587-646)||(21410914-21410973)
chr8 (587-646)||(21805406-21805465)
chr8 (587-646)||(21828097-21828156)
chr8 (554-628)||(35026831-35026903)
chr8 (538-621)||(37116434-37116517)
chr8 (212-442)||(18827650-18827879)
chr8 (212-306)||(24238977-24239071)
chr8 (591-644)||(1327013-1327066)
chr8 (212-291)||(4483796-4483875)
chr8 (538-628)||(22419367-22419455)
chr8 (212-444)||(45559572-45559796)
chr8 (551-620)||(2418839-2418906)
chr8 (212-294)||(4233215-4233297)
chr8 (562-623)||(8728620-8728682)
chr8 (212-369)||(21495086-21495243)
chr8 (587-646)||(19278366-19278425)
chr8 (587-646)||(21972668-21972727)
chr8 (587-646)||(21976753-21976812)
chr8 (587-646)||(43251777-43251836)
chr8 (212-302)||(223324-223414)
chr8 (212-302)||(688095-688185)
chr8 (212-302)||(736947-737037)
chr8 (212-302)||(860842-860932)
chr8 (565-606)||(21346241-21346282)
chr8 (445-510)||(26222945-26223010)
chr8 (557-641)||(34950611-34950694)
chr8 (538-621)||(17266945-17267028)
chr8 (557-639)||(21329095-21329176)
chr8 (557-639)||(21967540-21967621)
chr8 (419-457)||(23410018-23410056)
chr8 (554-595)||(18024465-18024506)
chr8 (552-621)||(22364748-22364816)
chr8 (212-248)||(272183-272219)
chr8 (212-248)||(643630-643666)
chr8 (212-248)||(829436-829472)
chr8 (212-276)||(17150635-17150699)
chr8 (404-440)||(18122327-18122363)
chr8 (212-276)||(22007105-22007169)
chr8 (440-488)||(22381593-22381641)
chr8 (212-276)||(29759455-29759519)
[»] chr4 (154 HSPs)
chr4 (152-646)||(10056698-10057188)
chr4 (212-612)||(630299-630695)
chr4 (212-620)||(23802860-23803264)
chr4 (212-620)||(12611106-12611507)
chr4 (212-620)||(51463463-51463867)
chr4 (212-646)||(18212792-18213222)
chr4 (212-646)||(24046930-24047360)
chr4 (212-477)||(9638399-9638663)
chr4 (212-465)||(28385646-28385899)
chr4 (212-444)||(35660270-35660502)
chr4 (212-508)||(56115232-56115528)
chr4 (212-492)||(15008342-15008622)
chr4 (212-468)||(15990439-15990695)
chr4 (212-444)||(53630869-53631101)
chr4 (212-465)||(10694643-10694896)
chr4 (212-465)||(10908409-10908662)
chr4 (217-442)||(11479012-11479237)
chr4 (212-444)||(25091077-25091309)
chr4 (214-477)||(10704890-10705152)
chr4 (214-477)||(10918660-10918922)
chr4 (212-442)||(9923622-9923852)
chr4 (212-492)||(40619907-40620186)
chr4 (212-444)||(42875223-42875455)
chr4 (212-442)||(37019095-37019325)
chr4 (215-444)||(3337523-3337752)
chr4 (212-457)||(15447812-15448057)
chr4 (212-444)||(19435093-19435326)
chr4 (216-444)||(19609748-19609976)
chr4 (212-444)||(10356832-10357064)
chr4 (212-444)||(16997954-16998181)
chr4 (212-444)||(33243692-33243924)
chr4 (212-508)||(33849102-33849398)
chr4 (212-443)||(15114648-15114878)
chr4 (212-457)||(33186312-33186557)
chr4 (212-444)||(14549050-14549282)
chr4 (212-467)||(16277723-16277978)
chr4 (212-467)||(53387333-53387588)
chr4 (212-432)||(3485347-3485564)
chr4 (216-400)||(15011913-15012097)
chr4 (440-632)||(17333352-17333542)
chr4 (440-646)||(13591785-13591987)
chr4 (212-444)||(19566315-19566546)
chr4 (212-448)||(46740619-46740854)
chr4 (440-642)||(32306854-32307052)
chr4 (212-448)||(40229723-40229959)
chr4 (212-444)||(14630250-14630482)
chr4 (212-448)||(15344297-15344531)
chr4 (213-436)||(10237895-10238117)
chr4 (212-444)||(11425379-11425601)
chr4 (440-622)||(14825551-14825730)
chr4 (213-443)||(15214442-15214672)
chr4 (446-645)||(26050340-26050534)
chr4 (215-448)||(44024003-44024235)
chr4 (213-444)||(25513167-25513397)
chr4 (318-463)||(15883917-15884062)
chr4 (537-646)||(17048086-17048195)
chr4 (212-369)||(16026325-16026482)
chr4 (212-356)||(55582703-55582847)
chr4 (212-445)||(45314733-45314965)
chr4 (212-444)||(26445309-26445540)
chr4 (212-355)||(18108274-18108417)
chr4 (212-444)||(2425017-2425248)
chr4 (535-631)||(16043087-16043183)
chr4 (212-331)||(15534658-15534777)
chr4 (440-642)||(14852734-14852933)
chr4 (212-331)||(49547340-49547459)
chr4 (212-331)||(14049054-14049173)
chr4 (535-646)||(15041911-15042023)
chr4 (535-646)||(15112401-15112513)
chr4 (212-331)||(36038347-36038466)
chr4 (213-331)||(12033341-12033459)
chr4 (572-646)||(14746570-14746644)
chr4 (225-339)||(22725494-22725608)
chr4 (213-331)||(44615765-44615883)
chr4 (547-643)||(40907134-40907230)
chr4 (374-508)||(43251120-43251255)
chr4 (212-442)||(20595827-20596056)
chr4 (535-633)||(40906987-40907084)
chr4 (376-477)||(9871126-9871226)
chr4 (442-622)||(15791857-15792034)
chr4 (212-324)||(14185426-14185538)
chr4 (212-331)||(30147392-30147511)
chr4 (213-331)||(50221907-50222025)
chr4 (447-621)||(52243059-52243230)
chr4 (212-291)||(15117919-15117998)
chr4 (546-639)||(4831496-4831589)
chr4 (546-639)||(4834791-4834884)
chr4 (546-639)||(14047706-14047799)
chr4 (559-645)||(26045268-26045353)
chr4 (213-331)||(29267830-29267948)
chr4 (212-370)||(54364086-54364244)
chr4 (212-353)||(13046041-13046182)
chr4 (573-646)||(14185039-14185112)
chr4 (214-331)||(19243177-19243294)
chr4 (442-602)||(26789441-26789598)
chr4 (212-291)||(7640753-7640832)
chr4 (212-286)||(1837086-1837160)
chr4 (546-630)||(30146462-30146546)
chr4 (371-441)||(13036332-13036402)
chr4 (312-448)||(12622792-12622927)
chr4 (312-444)||(14508186-14508317)
chr4 (255-367)||(19081780-19081892)
chr4 (587-646)||(12487675-12487734)
chr4 (587-646)||(14954250-14954309)
chr4 (591-646)||(15497041-15497096)
chr4 (587-646)||(25689834-25689893)
chr4 (587-646)||(27533990-27534049)
chr4 (212-286)||(18239179-18239253)
chr4 (212-269)||(9871071-9871128)
chr4 (593-646)||(10712820-10712873)
chr4 (593-646)||(10926590-10926643)
chr4 (212-281)||(44772650-44772719)
chr4 (158-226)||(9886387-9886455)
chr4 (212-298)||(17376062-17376148)
chr4 (212-302)||(18247739-18247829)
chr4 (212-302)||(22355079-22355169)
chr4 (212-302)||(47357183-47357273)
chr4 (445-531)||(54798627-54798713)
chr4 (591-628)||(49547744-49547781)
chr4 (212-264)||(14873653-14873705)
chr4 (212-276)||(14951296-14951360)
chr4 (587-646)||(4561417-4561476)
chr4 (587-646)||(5757021-5757080)
chr4 (587-646)||(9556494-9556553)
chr4 (156-227)||(13234547-13234618)
chr4 (448-531)||(14280474-14280557)
chr4 (587-646)||(14757505-14757564)
chr4 (591-646)||(19857581-19857636)
chr4 (216-302)||(17146303-17146389)
chr4 (587-633)||(33742355-33742401)
chr4 (591-628)||(14048732-14048769)
chr4 (212-293)||(15287878-15287959)
chr4 (212-293)||(15294988-15295069)
chr4 (399-444)||(26922254-26922299)
chr4 (591-628)||(36038025-36038062)
chr4 (587-631)||(17810251-17810295)
chr4 (212-276)||(55377205-55377269)
chr4 (177-228)||(12230500-12230551)
chr4 (479-576)||(44928821-44928914)
chr4 (591-646)||(52873148-52873203)
chr4 (212-302)||(10643746-10643836)
chr4 (212-302)||(19020009-19020099)
chr4 (445-510)||(8574742-8574807)
chr4 (382-443)||(12134425-12134486)
chr4 (591-628)||(15534336-15534373)
chr4 (479-524)||(20157189-20157234)
chr4 (479-508)||(44102404-44102433)
chr4 (212-276)||(5683375-5683439)
chr4 (212-248)||(8374094-8374130)
chr4 (212-244)||(12622936-12622968)
chr4 (212-276)||(14995670-14995734)
chr4 (212-276)||(16731702-16731766)
chr4 (212-248)||(18168347-18168383)
chr4 (535-643)||(19738310-19738418)
[»] chr2 (138 HSPs)
chr2 (152-646)||(27472479-27472969)
chr2 (152-646)||(34873783-34874273)
chr2 (212-646)||(21081367-21081797)
chr2 (212-646)||(18358365-18358794)
chr2 (212-620)||(22173424-22173828)
chr2 (152-489)||(34858721-34859058)
chr2 (212-646)||(19662051-19662481)
chr2 (212-646)||(21073123-21073553)
chr2 (212-646)||(9241986-9242416)
chr2 (152-448)||(20915525-20915821)
chr2 (212-646)||(6260774-6261205)
chr2 (212-476)||(41301369-41301633)
chr2 (212-465)||(26903561-26903814)
chr2 (212-444)||(23969019-23969251)
chr2 (212-465)||(21915025-21915278)
chr2 (212-452)||(25183603-25183843)
chr2 (216-444)||(43707685-43707912)
chr2 (213-444)||(24273656-24273887)
chr2 (212-444)||(9975353-9975585)
chr2 (212-444)||(24781236-24781468)
chr2 (316-646)||(31345176-31345495)
chr2 (212-470)||(24883785-24884042)
chr2 (212-477)||(31520509-31520773)
chr2 (212-444)||(5031526-5031758)
chr2 (212-444)||(27484866-27485098)
chr2 (212-444)||(36839595-36839827)
chr2 (212-459)||(18388693-18388940)
chr2 (212-508)||(23338796-23339092)
chr2 (213-457)||(10039531-10039775)
chr2 (212-444)||(17306911-17307143)
chr2 (212-443)||(21368532-21368763)
chr2 (212-443)||(19201596-19201828)
chr2 (212-450)||(20590718-20590956)
chr2 (216-440)||(6482946-6483171)
chr2 (216-440)||(6486413-6486638)
chr2 (212-437)||(9785013-9785238)
chr2 (212-508)||(28349268-28349573)
chr2 (215-437)||(23068849-23069071)
chr2 (212-437)||(28652898-28653123)
chr2 (212-444)||(24515610-24515842)
chr2 (346-646)||(30643811-30644107)
chr2 (212-448)||(22690101-22690336)
chr2 (212-448)||(22694697-22694932)
chr2 (442-646)||(34137000-34137200)
chr2 (440-646)||(26392442-26392643)
chr2 (212-444)||(21316058-21316289)
chr2 (215-444)||(21335852-21336080)
chr2 (513-646)||(23069215-23069344)
chr2 (254-444)||(29113786-29113975)
chr2 (212-369)||(1384082-1384239)
chr2 (212-467)||(2524143-2524380)
chr2 (212-444)||(22686264-22686495)
chr2 (440-632)||(23287438-23287625)
chr2 (537-646)||(9784741-9784848)
chr2 (223-369)||(25587094-25587240)
chr2 (440-621)||(23004835-23005012)
chr2 (212-331)||(20261696-20261815)
chr2 (182-444)||(22332142-22332402)
chr2 (212-331)||(10684329-10684448)
chr2 (535-640)||(21237818-21237924)
chr2 (212-369)||(23778691-23778849)
chr2 (535-646)||(19201924-19202036)
chr2 (440-621)||(20520051-20520227)
chr2 (212-331)||(38967956-38968075)
chr2 (572-646)||(23707275-23707349)
chr2 (572-646)||(24918170-24918244)
chr2 (212-354)||(28345472-28345614)
chr2 (255-444)||(23609901-23610089)
chr2 (212-323)||(40911868-40911979)
chr2 (572-646)||(24681474-24681548)
chr2 (440-631)||(18546803-18546991)
chr2 (216-327)||(31345661-31345771)
chr2 (572-646)||(24671055-24671129)
chr2 (213-331)||(24897763-24897881)
chr2 (213-331)||(24900246-24900364)
chr2 (213-331)||(24902723-24902841)
chr2 (213-331)||(24905200-24905318)
chr2 (213-331)||(24907675-24907793)
chr2 (212-303)||(22255777-22255868)
chr2 (440-584)||(22412994-22413134)
chr2 (362-477)||(22501260-22501374)
chr2 (362-477)||(22509194-22509308)
chr2 (213-331)||(23136056-23136174)
chr2 (442-621)||(24697467-24697641)
chr2 (212-291)||(18809459-18809538)
chr2 (212-443)||(22786694-22786924)
chr2 (212-291)||(28577615-28577694)
chr2 (212-369)||(20272855-20273012)
chr2 (212-292)||(7186942-7187022)
chr2 (212-291)||(23711580-23711659)
chr2 (212-291)||(26505895-26505974)
chr2 (212-291)||(26508373-26508452)
chr2 (212-291)||(27920331-27920410)
chr2 (212-291)||(32039065-32039144)
chr2 (212-286)||(571919-571993)
chr2 (546-639)||(22703165-22703258)
chr2 (212-306)||(36734881-36734975)
chr2 (212-286)||(39682835-39682909)
chr2 (212-293)||(22501375-22501456)
chr2 (212-293)||(22509309-22509390)
chr2 (562-623)||(6482838-6482899)
chr2 (562-623)||(6486305-6486366)
chr2 (587-651)||(41531087-41531151)
chr2 (587-646)||(1283353-1283412)
chr2 (546-639)||(13101597-13101691)
chr2 (587-646)||(30345074-30345133)
chr2 (538-622)||(43947324-43947408)
chr2 (572-620)||(24642807-24642855)
chr2 (212-291)||(23131378-23131457)
chr2 (212-291)||(23133845-23133924)
chr2 (212-291)||(34402089-34402168)
chr2 (212-302)||(19887294-19887384)
chr2 (484-576)||(23708521-23708609)
chr2 (399-444)||(24841377-24841422)
chr2 (587-646)||(12901595-12901654)
chr2 (587-646)||(24628562-24628621)
chr2 (587-646)||(27379516-27379575)
chr2 (587-646)||(27383562-27383621)
chr2 (587-646)||(27601760-27601819)
chr2 (587-633)||(24649334-24649380)
chr2 (415-465)||(34492091-34492141)
chr2 (254-391)||(28031919-28032056)
chr2 (587-631)||(10101728-10101772)
chr2 (212-276)||(16900841-16900905)
chr2 (212-276)||(16994232-16994296)
chr2 (602-646)||(22459579-22459623)
chr2 (212-368)||(24302220-24302374)
chr2 (212-248)||(24383131-24383167)
chr2 (212-276)||(34823776-34823840)
chr2 (186-224)||(22497852-22497890)
chr2 (591-628)||(10684735-10684772)
chr2 (591-628)||(20261374-20261411)
chr2 (212-248)||(11232232-11232268)
chr2 (160-224)||(19445355-19445419)
chr2 (212-248)||(22514079-22514115)
chr2 (212-248)||(23760032-23760068)
chr2 (212-248)||(28776681-28776717)
chr2 (442-486)||(43947232-43947276)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (152-646)||(67321-67810)
scaffold0032 (256-368)||(62410-62522)
scaffold0032 (212-443)||(116801-117032)
[»] chr7 (231 HSPs)
chr7 (152-646)||(46580260-46580736)
chr7 (213-646)||(16998652-16999087)
chr7 (212-620)||(13647492-13647898)
chr7 (328-646)||(14273574-14273888)
chr7 (152-465)||(48812241-48812554)
chr7 (212-646)||(18872386-18872816)
chr7 (212-646)||(11661332-11661761)
chr7 (212-646)||(14566228-14566658)
chr7 (212-646)||(16008604-16009034)
chr7 (212-510)||(18456044-18456342)
chr7 (212-646)||(18607513-18607943)
chr7 (212-651)||(14422005-14422441)
chr7 (212-465)||(708951-709204)
chr7 (212-470)||(58814-59071)
chr7 (212-477)||(8756792-8757056)
chr7 (212-465)||(16462439-16462692)
chr7 (212-444)||(14415880-14416112)
chr7 (212-465)||(32160598-32160851)
chr7 (315-646)||(13918266-13918586)
chr7 (212-465)||(14191484-14191735)
chr7 (212-470)||(30820652-30820910)
chr7 (212-465)||(47975307-47975560)
chr7 (212-492)||(16550400-16550679)
chr7 (212-492)||(16614983-16615262)
chr7 (212-465)||(14188690-14188941)
chr7 (212-450)||(15213917-15214155)
chr7 (212-457)||(17070689-17070934)
chr7 (212-444)||(13745172-13745404)
chr7 (316-646)||(25926993-25927309)
chr7 (212-444)||(44374370-44374602)
chr7 (212-444)||(44383235-44383467)
chr7 (212-444)||(46386483-46386715)
chr7 (212-457)||(47094491-47094736)
chr7 (212-444)||(12371699-12371931)
chr7 (212-444)||(12465656-12465888)
chr7 (212-440)||(15167403-15167631)
chr7 (212-471)||(13408170-13408428)
chr7 (212-467)||(17505400-17505655)
chr7 (212-467)||(17547559-17547814)
chr7 (212-470)||(36685645-36685904)
chr7 (212-470)||(832419-832676)
chr7 (212-470)||(1197599-1197856)
chr7 (212-630)||(38828304-38828717)
chr7 (212-477)||(13699285-13699549)
chr7 (212-457)||(40555139-40555384)
chr7 (212-444)||(11066892-11067124)
chr7 (212-444)||(14928728-14928960)
chr7 (212-444)||(15352194-15352426)
chr7 (212-444)||(19282516-19282748)
chr7 (212-476)||(29004214-29004478)
chr7 (212-444)||(33001338-33001570)
chr7 (216-470)||(12755106-12755359)
chr7 (212-586)||(147704-148074)
chr7 (212-440)||(10896390-10896618)
chr7 (212-444)||(13147868-13148100)
chr7 (212-448)||(32433985-32434221)
chr7 (212-460)||(34957579-34957827)
chr7 (212-443)||(8851555-8851786)
chr7 (212-477)||(4325448-4325712)
chr7 (440-646)||(9177524-9177726)
chr7 (457-646)||(1858707-1858892)
chr7 (216-444)||(48743727-48743955)
chr7 (212-470)||(37727323-37727580)
chr7 (212-437)||(32301613-32301838)
chr7 (212-436)||(32771760-32771984)
chr7 (212-437)||(16580091-16580316)
chr7 (216-448)||(14153372-14153603)
chr7 (440-641)||(17017326-17017523)
chr7 (216-437)||(14258783-14259004)
chr7 (212-444)||(20585780-20586008)
chr7 (440-646)||(17060282-17060485)
chr7 (212-416)||(12323326-12323530)
chr7 (282-442)||(15119761-15119921)
chr7 (212-440)||(20619714-20619942)
chr7 (212-444)||(12127559-12127792)
chr7 (212-393)||(29052551-29052732)
chr7 (255-437)||(16585390-16585572)
chr7 (212-444)||(24270378-24270609)
chr7 (513-646)||(32301347-32301476)
chr7 (212-444)||(39292133-39292364)
chr7 (212-471)||(13864791-13865040)
chr7 (537-646)||(16460717-16460826)
chr7 (288-444)||(13745672-13745828)
chr7 (212-444)||(18875242-18875474)
chr7 (212-367)||(15720250-15720405)
chr7 (291-437)||(16460407-16460553)
chr7 (537-646)||(14258510-14258619)
chr7 (537-646)||(16579818-16579927)
chr7 (537-646)||(16585736-16585845)
chr7 (212-444)||(43277139-43277372)
chr7 (212-444)||(4691292-4691523)
chr7 (446-644)||(16996284-16996477)
chr7 (537-646)||(20487601-20487710)
chr7 (212-444)||(14161251-14161482)
chr7 (212-444)||(48213341-48213572)
chr7 (535-646)||(10501373-10501484)
chr7 (212-443)||(15978452-15978682)
chr7 (442-646)||(42462009-42462209)
chr7 (460-622)||(48991266-48991422)
chr7 (212-448)||(8514142-8514377)
chr7 (212-444)||(21538585-21538816)
chr7 (212-444)||(25941862-25942093)
chr7 (535-646)||(14157054-14157165)
chr7 (440-620)||(16091844-16092019)
chr7 (535-646)||(38519432-38519543)
chr7 (212-369)||(3287489-3287646)
chr7 (446-646)||(130680-130878)
chr7 (223-443)||(3192700-3192920)
chr7 (440-642)||(11768777-11768977)
chr7 (312-444)||(13894519-13894651)
chr7 (458-646)||(11525440-11525625)
chr7 (225-444)||(20252751-20252969)
chr7 (212-442)||(9743477-9743706)
chr7 (212-331)||(1856796-1856915)
chr7 (440-596)||(9725518-9725670)
chr7 (212-331)||(23664519-23664638)
chr7 (440-646)||(9033204-9033407)
chr7 (223-369)||(18080125-18080271)
chr7 (561-646)||(15720055-15720140)
chr7 (479-584)||(2529951-2530052)
chr7 (152-324)||(11309853-11310025)
chr7 (513-622)||(14929152-14929257)
chr7 (513-622)||(15352618-15352723)
chr7 (535-646)||(20619440-20619552)
chr7 (212-331)||(11303724-11303843)
chr7 (212-331)||(13917969-13918088)
chr7 (212-331)||(29800906-29801025)
chr7 (572-646)||(8940309-8940383)
chr7 (152-242)||(11091080-11091170)
chr7 (212-306)||(13897808-13897902)
chr7 (216-444)||(15576233-15576458)
chr7 (440-528)||(14044922-14045010)
chr7 (440-528)||(14354952-14355040)
chr7 (440-621)||(15008357-15008533)
chr7 (323-443)||(28719885-28720005)
chr7 (212-331)||(16108255-16108374)
chr7 (212-331)||(25926696-25926815)
chr7 (212-331)||(29797087-29797206)
chr7 (339-437)||(20487874-20487972)
chr7 (440-513)||(14036387-14036460)
chr7 (440-513)||(14346417-14346490)
chr7 (212-296)||(44190645-44190729)
chr7 (212-331)||(32125967-32126086)
chr7 (213-331)||(41523394-41523512)
chr7 (213-331)||(41525856-41525974)
chr7 (460-632)||(1867874-1868040)
chr7 (212-291)||(15376280-15376359)
chr7 (212-331)||(18431188-18431307)
chr7 (212-291)||(20384690-20384769)
chr7 (546-639)||(837317-837410)
chr7 (546-639)||(1202497-1202590)
chr7 (546-639)||(16109474-16109567)
chr7 (213-331)||(24702705-24702823)
chr7 (213-331)||(24705152-24705270)
chr7 (546-646)||(833321-833421)
chr7 (546-646)||(1198501-1198601)
chr7 (572-632)||(38898181-38898241)
chr7 (212-364)||(46473562-46473714)
chr7 (212-291)||(27217377-27217456)
chr7 (212-286)||(456843-456917)
chr7 (212-286)||(11392866-11392940)
chr7 (212-306)||(37538970-37539064)
chr7 (562-623)||(10896687-10896748)
chr7 (562-623)||(15167285-15167346)
chr7 (212-444)||(8563987-8564218)
chr7 (212-276)||(14105863-14105927)
chr7 (216-331)||(14948693-14948808)
chr7 (212-286)||(16233042-16233116)
chr7 (212-291)||(13869864-13869941)
chr7 (212-296)||(39431624-39431707)
chr7 (216-291)||(16410575-16410650)
chr7 (553-632)||(18203887-18203965)
chr7 (587-646)||(45170089-45170148)
chr7 (213-291)||(26355549-26355627)
chr7 (213-291)||(26358001-26358079)
chr7 (590-646)||(8468777-8468833)
chr7 (212-276)||(10001004-10001068)
chr7 (572-620)||(15081900-15081948)
chr7 (388-444)||(15720200-15720256)
chr7 (293-448)||(3136715-3136869)
chr7 (591-646)||(14270032-14270087)
chr7 (587-646)||(18279367-18279426)
chr7 (587-646)||(18283330-18283389)
chr7 (212-275)||(20487973-20488036)
chr7 (316-378)||(1857092-1857154)
chr7 (484-621)||(2280021-2280155)
chr7 (587-646)||(33071-33130)
chr7 (587-646)||(70848-70907)
chr7 (587-646)||(74957-75016)
chr7 (587-646)||(12704742-12704801)
chr7 (587-646)||(12714828-12714887)
chr7 (587-646)||(12718632-12718691)
chr7 (587-646)||(12723543-12723602)
chr7 (587-646)||(16907284-16907343)
chr7 (587-646)||(39722230-39722289)
chr7 (557-639)||(13892661-13892742)
chr7 (587-633)||(26292372-26292418)
chr7 (445-531)||(48273550-48273636)
chr7 (447-621)||(12255657-12255827)
chr7 (212-345)||(16065970-16066103)
chr7 (538-621)||(20220142-20220222)
chr7 (399-444)||(21675491-21675536)
chr7 (212-344)||(12191849-12191981)
chr7 (606-646)||(15116540-15116580)
chr7 (587-631)||(16114220-16114264)
chr7 (587-631)||(16117373-16117417)
chr7 (226-298)||(21660587-21660659)
chr7 (212-276)||(28720041-28720105)
chr7 (603-646)||(15113003-15113046)
chr7 (156-227)||(16379749-16379820)
chr7 (212-275)||(18628098-18628161)
chr7 (212-275)||(18640804-18640867)
chr7 (212-302)||(15760758-15760848)
chr7 (557-639)||(34957407-34957488)
chr7 (387-432)||(1858644-1858689)
chr7 (591-628)||(11303402-11303439)
chr7 (591-628)||(16108659-16108696)
chr7 (212-245)||(19194774-19194807)
chr7 (591-628)||(23664923-23664960)
chr7 (562-639)||(29004057-29004133)
chr7 (591-628)||(29796763-29796800)
chr7 (591-628)||(29800582-29800619)
chr7 (212-276)||(125991-126055)
chr7 (212-248)||(7822067-7822103)
chr7 (212-248)||(7829378-7829414)
chr7 (212-276)||(11287002-11287066)
chr7 (212-248)||(16383172-16383208)
chr7 (212-248)||(27102531-27102567)
chr7 (212-248)||(27109879-27109915)
chr7 (212-248)||(27175759-27175795)
chr7 (212-248)||(38784623-38784659)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (212-646)||(219-649)
[»] chr5 (127 HSPs)
chr5 (212-646)||(6765888-6766317)
chr5 (216-636)||(30138564-30138979)
chr5 (212-632)||(29448078-29448494)
chr5 (212-510)||(22412365-22412662)
chr5 (212-510)||(18418770-18419068)
chr5 (212-646)||(37598513-37598943)
chr5 (212-646)||(42960602-42961033)
chr5 (212-646)||(28370652-28371082)
chr5 (212-477)||(24277002-24277266)
chr5 (212-477)||(24384947-24385211)
chr5 (216-470)||(17812795-17813048)
chr5 (212-465)||(263260-263513)
chr5 (216-465)||(33472964-33473213)
chr5 (212-444)||(32607721-32607953)
chr5 (212-470)||(36460368-36460626)
chr5 (212-441)||(21399400-21399628)
chr5 (212-492)||(17011102-17011382)
chr5 (212-444)||(41875989-41876221)
chr5 (212-442)||(26761827-26762057)
chr5 (212-457)||(17875410-17875655)
chr5 (212-444)||(20197982-20198216)
chr5 (212-574)||(38145134-38145492)
chr5 (212-444)||(20565978-20566210)
chr5 (212-444)||(19921058-19921289)
chr5 (212-444)||(27868971-27869203)
chr5 (212-442)||(8833603-8833824)
chr5 (212-470)||(31456196-31456454)
chr5 (212-470)||(21557440-21557699)
chr5 (212-440)||(22750372-22750597)
chr5 (212-440)||(19511614-19511843)
chr5 (234-442)||(33895300-33895508)
chr5 (212-508)||(22758286-22758583)
chr5 (212-367)||(40917369-40917524)
chr5 (212-450)||(21554775-21555013)
chr5 (212-444)||(16062910-16063141)
chr5 (442-642)||(25576716-25576911)
chr5 (213-444)||(36509181-36509405)
chr5 (440-646)||(23469863-23470064)
chr5 (537-646)||(22107386-22107495)
chr5 (212-440)||(22336748-22336976)
chr5 (213-444)||(8504266-8504496)
chr5 (442-642)||(25574330-25574525)
chr5 (442-642)||(25575523-25575718)
chr5 (212-444)||(16605000-16605231)
chr5 (212-440)||(22340286-22340514)
chr5 (212-444)||(18744074-18744305)
chr5 (212-444)||(14026204-14026435)
chr5 (440-633)||(26740505-26740693)
chr5 (212-339)||(24617319-24617446)
chr5 (212-339)||(24713550-24713677)
chr5 (212-339)||(24746578-24746705)
chr5 (446-646)||(26732698-26732893)
chr5 (212-322)||(43243054-43243164)
chr5 (212-369)||(23199788-23199942)
chr5 (212-444)||(1627777-1628008)
chr5 (212-331)||(37804469-37804588)
chr5 (212-339)||(24668593-24668720)
chr5 (212-339)||(24738362-24738489)
chr5 (212-339)||(24751131-24751258)
chr5 (440-646)||(21328073-21328276)
chr5 (562-646)||(22336627-22336711)
chr5 (562-646)||(22340165-22340249)
chr5 (212-443)||(28901346-28901576)
chr5 (212-443)||(28937741-28937971)
chr5 (282-444)||(22111024-22111185)
chr5 (212-369)||(17908966-17909123)
chr5 (537-646)||(33895607-33895706)
chr5 (535-646)||(21809531-21809642)
chr5 (371-470)||(12122077-12122175)
chr5 (551-646)||(21731426-21731522)
chr5 (212-331)||(29351402-29351521)
chr5 (213-331)||(10732508-10732626)
chr5 (546-646)||(10816462-10816562)
chr5 (182-291)||(20909528-20909637)
chr5 (212-291)||(264335-264414)
chr5 (579-646)||(18356256-18356323)
chr5 (212-291)||(23065030-23065109)
chr5 (549-632)||(27988892-27988978)
chr5 (212-331)||(29346456-29346575)
chr5 (212-331)||(29348929-29349048)
chr5 (546-639)||(23538495-23538588)
chr5 (213-331)||(42244933-42245051)
chr5 (562-623)||(22750264-22750325)
chr5 (533-646)||(15796479-15796594)
chr5 (445-576)||(18318942-18319068)
chr5 (440-567)||(20572025-20572149)
chr5 (579-646)||(20910910-20910977)
chr5 (212-291)||(39245652-39245731)
chr5 (562-623)||(19511516-19511577)
chr5 (182-291)||(38619952-38620061)
chr5 (587-646)||(10753328-10753387)
chr5 (212-439)||(31478801-31479026)
chr5 (212-302)||(11903-11993)
chr5 (212-302)||(25426177-25426267)
chr5 (311-444)||(30613937-30614069)
chr5 (212-291)||(39363900-39363979)
chr5 (182-228)||(13938457-13938503)
chr5 (212-302)||(35791744-35791834)
chr5 (213-302)||(21074229-21074318)
chr5 (399-448)||(26749534-26749583)
chr5 (311-444)||(30611977-30612109)
chr5 (212-276)||(22367114-22367178)
chr5 (587-646)||(15236863-15236922)
chr5 (587-646)||(19472803-19472862)
chr5 (587-646)||(20295811-20295870)
chr5 (186-221)||(25582095-25582130)
chr5 (587-646)||(40723670-40723729)
chr5 (538-632)||(22178172-22178266)
chr5 (212-293)||(7424886-7424967)
chr5 (593-646)||(15236924-15236977)
chr5 (445-510)||(20765993-20766058)
chr5 (212-276)||(27183188-27183252)
chr5 (212-276)||(43444028-43444092)
chr5 (212-303)||(7528427-7528518)
chr5 (212-243)||(19499487-19499518)
chr5 (212-274)||(9776699-9776761)
chr5 (212-302)||(11342190-11342280)
chr5 (212-302)||(18778625-18778715)
chr5 (591-628)||(9776513-9776550)
chr5 (212-276)||(1168811-1168875)
chr5 (212-276)||(1220363-1220427)
chr5 (212-248)||(21933262-21933298)
chr5 (212-248)||(21939432-21939468)
chr5 (212-276)||(23506529-23506593)
chr5 (180-228)||(23908687-23908735)
chr5 (212-248)||(35581394-35581430)
chr5 (212-248)||(36990658-36990694)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (212-646)||(15802-16229)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (220-646)||(105140-105560)
scaffold0023 (212-505)||(162647-162940)
scaffold0023 (212-291)||(94927-95006)
scaffold0023 (215-274)||(17202-17261)
scaffold0023 (212-260)||(154871-154919)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (212-646)||(477-905)
[»] chr6 (165 HSPs)
chr6 (212-646)||(15817154-15817582)
chr6 (212-646)||(14979018-14979448)
chr6 (212-633)||(25619353-25619770)
chr6 (212-620)||(20556489-20556893)
chr6 (152-477)||(27851394-27851719)
chr6 (152-477)||(20733783-20734107)
chr6 (212-646)||(4476884-4477314)
chr6 (212-444)||(28947768-28948000)
chr6 (212-477)||(18658598-18658862)
chr6 (212-465)||(23956265-23956518)
chr6 (317-646)||(23414944-23415262)
chr6 (212-492)||(15173851-15174130)
chr6 (198-442)||(18928149-18928393)
chr6 (315-646)||(27556702-27557022)
chr6 (212-646)||(23838234-23838655)
chr6 (212-448)||(5834131-5834366)
chr6 (392-620)||(25754972-25755196)
chr6 (212-470)||(611139-611396)
chr6 (212-470)||(19825885-19826142)
chr6 (212-444)||(7827396-7827628)
chr6 (212-444)||(19655625-19655857)
chr6 (212-448)||(20177166-20177401)
chr6 (212-444)||(23491567-23491799)
chr6 (212-444)||(23497165-23497397)
chr6 (216-444)||(18708923-18709151)
chr6 (212-448)||(22158590-22158825)
chr6 (212-492)||(13764730-13765002)
chr6 (212-444)||(17318518-17318750)
chr6 (216-444)||(18702988-18703216)
chr6 (212-444)||(23150663-23150894)
chr6 (212-443)||(25601673-25601904)
chr6 (212-410)||(1254215-1254413)
chr6 (440-632)||(33443122-33443307)
chr6 (212-457)||(29847899-29848146)
chr6 (212-431)||(15891107-15891326)
chr6 (212-438)||(8767659-8767885)
chr6 (212-438)||(25347556-25347782)
chr6 (212-437)||(19773105-19773330)
chr6 (212-437)||(15705007-15705232)
chr6 (212-444)||(31734132-31734362)
chr6 (212-448)||(20182984-20183219)
chr6 (212-448)||(22152772-22153007)
chr6 (212-403)||(23655804-23655995)
chr6 (212-444)||(27125872-27126105)
chr6 (212-455)||(16133066-16133309)
chr6 (216-455)||(19443681-19443919)
chr6 (392-584)||(25752838-25753026)
chr6 (212-438)||(8759913-8760138)
chr6 (216-401)||(755-940)
chr6 (182-440)||(27317919-27318179)
chr6 (212-470)||(34296664-34296923)
chr6 (440-631)||(20224018-20224205)
chr6 (440-631)||(22118002-22118189)
chr6 (440-646)||(18453242-18453444)
chr6 (212-386)||(31022093-31022267)
chr6 (212-444)||(18455468-18455699)
chr6 (212-444)||(25921154-25921385)
chr6 (212-398)||(25807602-25807788)
chr6 (216-448)||(20411072-20411303)
chr6 (537-646)||(19773494-19773603)
chr6 (513-646)||(22805992-22806120)
chr6 (212-444)||(32259272-32259502)
chr6 (216-369)||(29044809-29044962)
chr6 (538-646)||(28103851-28103959)
chr6 (212-322)||(7430069-7430179)
chr6 (212-369)||(34141023-34141178)
chr6 (212-369)||(34153639-34153794)
chr6 (537-634)||(15705395-15705492)
chr6 (212-369)||(18585117-18585274)
chr6 (212-441)||(22556676-22556905)
chr6 (215-443)||(17857091-17857319)
chr6 (212-444)||(18398343-18398574)
chr6 (440-584)||(18696609-18696749)
chr6 (212-441)||(13285136-13285364)
chr6 (212-331)||(12942666-12942785)
chr6 (440-621)||(18706391-18706568)
chr6 (535-646)||(20136730-20136840)
chr6 (535-646)||(22196029-22196139)
chr6 (212-331)||(28288903-28289022)
chr6 (212-322)||(14594021-14594131)
chr6 (212-341)||(22806276-22806405)
chr6 (480-625)||(18896215-18896354)
chr6 (212-331)||(23415441-23415560)
chr6 (480-625)||(19362507-19362646)
chr6 (212-332)||(27330368-27330488)
chr6 (212-332)||(27391108-27391228)
chr6 (535-645)||(20182854-20182962)
chr6 (535-645)||(22153029-22153137)
chr6 (545-643)||(23539032-23539130)
chr6 (216-331)||(19858493-19858608)
chr6 (212-448)||(15938622-15938857)
chr6 (535-646)||(16493206-16493317)
chr6 (212-331)||(27557199-27557318)
chr6 (212-446)||(23221288-23221521)
chr6 (213-331)||(33862270-33862388)
chr6 (212-331)||(1540478-1540597)
chr6 (216-331)||(15891979-15892094)
chr6 (538-632)||(18177624-18177719)
chr6 (538-632)||(18199368-18199463)
chr6 (538-632)||(18204152-18204247)
chr6 (212-291)||(18334159-18334238)
chr6 (212-291)||(24423063-24423142)
chr6 (538-632)||(23076806-23076900)
chr6 (538-632)||(23538884-23538978)
chr6 (212-306)||(35057066-35057160)
chr6 (212-291)||(33864794-33864873)
chr6 (212-286)||(2290747-2290821)
chr6 (212-286)||(8055551-8055625)
chr6 (213-331)||(17883065-17883183)
chr6 (213-291)||(26924015-26924093)
chr6 (535-631)||(23528056-23528150)
chr6 (546-630)||(29416865-29416949)
chr6 (212-291)||(22782743-22782822)
chr6 (217-331)||(12742794-12742908)
chr6 (538-632)||(35008224-35008318)
chr6 (445-576)||(16448435-16448561)
chr6 (587-646)||(16760259-16760318)
chr6 (212-295)||(19234658-19234741)
chr6 (587-646)||(22949072-22949131)
chr6 (587-646)||(22953028-22953087)
chr6 (587-646)||(23871516-23871575)
chr6 (587-646)||(23875472-23875531)
chr6 (216-302)||(25175112-25175198)
chr6 (212-302)||(27654616-27654706)
chr6 (587-637)||(31477893-31477943)
chr6 (371-443)||(16135519-16135591)
chr6 (594-646)||(18955853-18955905)
chr6 (591-646)||(15875443-15875498)
chr6 (212-299)||(16135613-16135699)
chr6 (440-486)||(20078033-20078079)
chr6 (212-298)||(31163536-31163622)
chr6 (546-639)||(25738448-25738540)
chr6 (235-442)||(22523388-22523594)
chr6 (587-646)||(11566826-11566885)
chr6 (587-646)||(14472235-14472294)
chr6 (587-646)||(18917349-18917408)
chr6 (587-646)||(19870554-19870613)
chr6 (587-646)||(22862910-22862969)
chr6 (587-646)||(23395032-23395091)
chr6 (587-646)||(23989884-23989943)
chr6 (212-298)||(3007508-3007594)
chr6 (557-639)||(7429909-7429990)
chr6 (480-576)||(8227409-8227501)
chr6 (587-633)||(8243838-8243884)
chr6 (587-633)||(12618927-12618973)
chr6 (212-302)||(16826387-16826477)
chr6 (212-302)||(21776115-21776205)
chr6 (235-369)||(31161878-31162012)
chr6 (479-576)||(18456846-18456938)
chr6 (606-646)||(17377818-17377858)
chr6 (255-355)||(32277441-32277541)
chr6 (212-302)||(1555527-1555617)
chr6 (557-639)||(14594210-14594291)
chr6 (479-529)||(25644495-25644545)
chr6 (593-646)||(1644672-1644725)
chr6 (591-628)||(12942356-12942393)
chr6 (442-483)||(17229776-17229817)
chr6 (212-261)||(19609621-19609670)
chr6 (212-248)||(10488025-10488061)
chr6 (212-276)||(16240322-16240386)
chr6 (212-248)||(16377267-16377303)
chr6 (212-248)||(16384591-16384627)
chr6 (212-276)||(22226588-22226652)
chr6 (212-276)||(25904501-25904565)
chr6 (212-248)||(33315095-33315131)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (212-620)||(269-672)
[»] chr1 (109 HSPs)
chr1 (212-646)||(13881012-13881442)
chr1 (212-614)||(22130461-22130858)
chr1 (212-620)||(45574448-45574841)
chr1 (212-646)||(28312574-28313004)
chr1 (212-646)||(20437623-20438054)
chr1 (212-477)||(21180721-21180985)
chr1 (212-477)||(24815248-24815512)
chr1 (212-457)||(44822518-44822763)
chr1 (440-646)||(27653081-27653283)
chr1 (212-444)||(21239691-21239923)
chr1 (212-458)||(50000883-50001130)
chr1 (212-444)||(7052451-7052684)
chr1 (212-469)||(20031286-20031543)
chr1 (212-465)||(46198121-46198374)
chr1 (212-444)||(20588103-20588335)
chr1 (212-444)||(20592641-20592873)
chr1 (212-477)||(8276388-8276652)
chr1 (220-444)||(14238016-14238240)
chr1 (212-630)||(2332606-2333019)
chr1 (212-477)||(7792248-7792512)
chr1 (212-444)||(38887483-38887716)
chr1 (212-436)||(19676143-19676367)
chr1 (216-444)||(41227104-41227332)
chr1 (212-436)||(42912482-42912706)
chr1 (216-444)||(51082640-51082868)
chr1 (213-444)||(51323699-51323930)
chr1 (212-444)||(21046445-21046677)
chr1 (212-465)||(29764030-29764287)
chr1 (212-477)||(16401060-16401324)
chr1 (212-444)||(20634030-20634263)
chr1 (212-444)||(4596241-4596473)
chr1 (212-444)||(12710312-12710544)
chr1 (212-444)||(16058710-16058942)
chr1 (216-444)||(41225851-41226079)
chr1 (212-444)||(45496369-45496602)
chr1 (212-508)||(296715-297011)
chr1 (212-477)||(22349980-22350244)
chr1 (212-438)||(23194947-23195173)
chr1 (215-470)||(38057050-38057304)
chr1 (442-646)||(22124345-22124545)
chr1 (440-646)||(52940736-52940937)
chr1 (212-448)||(14792958-14793193)
chr1 (212-444)||(22823803-22824034)
chr1 (212-444)||(50544276-50544507)
chr1 (442-646)||(21043142-21043342)
chr1 (212-444)||(1643020-1643249)
chr1 (212-444)||(39060520-39060752)
chr1 (441-646)||(20958168-20958369)
chr1 (212-440)||(16372178-16372407)
chr1 (537-646)||(48603512-48603621)
chr1 (212-444)||(24720090-24720321)
chr1 (212-448)||(44891869-44892103)
chr1 (537-646)||(41781542-41781649)
chr1 (212-369)||(9784739-9784896)
chr1 (212-444)||(17902158-17902389)
chr1 (442-646)||(21533735-21533933)
chr1 (457-646)||(14800589-14800779)
chr1 (457-646)||(14809463-14809653)
chr1 (440-533)||(20345973-20346066)
chr1 (212-444)||(18121029-18121260)
chr1 (212-323)||(21659689-21659800)
chr1 (289-508)||(294396-294624)
chr1 (212-331)||(13227340-13227459)
chr1 (562-646)||(16372057-16372141)
chr1 (262-369)||(6833713-6833820)
chr1 (212-443)||(16655793-16656023)
chr1 (212-331)||(29535528-29535647)
chr1 (213-331)||(16362395-16362513)
chr1 (213-331)||(21841243-21841361)
chr1 (213-331)||(21922859-21922977)
chr1 (212-324)||(10812765-10812877)
chr1 (213-331)||(41372948-41373066)
chr1 (442-600)||(47190707-47190861)
chr1 (538-631)||(48520586-48520679)
chr1 (548-646)||(635944-636043)
chr1 (212-291)||(13989382-13989461)
chr1 (446-573)||(16093748-16093871)
chr1 (546-639)||(32649778-32649871)
chr1 (545-632)||(16381256-16381346)
chr1 (535-597)||(20329118-20329181)
chr1 (536-598)||(11945564-11945626)
chr1 (440-600)||(26065045-26065201)
chr1 (447-577)||(16758780-16758906)
chr1 (213-321)||(23593301-23593409)
chr1 (587-646)||(1925212-1925271)
chr1 (587-646)||(20924226-20924285)
chr1 (587-646)||(23819381-23819440)
chr1 (557-639)||(29534615-29534697)
chr1 (440-621)||(35260939-35261114)
chr1 (591-646)||(43543188-43543243)
chr1 (212-286)||(21474653-21474727)
chr1 (592-646)||(51326852-51326906)
chr1 (212-302)||(22366527-22366617)
chr1 (587-646)||(1010687-1010746)
chr1 (603-646)||(12271614-12271657)
chr1 (587-646)||(20228892-20228951)
chr1 (223-298)||(20708730-20708805)
chr1 (587-646)||(21407319-21407378)
chr1 (538-621)||(41049988-41050070)
chr1 (538-621)||(50614068-50614151)
chr1 (538-621)||(50621896-50621979)
chr1 (440-483)||(48520787-48520830)
chr1 (538-621)||(50686698-50686781)
chr1 (587-646)||(52639505-52639564)
chr1 (581-646)||(20454548-20454614)
chr1 (439-477)||(42697112-42697150)
chr1 (587-646)||(16375541-16375601)
chr1 (212-248)||(17003963-17003999)
chr1 (212-276)||(21650889-21650953)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (217-643)||(1510-1932)
scaffold0125 (212-444)||(27724-27956)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (211-620)||(12221-12626)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (234-646)||(169415-169810)
scaffold0020 (213-443)||(143038-143268)
scaffold0020 (535-646)||(142641-142753)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (152-465)||(11100-11413)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (213-620)||(82235-82641)
scaffold0037 (593-646)||(80424-80477)
[»] scaffold0153 (2 HSPs)
scaffold0153 (152-397)||(4568-4813)
scaffold0153 (152-306)||(11679-11833)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (212-646)||(9352-9781)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (212-646)||(110713-111143)
scaffold0026 (212-465)||(21484-21737)
scaffold0026 (212-444)||(146156-146388)
scaffold0026 (212-438)||(123956-124182)
[»] scaffold0019 (5 HSPs)
scaffold0019 (212-646)||(132976-133406)
scaffold0019 (223-483)||(133571-133831)
scaffold0019 (265-444)||(29582-29761)
scaffold0019 (212-303)||(33803-33894)
scaffold0019 (513-631)||(29285-29390)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (212-442)||(10843-11073)
scaffold0371 (312-404)||(17223-17315)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (212-477)||(19040-19304)
[»] scaffold0107 (3 HSPs)
scaffold0107 (440-646)||(9943-10145)
scaffold0107 (462-646)||(36240-36420)
scaffold0107 (212-276)||(30496-30560)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (212-465)||(176195-176448)
scaffold0001 (212-461)||(168846-169095)
scaffold0001 (216-469)||(152610-152863)
scaffold0001 (212-457)||(77098-77343)
scaffold0001 (557-639)||(163071-163152)
[»] scaffold0338 (3 HSPs)
scaffold0338 (212-465)||(3338-3591)
scaffold0338 (212-286)||(1-75)
scaffold0338 (212-276)||(8592-8656)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (440-646)||(24456-24658)
scaffold0076 (212-248)||(38429-38465)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (212-492)||(5835-6114)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (212-457)||(3117-3362)
[»] scaffold0108 (4 HSPs)
scaffold0108 (216-457)||(5828-6069)
scaffold0108 (212-444)||(7179-7409)
scaffold0108 (578-646)||(3317-3385)
scaffold0108 (440-483)||(3395-3438)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (212-441)||(64465-64694)
scaffold0051 (316-646)||(31183-31502)
scaffold0051 (212-331)||(31680-31799)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (212-444)||(21679-21911)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (212-444)||(28764-28996)
scaffold0180 (212-306)||(9997-10091)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (212-444)||(78488-78720)
scaffold0047 (440-622)||(22361-22540)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (212-470)||(395-653)
scaffold0599 (572-646)||(1279-1353)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (212-586)||(2123-2493)
[»] scaffold0109 (4 HSPs)
scaffold0109 (212-505)||(2702-2994)
scaffold0109 (212-444)||(373-605)
scaffold0109 (216-442)||(5680-5906)
scaffold0109 (587-646)||(36025-36084)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (212-444)||(5109-5341)
scaffold0737 (216-468)||(6077-6330)
[»] scaffold0672 (1 HSPs)
scaffold0672 (216-444)||(7956-8184)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (212-465)||(4433-4690)
[»] scaffold0306 (2 HSPs)
scaffold0306 (212-465)||(4433-4690)
scaffold0306 (572-634)||(15069-15131)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (212-454)||(8478-8720)
[»] scaffold0575 (2 HSPs)
scaffold0575 (212-437)||(5722-5947)
scaffold0575 (537-646)||(6111-6220)
[»] scaffold0077 (6 HSPs)
scaffold0077 (212-508)||(22929-23225)
scaffold0077 (212-416)||(33791-33995)
scaffold0077 (212-438)||(17653-17879)
scaffold0077 (212-401)||(22575-22765)
scaffold0077 (440-642)||(55543-55742)
scaffold0077 (312-438)||(23386-23512)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (212-444)||(14982-15214)
scaffold0061 (212-444)||(24040-24272)
[»] scaffold1766 (1 HSPs)
scaffold1766 (234-525)||(1112-1390)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (213-444)||(58172-58403)
scaffold0064 (212-331)||(68438-68557)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (212-442)||(1130-1360)
scaffold0335 (212-276)||(6215-6279)
[»] scaffold0123 (4 HSPs)
scaffold0123 (212-486)||(6407-6681)
scaffold0123 (443-585)||(658-796)
scaffold0123 (441-600)||(25213-25367)
scaffold0123 (281-444)||(16362-16524)
[»] scaffold0117 (4 HSPs)
scaffold0117 (316-646)||(39312-39631)
scaffold0117 (212-344)||(21285-21417)
scaffold0117 (213-290)||(42271-42348)
scaffold0117 (285-331)||(39809-39855)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (212-470)||(159346-159603)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (440-646)||(3186-3388)
[»] scaffold0639 (2 HSPs)
scaffold0639 (212-440)||(6984-7213)
scaffold0639 (535-646)||(7438-7550)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (212-465)||(11903-12156)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (212-444)||(863-1095)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (212-444)||(39523-39755)
[»] scaffold1539 (2 HSPs)
scaffold1539 (217-443)||(1332-1558)
scaffold1539 (535-646)||(998-1110)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (212-442)||(5063-5293)
[»] scaffold0546 (3 HSPs)
scaffold0546 (216-442)||(7401-7627)
scaffold0546 (212-322)||(10313-10423)
scaffold0546 (396-444)||(11219-11267)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (316-646)||(17633-17952)
scaffold0200 (214-331)||(18130-18247)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (182-444)||(9479-9741)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (215-465)||(70227-70477)
scaffold0057 (212-344)||(71935-72067)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (212-477)||(6191-6455)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (212-444)||(589-821)
[»] scaffold0220 (3 HSPs)
scaffold0220 (213-457)||(16175-16419)
scaffold0220 (212-457)||(13357-13602)
scaffold0220 (223-418)||(8686-8881)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (212-444)||(21157-21389)
scaffold0106 (572-646)||(15225-15299)
scaffold0106 (440-632)||(19505-19693)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (212-444)||(22187-22419)
scaffold0080 (216-476)||(29124-29384)
scaffold0080 (216-476)||(34589-34849)
[»] scaffold0046 (3 HSPs)
scaffold0046 (212-492)||(22165-22444)
scaffold0046 (480-625)||(16818-16957)
scaffold0046 (480-625)||(25978-26117)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (152-337)||(767-952)
scaffold0686 (212-276)||(6949-7013)
[»] scaffold0452 (3 HSPs)
scaffold0452 (212-437)||(13061-13286)
scaffold0452 (212-443)||(8046-8277)
scaffold0452 (537-591)||(13450-13502)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (216-413)||(106603-106800)
scaffold0040 (535-643)||(11209-11316)
scaffold0040 (535-643)||(22309-22416)
[»] scaffold0635 (1 HSPs)
scaffold0635 (213-457)||(7295-7539)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (212-444)||(1509-1741)
scaffold0334 (212-380)||(4-172)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (213-457)||(8468-8712)
[»] scaffold0293 (3 HSPs)
scaffold0293 (315-646)||(19951-20271)
scaffold0293 (440-644)||(17564-17764)
scaffold0293 (212-331)||(19655-19774)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (254-444)||(7823-8013)
[»] scaffold0462 (3 HSPs)
scaffold0462 (212-452)||(10636-10877)
scaffold0462 (212-448)||(740-974)
scaffold0462 (212-448)||(6246-6480)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (212-444)||(3843-4076)
scaffold0439 (216-444)||(11583-11811)
[»] scaffold0364 (2 HSPs)
scaffold0364 (223-444)||(7557-7778)
scaffold0364 (156-227)||(13877-13948)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (212-437)||(6944-7169)
scaffold0292 (537-633)||(6684-6780)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (212-437)||(3701-3926)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (212-437)||(21499-21724)
scaffold0096 (537-646)||(21226-21335)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (212-444)||(168861-169094)
scaffold0021 (546-639)||(146252-146345)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (212-437)||(21083-21308)
scaffold0018 (537-646)||(20810-20919)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (216-437)||(126179-126400)
scaffold0011 (537-646)||(126015-126124)
scaffold0011 (212-448)||(32874-33109)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (212-444)||(30036-30268)
scaffold0205 (535-631)||(29747-29844)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (214-470)||(35969-36224)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (212-444)||(7643-7875)
scaffold0104 (212-444)||(14274-14506)
scaffold0104 (212-436)||(26358-26582)
scaffold0104 (212-436)||(27740-27964)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (214-472)||(51355-51612)
scaffold0042 (221-349)||(67187-67315)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (212-440)||(10325-10554)
scaffold0039 (212-276)||(19919-19983)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (212-437)||(120341-120566)
scaffold0034 (212-404)||(29593-29785)
scaffold0034 (538-646)||(120068-120176)
[»] scaffold0111 (4 HSPs)
scaffold0111 (212-444)||(12932-13164)
scaffold0111 (535-646)||(7491-7601)
scaffold0111 (535-646)||(14610-14720)
scaffold0111 (382-444)||(19369-19431)
[»] scaffold0083 (4 HSPs)
scaffold0083 (212-444)||(378-610)
scaffold0083 (212-444)||(5682-5914)
scaffold0083 (212-323)||(1480-1591)
scaffold0083 (212-248)||(11401-11437)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (265-441)||(8752-8928)
[»] scaffold0241 (3 HSPs)
scaffold0241 (212-444)||(1988-2220)
scaffold0241 (212-364)||(5413-5565)
scaffold0241 (356-444)||(5141-5229)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (224-508)||(138135-138419)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (443-612)||(121-286)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (262-444)||(7941-8123)
scaffold0529 (302-413)||(8152-8263)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (212-441)||(632-861)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (442-646)||(621-821)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (212-411)||(23600-23799)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (440-631)||(4555-4742)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (293-444)||(22482-22633)
scaffold0146 (212-269)||(22627-22684)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (440-603)||(2285-2444)
[»] scaffold1186 (1 HSPs)
scaffold1186 (212-444)||(1135-1367)
[»] scaffold0054 (3 HSPs)
scaffold0054 (212-448)||(65377-65612)
scaffold0054 (535-644)||(75778-75887)
scaffold0054 (439-486)||(75686-75733)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (212-444)||(186901-187133)
scaffold0005 (440-622)||(13979-14158)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (216-444)||(66432-66660)
scaffold0004 (480-642)||(332380-332537)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (460-646)||(10533-10715)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (440-646)||(18026-18228)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (212-448)||(106-341)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (256-412)||(11101-11257)
scaffold0413 (479-508)||(15513-15542)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (254-454)||(12748-12948)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (213-443)||(747-977)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (212-448)||(8240-8476)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (440-600)||(3701-3857)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (440-623)||(520-699)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (300-441)||(9711-9851)
scaffold0134 (212-291)||(38338-38417)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (212-448)||(18050-18285)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (212-448)||(62139-62374)
scaffold0063 (212-279)||(39305-39372)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (216-448)||(56397-56628)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (212-444)||(25940-26171)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (316-470)||(21040-21193)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (440-646)||(85605-85807)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (212-444)||(10135-10356)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (212-444)||(18589-18820)
scaffold0213 (212-276)||(28495-28559)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (212-443)||(7931-8162)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (550-645)||(15030-15125)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (535-646)||(1954-2065)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (212-444)||(34689-34916)
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (212-353)||(2403-2543)
scaffold0676 (587-646)||(414-473)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (212-444)||(35913-36144)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (212-443)||(11603-11833)
[»] scaffold0436 (2 HSPs)
scaffold0436 (535-646)||(8091-8202)
scaffold0436 (212-331)||(8495-8614)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (440-632)||(206383-206570)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (442-646)||(707-906)
scaffold0010 (440-577)||(60573-60706)
scaffold0010 (181-228)||(142823-142870)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (212-369)||(1-158)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (537-646)||(912-1021)
[»] scaffold0825 (2 HSPs)
scaffold0825 (212-355)||(1030-1173)
scaffold0825 (374-470)||(1373-1468)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (212-443)||(11614-11844)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (446-646)||(221072-221267)
scaffold0012 (587-646)||(189460-189519)
[»] scaffold2015 (1 HSPs)
scaffold2015 (212-322)||(79-189)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (212-369)||(7251-7408)
scaffold0230 (213-331)||(14424-14542)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (212-356)||(2449-2593)
scaffold0256 (354-444)||(3059-3149)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (212-332)||(24459-24579)
scaffold0162 (399-448)||(24586-24635)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (212-443)||(2176-2406)
scaffold0409 (212-443)||(10431-10661)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (317-452)||(33334-33469)
scaffold0138 (215-331)||(33648-33764)
scaffold0138 (538-632)||(18190-18284)
[»] scaffold0357 (4 HSPs)
scaffold0357 (440-551)||(2849-2956)
scaffold0357 (441-621)||(15959-16136)
scaffold0357 (441-621)||(13213-13391)
scaffold0357 (567-632)||(2737-2802)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (440-533)||(8296-8389)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (535-646)||(3927-4039)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (535-646)||(3016-3128)
[»] scaffold0422 (2 HSPs)
scaffold0422 (212-331)||(3500-3619)
scaffold0422 (591-628)||(3178-3215)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (440-642)||(29282-29481)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (152-242)||(1361-1451)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (212-369)||(8016-8173)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (216-369)||(18526-18679)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (212-441)||(32671-32899)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (212-444)||(11743-11974)
[»] scaffold0485 (2 HSPs)
scaffold0485 (535-646)||(10223-10334)
scaffold0485 (442-495)||(10358-10411)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (152-242)||(13060-13150)
scaffold0174 (212-369)||(20470-20627)
[»] scaffold0369 (2 HSPs)
scaffold0369 (212-321)||(16384-16493)
scaffold0369 (371-444)||(16525-16598)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (535-646)||(2620-2732)
scaffold0507 (359-440)||(2377-2458)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (212-442)||(13168-13402)
scaffold0317 (572-651)||(6889-6968)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (213-331)||(21225-21343)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (572-646)||(53825-53899)
scaffold0022 (538-621)||(128922-129005)
scaffold0022 (445-510)||(116608-116673)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (535-646)||(30391-30503)
scaffold0013 (223-350)||(7784-7911)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (572-639)||(626-693)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (540-646)||(7894-8000)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (538-628)||(101-191)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (572-645)||(4256-4329)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (480-625)||(57898-58037)
[»] scaffold0914 (2 HSPs)
scaffold0914 (540-622)||(1785-1868)
scaffold0914 (442-478)||(1928-1964)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (576-646)||(6932-7002)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (212-302)||(9606-9696)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (538-625)||(6116-6203)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (212-331)||(6423-6542)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (217-331)||(53-168)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (212-291)||(13909-13988)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (212-291)||(40916-40995)
scaffold0044 (212-275)||(37886-37949)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (212-331)||(11766-11885)
scaffold0029 (587-646)||(65611-65670)
scaffold0029 (587-646)||(61695-61754)
scaffold0029 (587-646)||(80679-80738)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (213-331)||(9718-9836)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (546-639)||(48394-48487)
scaffold0066 (212-276)||(53972-54036)
[»] scaffold0956 (1 HSPs)
scaffold0956 (212-296)||(2319-2403)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (212-296)||(174544-174628)
scaffold0016 (593-646)||(207591-207644)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (441-529)||(27526-27614)
scaffold0165 (479-621)||(27646-27785)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (587-646)||(359-418)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (587-646)||(11584-11643)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (587-646)||(32743-32802)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (587-646)||(36169-36228)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (538-621)||(97092-97175)
scaffold0006 (538-621)||(106370-106453)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (212-448)||(874-1109)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (158-226)||(12089-12157)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (587-646)||(14170-14229)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (587-646)||(58802-58861)
scaffold0028 (213-248)||(134770-134805)
scaffold0028 (213-248)||(137239-137274)
scaffold0028 (213-248)||(139708-139743)
scaffold0028 (213-248)||(142177-142212)
scaffold0028 (213-248)||(144646-144681)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (386-444)||(2364-2422)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (587-646)||(3958-4017)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (587-646)||(5184-5243)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (587-646)||(12386-12445)
[»] scaffold1405 (1 HSPs)
scaffold1405 (186-224)||(1214-1252)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (538-632)||(6235-6329)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (538-632)||(38392-38486)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (591-628)||(1583-1620)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (212-276)||(894-958)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (396-444)||(1-49)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (212-276)||(936-1000)
[»] scaffold1043 (1 HSPs)
scaffold1043 (181-228)||(856-903)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (254-369)||(17163-17278)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (212-303)||(35026-35117)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (591-646)||(36036-36091)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (557-639)||(208992-209073)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (212-261)||(1416-1465)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (592-633)||(10858-10899)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (479-508)||(11659-11688)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (557-630)||(16541-16613)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (212-276)||(18231-18295)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 220)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 14966718 - 14966228
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14966718 cgagcatacgaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataatttttttagcttttcaatgaca 14966619  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 351  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14966618 ttggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 14966519  T
Q  352 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14966518 aagttaatccaaaacttagggaataattctaaacctaaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagtt 14966419  T
Q  452 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 551  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  14966418 gatcattggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatt 14966323  T
Q  552 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14966322 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaattgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 14966228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 212 - 620
Target Start/End: Original strand, 43550073 - 43550477
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  43550073 catgaaagttgtagataattttgttaattttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaaggagg 43550172  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43550173 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 43550272  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  43550273 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 43550372  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  43550373 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatg 43550468  T
Q  612 ttgttatat 620  Q
    |||||||||    
T  43550469 ttgttatat 43550477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 212 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 16643661 - 16643244
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  16643661 catgaaagttgtagacaattgagttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttatagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 16643562  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16643561 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaacactcaaaactagaagtactatgagttc 16643462  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16643461 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggagattgaagataacattactgatgatctgtgaagctgtta 16643362  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16643361 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataggatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 16643266  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  16643265 ttgttatatctcaagatgttta 16643244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 212 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 50243389 - 50242985
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  50243389 catgaaagttgtagataattgagttacatttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 50243290  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  50243289 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 50243190  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  50243189 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaatgagggttaaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 50243090  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50243089 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatg 50242994  T
Q  612 ttgttatat 620  Q
    |||||||||    
T  50242993 ttgttatat 50242985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 350 - 646
Target Start/End: Original strand, 52989492 - 52989783
Alignment:
Q  350 ctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgag 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52989492 ctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgag 52989591  T
Q  450 ttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatata 549  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  52989592 ttgatccttggg-taggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaatata 52989686  T
Q  550 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52989687 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 52989783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 212 - 642
Target Start/End: Original strand, 10833735 - 10834160
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10833735 catgaaagttttagaaaattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 10833834  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  10833835 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 10833934  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  10833935 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggtttattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 10834034  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10834035 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatata-ttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgata 10834129  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcc 642  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10834130 ttgttatatcttgagatgtttatttgctgcc 10834160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Original strand, 14763357 - 14763787
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  14763357 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 14763456  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  14763457 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 14763556  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  14763557 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 14763656  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||| |||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  14763657 taatataatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgata 14763752  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14763753 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 14763787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Original strand, 23371103 - 23371533
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  23371103 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactataaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 23371202  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  23371203 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 23371302  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  23371303 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 23371402  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  23371403 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgata 23371498  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23371499 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 23371533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 212 - 510
Target Start/End: Original strand, 24152840 - 24153138
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24152840 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24152939  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24152940 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 24153039  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 510  Q
    || |||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24153040 aattaaggtgtctaagagtacttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaattataatctgtgaagctgtt 24153138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 51301051 - 51300621
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||  ||     
T  51301051 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggatttatgatgaaaatactccaagtagg 51300952  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||      
T  51300951 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgt 51300852  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  51300851 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 51300752  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  51300751 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgata 51300656  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51300655 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 51300621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 216 - 639
Target Start/End: Original strand, 8928065 - 8928483
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  8928065 aaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtctt 8928164  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||  || |||||||||||||||| |||||||| |    
T  8928165 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagataatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaactagaagtactatgagttcaatt 8928264  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 515  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||| |  ||||| || ||||  ||| |||||     
T  8928265 aaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtttattataatactgttgatgttcagtgagtctgatataag 8928364  T
Q  516 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgt-gaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttg 614  Q
    |||| || |||||    | || | ||||  |||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  8928365 atga-ttgatgtt----gttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattg 8928458  T
Q  615 ttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  8928459 ttatatcttgagatgtctatgtgct 8928483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 216 - 442
Target Start/End: Original strand, 53646460 - 53646686
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53646460 aaagttgtagataattttgttagatttccaatgattttggtttgacttgaaaatgatttttgttttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatctt 53646559  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  53646560 agtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaatt 53646659  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  53646660 aaggtgtttaagagtatttaacatatg 53646686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 216 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 6159049 - 6158789
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6159049 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatgtttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtctt 6158950  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6158949 agtgaaattttatgaaaattcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 6158850  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  6158849 aaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 6158789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 446 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 324490 - 324294
Alignment:
Q  446 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 545  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  324490 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 324395  T
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctat 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  324394 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctat 324295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Original strand, 2248366 - 2248624
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  2248366 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 2248465  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  2248466 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttc 2248565  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  2248566 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatg 2248624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 33564785 - 33564555
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33564785 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 33564686  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  33564685 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctatgttaatccaaaacttatggaataattccaatcctcaaaactagaagtactaggggttc 33564586  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33564585 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 33564555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 212 - 457
Target Start/End: Original strand, 14641946 - 14642191
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  14641946 catgaaagttttagataatttcgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 14642045  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14642046 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14642145  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14642146 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 14642191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Original strand, 35961283 - 35961536
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  35961283 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 35961382  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35961383 tcttagtgaaattttatgaaaaattagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttc 35961482  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  35961483 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 35961536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 42183 - 41930
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  42183 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttggcatgaaaataatttttagtttaagagttatgatgaaaatactccaaggagg 42084  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42083 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 41984  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  41983 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 41930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 212 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 9533785 - 9533416
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  9533785 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 9533686  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||| |    
T  9533685 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgc 9533586  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  9533585 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcggata 9533486  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 585  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9533485 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 9533416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11192736 - 11192505
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  11192736 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttt-tttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 11192638  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11192637 ccttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 11192538  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11192537 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 11192505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 40807652 - 40807420
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  40807652 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 40807553  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40807552 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 40807453  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  40807452 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 40807420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11913377 - 11913119
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  11913377 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttcacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 11913278  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11913277 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 11913178  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||| | || | ||||||||||||||    
T  11913177 aattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttttgattcgacccttggggtaggaatg 11913119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 50351396 - 50351628
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  50351396 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 50351495  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  50351496 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccatttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagttt 50351595  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  50351596 aattaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 50351628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 54875879 - 54876111
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  54875879 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggagttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 54875978  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54875979 tcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 54876078  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  54876079 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 54876111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 212 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 6819765 - 6819507
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  6819765 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 6819666  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  6819665 tcttagtgaaatcttatgaaaattaaggataaccgtttctaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaagctcaaaactataagtactatgagttc 6819566  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgg 471  Q
    || |||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||    
T  6819565 aattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgggttgatc-ttgggataggaatgg 6819507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Original strand, 1988628 - 1988885
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1988628 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 1988727  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  1988728 tcttagtgcaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataactactatgagttc 1988827  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1988828 aattaaggtgtttaagagtgtttaaccaatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 1988885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 316 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 15465453 - 15465134
Alignment:
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  15465453 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 15465354  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 515  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15465353 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 15465261  T
Q  516 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 615  Q
    || ||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15465260 ataatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgcttaagttgttgttgattatcatttgatattgt 15465165  T
Q  616 tatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15465164 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 15465134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 12276205 - 12275941
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  12276205 catgaaaattttagataatttggttagctttccaatgactttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 12276106  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12276105 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaagccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 12276006  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  12276005 aattaaggtgtttaagagtgtttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 12275941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 37038475 - 37038226
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa-tactccaatgag 310  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||    
T  37038475 catgaaagttttagataattttattagcttttcaatggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaaatactccagagag 37038376  T
Q  311 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37038375 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 37038276  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttgg 460  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37038275 caattaagatgtttaagagtatttaacctatgttttgagttgatctttgg 37038226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 508
Target Start/End: Original strand, 10989200 - 10989495
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||     
T  10989200 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtctgacatgaaaataatttt-ggtttttaagatatgatgaaaatgctccaaggagg 10989298  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10989299 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 10989398  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 508  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||  |||| | |||  |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  10989399 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatatcaatgaaagttatataggatattaaggatgatctgtgaagctg 10989495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14441824 - 14441592
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  14441824 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 14441725  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14441724 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14441625  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14441624 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14441592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16979566 - 16979287
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16979566 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 16979467  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16979466 tcttagtgaaatcttataaaaattcagcatgaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 16979367  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 492  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  16979366 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 16979287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 35064977 - 35065208
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  35064977 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcccatgagg 35065076  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35065077 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattc-aaacctcaaaactagaagtactatgagttc 35065175  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  35065176 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 35065208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 40812489 - 40812258
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  40812489 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 40812390  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  40812389 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 40812290  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40812289 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 40812258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 316 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 5223682 - 5223363
Alignment:
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  5223682 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 5223583  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 515  Q
    ||||| |||||||||||   |   || ||||    ||    | ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5223582 aaggtgtttaagagtataata---atattatttagtg----tcggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 5223490  T
Q  516 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 615  Q
    |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5223489 atgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgt 5223394  T
Q  616 tatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  5223393 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 5223363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Original strand, 3394398 - 3394662
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3394398 catgaaagttttagataactttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 3394497  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  3394498 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtactatgaattc 3394597  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  3394598 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 3394662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 21837685 - 21837484
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    ||    
T  21837685 atgttatgagttgatccttcgggtaggaattgaggttgaatataatattactgatgatcagtgaagctgttacaatatgatttaatgatgatag----ta 21837590  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837589 atgtaataaatttgtatatgcatt-tgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 21837491  T
Q  640 gcctatg 646  Q
    |||||||    
T  21837490 gcctatg 21837484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 3803491 - 3803259
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  3803491 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 3803392  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  3803391 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatcaaaatcttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtta 3803292  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3803291 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 3803259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 213 - 465
Target Start/End: Original strand, 6805358 - 6805610
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | | ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6805358 atgaaagttgtggataattatgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgatttctggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 6805457  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6805458 cctagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttca 6805557  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||    
T  6805558 attaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggttcttggggtag 6805610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14508503 - 14508272
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | | |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||     
T  14508503 catgaaagttgtagataattgagttagctttcctatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 14508404  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14508403 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt-taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14508305  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14508304 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14508272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 182 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17693754 - 17693492
Alignment:
Q  182 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 281  Q
    |||||||| |||||||| ||| || ||   ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | | |||||||  ||||| | ||||||||||     
T  17693754 tttctgttttgaattagcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgagttagttttccaatggctttggtttgatgtgaaagttatttttggttc 17693655  T
Q  282 ttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattca 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  17693654 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 17693555  T
Q  382 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17693554 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17693492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Original strand, 179103 - 179367
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||     
T  179103 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaataccccaagtagg 179202  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  179203 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttg 179302  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  179303 aattaaggtgtttaacagtatttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaggttg 179367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 437
Target Start/End: Original strand, 10541854 - 10542079
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||| |||     
T  10541854 catgaaagttgtagataattgtgttatctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatcatgaaaatacttcaaggagg 10541953  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10541954 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 10542053  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||    
T  10542054 aattaaggggtttaacagtatttaac 10542079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 437
Target Start/End: Original strand, 43889195 - 43889420
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  43889195 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 43889294  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  43889295 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 43889394  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  43889395 aattaagggttttaagagtatttaac 43889420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 5206050 - 5206282
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5206050 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 5206149  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5206150 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 5206249  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5206250 aattatggtgtttaagattatttaacctatgtt 5206282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17538762 - 17538531
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  | | |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17538762 catgaaagttgtagataaatgagttagctttccaatt-ctttggtttgacgtgcaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17538664  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17538663 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccttttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 17538564  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17538563 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17538531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 22306979 - 22307211
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||     
T  22306979 catgaaagttgtagataatttagttatctttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttgattattgagatatgatgaaaatactcgaaggagg 22307078  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||| ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22307079 tcttactgaaatcctatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcccaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 22307178  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22307179 aactagggtgtttaagagtatttaacttatgtt 22307211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 213 - 457
Target Start/End: Original strand, 42324618 - 42324862
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |    
T  42324618 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatataatcaaaatactccaaggaggt 42324717  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42324718 cttagtgaaatcttagaaaaattcagtataaccatttctaagttagtcaaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttca 42324817  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  42324818 attaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatctt 42324862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 17044622 - 17044392
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| || |||||||||  ||||| |||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17044622 catgaaatttatagataattgagttagatttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17044523  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  17044522 tcttagtgaaattttatgaaaattcaacataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaaatactaggggttc 17044423  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17044422 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 17044392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 212 - 457
Target Start/End: Original strand, 18367154 - 18367399
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||| |||     
T  18367154 catgaaagttttagataatttttttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatatttcaaggagg 18367253  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18367254 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataacccgttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaagctagaagtactatgagttc 18367353  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18367354 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatctt 18367399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 35354258 - 35354023
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgat---ttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatg 308  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  35354258 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacg 35354159  T
Q  309 agatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggag 408  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35354158 agatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactgggag 35354059  T
Q  409 ttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35354058 tttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 35354023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 20248380 - 20248608
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  20248380 catgaaagttgtagataattttgttagttttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 20248479  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  20248480 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcgaaactagaagtattatgagttc 20248579  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  20248580 aattaaggtgtttaaaagtatttaaccta 20248608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 10554923 - 10554668
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  10554923 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 10554824  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  10554823 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 10554724  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 467  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  10554723 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 10554668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 467
Target Start/End: Original strand, 55292037 - 55292292
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  55292037 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 55292136  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  55292137 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaacccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 55292236  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 467  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  55292237 aattaaggtgtttaaaagtatttaacccatgttatgagtagacctttgaggtagga 55292292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 212 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12511504 - 12511279
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  12511504 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 12511405  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  12511404 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagttt 12511305  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  12511304 aattaaggggtttaagagtatttaac 12511279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 38311399 - 38311628
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  38311399 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 38311498  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatt-caaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  38311499 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttagggaataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagtt 38311598  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  38311599 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 38311628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 2841859 - 2842090
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||     
T  2841859 catgaaagttttagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggagg 2841958  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2841959 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccg-ttccaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 2842057  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2842058 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 2842090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 213 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14671479 - 14671255
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||| |||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |    
T  14671479 atgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcgatttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggt 14671380  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14671379 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttta 14671280  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    | |||||  ||||| ||||||||||    
T  14671279 attaaggggtttaacagtatttaac 14671255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 256 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 44274086 - 44273898
Alignment:
Q  256 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 355  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44274086 tttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagt 44273987  T
Q  356 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44273986 taatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgtt 44273898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 254 - 465
Target Start/End: Original strand, 13029714 - 13029925
Alignment:
Q  254 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||    
T  13029714 ggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaa 13029813  T
Q  354 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 453  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13029814 gttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgg 13029913  T
Q  454 tctttggggtag 465  Q
    || |||||||||    
T  13029914 tcattggggtag 13029925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 15931903 - 15932135
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || | | |||||||  || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15931903 catgaaagttatagataattgagttagctttccagtggccttggtttgatgtgcaaatgattttgggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15932002  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15932003 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 15932102  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15932103 aactagggtgtttaagagtatttcatctatgtt 15932135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 17519269 - 17519501
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||| |||||   ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  17519269 catgaaagttgtaggtaattgacttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggagg 17519368  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17519369 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 17519468  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17519469 aactaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 17519501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 17534131 - 17534363
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||| |||||   ||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  17534131 catgaaagttgtaggtaattgacttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggagg 17534230  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17534231 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 17534330  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17534331 aactaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 17534363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 254 - 465
Target Start/End: Original strand, 13026122 - 13026333
Alignment:
Q  254 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||    
T  13026122 ggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaa 13026221  T
Q  354 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 453  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13026222 gttaatccaaaaattatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgg 13026321  T
Q  454 tctttggggtag 465  Q
    || |||||||||    
T  13026322 tcattggggtag 13026333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 223 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13519928 - 13519706
Alignment:
Q  223 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 322  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13519928 tagataattatgttagctttctattgactttcgtttgacttgaaattgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 13519829  T
Q  323 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa-ggta 421  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||      
T  13519828 tcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttgattaaggggg 13519729  T
Q  422 tttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13519728 tttaagagtatttaacctatgtt 13519706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Original strand, 13522806 - 13523071
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  13522806 catgaaagttttagagaattttgttagctttccaatggctttggtttaacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgagaatactccaagtagg 13522905  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcc-aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  13522906 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaaacttatgcgataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagtt 13523005  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  13523006 caattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 13523071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 441
Target Start/End: Original strand, 17670105 - 17670334
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | | |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  17670105 catgaaagttgtagataattgagttagcttttcagtggcgttggtttgacgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 17670204  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17670205 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttc 17670304  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 441  Q
    || || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  17670305 aattagggtgtttaagagtatttaatctat 17670334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 441
Target Start/End: Original strand, 17685239 - 17685468
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17685239 catgaaaattgtagataattgagttagctttccagtggcgttggtttgacgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17685338  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  17685339 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgaattc 17685438  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 441  Q
    || || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  17685439 aattagggtgtttaagagtatttaatctat 17685468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 437
Target Start/End: Original strand, 18699869 - 18700094
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | |   |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  18699869 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttaatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 18699968  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  18699969 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttggaataattccaaacctcaaaactagaagtgctaggagttt 18700068  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||    
T  18700069 agttaagggatttaagagtatttaac 18700094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14519918 - 14519687
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  14519918 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14519819  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  14519818 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 14519720  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14519719 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14519687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 212 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 17513236 - 17513010
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17513236 catgaaagttgtagattattttgttagctttctaattgagttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17513137  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  17513136 tcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattgaataattccaaacctccaaactagaagtgctatgagttc 17513037  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacc 438  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||    
T  17513036 aattaaggtgtttgagagtatttaacc 17513010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 212 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 10563365 - 10563120
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || | | |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||  ||     
T  10563365 catgaaagttgcagataattgagttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaacatactcaaagtagg 10563266  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10563265 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 10563166  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10563165 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 10563120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 213 - 444
Target Start/End: Original strand, 41172767 - 41172999
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||  | | |  ||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  41172767 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagcggctttcgtttgacgtgaaaacaattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 41172866  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41172867 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttta 41172966  T
Q  413 actaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  41172967 attaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 41172999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 43929007 - 43928775
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||  ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  43929007 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgatttgatctgaaaataatttttaatttttgagatataatgaaaatactccaaggagg 43928908  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43928907 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttgatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaattagaagtactatgagttc 43928808  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || ||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  43928807 aattaaggtgcttaagagtatttaacatatgtt 43928775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Original strand, 31224349 - 31224608
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  31224349 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttcacttgaaaatgatttttggtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 31224448  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31224449 tcttagtgaaatcttaggaaatttcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 31224548  T
Q  412 aactaaggt-atttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || || |||  ||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||||||| ||||||    
T  31224549 aattagggtgttttaagagtatttaacccatgctgtgagtcgacccttggggtcggaatg 31224608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 212 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19444167 - 19443941
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  19444167 catgaaagttgtagataattttgttagcttcccaatggctttggtttgacatgaaagtgatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaaggagg 19444068  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||| | | ||||||    
T  19444067 tcttattaaaattttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctccaaactagaagtgccatgagttc 19443968  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacc 438  Q
    || |||||| ||| ||| |||||||||    
T  19443967 aattaaggtgtttgagaatatttaacc 19443941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 49900392 - 49900153
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||   | |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  49900392 catgaaagttgtagataattaagttagcttttcagtggatttggtttgacgtgaaaatggtttttggttattgagatatgatgaaaatactccaaggagg 49900293  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttcta--------agttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtact 403  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49900292 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtact 49900193  T
Q  404 aggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  49900192 agaagtttaattaaggattttaagagtatttaacctatgt 49900153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 215 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 18890017 - 18889749
Alignment:
Q  215 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 314  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||   || |||    
T  18890017 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatgtttgagttatgatggaaatactccaggtaggtct 18889918  T
Q  315 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 414  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||  |||||| ||||||||| || ||||||||     
T  18889917 tagtgaaatcttatgaaaattccgcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatagttccaaggctcaaatctagaagtaatatgagttcaat 18889818  T
Q  415 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 483  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  18889817 taaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagatgacccttgggacaggaatggaggttgattata 18889749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 216 - 444
Target Start/End: Original strand, 50348426 - 50348654
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  50348426 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctt 50348525  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
     ||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || |    
T  50348526 ggtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaactcatgggataattccaaacctcaaaactataagtactaggggtttaatt 50348625  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  50348626 aaggggtttaagagtatttaacctatgtt 50348654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 440 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 13919591 - 13919408
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||         
T  13919591 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgttatgtgaagctgttataatatgatttaatgtttatagc----g 13919496  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  13919495 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaag-tgttgttgattattatgtgataatgttatatcttgagat 13919408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 256 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12470414 - 12470233
Alignment:
Q  256 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 355  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  12470414 tttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaatt 12470315  T
Q  356 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  12470314 taatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 12470233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 215 - 465
Target Start/End: Original strand, 16324940 - 16325190
Alignment:
Q  215 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||| | |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16324940 gaaagttgtagataattttgttatctttccaatggatttggtttggcgtgaaaatgatttatggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtct 16325039  T
Q  315 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 414  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||     
T  16325040 tagtgaaattttatgaaaatttagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatcggataatttcaaggctaaaaactagaagtactaggggttcaat 16325139  T
Q  415 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    |||||| |||| || |||||| |||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  16325140 taaggtgtttatgaatatttatcctaagttgtgagttggtccttggggtag 16325190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 14152795 - 14153027
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||| || | | ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  14152795 catgaaagttgtagatttttgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaaagaattttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaagg 14152894  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14152895 tcttagtgaacttttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 14152994  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14152995 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 14153027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15566169 - 15565938
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  15566169 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcatcagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 15566070  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    || |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |   |  ||||| ||||||    
T  15566069 tcatagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc-ctatttactatgagttc 15565971  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15565970 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 15565938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 213 - 444
Target Start/End: Original strand, 9511563 - 9511793
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9511563 atgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 9511662  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||     || |||| |||||||| |  |||||| ||| | |    
T  9511663 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagatta 9511761  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9511762 attaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 9511793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 213 - 444
Target Start/End: Original strand, 9519538 - 9519768
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9519538 atgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 9519637  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||     || |||| |||||||| |  |||||| ||| | |    
T  9519638 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagatta 9519736  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9519737 attaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 9519768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 223 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 6156350 - 6156130
Alignment:
Q  223 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6156350 tagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 6156251  T
Q  323 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 422  Q
    |||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |    
T  6156250 ttttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgt 6156152  T
Q  423 ttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6156151 ttaagagtatttaacctatgtt 6156130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 516 - 646
Target Start/End: Original strand, 54876322 - 54876448
Alignment:
Q  516 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 615  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54876322 atgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 54876417  T
Q  616 tatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54876418 tatatcttgagatgtttacgtgctgtctatg 54876448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 50755778 - 50756009
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  50755778 catgaaagttttagataatcgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggtgg 50755877  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  50755878 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 50755976  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50755977 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 50756009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24546496 - 24546261
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24546496 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaga 24546397  T
Q  312 tcttagtgaaattttttga----aaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactagga 407  Q
    ||||||||||||||| |||    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| | ||| |   || |||| ||||| |  |  |||||| ||    
T  24546396 tcttagtgaaattttatgaaattaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactcatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgtactatga 24546298  T
Q  408 gttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24546297 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24546261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 215 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 18893277 - 18893067
Alignment:
Q  215 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 314  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||    
T  18893277 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtct 18893178  T
Q  315 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 414  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  18893177 tagtgaaatcttatgaaaattcagcagaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactacaagtaatatgagtttaat 18893078  T
Q  415 taaggtattta 425  Q
    |||||| ||||    
T  18893077 taaggtgttta 18893067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 14179539 - 14179430
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14179539 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 14179440  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  14179439 gctgcctatg 14179430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 14671091 - 14670982
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14671091 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgt 14670992  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  14670991 gctgcctatg 14670982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Original strand, 43889578 - 43889687
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43889578 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 43889677  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  43889678 gctgcctatg 43889687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 440 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 12378184 - 12378003
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||    
T  12378184 atgttttgagttgatccttagggtagcaatggaggttaaatacaatattaatgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagta 12378089  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgag 626  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  12378088 atttaatata-ttgtatatgtattatttgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgag 12378003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 12470069 - 12469960
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12470069 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttcacgt 12469970  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  12469969 gctgcctatg 12469960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 14682590 - 14682481
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  14682590 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatcttgttatatcttgagatgtttatgt 14682491  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  14682490 gctgcctatg 14682481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 16796654 - 16796545
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16796654 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgaaatgtttacgt 16796555  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  16796554 gctgcctatg 16796545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 54330702 - 54330933
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||     
T  54330702 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacacttcaaggagg 54330801  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| || ||||||    
T  54330802 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttc 54330900  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54330901 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 54330933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 212 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17046782 - 17046631
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17046782 catgaaagttatagataattgagttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17046683  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaa 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17046682 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaa 17046631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 12339874 - 12339765
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12339874 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 12339775  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    |  |||||||    
T  12339774 gtcgcctatg 12339765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 516 - 646
Target Start/End: Original strand, 17691644 - 17691769
Alignment:
Q  516 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 615  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  17691644 atgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgataatcatttgatgttat 17691739  T
Q  616 tatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17691740 tatatc-tgagatgtttacgtgctgcctatg 17691769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17938182 - 17938025
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||     
T  17938182 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaatactctaaggagg 17938083  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  17938082 tcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaacctta 17938025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Original strand, 18700259 - 18700368
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18700259 gtaatataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 18700358  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  18700359 gctgcctatg 18700368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 537 - 633
Target Start/End: Original strand, 10542384 - 10542480
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10542384 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 10542480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 255 - 406
Target Start/End: Original strand, 14567651 - 14567802
Alignment:
Q  255 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 354  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14567651 gtttgaattgaaaatgacatttagtttttgatttatgatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 14567750  T
Q  355 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactagg 406  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14567751 ttaatccaaaacttatgaaataattccaaacctcaaaactagaagtactagg 14567802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 212 - 343
Target Start/End: Original strand, 51602996 - 51603127
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  51602996 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 51603095  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataa 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  51603096 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataa 51603127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 440 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 316381 - 316202
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||| || || |||| |||||||||||||||||    ||    
T  316381 atgttatgagttgatcattgggatatgaatggaggttgattatgatattactgatgctatgtgaatctattgtaatgtgatttaatgttgatag----ta 316286  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  316285 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 316202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 212 - 322
Target Start/End: Original strand, 14647499 - 14647609
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14647499 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 14647598  T
Q  312 tcttagtgaaa 322  Q
    ||||| |||||    
T  14647599 tcttaatgaaa 14647609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 442 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 9577882 - 9577700
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 541  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| |||||||||  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  9577882 gttataagttgatccttggggtgggaacgaaggttgattataatattgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 9577787  T
Q  542 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9577786 gtgacatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaggtgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagat 9577700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Original strand, 19568807 - 19568939
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  19568807 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagcagg 19568906  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataac 344  Q
    |||||||||||| ||   ||||||||| |||||    
T  19568907 tcttagtgaaatcttagcaaaattcagtataac 19568939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5215303 - 5215156
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  5215303 catgaaagttgtagataaatgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 5215204  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaat 359  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5215203 tcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 5215156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Original strand, 52989397 - 52989491
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaa 246  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52989397 cgagcataggaaaatcaatttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaa 52989491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18739551 - 18739394
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  18739551 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggctttggtttcactttaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18739452  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  18739451 tcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaacctta 18739394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17207996 - 17207766
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| | ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  17207996 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggttttaattgcaaatgaattttggtttt-gagttatgatgaaaatactccaaggagg 17207898  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||| |||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||  || |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  17207897 tcttactgaaatgttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttattgattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 17207799  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17207798 aaataaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17207766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12305718 - 12305599
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  12305718 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 12305619  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  12305618 tcttagtgaatttttatgaa 12305599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 212 - 339
Target Start/End: Original strand, 46723022 - 46723149
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  46723022 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 46723121  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 339  Q
    ||||| | |||| || ||||||||||||    
T  46723122 tcttactaaaatcttatgaaaattcagc 46723149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 25104600 - 25104829
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  25104600 catgaaagtt-tagataattgtgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaa-tgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 25104697  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |  ||| |||| |||||| | |  ||||||  |||||    
T  25104698 tcttagtaaaattttacgaaaattccgcataactatttccaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaatttg-tgtactatcagttc 25104796  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25104797 aattaaggtgtttaagagtatttaacttatgtt 25104829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12952697 - 12952466
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  |||||| || | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  12952697 catgaaagttttagataatagtgttaaatttccattggctttggtttgacttgaaactgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 12952598  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||||||  |||||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||||  || |   || |||| ||||| || |  || ||| ||| ||    
T  12952597 tcttagtgaaattttacgaaaatcccgcataactatttcaaagtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaatcttg-tgttctatgagctc 12952499  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12952498 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 12952466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 28194863 - 28194751
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28194863 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 28194764  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     |||||| |||||    
T  28194763 tgtgctgtctatg 28194751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 349 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11258986 - 11258891
Alignment:
Q  349 tctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11258986 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 11258891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13436894 - 13436776
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13436894 catgaaagttgtagataatgttgttagctttccaatggatttggtttggcttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa-gaga 13436796  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||| |||||| |||| ||||    
T  13436795 tctcagtgaatttttatgaa 13436776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15465750 - 15465631
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15465750 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15465651  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  15465650 tcttagtgaatttttatgaa 15465631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 535 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 44494976 - 44494901
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44494976 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 44494901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 15246281 - 15246078
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   || || |  ||||| |||||||  ||| |||||| |||||| |||||| ||     ||    
T  15246281 atgttatgagttgatccttgtggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgttctgtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttat----ta 15246186  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgc 638  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||   ||||    
T  15246185 atgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgttattgtgc 15246086  T
Q  639 tgcctatg 646  Q
    ||||||||    
T  15246085 tgcctatg 15246078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 535 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 37427885 - 37427772
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 634  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  37427885 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgatgattatcatttgatactgttatatcttgagatgtttat 37427786  T
Q  635 gtgctgcctatgct 648  Q
    ||||||||| ||||    
T  37427785 gtgctgcctgtgct 37427772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 26054831 - 26054950
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  26054831 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcttcggttttacatgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 26054930  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  26054931 tcttagtgaatttttatgaa 26054950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 290 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 22652409 - 22652236
Alignment:
Q  290 tgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctca 389  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| |||    
T  22652409 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttca 22652310  T
Q  390 aaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggta 464  Q
    || || |  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  22652309 aagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta 22652236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 54521418 - 54521304
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  54521418 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttaattttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 54521319  T
Q  312 tcttagtgaaatttt 326  Q
    |||||||||| ||||    
T  54521318 tcttagtgaattttt 54521304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 480 - 625
Target Start/End: Original strand, 23318615 - 23318754
Alignment:
Q  480 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 579  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23318615 tataatattactgatgaactgtgaatctgttataa-atgatttaatgttgttag----taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataag 23318709  T
Q  580 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 625  Q
     |||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  23318710 ttgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 23318754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5223979 - 5223860
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  5223979 catgaaagttgtagatagttgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgcgatatgatgaaaatactccaaggagg 5223880  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  5223879 tcttagtgaatttttatgaa 5223860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 215 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8631395 - 8631265
Alignment:
Q  215 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 314  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||    
T  8631395 gaaagttttagataatgatgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgttgaaaacactccaaggagatct 8631296  T
Q  315 tagtgaaattttttgaaaattcagcataact 345  Q
    || |||||||||  |||||||| | ||||||    
T  8631295 tattgaaattttacgaaaattccgtataact 8631265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 646
Target Start/End: Original strand, 11914003 - 11914077
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11914003 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctggctatg 11914077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 440 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 15207199 - 15207032
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   || || |  ||||| |||||||  ||| |||||| |||||| |||||| ||     ||    
T  15207199 atgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgttctgtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttat----ta 15207104  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 610  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15207103 atgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgat 15207032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 15265402 - 15265199
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   || || |  |||||  | ||||  ||| |||||| |||||| |||||| ||     ||    
T  15265402 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgtacagtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttat----ta 15265307  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgc 638  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||   ||||    
T  15265306 atgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgttattgtgc 15265207  T
Q  639 tgcctatg 646  Q
    ||||||||    
T  15265206 tgcctatg 15265199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 316 - 432
Target Start/End: Original strand, 26055128 - 26055244
Alignment:
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  26055128 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 26055227  T
Q  416 aaggtatttaagagtat 432  Q
    ||||| |||||||||||    
T  26055228 aaggtgtttaagagtat 26055244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 567 - 646
Target Start/End: Original strand, 3264997 - 3265076
Alignment:
Q  567 tgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  3264997 tgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcatgagatgtttatgtgttgcctatg 3265076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 22764026 - 22764145
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||| || || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  22764026 catgaaagttatagataattgagttagcttttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaga 22764125  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  22764126 tcttagtgaatttttatgaa 22764145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 29544408 - 29544527
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  29544408 catgaaagttgtagataatttgtttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 29544507  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||| ||||| |||| ||||    
T  29544508 tcttggtgaatttttatgaa 29544527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 440 - 627
Target Start/End: Original strand, 32402819 - 32403002
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||| |||| ||||||||  |||||    | ||||    
T  32402819 atgttatgagttgatctttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgctcagtgagtctgatata-tatgatttgttgttg----cgagta 32402913  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-aagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaga 627  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32402914 atgtgatatagttttatatgcattatgtgaattatctaagatgtttaaagttgctattgattattatttgatattgttatatcttgaga 32403002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 567 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 36527882 - 36527803
Alignment:
Q  567 tgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  36527882 tgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatatttatgtgttgcctatg 36527803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 350 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14682841 - 14682754
Alignment:
Q  350 ctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  14682841 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 14682754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 28848188 - 28848307
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  28848188 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 28848287  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  28848288 tcttagtgaatttttatgaa 28848307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34159921 - 34159842
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34159921 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 34159842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11259086 - 11258992
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  11259086 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaa 11258992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15978127 - 15978009
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||  | | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  15978127 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtggggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 15978028  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  15978027 cttagtgaatttttatgaa 15978009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 546 - 639
Target Start/End: Original strand, 34852617 - 34852710
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  34852617 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgct 34852710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 17463773 - 17463694
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17463773 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 17463694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 55477086 - 55477007
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  55477086 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 55477007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 7780914 - 7781032
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| || ||||||  | | ||||||||||||||||||| ||| |    
T  7780914 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttctggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggaggt 7781013  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  7781014 cttagtgaatttttatgaa 7781032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 327
Target Start/End: Original strand, 16453847 - 16453961
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |    
T  16453847 atgaaagttgtagataattttattagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggt 16453946  T
Q  313 cttagtgaaattttt 327  Q
    ||||||||| |||||    
T  16453947 cttagtgaatttttt 16453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8023878 - 8023721
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  8023878 catgaaagttttagataaatatgttagctttctaatggcttgggtttgacttaaaaatgatttctagattttgagttatgatgaaaatactacaagtagg 8023779  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    | || ||| |||||   ||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  8023778 ttttggtgcaatttaacgaaaatttagcataactatttttaagtcaacccaaaactta 8023721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 36528170 - 36528061
Alignment:
Q  215 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 314  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||| ||| |||    
T  36528170 gaaagttttagataattttgtcagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgattcttggtgtttgatttatgatgaaaataccccaaggaggtct 36528071  T
Q  315 tagtgaaatt 324  Q
    ||| ||||||    
T  36528070 tagcgaaatt 36528061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 562 - 623
Target Start/End: Original strand, 38311759 - 38311820
Alignment:
Q  562 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 623  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  38311759 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 38311820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 395 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 18893063 - 18892975
Alignment:
Q  395 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 483  Q
    ||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18893063 agaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattata 18892975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 10247290 - 10247409
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||| |||| ||  |||     
T  10247290 catgaaagttgtagataattgcgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgtgttatggtcaaattactgcacggagg 10247389  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  10247390 tcttagtgaatttttatgaa 10247409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15413026 - 15412947
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  15413026 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcgatttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 15412947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Original strand, 13151357 - 13151431
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  13151357 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgaattttggtttatgag 13151431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 545 - 631
Target Start/End: Original strand, 14568921 - 14569007
Alignment:
Q  545 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 631  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||| ||||    
T  14568921 atataattgtatatgcgttatgtgaattatatatgatgtttaggttgatgttgactgtcacttgatattgttatatcatgagctgtt 14569007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Original strand, 45606473 - 45606547
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  45606473 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcgttttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 45606547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 621
Target Start/End: Original strand, 52523593 - 52523763
Alignment:
Q  447 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaat 546  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| |   || |||||| ||    
T  52523593 gagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataagatattaatgatgatctgagaagctgttataagatga-ttgatgttgtt---ta-taatgtgat 52523687  T
Q  547 atatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| || || ||||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  52523688 ataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatc 52523763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 324
Target Start/End: Original strand, 3264646 - 3264818
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||    || || ||   || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |     
T  3264646 cgagcttaggaaaaccaacttttctggaattttctgtttcgaattgtcctttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgttagcttcccagtggcc 3264745  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatt 324  Q
      |||||||| ||||||||||||||| | |||||  | |||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  3264746 atggtttgacgtgaaaatgatttttgatgtttgatttgtgatgaaaataccccaaggaggtcttagcgaaatt 3264818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Original strand, 19568940 - 19568996
Alignment:
Q  388 caaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19568940 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19568996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 361 - 444
Target Start/End: Original strand, 42353218 - 42353302
Alignment:
Q  361 caaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggta-tttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  42353218 caaaacttagggaataattctaaacctcaaaacaaaaagtattaggagtttaattaagggagtttaagagtatttaacgtatgtt 42353302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 15964995 - 15964936
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15964995 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 15964936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 15968919 - 15968860
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15968919 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 15968860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 15972843 - 15972784
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15972843 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 15972784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 623
Target Start/End: Original strand, 20248741 - 20248803
Alignment:
Q  562 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatctt 623  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  20248741 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgaattatcatttgatactgttatatctt 20248803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6002603 - 6002446
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||  ||     
T  6002603 catgaaggttttagataattatgttatctttccaatggcgttagtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtagg 6002504  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    |||| | ||||||||    ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||| |||||    
T  6002503 tcttggggaaattttaaagaaatttagcataactatttccaagtcattccaatactta 6002446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 322
Target Start/End: Original strand, 11986844 - 11986912
Alignment:
Q  254 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 322  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||    
T  11986844 ggtttgacttgaaaatgatctttagtttttgagttatgatgaaaatactacaagggggtcttagtgaaa 11986912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 6468701 - 6468780
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  6468701 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtccgtttgacttgaaaataattttcggtttatgagttatg 6468780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 11854759 - 11854700
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11854759 agttgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 11854700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 587 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 19775791 - 19775744
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 634  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19775791 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 19775744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Original strand, 13153823 - 13153896
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 286  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  13153823 catgaaagttgtagata-ttgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgaattttggtttatgag 13153896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 306
Target Start/End: Original strand, 17759054 - 17759148
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  17759054 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggatttggtttgacttaaaaattgtttgtggattttgagttatgataaaaacactccaa 17759148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 306
Target Start/End: Original strand, 19060374 - 19060468
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  19060374 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggatttggtttgacttaaaaattgtttgtggattttgagttatgataaaaacactccaa 19060468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 576
Target Start/End: Original strand, 29172491 - 29172618
Alignment:
Q  445 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgta 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||||  ||||| || ||||  ||| |||||||| |||| |||||||    ||||| |||     
T  29172491 atgagttgatccttggggtaggaatggaggtcggttatagtattgttgatgttcagtgagtctgatataatataatttgatgttga----tagtattgtg 29172586  T
Q  545 atatatttgtatatgcattatgtgaattatat 576  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29172587 atataattgtatatgcattacttgaattatat 29172618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 298
Target Start/End: Original strand, 40039740 - 40039826
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||   | ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  40039740 catgaaagttttagataattttgttatcttttcaatggatttggtttgacttgaaaatattttatggattttgagttatgatgaaaa 40039826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 587 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 15617400 - 15617339
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgct 648  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||    
T  15617400 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgct 15617339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 587 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 30065972 - 30065911
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgct 648  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||    
T  30065972 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgct 30065911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 621
Target Start/End: Original strand, 2051102 - 2051235
Alignment:
Q  484 atattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atg 582  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||| |   || |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||    
T  2051102 atattaatgatgatttgtgaagctgctataagatgattga-tgttgtt---ta-taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatg 2051196  T
Q  583 tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    ||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  2051197 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 2051235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 4107480 - 4107539
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  4107480 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 4107539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 4111332 - 4111391
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  4111332 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 4111391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 7109724 - 7109665
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  7109724 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 7109665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 7113659 - 7113600
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  7113659 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 7113600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 11070094 - 11070035
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  11070094 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 11070035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 11165612 - 11165671
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  11165612 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 11165671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 22321690 - 22321631
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  22321690 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 22321631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 22336745 - 22336686
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  22336745 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 22336686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 27409727 - 27409786
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  27409727 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 27409786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 28949750 - 28949691
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  28949750 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 28949691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 37439719 - 37439778
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37439719 agttgttgttgattattatttgatatggttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 37439778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 55022893 - 55022834
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  55022893 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 55022834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Original strand, 8269382 - 8269472
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  8269382 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggcttgggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8269472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Original strand, 8276493 - 8276583
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  8276493 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8276583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 593 - 646
Target Start/End: Original strand, 4588862 - 4588915
Alignment:
Q  593 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  4588862 tgttgattatcatttgaaattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatg 4588915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 261
Target Start/End: Original strand, 17956848 - 17956897
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgac 261  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  17956848 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgac 17956897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 21618692 - 21618627
Alignment:
Q  445 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 510  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21618692 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctatgaagctgtt 21618627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27840549 - 27840500
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgac 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  27840549 catgaaagttgtagataattttgttagccttctaatgactttggtttgac 27840500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 36166841 - 36166776
Alignment:
Q  445 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 510  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36166841 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctatgaagctgtt 36166776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 54521014 - 54520977
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54521014 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 54520977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 552 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 43926114 - 43926034
Alignment:
Q  552 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  43926114 tgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttt 43926034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 643
Target Start/End: Original strand, 14568804 - 14568859
Alignment:
Q  588 gttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 643  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||    
T  14568804 gttggtgttaattatcatttgatattcttatatcttgagatgtatatgtgctgcct 14568859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16820552 - 16820505
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttg 259  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  16820552 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcattggtttg 16820505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 557 - 639
Target Start/End: Original strand, 14647688 - 14647769
Alignment:
Q  557 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| ||||| || |||||    
T  14647688 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatgtgct 14647769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 440 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 37427976 - 37427930
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 486  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  37427976 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataata 37427930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 12567752 - 12567723
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567752 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 12567723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 13544217 - 13544188
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544217 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 13544188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 16059659 - 16059622
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16059659 atgttatgagttggtctttggggtaggaatggaagttg 16059622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Original strand, 29544812 - 29544849
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  29544812 gatgttgattaccatttgatgttgttatgtcttgagat 29544849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 293
Target Start/End: Original strand, 54039146 - 54039227
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 293  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   ||||||||||||    
T  54039146 catgaatgttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 54039227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 1468633 - 1468669
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1468633 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 1468669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 606 - 646
Target Start/End: Original strand, 11300532 - 11300572
Alignment:
Q  606 ttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11300532 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 11300572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12808595 - 12808559
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12808595 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 12808559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 14528644 - 14528708
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||  |||||||||||    
T  14528644 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggatttggtttgacttccaaatgattttt 14528708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 16934830 - 16934894
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  16934830 catgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgattttt 16934894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 480 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 23274910 - 23274882
Alignment:
Q  480 tataatattaatgatgatctgtgaagctg 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23274910 tataatattaatgatgatctgtgaagctg 23274882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25058388 - 25058324
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  25058388 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgattttt 25058324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 49231858 - 49231794
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  49231858 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgattttt 49231794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 161)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 646
Target Start/End: Original strand, 19807933 - 19808423
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  19807933 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattagatttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgtaagctttccaatgata 19808032  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 351  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19808033 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatcctctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 19808132  T
Q  352 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19808133 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagtt 19808232  T
Q  452 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 551  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  19808233 gatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatt 19808328  T
Q  552 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19808329 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgtctatg 19808423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 637
Target Start/End: Original strand, 22237590 - 22238071
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22237590 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggca 22237689  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 351  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  22237690 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgttgaaaatactccaaggaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttct 22237789  T
Q  352 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237790 aagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattatgttgtttaagagtatttaacctatgttatgagtt 22237889  T
Q  452 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 551  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||    
T  22237890 gatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtattatatt 22237985  T
Q  552 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 637  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237986 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 22238071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 223 - 646
Target Start/End: Original strand, 17460694 - 17461113
Alignment:
Q  223 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 322  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17460694 tagataattttgttagtttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 17460793  T
Q  323 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 422  Q
      || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  17460794 ccttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgt 17460893  T
Q  423 ttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt 522  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17460894 ttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagttgttataatatgattt 17460993  T
Q  523 aatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 622  Q
    ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460994 aatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 17461089  T
Q  623 tgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
      ||||||||| ||| | ||||||    
T  17461090 ctagatgtttatgtgtttcctatg 17461113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 212 - 620
Target Start/End: Original strand, 25483870 - 25484274
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  25483870 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 25483969  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25483970 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaacgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagtactatgagttc 25484069  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  25484070 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 25484169  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25484170 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatg 25484265  T
Q  612 ttgttatat 620  Q
    || ||||||    
T  25484266 ttattatat 25484274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Original strand, 15635576 - 15635840
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||     
T  15635576 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggcttttgagatataatgaagatactccaaggagg 15635675  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15635676 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatcctcaaaactagaagtactatgagttc 15635775  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  15635776 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 15635840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Original strand, 39694924 - 39695188
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39694924 catgaaaattttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 39695023  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39695024 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 39695123  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  39695124 aattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 39695188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Original strand, 41680530 - 41680795
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  41680530 catgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggattgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 41680629  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41680630 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 41680729  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  41680730 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatggaggttg 41680795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 212 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 364444 - 364148
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  364444 catgaaagttgtggataattttgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 364345  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  364344 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 364245  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 508  Q
    || |||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  364244 aattaaggtgtttaagattatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctg 364148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 19882624 - 19882371
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  19882624 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggagg 19882525  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  19882524 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcccaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtta 19882425  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  19882424 aattaaggtgtttaagggtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggtag 19882371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 212 - 508
Target Start/End: Original strand, 44522822 - 44523118
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44522822 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 44522921  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  44522922 tcttagtgaaatctcatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 44523021  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 508  Q
    || |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||  ||||||||||    
T  44523022 aattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgacgtgtgaagctg 44523118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 11775378 - 11775125
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  11775378 catgaaagttgtagataattttgttagatttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 11775279  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  11775278 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttt 11775179  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  11775178 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 11775125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 152 - 444
Target Start/End: Original strand, 21321676 - 21321968
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |     
T  21321676 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtttttgataatttggttagctttccaatggct 21321775  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 351  Q
    | | |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||||| |||| || |||||||||||||||||   ||||    
T  21321776 tagatttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccagttct 21321875  T
Q  352 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||| || |||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21321876 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaattataagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 21321968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 212 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26454367 - 26454087
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  26454367 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatataatgaaaatactccaaggagg 26454268  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  26454267 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtattatgagttc 26454168  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 492  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||   |||  |||||||  |||||||||||||    
T  26454167 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttgggggtagaaacgaggttgtttataatattaatg 26454087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 316 - 646
Target Start/End: Original strand, 14397604 - 14397923
Alignment:
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  14397604 agtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 14397703  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 515  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14397704 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 14397796  T
Q  516 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 615  Q
    |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  14397797 atgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgctgttgattatcaattgatattgt 14397892  T
Q  616 tatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14397893 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 14397923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 18024091 - 18024323
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18024091 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatagctttgatttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18024190  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18024191 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggcatagttccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 18024290  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18024291 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18024323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20454895 - 20454638
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||     
T  20454895 catgaaagttgtagataattgagttagctttccattggctttcatttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcgaaggagg 20454796  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  20454795 tcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaacccacaaaactagaagtactatgagttc 20454696  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  20454695 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 20454638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22207923 - 22207693
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22207923 catgaaagttgtaaataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttgggttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 22207824  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| ||||    
T  22207823 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaaattaatccaaaacttatggaataattccaaacctgaaaactagaagtatcaggggttc 22207724  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22207723 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 22207693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 212 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 18834127 - 18833898
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  18834127 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18834028  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18834027 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 18833928  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 441  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18833927 aattaaggggtttaagagtatttaacctat 18833898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 212 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 44432518 - 44432221
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt-ggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |  |||    
T  44432518 catgaaagttgtagataattttgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggag 44432419  T
Q  311 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
     |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  44432418 gtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 44432319  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 508  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  44432318 caattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctg 44432221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 20178917 - 20179149
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20178917 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 20179016  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20179017 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttc 20179116  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20179117 aaatagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20179149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Original strand, 6573453 - 6573682
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  6573453 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttt-gagatatgatgaaaatactccaaggagg 6573551  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6573552 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaggtactaggggttc 6573651  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    || |||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  6573652 aattaagttgtttaagagtatctaacatatg 6573682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 23478736 - 23478478
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23478736 catgaaagttgtagataattgtgttacctttccagtggcttgggtttgacttgaaaatgatttttagtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23478637  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23478636 tcttagtgaaatcttatgaaaatgcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 23478537  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||||    
T  23478536 aactaaggtgtttcatagtatttaacatatgttgtgagttggtccttggggtagaaatg 23478478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 27941285 - 27941655
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  27941285 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggcttcggtgtgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaagtagg 27941384  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  27941385 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtaatatgagtgc 27941484  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  27941485 aattaaggtgtttaatagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 27941584  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttta 586  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27941585 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatatgagatgttta 27941655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 17795888 - 17795592
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  17795888 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttgggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 17795789  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17795788 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 17795689  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 508  Q
    || |||||| ||||  ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  17795688 aattaaggtgtttacaagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtgtgaagctg 17795592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 152 - 444
Target Start/End: Original strand, 21326274 - 21326566
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |     
T  21326274 cgagtataggaaaatcaacgtttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtctgcatgaaagctttagataatttggttagctttccaatggct 21326373  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 351  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||   | |||||||||||| || |||||||||||||||||   ||||    
T  21326374 ttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccagttct 21326473  T
Q  352 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||| || |||||| | |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  21326474 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaattaaaagtacaatgagttcaattaaagagtttaagagtatttaacctatgtt 21326566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 21861016 - 21861248
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | | |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  21861016 catgaaagttgtagataatttggttagctttctaaaggcttttgtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgctgaaaatactccaaggagg 21861115  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21861116 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtttatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 21861215  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21861216 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 21861248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 436
Target Start/End: Original strand, 38185482 - 38185706
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  38185482 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 38185581  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  38185582 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtattatgagttc 38185681  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaa 436  Q
    || |||||| |||||||||||||||    
T  38185682 aattaaggtgtttaagagtatttaa 38185706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Original strand, 42559924 - 42560181
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  42559924 catgaaagttgtagataattttgttagcttttcaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 42560023  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42560024 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaagctc-aaactagaagtactatgagttc 42560122  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| || | ||||||| ||||||    
T  42560123 aattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaatg 42560181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 212 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 39364180 - 39363955
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  39364180 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaaagagg 39364081  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  39364080 tcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtgctatgagttc 39363981  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||    
T  39363980 aattaaggtgtttgagagtatttaac 39363955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5761189 - 5760957
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5761189 catgaaagttgtcgataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 5761090  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5761089 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaggttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaccatgagttc 5760990  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5760989 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 5760957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 216 - 444
Target Start/End: Original strand, 6102153 - 6102381
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  6102153 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgcaaatggtttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtctt 6102252  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6102253 agtgaaatcttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 6102352  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||    
T  6102353 aggatatttaagagtatttaacctatgtt 6102381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19140421 - 19140189
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||     
T  19140421 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgtgatatgatgcaaatactccaaggagg 19140322  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19140321 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 19140222  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19140221 aactagggtgtttaacagtatttaacctatgtt 19140189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20455652 - 20455395
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | || | |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  20455652 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttcgtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaataccccaaggagg 20455553  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  20455552 tcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccatccctcaaaactagaagtactatgaggtc 20455453  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  20455452 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 20455395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20460630 - 20460373
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | || | |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  20460630 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttcgtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaataccccaaggagg 20460531  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  20460530 tcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccatccctcaaaactagaagtactatgaggtc 20460431  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  20460430 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 20460373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Original strand, 42818303 - 42818533
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||     
T  42818303 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 42818402  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42818403 ttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 42818502  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  42818503 aactagggtgtttaagagtatttaatctatg 42818533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 39936407 - 39936638
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||  || | | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39936407 catgaaagttgtagataattgagttagctttccggtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 39936506  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39936507 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttc 39936606  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39936607 aact-aggtgtttaagagtatttaacctatgtt 39936638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 44477080 - 44476851
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  ||     
T  44477080 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtagg 44476981  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagtt 410  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || ||    
T  44476980 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaatt 44476881  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  44476880 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 44476851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 44480342 - 44480113
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  ||     
T  44480342 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtagg 44480243  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagtt 410  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || ||    
T  44480242 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaatt 44480143  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  44480142 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 44480113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19880484 - 19880205
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||   |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  19880484 catgaaagttgtagataattttgttagcttttcaatggctttggtttggtgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactacaaggagg 19880385  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19880384 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattggataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttc 19880285  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 492  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| | |||  || |||| ||||||||||||||    
T  19880284 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttggggca-gaaacgaagttgtatataatattaatg 19880205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Original strand, 17437714 - 17437945
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  17437714 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtaaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 17437813  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||     
T  17437814 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaatttaatccaaaacttatggaataattccaaatctcaaaactagaaataataggatttt 17437913  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17437914 aattaaggagtttaagagtatttaacctatgt 17437945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 8728333 - 8728561
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  8728333 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgaattttagtttaggagttatgatgaaaatactacaagtagg 8728432  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatt-caaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  8728433 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aaacttagggaataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagtt 8728531  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8728532 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 8728561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 20084034 - 20084266
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  20084034 catgaaagttttagataattatgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaagagg 20084133  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  20084134 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagagaataattccaaacctcaaa-ctagaagtactaggagttt 20084232  T
Q  412 aactaaggtat-ttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||    |||||| |||||||||||||||    
T  20084233 aattaagggggcttaagattatttaacctatgtt 20084266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 212 - 457
Target Start/End: Original strand, 21579603 - 21579848
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || | | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||     
T  21579603 catgaaagttgtagataattttgttagatttctagtggctttggtttgactcgaatatgatttttagtttttgatttatgatgaaaatactccaaggagg 21579702  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  21579703 tcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaattagaaatactatgagttc 21579802  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21579803 aattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatctt 21579848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 215 - 477
Target Start/End: Original strand, 42265994 - 42266252
Alignment:
Q  215 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 314  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  42265994 gaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 42266093  T
Q  315 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 414  Q
    ||||||||| ||   ||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  42266094 tagtgaaatctt---aaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaagcttatggaataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttcaat 42266190  T
Q  415 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    |||||| |||||||||||| |||  |||||  ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||    
T  42266191 taaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttaatc-ttgggataggaatggaagttg 42266252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Original strand, 5082608 - 5082838
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||   | ||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  5082608 catgaaagttttagataattgagttagctttccagtggttttggtttaacatgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 5082707  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5082708 tctgagtgaaattttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 5082807  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    || |||||  |||||||||||||||| ||||    
T  5082808 aattaaggggtttaagagtatttaacttatg 5082838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23914579 - 23914344
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||  ||     
T  23914579 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatgaaaatacttcaagtagg 23914480  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  23914479 tcctattgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaagtagaagtactaggagtt- 23914381  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
     | |||||  ||||| |||||||||| | ||||||||    
T  23914380 tattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttatga 23914344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 464 - 646
Target Start/End: Original strand, 23943876 - 23944054
Alignment:
Q  464 aggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcatt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23943876 aggaatggaggttgaatataatattactgatgttctgtgaagctgttataatatgatttgatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcatt 23943971  T
Q  564 atgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| | ||||||| ||||    
T  23943972 atgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttaatgtgctgcatatg 23944054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 37515967 - 37515765
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| | | |||  ||| |||||| ||||||||||||| |||    ||    
T  37515967 atgttataagttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttttatgagtctgatataatgtgatttaatgttgttag----ta 37515872  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  37515871 atgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgct 37515772  T
Q  640 gcctatg 646  Q
    |||||||    
T  37515771 gcctatg 37515765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Original strand, 22258700 - 22258935
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  22258700 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatactccaaggagg 22258799  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  22258800 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 22258898  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22258899 aattaaggtgtttaagagtatttaaactatgttatga 22258935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22483402 - 22483171
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  22483402 catgaaagttttagataattgtgtaagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 22483303  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  22483302 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 22483204  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22483203 aattaaggtgtttaagagtatttaacttatgtt 22483171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 440 - 632
Target Start/End: Original strand, 20533267 - 20533455
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    |||||    
T  20533267 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgttctgtgaagctgttataatgtgatttattgttga----tagta 20533362  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  20533363 atgtaatataattgtatatgcattttgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatcatcacttgatattattatatctggatatgttt 20533455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 442 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 16799748 - 16799561
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatc-tttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 540  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    ||||||    
T  16799748 gttaagagttgatcctttggggtatgaatggaggatgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagtaa 16799653  T
Q  541 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 631  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  16799652 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaaatatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctggatatgtt 16799561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 440 - 632
Target Start/End: Original strand, 19154744 - 19154932
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||    
T  19154744 atgttacgagttgatccttggtgtaggaatggaggttatatgtaatattaatgatgatttgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tacta 19154839  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||    
T  19154840 atgtaatatatttgtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattagcacttgatattattatatctggatatgttt 19154932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 507 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 23659602 - 23659467
Alignment:
Q  507 tgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23659602 tgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 23659507  T
Q  607 tgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||    
T  23659506 tgatgttgttatatctcaagatgtttatgtgatgcctatg 23659467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 279 - 444
Target Start/End: Original strand, 361675 - 361840
Alignment:
Q  279 tttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  361675 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 361774  T
Q  379 tcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  361775 tccaaagctcaaaactaggagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 361840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 32950241 - 32950025
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||                ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  32950241 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttga----------------ttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 32950158  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  32950157 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttt 32950058  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32950057 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 32950025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 443 - 621
Target Start/End: Original strand, 17439367 - 17439541
Alignment:
Q  443 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatg 542  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||    
T  17439367 ttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatacagtattaatgatgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttgataa----taatg 17439462  T
Q  543 taatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  17439463 tgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17439541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 212 - 457
Target Start/End: Original strand, 29763265 - 29763510
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | | ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  29763265 catgaaagttgtagataattttgttagctttctagtgtctttggtttgactcgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggagg 29763364  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || ||||   ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||    
T  29763365 tcttagtgaaatcttaggaaaatttagaataatcatttctaagttaatccgaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtaatatgagttc 29763464  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    || |||| |    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  29763465 aattaagatgggaaagagtgtttaacctatgttgtgaattgatctt 29763510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 440 - 623
Target Start/End: Original strand, 14103083 - 14103262
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt-aatgttgatagctagt 538  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||     |    
T  14103083 atgttacgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatataaatgatgatctatgaagttgt-ataatatgattttaatgttgatat----t 14103177  T
Q  539 aatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 623  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14103178 aatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 14103262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17501581 - 17501350
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | | ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||||  |      
T  17501581 catgaaagtttgagataattttattagctttccaatggcttgggtttaacttaaaaatgatttttagattttgagatatgatggaattaccccaagcaag 17501482  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| || || |||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  17501481 tcttggtaaatttttatgaaaaattagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 17501382  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17501381 aattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 17501350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 212 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23660871 - 23660688
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||     
T  23660871 catgaaagttgtagataattgagttagctttacagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaattagtccaaggagg 23660772  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaacta 395  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  23660771 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaacta 23660688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 223 - 444
Target Start/End: Original strand, 20517525 - 20517745
Alignment:
Q  223 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 322  Q
    ||||||| | |||||| |||||| || | | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  20517525 tagataactgtgttagttttccagtggctttggcttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaa 20517624  T
Q  323 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 422  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||     || |||| |||||||| |  |||||| |||||||| |||||| |    
T  20517625 ttttatgaaaattccgcataactgtttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgt 20517723  T
Q  423 ttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20517724 ttaagagtatttaacctatgtt 20517745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 36732920 - 36733077
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  36732920 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgagg 36733019  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  36733020 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactta 36733077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 4381189 - 4381420
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||     
T  4381189 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttacgataaaaatacttcaaggagg 4381288  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| | | |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  4381289 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 4381387  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4381388 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 4381420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22344697 - 22344466
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| | || | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  22344697 catgaaaattttagataattgtgttagctttctagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22344598  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||  ||||||    
T  22344597 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttc 22344499  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22344498 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22344466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22356357 - 22356126
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| | || | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  22356357 catgaaaattttagataattgtgttagctttctagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22356258  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||  ||||||    
T  22356257 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttc 22356159  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22356158 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22356126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 216 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23670300 - 23670069
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||    
T  23670300 aaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggtctt 23670201  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| | | |   || |||| |||||  | |  |||||| |||||||| |    
T  23670200 agtgaaattttattaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtatccaaacttcaaagattg-tgtactatgagttcaatt 23670102  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23670101 aaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 23670069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 38989121 - 38988886
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||     
T  38989121 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggagg 38989022  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  | || ||| |||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||||||  |||||    
T  38989021 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactataagttc 38988923  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38988922 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 38988886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 39020218 - 39019983
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||     
T  39020218 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggagg 39020119  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  | || ||| |||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||||||  |||||    
T  39020118 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactataagttc 39020020  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39020019 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 39019983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 442 - 646
Target Start/End: Original strand, 20501962 - 20502162
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 541  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  20501962 gttatgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatataattgttgatgttcagtgaatctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 20502057  T
Q  542 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgc 641  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20502058 atgacatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgttgttggttatcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgctgc 20502157  T
Q  642 ctatg 646  Q
    |||||    
T  20502158 ctatg 20502162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 537 - 637
Target Start/End: Original strand, 25363154 - 25363254
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25363154 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 25363253  T
Q  637 g 637  Q
    |    
T  25363254 g 25363254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 36305314 - 36305083
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | |  |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  36305314 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatggtttttgctttttgagttatgataaaaatactccaatgagg 36305215  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||| | ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| |||| |    
T  36305214 tcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtaaacccaaaactcatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagtcc 36305116  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  36305115 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 36305083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 440 - 621
Target Start/End: Original strand, 40492711 - 40492887
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||     
T  40492711 atgttgtgagttgatccttgtggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtg 40492806  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||||||| || ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  40492807 atgtaatatatttgtatatgcaat-catgaattatttatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 40492887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21399366 - 21399209
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21399366 catgaaagttgtagataattgagttagttttccaatggattcggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21399267  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  21399266 tcttagtaaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 21399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21793859 - 21793702
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21793859 catgaaagttgtagataattgagttagttttccaatggattcggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21793760  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  21793759 tcttagtaaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 21793702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 440 - 645
Target Start/End: Original strand, 17086012 - 17086213
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| ||  |||  |   ||||||||||||| ||||||||||    ||    
T  17086012 atgttatgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcaatgagtccaatataatatgatttgatgttgatag----ta 17086107  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17086108 atgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttgatgttgattattatttggtattgttatatcttgagatgtttatgtgct 17086207  T
Q  640 gcctat 645  Q
    ||||||    
T  17086208 gcctat 17086213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 346 - 464
Target Start/End: Original strand, 8414240 - 8414358
Alignment:
Q  346 gtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtta 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  8414240 gtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttg 8414339  T
Q  446 tgagttgatctttggggta 464  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  8414340 tgagttggtccttggggta 8414358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 254 - 444
Target Start/End: Original strand, 18816898 - 18817089
Alignment:
Q  254 ggtttgacttgaaaatgatttttg--gtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 351  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||    
T  18816898 ggtttgacttgaaaatgatttttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataattatttct 18816997  T
Q  352 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18816998 aagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacatcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18817089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 17978813 - 17979044
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || | | |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||     
T  17978813 catgaaagttgtagataattgtgttagagttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttggtttttgagttatgatgaaaatatttcaaagagg 17978912  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||  | |  |||||| ||||||    
T  17978913 tcttagtgaaattttatgaaaattccggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttc 17979011  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17979012 aattaaggtgtttaatagtatttaacctatgtt 17979044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22474407 - 22474176
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||     
T  22474407 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcccatggctttagtttgacttgaaaacgatttttggtttttgaattatgatgaaaatagtccaaggagg 22474308  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  ||||| | |||||| || || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  22474307 tcttagtgaaattttatgaaaactccacataattatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 22474209  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22474208 aattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 22474176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Original strand, 36405456 - 36405691
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | | |  |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  36405456 catgaaaattgtagataattgtgttagctttcccgtggctttgaattgatttgaaaatgatttttgttttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 36405555  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| | | |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  36405556 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 36405654  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36405655 aattaatgtgtttaatagtatttaacctaagttatga 36405691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 440 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 23668071 - 23667872
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |  | ||| || ||||  ||  ||| ||||||||| | |||| |||    ||    
T  23668071 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattataatactgttaatgttcagtgagtctaatatgatatgatttgaggttgttag----ta 23667976  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgtt-gattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgc 638  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23667975 atgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgtttaagttgatgttaaaatattatttgatattgttatatcttgagatggttatgtgc 23667876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 212 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21513975 - 21513823
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| | || | | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  21513975 catgaaagttgtagataattgtgttagcattctagtggctttggtttggcttgaaaatgatttttgggttttgagatatgatcaaaatactccaa-gagg 21513877  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaa 365  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||    
T  21513876 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaa 21513823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Original strand, 22253024 - 22253226
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || || |  ||| ||||||||||||| |||||  |||    ||    
T  22253024 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtaagtctgatataatatgatttgatgttcttag----ta 22253119  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||| ||| | || ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  22253120 atgtgataaagttatatatgcattatgtggatcacataagatgtttaagttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtatatgtgct 22253219  T
Q  640 gcctatg 646  Q
     ||||||    
T  22253220 acctatg 22253226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 272 - 444
Target Start/End: Original strand, 18815279 - 18815450
Alignment:
Q  272 tttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| |    
T  18815279 tttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatg 18815378  T
Q  372 gaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |   || |||| |||||  | |  |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18815379 gattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 18815450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 571 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 23409930 - 23409855
Alignment:
Q  571 ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23409930 ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 23409855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Original strand, 5083103 - 5083215
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5083103 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatccttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 5083202  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     ||||||||||||    
T  5083203 tgtgctgcctatg 5083215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Original strand, 17438166 - 17438278
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17438166 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 17438265  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     ||| ||||||||    
T  17438266 tgtgttgcctatg 17438278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 18833733 - 18833622
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18833733 tagtaatgtgatatatgtgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttgtttattatttgatattgttatatc-tgagatgttta 18833635  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     ||||||||||||    
T  18833634 tgtgctgcctatg 18833622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 442 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 22996104 - 22995927
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata-atatgatttaatgttgatagctagtaa 540  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || || |  ||||| |||||||  ||| |||| | ||||||| ||||| | |     |||    
T  22996104 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattttagtactgttgatgttctgtgagtctgctatatacatgatttgatgttaaaaa----taa 22996009  T
Q  541 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 622  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22996008 tgtgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 22995927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16198490 - 16198371
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||     
T  16198490 catgaaagttgtatataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgattaaaatactccacggagg 16198391  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  16198390 tcttagtgaaattttatgaa 16198371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 24907430 - 24907203
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||| ||| || |||||| ||||||||||| | || | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| || |||     
T  24907430 catgaatgttttatataattgtgttagctttctagtggctttggtttgactttaaaatgatttttgatttttgagttatgacgaaaatactctaaggagg 24907331  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| || |||||||||| ||| |  |||  ||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  24907330 tttgagtgaaattttatgaaaattccgcataactaattctaagtcaacccaaaacttatggattgtttc-caacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 24907233  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 441  Q
    || |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  24907232 aattaagttgtttaagaatatttaacctat 24907203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 14397308 - 14397426
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||   |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  14397308 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtatggtgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 14397407  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  14397408 cttagtgaaaatttatgaa 14397426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 18677632 - 18677750
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  18677632 atgaaagttgtagataattttgttacctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 18677731  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  18677732 cttagtgaatttttatgaa 18677750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Original strand, 22963364 - 22963474
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacg 635  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  22963364 gtaatgtgatataattgtatatgcattgtgtgaattataaaatatgttaaagttgatgttgaattattatttgatattgttatatcttgagatgtttatg 22963463  T
Q  636 tgctgcctatg 646  Q
    | |||||||||    
T  22963464 tactgcctatg 22963474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 561 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 23914183 - 23914097
Alignment:
Q  561 attatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23914183 attatgtgaattaatataagatgtttaagttgttgctgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatg 23914097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 4541941 - 4542059
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  4541941 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 4542040  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  4542041 cttagtgaatttttatgaa 4542059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 306
Target Start/End: Original strand, 8414145 - 8414239
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  8414145 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaa 8414239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 24485611 - 24485729
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||| | ||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||| |    
T  24485611 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggcttggcgtgaaaatgacttttggtttaggagttatgattaaaatactccaaggaggt 24485710  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24485711 cttagtgaatttttatgaa 24485729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1484997 - 1484918
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1484997 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 1484918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 20045762 - 20045841
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20045762 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 20045841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 303
Target Start/End: Original strand, 45290114 - 45290205
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 303  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  45290114 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttgttttaggagttatgatgaaaatactc 45290205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 440 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 22525778 - 22525659
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||    | | |||    
T  22525778 atgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttaattataatactcctgatgttttgtgaatctgttataacatgatttaatgtt----gttggta 22525683  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcatt 563  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  22525682 atgtcatatatttgtatatgcatt 22525659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 572 - 646
Target Start/End: Original strand, 16401983 - 16402063
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcattt------gatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401983 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgaatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 16402063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22002347 - 22002239
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||| | ||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||| |    
T  22002347 atgaaagttgtagataatttggttagctttccaatggctttggtttgacgtaaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggaggt 22002248  T
Q  313 cttagtgaa 321  Q
    |||||||||    
T  22002247 cttagtgaa 22002239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 25757808 - 25757577
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | ||| |||||   | |||||||||||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||   |     
T  25757808 catgaaagttatagataattgtgttggtttttcaatggttttggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtggg 25757709  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||  ||| ||| |||||||||||||||| | || ||||||||| |||||  ||| ||  |  ||| |||| |||||| | | |||| ||||||||     
T  25757708 tcttagcaaaactttatgaaaattcagcataattattcctaagttaaaccaaactttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagttt 25757610  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  25757609 aattaagaggtttaagagtatttaacctatgtt 25757577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 5852859 - 5852938
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5852859 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 5852938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 14409011 - 14409090
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14409011 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 14409090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 255 - 444
Target Start/End: Original strand, 18118603 - 18118792
Alignment:
Q  255 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 354  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| || ||| ||||  || |||| || || ||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  18118603 gtttgacttaaaaatgatttttagattttgagataagatggaattacaccaagtaggtcttggtaaatttttacgaaaattcagcctaaccgtttctaag 18118702  T
Q  355 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtacta-ggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | ||||||||||||| ||  |  | | |||| |||||||| | |||| || ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18118703 tcaatccaaaacttatggtttgttcccaaacttcaaaacttg-agtattagggagttcaattaaggtgttttagagtatttaacctatgtt 18118792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 537 - 591
Target Start/End: Original strand, 21346185 - 21346239
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21346185 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttg 21346239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 562 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 44476814 - 44476753
Alignment:
Q  562 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 623  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44476814 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 44476753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 562 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 44480076 - 44480015
Alignment:
Q  562 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 623  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44480076 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 44480015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 25295788 - 25295557
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | ||| |||||   | |||||||||||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||   |     
T  25295788 catgaaagttatagataattgtgttggtttttcaatggttttggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtggg 25295689  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||  ||| ||  |||||||||||||||| | || ||||||||| |||||  ||| ||  |  ||| |||| |||||| | | |||| ||||||||     
T  25295688 tcttagcaaaacttcatgaaaattcagcataattattcctaagttaaaccaaactttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagttt 25295590  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  25295589 aattaagaggtttaagagtatttaacctatgtt 25295557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14824370 - 14824291
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  14824370 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaattatttttggtttatgagttatg 14824291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 362 - 437
Target Start/End: Original strand, 21345945 - 21346020
Alignment:
Q  362 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  21345945 aaaacttagggaataattccaaatctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 21346020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22313488 - 22313401
Alignment:
Q  211 tcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||    
T  22313488 tcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggttccggtttgacttgaaaatgttttgtgaattttgagttatgatgaaaa 22313401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 254 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24624282 - 24624171
Alignment:
Q  254 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 353  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  24624282 ggtttgacttaaaaattatttttagattttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtctttgtgcaattttacgaaaattcaacataactatttctaa 24624183  T
Q  354 gttaatccaaaa 365  Q
    || || ||||||    
T  24624182 gtgaacccaaaa 24624171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 28397809 - 28397635
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgat-ctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 540  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||  | | | ||  ||| ||||| |||||||||||||| ||     |||    
T  28397809 gttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattataatattgttgatttttcagagagtctgatataa-atgatttaatgttgttaa----taa 28397715  T
Q  541 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 620  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  28397714 tgtgatatatt-gtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatat 28397635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 572 - 620
Target Start/End: Original strand, 19936956 - 19937004
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 620  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936956 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 19937004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 18862728 - 18862787
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18862728 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 18862787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 369
Target Start/End: Original strand, 19331976 - 19332128
Alignment:
Q  215 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 314  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    |  |||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||   | |||    
T  19331976 gaaagttttagataattgtgttagctttgcaatagtttttgtttgacttgaaaatgatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtct 19332075  T
Q  315 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    |||| |||   |||||||||| ||||||| | || ||||||||| ||||| ||||    
T  19332076 tagtaaaa--ctttgaaaatttagcataaatattcctaagttaaaccaaatctta 19332128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 21410973 - 21410914
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21410973 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 21410914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 21805465 - 21805406
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21805465 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 21805406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 21828097 - 21828156
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21828097 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 21828156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 554 - 628
Target Start/End: Original strand, 35026831 - 35026903
Alignment:
Q  554 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  35026831 tatatgcattatgtgaattatatatgatgttttaa--gatgttgattatcgtttgatattgttatatcttgagat 35026903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 538 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 37116517 - 37116434
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  37116517 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37116434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18827879 - 18827650
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||   |||||| |||||||||   | |||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  18827879 catgaaagttttagataaagatgttagatttccaatggatttggtttggcttaaaaatgattgttagtttttgagttatggtgaaaatactacaagtaga 18827780  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||  |||||||||  ||||||||| ||||| | ||| | ||  |||||||||  || ||  | |||| ||| ||||||||| || |||||||||||      
T  18827779 tcttgctgaaattttacgaaaattcaacataattatttttgagcgaatccaaaagatatggtttgattccaaaactcaaaacttga-gtactaggagtct 18827681  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    || || | | ||||||||||||||| |||||    
T  18827680 aattaggatgtttaagagtatttaaactatg 18827650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24239071 - 24238977
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  24239071 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttagtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttataatgaaaacactccaa 24238977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 644
Target Start/End: Original strand, 1327013 - 1327066
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgccta 644  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1327013 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgccta 1327066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 4483875 - 4483796
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  4483875 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 4483796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 538 - 628
Target Start/End: Original strand, 22419367 - 22419455
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |   ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  22419367 taatgtgatatgattgtatatgcattatgtgaattatttatgatgtttta--agatgttgattatcgtttgaaattgttatatcttgagat 22419455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 45559572 - 45559796
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactcc-aatgag 310  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    | |||||||||||||||| |||||| | |||        |||||||||||||| ||||||    
T  45559572 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaattgttttggtttgacttgaaaataatttttagattt-------ggatgaaaatactccaaatgag 45559664  T
Q  311 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
     ||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| | || ||||||||| ||||| |||| ||  |  ||| |||| |||||| | | |||| ||||| ||    
T  45559665 -tcttagtaaaactttatgaaaattcaacataattattcctaagttaaaccaaaccttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggattt 45559762  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
     || ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  45559763 taattaagaggtttaagagtatttaacctatgtt 45559796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 551 - 620
Target Start/End: Original strand, 2418839 - 2418906
Alignment:
Q  551 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2418839 ttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttca--agatgttgattatcgtttgatattgttatat 2418906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4233297 - 4233215
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatg 294  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | |  ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  4233297 catgaaagtttgagataattttattagctttccaatggctttcgtttgacttaaaaataatttttagattttgagatatgatg 4233215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 562 - 623
Target Start/End: Original strand, 8728620 - 8728682
Alignment:
Q  562 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatctt 623  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  8728620 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgaattaccatttgatactgttatatctt 8728682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 21495086 - 21495243
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||| || ||||| || | | |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| || |||     
T  21495086 catgaaagttttagacaattgagttggcattccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggagg 21495185  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || ||||||||||| || ||||| ||||    
T  21495186 ttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaagtcaacccaaacctta 21495243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 19278366 - 19278425
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  19278366 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 19278425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 21972668 - 21972727
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  21972668 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 21972727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 21976753 - 21976812
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  21976753 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 21976812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 43251836 - 43251777
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  43251836 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 43251777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Original strand, 223324 - 223414
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  223324 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 223414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Original strand, 688095 - 688185
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  688095 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 688185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Original strand, 736947 - 737037
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  736947 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 737037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Original strand, 860842 - 860932
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  860842 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 860932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 565 - 606
Target Start/End: Original strand, 21346241 - 21346282
Alignment:
Q  565 tgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 606  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21346241 tgtgaattatataagatatttaagttgttgttgattatcatt 21346282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 510
Target Start/End: Original strand, 26222945 - 26223010
Alignment:
Q  445 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 510  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26222945 atgagttggtctttcgggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgtt 26223010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 557 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 34950694 - 34950611
Alignment:
Q  557 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgc 641  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| || |||||||    
T  34950694 atgcattatgtggattaagtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgttatattttgggatgtctatgtgctgc 34950611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 621
Target Start/End: Original strand, 17266945 - 17267028
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||   |||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  17266945 taatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17267028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 557 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 21329176 - 21329095
Alignment:
Q  557 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| || |||||    
T  21329176 atgcattatgtggataatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgagatgtctatgtgct 21329095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 557 - 639
Target Start/End: Original strand, 21967540 - 21967621
Alignment:
Q  557 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| ||||| || |||||    
T  21967540 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatgtgct 21967621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 419 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 23410056 - 23410018
Alignment:
Q  419 gtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23410056 gtatttaagagtatttaacatatgttgtgagttgatctt 23410018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 554 - 595
Target Start/End: Original strand, 18024465 - 18024506
Alignment:
Q  554 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgt 595  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  18024465 tatatgcattatatggattatacaagatgtttaagttgatgt 18024506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 22364816 - 22364748
Alignment:
Q  552 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || |||||||| || |||||| ||||||||||    
T  22364816 tgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgattttc-tttgatattgttatatc 22364748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 272183 - 272219
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  272183 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 272219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 643666 - 643630
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  643666 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 643630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 829472 - 829436
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  829472 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 829436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 17150635 - 17150699
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | | |||| |||||  |||||||||||    
T  17150635 catgaaagttgcagataattatgttagctttctaatggctttggttggacttccaaatgattttt 17150699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 404 - 440
Target Start/End: Original strand, 18122327 - 18122363
Alignment:
Q  404 aggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18122327 aggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 18122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 22007105 - 22007169
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  22007105 catgaaagttatagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgattttt 22007169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 440 - 488
Target Start/End: Original strand, 22381593 - 22381641
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatatt 488  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22381593 atgttatgggtttatccttggggtaggaatcgaggttgattataatatt 22381641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29759519 - 29759455
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  29759519 catgaaaggtttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 29759455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 154)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 10057188 - 10056698
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10057188 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcaccaaagttgtagataattttgttagctttccaatggca 10057089  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 351  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10057088 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttct 10056989  T
Q  352 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10056988 aagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaatctagaagtaccaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttatgagtt 10056889  T
Q  452 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 551  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  10056888 gatcctttgggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatt 10056793  T
Q  552 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056792 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 10056698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 212 - 612
Target Start/End: Original strand, 630299 - 630695
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  630299 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 630398  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  630399 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 630498  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  630499 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 630598  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  630599 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatg 630694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 212 - 620
Target Start/End: Original strand, 23802860 - 23803264
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  23802860 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatagtccaaggagg 23802959  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23802960 tcttagtgaaaccttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 23803059  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  23803060 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttatgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 23803159  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  23803160 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgattttatg 23803255  T
Q  612 ttgttatat 620  Q
    |||||||||    
T  23803256 ttgttatat 23803264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 212 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 12611507 - 12611106
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  12611507 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaacgagg 12611408  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12611407 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 12611308  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  12611307 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatctatgaagctatta 12611208  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12611207 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcatt---tgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatg 12611115  T
Q  612 ttgttatat 620  Q
    |||||||||    
T  12611114 ttgttatat 12611106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 212 - 620
Target Start/End: Original strand, 51463463 - 51463867
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||     
T  51463463 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtctaaggagg 51463562  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||     
T  51463563 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatgcgataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttt 51463662  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  51463663 aattaaggcgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctatta 51463762  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51463763 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatg 51463858  T
Q  612 ttgttatat 620  Q
    |||||||||    
T  51463859 ttgttatat 51463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 18213222 - 18212792
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18213222 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 18213123  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  18213122 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 18213023  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  18213022 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 18212923  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18212922 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgata 18212827  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18212826 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 18212792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Original strand, 24046930 - 24047360
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |   ||     
T  24046930 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatggaaatactctaggtagg 24047029  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  24047030 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 24047129  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  24047130 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgaccattagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 24047229  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24047230 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgata 24047325  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24047326 ttgttatatcttaagatgtttatgtgctgcctatg 24047360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 9638663 - 9638399
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9638663 catgaaagttttatataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 9638564  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  9638563 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaatctcaaaactagaagtactatgagttc 9638464  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  9638463 aattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 9638399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 28385899 - 28385646
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  28385899 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 28385800  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28385799 tcttagtgaatttttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 28385700  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||||||    
T  28385699 aattaaggtgtttaagagtatttaacccaagttgtgagttggtccttggggtag 28385646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 35660502 - 35660270
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  35660502 catgaaagttttagatagttttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 35660403  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||     
T  35660402 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataatctcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 35660303  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  35660302 aattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 35660270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 212 - 508
Target Start/End: Original strand, 56115232 - 56115528
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  56115232 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 56115331  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  56115332 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaagcagaagtactatgagttc 56115431  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 508  Q
     | |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  56115432 tattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctg 56115528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 212 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 15008622 - 15008342
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15008622 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15008523  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15008522 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggcataattcgaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 15008423  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 492  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||   |||  |||||||  |||||||||||||    
T  15008422 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttgggggtagaaacgaggttgtttataatattaatg 15008342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 212 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15990695 - 15990439
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15990695 catgaaagttttagataatttagttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15990596  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15990595 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttc 15990496  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaa 468  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  15990495 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtcattggggtaggaa 15990439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 53630869 - 53631101
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  53630869 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 53630968  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  53630969 tcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 53631068  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  53631069 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 53631101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Original strand, 10694643 - 10694896
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||     
T  10694643 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 10694742  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10694743 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 10694842  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  10694843 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 10694896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Original strand, 10908409 - 10908662
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||     
T  10908409 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 10908508  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10908509 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 10908608  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  10908609 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 10908662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 217 - 442
Target Start/End: Original strand, 11479012 - 11479237
Alignment:
Q  217 aagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctta 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11479012 aagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtctta 11479111  T
Q  317 gtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 416  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11479112 gtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttccaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaatta 11479211  T
Q  417 aggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  11479212 aggtgtttaagattatttaacctatg 11479237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 25091309 - 25091077
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25091309 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25091210  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25091209 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcgaaactagaagtactatgagttc 25091110  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25091109 aactagggtgtttaagagtatttaaccaatgtt 25091077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 214 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 10705152 - 10704890
Alignment:
Q  214 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatc 313  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||    
T  10705152 tgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtc 10705053  T
Q  314 ttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaa 413  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10705052 ttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 10704953  T
Q  414 ctaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  10704952 ttaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 10704890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 214 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 10918922 - 10918660
Alignment:
Q  214 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatc 313  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||    
T  10918922 tgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtc 10918823  T
Q  314 ttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaa 413  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10918822 ttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 10918723  T
Q  414 ctaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  10918722 ttaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 10918660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 9923852 - 9923622
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9923852 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 9923753  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9923752 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 9923653  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    || |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  9923652 aattaaggtgtttaatagtgtttaacctatg 9923622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 212 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 40620186 - 40619907
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40620186 catgaaagttgtaaataattgtgctagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 40620087  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  40620086 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaatctcaaaactagaagtactatgagtta 40619987  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 492  Q
    || |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  40619986 aattaaggtgtttaagagtattatacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 40619907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 42875455 - 42875223
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  42875455 catgaaagttgtagataattaagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 42875356  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42875355 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcgtaactgtttctaagttaatccaaaacttaatgaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 42875256  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42875255 aactagggtgtttaggagtatttaacctatgtt 42875223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 37019325 - 37019095
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  37019325 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 37019226  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  37019225 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttataagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgggttc 37019126  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37019125 aactaaggtgtttaagagtatttaacctatg 37019095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 215 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 3337752 - 3337523
Alignment:
Q  215 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 314  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3337752 gaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttcaatatatgatgaaaatactccaaggaggtct 3337653  T
Q  315 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 414  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  3337652 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaat 3337553  T
Q  415 taaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3337552 taaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 3337523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 457
Target Start/End: Original strand, 15447812 - 15448057
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| | || | | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15447812 catgaaagttgtaggtaattgagttagctttctattggctttggtctgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15447911  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15447912 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactggaagtactatgagttc 15448011  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15448012 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttctgagttgatctt 15448057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 19435093 - 19435326
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  19435093 catgaaagttgtagataactttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagagg 19435192  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19435193 tcttagtgaaattatatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcagtctaaaatttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 19435292  T
Q  412 aactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  19435293 aattaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 19435326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 216 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19609976 - 19609748
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19609976 aaagttgtagataattgagttacctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 19609877  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19609876 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttaaggtataattccaaacctcaaaactagaagtactatcagttcaact 19609777  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19609776 agggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19609748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 10356832 - 10357064
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| || | | ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||     
T  10356832 catgaaagttgtagataatggagttagctttccagtggctttggtgtgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacaccaaggagg 10356931  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10356932 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 10357031  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10357032 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 10357064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16998181 - 16997954
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  16998181 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttaaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 16998082  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||     |||||||| |||||     
T  16998081 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaa-----aagtactatgagttg 16997987  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16997986 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 16997954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 33243692 - 33243924
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |     
T  33243692 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgattttgatttgacttgaaaataatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaagggg 33243791  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  33243792 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 33243891  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || | |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  33243892 aattgaggtgtttaagagtagctaacctatgtt 33243924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 33849398 - 33849102
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  33849398 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaatcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 33849299  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  33849298 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 33849199  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 508  Q
    || |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| | ||||||||    
T  33849198 aattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtttgaagctg 33849102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15114878 - 15114648
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  15114878 catgaaagttgtagataatttagttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcaaagtagg 15114779  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  15114778 tcttagtgaaatttat-gaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagttt 15114680  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15114679 aattaaggagtttaagagtatttaacctatgt 15114648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 212 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 33186557 - 33186312
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  33186557 catgaaagttgtagataattttgttagctttccagtggctttggtttgactcgaaaataatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaga 33186458  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  33186457 tcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataacattttctaagttagtccaaaacttatggaataactccaaccctcaaaattagaagtactatgagttc 33186358  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33186357 aattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatctt 33186312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14549282 - 14549050
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||     
T  14549282 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaagtactccatggagg 14549183  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14549182 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaagactagaagtactatgagttc 14549083  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14549082 aactagggtgtttaagagtatttagcctatgtt 14549050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 212 - 467
Target Start/End: Original strand, 16277723 - 16277978
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  16277723 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaacggctttggtttgactcgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 16277822  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    | ||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  16277823 ttttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 16277922  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 467  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  16277923 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 16277978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 212 - 467
Target Start/End: Original strand, 53387333 - 53387588
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  53387333 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 53387432  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||    
T  53387433 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaattagaagtaatatgagttc 53387532  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 467  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  53387533 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 53387588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 212 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3485564 - 3485347
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| | || | || |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3485564 catgaaagttgtagataattgtgttagttttctagtggcgtcagtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaga 3485465  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||     
T  3485464 tcttagtgaa--ttgttaaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattc-caaccccaagactagaagtactaggagttt 3485368  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtat 432  Q
    || |||||| |||||||||||    
T  3485367 aattaaggtgtttaagagtat 3485347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 216 - 400
Target Start/End: Original strand, 15011913 - 15012097
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||  || | | |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  15011913 aaagttgtagataattaagttagctttcccgtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctt 15012012  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagt 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15012013 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagt 15012097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 440 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 17333542 - 17333352
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||    
T  17333542 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataataatactgatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt----gttagta 17333447  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaa--gttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17333446 atgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgattaagtgttgttgattattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 17333352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Original strand, 13591785 - 13591987
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| || ||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||    ||    
T  13591785 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttgttag----ta 13591880  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13591881 atgtgatatagttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatattttgagatgtttatgtgct 13591980  T
Q  640 gcctatg 646  Q
    |||||||    
T  13591981 gcctatg 13591987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 19566315 - 19566546
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  19566315 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 19566414  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  19566415 tcttactgaaattttgtgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 19566513  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19566514 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19566546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 46740854 - 46740619
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||      
T  46740854 catgaaagttgtagataattttgttagctttccagtgactttggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgataaaaatactccaaagacg 46740755  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  46740754 tcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 46740656  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  46740655 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatga 46740619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 440 - 642
Target Start/End: Original strand, 32306854 - 32307052
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || |  ||| ||||||||| ||| ||||||||||    ||    
T  32306854 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattattgatgttcagtaagtctgatataatatggtttgatgttgatag----ta 32306949  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  32306950 atgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttaatattgttatatcttgagatgtttatgtgct 32307049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 40229959 - 40229723
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  40229959 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaggagg 40229860  T
Q  312 tctt-agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||    
T  40229859 tcttaagtgaaattttatgaaaattctgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagtt 40229761  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40229760 caattaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 40229723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14630482 - 14630250
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  14630482 catgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14630383  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14630382 tcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14630283  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14630282 aattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 14630250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15344531 - 15344297
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  15344531 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 15344432  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||||| ||| |   || |||  ||||| ||  | |||||| ||||||    
T  15344431 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttatggattgtctccaaa-ttcaaagct-tatgtactatgagttc 15344334  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15344333 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 15344297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 213 - 436
Target Start/End: Original strand, 10237895 - 10238117
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  10237895 atgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggt 10237994  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||| ||||| |    
T  10237995 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttaa 10238093  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaa 436  Q
    | ||| || |||||||||||||||    
T  10238094 attaatgtgtttaagagtatttaa 10238117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11425601 - 11425379
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||| |  | | ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  11425601 catgaaagttgtagatgattgagttagctttccagtagctttggttttacgtgcaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggagg 11425502  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  11425501 tcttagtgaaa----------attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttc 11425412  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11425411 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 11425379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 440 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 14825730 - 14825551
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||    
T  14825730 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttga----tagta 14825635  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  14825634 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 14825551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 213 - 443
Target Start/End: Original strand, 15214442 - 15214672
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |  |    
T  15214442 atgaaagttttaattaattttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaattaccccaagcaagt 15214541  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    ||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  15214542 cttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaatatttccaaacctcgaaactggaagtactaggagttta 15214641  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    | ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  15214642 attaagaggtttaagagtatttaacctatgt 15214672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 446 - 645
Target Start/End: Original strand, 26050340 - 26050534
Alignment:
Q  446 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 545  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| |    
T  26050340 tgagttgatccttgggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcaatgagtctgatataatatgatttgatgttgatag----taatgtga 26050435  T
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctat 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26050436 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttttgtgctgcctat 26050534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 215 - 448
Target Start/End: Original strand, 44024003 - 44024235
Alignment:
Q  215 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 314  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  || | | |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  44024003 gaaagttgtagataattgtgttagatttcccgtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtttctgagttattatgaaaatactccaaggaggtct 44024102  T
Q  315 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 414  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||||     
T  44024103 tagtgaaattttatgaaaattccgcataactgtttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaat 44024201  T
Q  415 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44024202 taaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 44024235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 25513397 - 25513167
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  25513397 atgaaagttgtagataattgtgttagctttccattgactttggttcgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggt 25513298  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||  |   |  |||||||||| || |  |||||| |||||||    
T  25513297 cttagtgaaattttatgaaagttccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgggttgtcttcaaacctcaaagcttg-tgtactacgagttca 25513199  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25513198 attacggtgtttaagaatatttaacctatgtt 25513167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 318 - 463
Target Start/End: Original strand, 15883917 - 15884062
Alignment:
Q  318 tgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa 417  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  15883917 tgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttgatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa 15884016  T
Q  418 ggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggt 463  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  15884017 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggt 15884062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Original strand, 17048086 - 17048195
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17048086 gtaatgtaatatatttgtacatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 17048185  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  17048186 gctgcctatg 17048195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 16026325 - 16026482
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  16026325 catgaaagttttagataattgtgctagctttccagtggcttcagtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 16026424  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  16026425 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataagtatttctaagttaacccaaaactta 16026482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 55582847 - 55582703
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  55582847 catgaaagttttagataatcgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaga 55582748  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtt 356  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  55582747 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtt 55582703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 212 - 445
Target Start/End: Original strand, 45314733 - 45314965
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | ||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  45314733 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgagtctggtttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 45314832  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||  ||| |   || |||| ||||| || |  | | || ||||||    
T  45314833 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttgtggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcattatgagttc 45314931  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtta 445  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45314932 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtta 45314965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26445540 - 26445309
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  | | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  26445540 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtagctttggtttgaattgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 26445441  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| || |||    
T  26445440 tcttggtgaaattttatgaaaatttcggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgatttc 26445342  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26445341 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 26445309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 355
Target Start/End: Original strand, 18108274 - 18108417
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18108274 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggtgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 18108373  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 355  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18108374 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagt 18108417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 2425017 - 2425248
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||     
T  2425017 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaactactccaaggagg 2425116  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||  |||||  | |  | |||| ||||||    
T  2425117 tcttagtgaaattttatgaaatttccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaaggttg-tgcactatgagttc 2425215  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2425216 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 2425248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 535 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 16043183 - 16043087
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 631  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16043183 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 16043087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15534777 - 15534658
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  15534777 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15534678  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  15534677 tcttagtgaatttttatgaa 15534658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 440 - 642
Target Start/End: Original strand, 14852734 - 14852933
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||  ||||||||||||| | |||| |||    ||    
T  14852734 atgttataagttgacccttggggtgggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttag----ta 14852829  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgc 638  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14852830 atgtgatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgc 14852929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 49547340 - 49547459
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  49547340 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 49547439  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||| |||| |||| ||||    
T  49547440 tcttaatgaatttttatgaa 49547459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14049173 - 14049054
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||     
T  14049173 catgaaagttgtatataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatcataaaaatactccaaggagg 14049074  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  14049073 tcttagtgaatttttatgaa 14049054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Original strand, 15041911 - 15042023
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  15041911 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattgatatatcttaagatgttta 15042010  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     ||||||| ||||    
T  15042011 tgtgctgcatatg 15042023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 15112513 - 15112401
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  15112513 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattgatatatcttaagatgttta 15112414  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     ||||||| ||||    
T  15112413 tgtgctgcatatg 15112401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36038466 - 36038347
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||     
T  36038466 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgataaaaatactcaaaggagg 36038367  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  36038366 tcttagtgaatttttatgaa 36038347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 12033341 - 12033459
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  12033341 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 12033440  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  12033441 cttagtgaatttttatgaa 12033459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 646
Target Start/End: Original strand, 14746570 - 14746644
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14746570 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctacctatg 14746644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 339
Target Start/End: Original strand, 22725494 - 22725608
Alignment:
Q  225 gataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatt 324  Q
    |||||||||||||||||||||| | | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||     
T  22725494 gataattttgttagctttccaaaggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaagtcttactgaaatc 22725593  T
Q  325 ttttgaaaattcagc 339  Q
    || ||||||||||||    
T  22725594 ttatgaaaattcagc 22725608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 44615883 - 44615765
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  44615883 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 44615784  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  44615783 cttagtgaatttttatgaa 44615765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 547 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 40907230 - 40907134
Alignment:
Q  547 atatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 643  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  40907230 atatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatgttgattatcatttgatatttttatatcttgagatgtttatgtgttgcct 40907134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 374 - 508
Target Start/End: Original strand, 43251120 - 43251255
Alignment:
Q  374 ataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtattt-aagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgga 472  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||  |||| |    
T  43251120 ataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggataacaatgaa 43251219  T
Q  473 ggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 508  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43251220 agttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctg 43251255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Original strand, 20595827 - 20596056
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||  | | ||||||||| |||| | | |||||||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  20595827 catgaaagttttagatacatgtattagctttctaatggctttggtttgacatgaaaataatttttagattttgagttatgatgaaaatacttcaagtagg 20595926  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||| || || ||||||| ||  | || | ||||||||||||| | |||  |||||||||    
T  20595927 tcttggtgaaattttacgaaaattcagcataattatttgtaagtcaaccccaaacttatggtttgatgccaaacctcaaaacttg-agttataggagttc 20596025  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    || || | | |||||||||||||||||||||    
T  20596026 aattatgatgtttaagagtatttaacctatg 20596056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 535 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 40907084 - 40906987
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40907084 tagtaatgtgatatagttatatatgcatgatgtggattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 40906987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 376 - 477
Target Start/End: Original strand, 9871126 - 9871226
Alignment:
Q  376 aattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggt 475  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| ||    
T  9871126 aattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtttatc-ttgggataggaatggaagt 9871224  T
Q  476 tg 477  Q
    ||    
T  9871225 tg 9871226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 442 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 15792034 - 15791857
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgat-ctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 540  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| | | | ||  ||| ||||| ||||||| |||||| ||     |||    
T  15792034 gttatgagttgatcattgaggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtctgatataa-atgatttgatgttgttaa----taa 15791940  T
Q  541 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatct 622  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  15791939 tgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatacaagatgtttaagttgatgttgaattatcctttgatattgttatatct 15791857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14185538 - 14185426
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | | ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||     
T  14185538 catgaaagttgtagataagtgtgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggagg 14185439  T
Q  312 tcttagtgaaatt 324  Q
    |||||| ||||||    
T  14185438 tcttagcgaaatt 14185426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 30147511 - 30147392
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||  ||     
T  30147511 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggttttacttaaaaatgatttttaacttttgagatatgatggaaatactccaagtagg 30147412  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  30147411 tcttagtgaatttttatgaa 30147392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 50221907 - 50222025
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  50221907 atgaaagttgtagataagtttgttggctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 50222006  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  50222007 cttagtgaatttttatgaa 50222025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 447 - 621
Target Start/End: Original strand, 52243059 - 52243230
Alignment:
Q  447 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaat 546  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||| ||    
T  52243059 gagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataagatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtt---ta-taatgtgat 52243154  T
Q  547 atatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    ||| ||||||||||||||  || |||||||| | |||||| || || |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  52243155 ataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatc 52243230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 15117919 - 15117998
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15117919 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 15117998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 546 - 639
Target Start/End: Original strand, 4831496 - 4831589
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  4831496 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgct 4831589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 546 - 639
Target Start/End: Original strand, 4834791 - 4834884
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  4834791 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgct 4834884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 546 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 14047799 - 14047706
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  14047799 tatattcgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgct 14047706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 559 - 645
Target Start/End: Original strand, 26045268 - 26045353
Alignment:
Q  559 gcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctat 645  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26045268 gcattatgtggattatataagatgtttaagt-gttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttttgtgctgcctat 26045353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29267948 - 29267830
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||   | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  29267948 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttagtgtggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 29267849  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    || |||||| |||| ||||    
T  29267848 ctcagtgaatttttatgaa 29267830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 370
Target Start/End: Original strand, 54364086 - 54364244
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||   |     
T  54364086 catgaaagttttagataattttgttagatttccaatgaatttagtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacactccaagtggg 54364185  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttag 370  Q
    |||| | ||||||||  | ||| | ||||||||| |||| |||| || |||||||||||    
T  54364186 tcttggagaaattttaagtaaacttagcataactatttccaagtcaacccaaaacttag 54364244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 353
Target Start/End: Original strand, 13046041 - 13046182
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||||||||||  ||     
T  13046041 catgaaagttttatataaatttgttagctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgatttttatatttttatttatgatgaaaatactccaagtagg 13046140  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 353  Q
    |||| || |||||||  ||||||||| ||||||  |||||||    
T  13046141 tcttggtaaaattttacgaaaattcaacataaccatttctaa 13046182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 573 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 14185112 - 14185039
Alignment:
Q  573 atataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  14185112 atatgagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgatgttatatcttgagacgtttatgtgttgcctatg 14185039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 214 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19243294 - 19243177
Alignment:
Q  214 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||   | || ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  19243294 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggagtaaatatgatttttggtttaggtgttatgatgaaaatactccaaggaggtc 19243195  T
Q  314 ttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  19243194 ttagtgaatttttatgaa 19243177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 442 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 26789598 - 26789441
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatg-atctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 540  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||  || | ||  ||| ||||| || |||| |||||    | || |||    
T  26789598 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatgttgtagatgtttcagagagtctgatataa-ataatttgatgtt----gttaataa 26789504  T
Q  541 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgtttaagttgatgttgattat 602  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789503 tgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattat 26789441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 7640753 - 7640832
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  7640753 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 7640832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Original strand, 1837086 - 1837160
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1837086 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 1837160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 546 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 30146546 - 30146462
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 630  Q
    |||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30146546 tatatttgcaaatgcattaagtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 30146462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 371 - 441
Target Start/End: Original strand, 13036332 - 13036402
Alignment:
Q  371 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||||||||||||||    
T  13036332 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctat 13036402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12622927 - 12622792
Alignment:
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  12622927 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgt-gtactatgagttc 12622829  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12622828 aattaaggtgtttaagagtatttaacctattttatga 12622792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14508317 - 14508186
Alignment:
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| | ||| || |  |||||| ||||||    
T  14508317 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttgt-gtactatgagttc 14508219  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14508218 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14508186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 255 - 367
Target Start/End: Original strand, 19081780 - 19081892
Alignment:
Q  255 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 354  Q
    ||||||| | ||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||    
T  19081780 gtttgacatcaaaatgatttttaaattttgagttatgatgaaaacacttcaaggagatcttggtaaaattttacgaaaattcagcataaccgtttccaag 19081879  T
Q  355 ttaatccaaaact 367  Q
    | || ||||||||    
T  19081880 tcaacccaaaact 19081892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 12487734 - 12487675
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12487734 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 12487675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 14954250 - 14954309
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14954250 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 14954309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Original strand, 15497041 - 15497096
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15497041 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatg 15497096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 25689893 - 25689834
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25689893 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 25689834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 27534049 - 27533990
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27534049 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 27533990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Original strand, 18239179 - 18239253
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | || |||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18239179 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtctgtttcacttgaaaatgattttcggtttatgag 18239253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Original strand, 9871071 - 9871128
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaat 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  9871071 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatgactttggtttgacttgaaaat 9871128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 593 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 10712873 - 10712820
Alignment:
Q  593 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10712873 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 10712820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 593 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 10926643 - 10926590
Alignment:
Q  593 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10926643 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 10926590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 281
Target Start/End: Original strand, 44772650 - 44772719
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 281  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44772650 catgaaagttgtagataattgtattatctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggttt 44772719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9886455 - 9886387
Alignment:
Q  158 taggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtaga 226  Q
    ||||||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9886455 taggaaaatcaacttttctaccactttcttttctgaattaggtttgggagtattcatgaaagttgtaga 9886387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 298
Target Start/End: Original strand, 17376062 - 17376148
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg-acatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  17376062 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttaggttt-acttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaa 17376148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18247829 - 18247739
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  18247829 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18247739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Original strand, 22355079 - 22355169
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  22355079 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22355169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 47357273 - 47357183
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  47357273 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggccttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 47357183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 531
Target Start/End: Original strand, 54798627 - 54798713
Alignment:
Q  445 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 531  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  54798627 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgat 54798713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Original strand, 49547744 - 49547781
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49547744 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 49547781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 264
Target Start/End: Original strand, 14873653 - 14873705
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttg 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14873653 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttg 14873705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14951360 - 14951296
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  14951360 catgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 14951296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 4561417 - 4561476
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  4561417 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 4561476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 5757021 - 5757080
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  5757021 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 5757080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 9556553 - 9556494
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  9556553 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 9556494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13234618 - 13234547
Alignment:
Q  156 cataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagat 227  Q
    |||||||||||||| | || ||  | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13234618 cataggaaaatcaattgttctgtcactttatgttccgaattaggtttggtagtcttcatgaaagttgtagat 13234547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 14280557 - 14280474
Alignment:
Q  448 agttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 531  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  14280557 agttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgat 14280474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 14757505 - 14757564
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  14757505 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 14757564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 19857636 - 19857581
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||    
T  19857636 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgtctatg 19857581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Original strand, 17146303 - 17146389
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  17146303 aaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 17146389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 33742401 - 33742355
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33742401 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgttta 33742355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 14048769 - 14048732
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14048769 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 14048732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 293
Target Start/End: Original strand, 15287878 - 15287959
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   ||||||||||||    
T  15287878 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 15287959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 293
Target Start/End: Original strand, 15294988 - 15295069
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   ||||||||||||    
T  15294988 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 15295069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 399 - 444
Target Start/End: Original strand, 26922254 - 26922299
Alignment:
Q  399 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26922254 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 26922299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 36038062 - 36038025
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36038062 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 36038025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 587 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 17810295 - 17810251
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 631  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17810295 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtt 17810251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 55377205 - 55377269
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  55377205 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 55377269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12230551 - 12230500
Alignment:
Q  177 ggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagata 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  12230551 ggaattttcggttctgaattaggatttggtgtcttcatcaaagttgtagata 12230500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 479 - 576
Target Start/End: Original strand, 44928821 - 44928914
Alignment:
Q  479 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||| |   || || ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  44928821 atataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgtt---ta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 44928914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Original strand, 52873148 - 52873203
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| || |||||    
T  52873148 gatgttgattattatttgatgttgttataccttgaggtgtttaagtgttggctatg 52873203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 10643836 - 10643746
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  10643836 catgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggttttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 10643746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19020099 - 19020009
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  19020099 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 19020009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 510
Target Start/End: Original strand, 8574742 - 8574807
Alignment:
Q  445 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 510  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8574742 atgagttggtctttagggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctatgaagctgtt 8574807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 443
Target Start/End: Original strand, 12134425 - 12134486
Alignment:
Q  382 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  12134425 aaacttcaaaactaaaagtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 12134486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 15534373 - 15534336
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15534373 gatgttgattaccatttgatgttgttatattttgagat 15534336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 479 - 524
Target Start/End: Original strand, 20157189 - 20157234
Alignment:
Q  479 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaa 524  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  20157189 atatgatattaatgatgatctgtgaagttgttatatgatgatttaa 20157234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 479 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 44102433 - 44102404
Alignment:
Q  479 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102433 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 44102404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 5683375 - 5683439
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||| |  |||||||||||    
T  5683375 catgaaagttttaggtaattttgttagctttccaatggttttggtttgacgtccaaatgattttt 5683439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8374130 - 8374094
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8374130 catgaaagttgtagataattttgttaactttctaatg 8374094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12622968 - 12622936
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttcc 244  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12622968 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcc 12622936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14995734 - 14995670
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  14995734 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgattttt 14995670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16731766 - 16731702
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| || |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  16731766 catgaaagttttagataattatgttagctctctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 16731702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18168383 - 18168347
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18168383 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 18168347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 535 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 19738418 - 19738310
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 634  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||| | ||| ||||   || | |||||||| |  |||||||||||     
T  19738418 tagtaatgttatatagttatatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttattcattaacgttgttatgttgtgagatgtttat 19738319  T
Q  635 gtgctgcct 643  Q
    |||||||||    
T  19738318 gtgctgcct 19738310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 138)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 27472969 - 27472479
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27472969 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcattaaagttgtagataattttgttagctttccagtgaaa 27472870  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 351  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27472869 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 27472770  T
Q  352 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27472769 aagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttatgagtt 27472670  T
Q  452 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 551  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||    
T  27472669 gatccttggggtaggactggaggttgaatataatattactaatgatctgtgaagctgttaaaatatgatttaatgttga----tagtaatataatatatt 27472574  T
Q  552 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27472573 tgtatatgcattatgtgaattatataatatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgtctatg 27472479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 646
Target Start/End: Original strand, 34873783 - 34874273
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34873783 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttggaagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggca 34873882  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 351  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  34873883 ttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttct 34873982  T
Q  352 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34873983 aagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagtt 34874082  T
Q  452 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 551  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| |||||||||||    
T  34874083 gatccttgggataggaatggaggttgaatataatattactgatgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----aagtattgtaatatatt 34874178  T
Q  552 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34874179 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtgccgcctatg 34874273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Original strand, 21081367 - 21081797
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21081367 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttaaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21081466  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21081467 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21081566  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21081567 aattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtaggaatggaggatgaatataatattactgatgatatgtgaagctgtta 21081666  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21081667 taatatgatttaatgttga----tactaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 21081762  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21081763 tttttatatctttagatgtttacgtgctgcctatg 21081797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Original strand, 18358365 - 18358794
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18358365 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgttttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18358464  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18358465 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 18358564  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  18358565 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaccgatgatctgcgaagctgtta 18358664  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    | |||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18358665 t-atatgatttaatgttga----tagtaatgtattatatttgtatatgcaatatgtgaattatataagatgcttaagttgatgttgattattatttgatg 18358759  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  18358760 ttgttatatcttgagatgtttaagtaccgcctatg 18358794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 212 - 620
Target Start/End: Original strand, 22173424 - 22173828
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  22173424 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgggtttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 22173523  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||    
T  22173524 tcttagtgaaaccttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaccctcaaaactcaaagtactatgagttc 22173623  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22173624 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 22173723  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22173724 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattaagtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatg 22173819  T
Q  612 ttgttatat 620  Q
    |||||||||    
T  22173820 ttgttatat 22173828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 152 - 489
Target Start/End: Original strand, 34858721 - 34859058
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34858721 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttggaagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggca 34858820  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 351  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  34858821 ttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttct 34858920  T
Q  352 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34858921 aagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagtt 34859020  T
Q  452 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatatta 489  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34859021 gatccttgggataggaatggaggttgaatataatatta 34859058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Original strand, 19662051 - 19662481
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  19662051 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 19662150  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  19662151 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 19662250  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  19662251 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 19662350  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  19662351 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgata 19662446  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19662447 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 19662481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Original strand, 21073123 - 21073553
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  |      
T  21073123 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaag 21073222  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||||    
T  21073223 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaatactcaaaactagaagcaatatgagttc 21073322  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  21073323 aattaaggtatttcagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 21073422  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21073423 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatattcattatgtggattatataagatatttaagttgatgttgattatcatttgata 21073518  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21073519 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcatatg 21073553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 9242416 - 9241986
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||    
T  9242416 catggaagttttagataattttgttagcttcccaatggctttggtttgactttaaagtgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaga 9242317  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  9242316 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 9242217  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| || |  ||||| |   |||    | ||    
T  9242216 aactaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttgatgttgaatgagtaagata 9242117  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9242116 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgata 9242021  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9242020 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 9241986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 152 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20915821 - 20915525
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  |     
T  20915821 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttatgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagatttagataattttgttagttttccaattgct 20915722  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 351  Q
    | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||     
T  20915721 ttggtttgacttgaaaatgattcttattttttgagatatgatgaaaatactccaatgatatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttcc 20915622  T
Q  352 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20915621 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagctgtttaagagtatttaacctatgctatga 20915525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Original strand, 6260774 - 6261205
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  6260774 catgaaagttgtagataattttgttaactttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 6260873  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||      
T  6260874 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaaatattacgagtga 6260973  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  6260974 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 6261073  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata-tgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 610  Q
    |||||| |||| |||||    | ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6261074 taatataatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatattgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgat 6261169  T
Q  611 gttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6261170 attgttatatcttgagacgtttatgtgctgcctatg 6261205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 212 - 476
Target Start/End: Original strand, 41301369 - 41301633
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  41301369 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaagtgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 41301468  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41301469 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttc 41301568  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 476  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  41301569 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtt 41301633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 26903814 - 26903561
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  26903814 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 26903715  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26903714 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttc 26903615  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  26903614 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtgagttggtcattggggtag 26903561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 23969019 - 23969251
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |  |||     
T  23969019 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatacgatgaaaataattaatggagg 23969118  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23969119 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 23969218  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23969219 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 23969251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 21915278 - 21915025
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| | ||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||     
T  21915278 catgaaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttggcgtgaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggagg 21915179  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21915178 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21915079  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  21915078 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 21915025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 212 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 25183843 - 25183603
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25183843 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25183744  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  25183743 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtattatgagttc 25183644  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttg 452  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25183643 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 25183603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 216 - 444
Target Start/End: Original strand, 43707685 - 43707912
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43707685 aaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 43707784  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  43707785 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccg-ttctaagttaatctaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtaccatgagttcaatt 43707883  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  43707884 aaggtgtttaagattatttaacctatgtt 43707912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 213 - 444
Target Start/End: Original strand, 24273656 - 24273887
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  24273656 atgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacctgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 24273755  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24273756 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 24273855  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24273856 attaaggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 24273887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 9975585 - 9975353
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9975585 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 9975486  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9975485 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 9975386  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9975385 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 9975353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 24781236 - 24781468
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24781236 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 24781335  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24781336 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 24781435  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24781436 aactagggtgtttaagaatatttaacctatgtt 24781468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 316 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 31345495 - 31345176
Alignment:
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  31345495 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttataggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 31345396  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 515  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  31345395 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattattgatgatttgtgaagctattataat 31345303  T
Q  516 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 615  Q
    |||| ||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31345302 atgaattagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgt 31345207  T
Q  616 tatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31345206 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 31345176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24884042 - 24883785
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24884042 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24883943  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24883942 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccctttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaattactatgagttc 24883843  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  24883842 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtagtgagttgatc-ttgggataggaatg 24883785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 31520773 - 31520509
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31520773 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 31520674  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||  |||||||| ||||||    
T  31520673 tcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactgaaagtactatgagttc 31520574  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| ||||    
T  31520573 aattaaggtgtttaagagtatttaactcatgttgtgagtttatc-ttgggataggaatggaagttg 31520509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 5031526 - 5031758
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5031526 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 5031625  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5031626 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttc 5031725  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| | | |||||||||||||||| ||||||    
T  5031726 aactaggctgtttaagagtatttaacatatgtt 5031758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 27484866 - 27485098
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||     
T  27484866 catgaaagatgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaagtagg 27484965  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27484966 tcttagtggaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 27485065  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27485066 aactagggtgtttaagagtatttaacatatgtt 27485098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 36839827 - 36839595
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||   | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  36839827 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggatttggttttacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 36839728  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36839727 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 36839628  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36839627 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 36839595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 212 - 459
Target Start/End: Original strand, 18388693 - 18388940
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18388693 catgaaagttgtagataattgggttagctttccagtgactttggtttgacttaaaaatgatttatggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18388792  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18388793 tcttagtgaaatctttggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 18388892  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttg 459  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||  |||||  |||||||| ||||    
T  18388893 aattaaggtgtttaagagtattttactcatgttgagagttgatttttg 18388940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 508
Target Start/End: Original strand, 23338796 - 23339092
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  23338796 catgaaagttgtagataattttactagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 23338895  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23338896 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 23338995  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 508  Q
    || |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  23338996 aattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtgtgaagctg 23339092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 213 - 457
Target Start/End: Original strand, 10039531 - 10039775
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  10039531 atgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggt 10039630  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10039631 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 10039730  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    | |||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||    
T  10039731 attaaggtgtttaagagtatttaatccatgatgtgagttgatctt 10039775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17307143 - 17306911
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | || | | |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||     
T  17307143 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17307044  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17307043 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttcttagttaatccaaaacttaaggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttc 17306944  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  17306943 aactaaggtgtttaagatcatttaacatatgtt 17306911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21368763 - 21368532
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||   | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  21368763 catgaaagttttagataattgtgttagctttccggtggatttggtttggcttgaaaatgagttttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 21368664  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21368663 tcttagtgaaattttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaaattatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 21368564  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  21368563 aaataagaggtttaagagtatttaacctatgt 21368532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Original strand, 19201596 - 19201828
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa-tactccaatgag 310  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  19201596 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatatgtggttcttgagatatgatgaaaaatactccaaggag 19201695  T
Q  311 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19201696 gtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatttaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 19201795  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
     || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19201796 taattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 19201828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 450
Target Start/End: Original strand, 20590718 - 20590956
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  20590718 catgaaagctgtagataattttgttatctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 20590817  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  20590818 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttaagggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 20590917  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagt 450  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20590918 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagt 20590956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 216 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6483171 - 6482946
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  || ||||    
T  6483171 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtctt 6483072  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagttcaac 414  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || |||||     
T  6483071 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaat 6482972  T
Q  415 taaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  6482971 taaggtgtttaagagtatttaaccta 6482946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 216 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6486638 - 6486413
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  || ||||    
T  6486638 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtctt 6486539  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagttcaac 414  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || |||||     
T  6486538 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaat 6486439  T
Q  415 taaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  6486438 taaggtgtttaagagtatttaaccta 6486413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 9785238 - 9785013
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  9785238 catgaaagttgttgataattgtgttagctttcaagtggcgttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 9785139  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9785138 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagaactaggagttt 9785039  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||    
T  9785038 aattaaggggtttaacagtatttaac 9785013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 212 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 28349573 - 28349268
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||     
T  28349573 catgaaagttttagataattttgttagctttgcaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatggaaatactccaagtagg 28349474  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta-ggga--------ataattcaaaacctcaaaactagaagtac 402  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28349473 tcttcgtgaaatcttatgaaaattcagctcaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataattccaaagctcaaaactagaagtac 28349374  T
Q  403 taggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtg 502  Q
    || |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  |||||||||||||||||||    
T  28349373 tatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgatttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaatgatgatctgtg 28349274  T
Q  503 aagctg 508  Q
    ||||||    
T  28349273 aagctg 28349268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 215 - 437
Target Start/End: Original strand, 23068849 - 23069071
Alignment:
Q  215 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 314  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||| | || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  23068849 gaaagttgtagataattgagtttgttttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtaggtct 23068948  T
Q  315 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 414  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||     
T  23068949 tagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactataagtactaagagtttaat 23069048  T
Q  415 taaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    |||||  ||||||||||||||||    
T  23069049 taaggggtttaagagtatttaac 23069071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 212 - 437
Target Start/End: Original strand, 28652898 - 28653123
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||| || || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||     
T  28652898 catgaaagttgtagataattgagttagattttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggagg 28652997  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28652998 tcttagtgaaatcttatggaaattcagcataaccgtttttaggttaatccgaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 28653097  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28653098 aactagggtgtttaagagtatttaac 28653123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24515842 - 24515610
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||     
T  24515842 catgaaagttgtagatagttgagttagctttccagtgtctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttctttagatatgatgaaaatactccaaggagg 24515743  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24515742 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataatcgtttctacgttaatccaaaacttaaggaataaattcaaatctcaaaactagaagtactatgagttc 24515643  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24515642 aattaaggtgtttaagagtatttaatctatgtt 24515610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 346 - 646
Target Start/End: Original strand, 30643811 - 30644107
Alignment:
Q  346 gtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtta 445  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||| ||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  30643811 gtttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttg 30643910  T
Q  446 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 545  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | |||||||  |||| |||||| |||    |||||  |    
T  30643911 tgagttgaccattagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatacaatttgatgttgttag----taatgaga 30644006  T
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctat 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30644007 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagtagatattgattatcatttgatattgttatatcttgagacgtttatgtgctgcctat 30644106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22690336 - 22690101
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  22690336 catgaaagttggagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22690237  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||   ||  |||||| ||||||    
T  22690236 tcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtcag-tgtactatgagttc 22690138  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22690137 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatga 22690101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22694932 - 22694697
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  22694932 catgaaagttggagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22694833  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| |||||   ||  |||||| ||||||    
T  22694832 tcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtcag-tgtactatgagttc 22694734  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22694733 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatga 22694697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 442 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 34137200 - 34137000
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 541  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||| || ||||  ||| ||||||||||| | |||||     ||||||||    
T  34137200 gttatgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattgttaatgttcagtgagtctgatataatatgatgtgatgtta----ctagtaat 34137105  T
Q  542 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgc 641  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  34137104 gtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatctcttgagatgtttatgtgttgc 34137005  T
Q  642 ctatg 646  Q
    |||||    
T  34137004 ctatg 34137000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 26392643 - 26392442
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||  ||      
T  26392643 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgttctgtgaatttgttattacatgatctaatgttgatagaaag-- 26392546  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
      || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  26392545 --gtgatatatttgtatatgcattatgtggattagataagatgtttaag-tattgttgattattatttgatattgttatatcctgagatgtttatgcact 26392449  T
Q  640 gcctatg 646  Q
    |||||||    
T  26392448 gcctatg 26392442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 21316058 - 21316289
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |  ||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  21316058 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtccttcgtttgacgtgaaaataatatttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagg 21316157  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  21316158 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcttaactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 21316256  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21316257 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 21316289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 215 - 444
Target Start/End: Original strand, 21335852 - 21336080
Alignment:
Q  215 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  21335852 gaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtct 21335951  T
Q  315 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 414  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||  || ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||||     
T  21335952 tagtgaagttttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaagctatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaat 21336050  T
Q  415 taaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21336051 taagatgtttaagagtatttaacctatgtt 21336080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 513 - 646
Target Start/End: Original strand, 23069215 - 23069344
Alignment:
Q  513 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 612  Q
    |||||||||| |||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  23069215 aatatgatttgatgttgatggc----aatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatat 23069310  T
Q  613 tgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23069311 tgttatatcttgagatgtttacgtgctacctatg 23069344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29113975 - 29113786
Alignment:
Q  254 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||    
T  29113975 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactattcctaa 29113876  T
Q  354 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || |||||||||| ||| |  ||| |||| |||||| | |  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29113875 gtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaatttg-tgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 29113786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 1384082 - 1384239
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  1384082 catgaaagttgtagataattgtattagctttccagtggctttggattgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaacgagg 1384181  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  1384182 tcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaagtcaactcaaaactta 1384239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 212 - 467
Target Start/End: Original strand, 2524143 - 2524380
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |       
T  2524143 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagg--- 2524239  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa-gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
                 || |||||||||||||||||    ||||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2524240 -------------ttatgaaaattcagcataacc---tctaaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactatgagtt 2524323  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 467  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  2524324 caatcaaggtatttaagagtatttaacctatgttgtgagttgacctttagggtagga 2524380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22686495 - 22686264
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||     
T  22686495 catgaacgttttagatatttttattagctttccaatggctttggtttgacttgaatatgatttttggtttttgaggtatgatgaaaacactctaagtagg 22686396  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| | || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  22686395 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcacaactatttctaattcaacccaaaacttatggattgtctcgaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 22686297  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22686296 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22686264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 440 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 23287625 - 23287438
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| || |||||| | |||    |||||    
T  23287625 atgttgtgagttgatccttagggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtggatctgttataacattatttaacgatga----tagta 23287530  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23287529 atgtgatatatttgtatatgcaatatgtggattatatatgatgattaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 23287438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 9784848 - 9784741
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9784848 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag--gttgttgattatcattggatgttgttatatcttgagatgtttatgt 9784751  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  9784750 gctgcctatg 9784741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 223 - 369
Target Start/End: Original strand, 25587094 - 25587240
Alignment:
Q  223 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25587094 tagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 25587193  T
Q  323 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    |||| |||||||||  ||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  25587194 ttttatgaaaattccacataactatttctaggtcaacccaaaactta 25587240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 440 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 23005012 - 23004835
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    | || |     
T  23005012 atgttatgagttgatcctttgggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttatactatgatttaacgtt----gttaatg 23004917  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| || |||||||    
T  23004916 atgttaaatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 23004835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20261815 - 20261696
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  20261815 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 20261716  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  20261715 tcttagtgaatttttatgaa 20261696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 182 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22332402 - 22332142
Alignment:
Q  182 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 281  Q
    |||||||| |||||| | ||| |||||   ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||||| | ||    
T  22332402 tttctgttttgaattggcttttggagtgaacataaatgttttagataattgtgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaaatgatttttagatt 22332303  T
Q  282 ttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattca 381  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |  |||     
T  22332302 ttgagttatggcgaaaacactccaatgaggtcttggtg-aattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttcc 22332204  T
Q  382 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||| |||||| | |  |||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22332203 aaacttcaaaaattg-tgtactatgagttcaattaaggtgttcaagagtatttaacctatgtt 22332142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 10684329 - 10684448
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  10684329 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagttttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 10684428  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  10684429 tcttagtgaatttttatgaa 10684448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 535 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 21237924 - 21237818
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21237924 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgatgaattattatttgatattgttatatcttgagatgttta 21237825  T
Q  634 cgtgctg 640  Q
     ||||||    
T  21237824 tgtgctg 21237818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 23778691 - 23778849
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||     
T  23778691 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggagg 23778790  T
Q  312 tcttagtgaaattttttg-aaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    | |||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  23778791 ttttagtgaaattttacgaaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaacctta 23778849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Original strand, 19201924 - 19202036
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19201924 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 19202023  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     ||| ||||||||    
T  19202024 tgtgttgcctatg 19202036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 440 - 621
Target Start/End: Original strand, 20520051 - 20520227
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||    | | || ||    
T  20520051 atgttatgagtttatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgataatctgtgaagttgttataagatgatttgatg----tcgttaata 20520146  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  20520147 atgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 20520227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38968075 - 38967956
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  38968075 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttttgtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 38967976  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  38967975 tcttagtgaatttttatgaa 38967956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 572 - 646
Target Start/End: Original strand, 23707275 - 23707349
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707275 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 23707349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 572 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 24918244 - 24918170
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918244 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 24918170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 354
Target Start/End: Original strand, 28345472 - 28345614
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || | | | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||     
T  28345472 catgaaaattttagataattgtgttagctttccagtggctttgattttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaaggagg 28345571  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 354  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  28345572 tcttggtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaag 28345614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 255 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23610089 - 23609901
Alignment:
Q  255 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 354  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||    
T  23610089 gtttgacttgaaaatgatttacgatttttgagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttagtgaaattttatgcaaattctgcataactatttctaag 23609990  T
Q  355 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | || ||||||| || ||| |   || |||| ||||| || |  |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23609989 tcaacccaaaacctatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 23609901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 40911979 - 40911868
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  | | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40911979 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtagctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaatgaga 40911880  T
Q  312 tcttagtgaaat 323  Q
    ||||||||||||    
T  40911879 tcttagtgaaat 40911868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 24681548 - 24681474
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681548 tatatatgatgtttaagttgatgttgatcatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 24681474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 440 - 631
Target Start/End: Original strand, 18546803 - 18546991
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || || |  ||||| |||||||   || ||||||||  ||| |||||| |||    ||    
T  18546803 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattttagtactgttgatgttctgtgagtttgatataatatattttgatgttgttag----ta 18546898  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 631  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||    
T  18546899 atgtgatacatttgtatatgcattatgtaaattaatgtaagatgtctaagttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgtt 18546991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 216 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31345771 - 31345661
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || || | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31345771 aaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 31345672  T
Q  316 agtgaaattttt 327  Q
    ||| ||||||||    
T  31345671 agt-aaattttt 31345661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 24671129 - 24671055
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24671129 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtactgcctatg 24671055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 24897763 - 24897881
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |    
T  24897763 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24897862  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24897863 cttagtgaatttttatgaa 24897881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 24900246 - 24900364
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |    
T  24900246 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24900345  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24900346 cttagtgaatttttatgaa 24900364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 24902723 - 24902841
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |    
T  24902723 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24902822  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24902823 cttagtgaatttttatgaa 24902841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 24905200 - 24905318
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |    
T  24905200 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24905299  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24905300 cttagtgaatttttatgaa 24905318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 24907675 - 24907793
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |    
T  24907675 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggt 24907774  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24907775 cttagtgaatttttatgaa 24907793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22255868 - 22255777
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 303  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22255868 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactc 22255777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 440 - 584
Target Start/End: Original strand, 22412994 - 22413134
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    | || ||    
T  22412994 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgttaatctgtgaagctgttataagatgatttgatgtt----gttaata 22413089  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 584  Q
    |||| |||||  |||||||||||||  |||||||| || ||||||    
T  22413090 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgtt 22413134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 362 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 22501374 - 22501260
Alignment:
Q  362 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggg 461  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  22501374 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttgatc-ttggg 22501276  T
Q  462 gtaggaatggaggttg 477  Q
     |||||||||| ||||    
T  22501275 ataggaatggaagttg 22501260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 362 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 22509308 - 22509194
Alignment:
Q  362 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggg 461  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  22509308 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttgatc-ttggg 22509210  T
Q  462 gtaggaatggaggttg 477  Q
     |||||||||| ||||    
T  22509209 ataggaatggaagttg 22509194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23136174 - 23136056
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  23136174 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 23136075  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  23136074 cttagtgaatttttatgaa 23136056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 442 - 621
Target Start/End: Original strand, 24697467 - 24697641
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 541  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    | || ||||    
T  24697467 gttatgagtagatccttagggtaggagtggaggttgtatttaatattaatgatgatctgtgaagctg-tataatatgattttatgtt----gttaataat 24697561  T
Q  542 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    || |||||  |||||||||||||  |||||| |||| || |||| || || |||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  24697562 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatc 24697641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18809538 - 18809459
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18809538 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 18809459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Original strand, 22786694 - 22786924
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| | |  ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| | || ||| ||||  |      
T  22786694 catgaaagttttagctaattttattagctttccaatggctttagtttgacttaaaaatgttttttagattttgagatatgagggaattaccccaagcaag 22786793  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| || || |||| ||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||||| || ||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  22786794 tcttggtaaatttttgtgaaaatt-tgcataaccgtttctaactcaatccaaaacctatggaacgtttccaaacctcaaaactagaagtattaggagttt 22786892  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    ||   ||  |||  ||||||||||||||||||    
T  22786893 aatcgagagattggagagtatttaacctatgt 22786924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28577694 - 28577615
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28577694 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 28577615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20273012 - 20272855
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  |  | |||| || |||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||  ||     
T  20273012 catgaaagttttagataatctcgttagctttccaatgaatttagattgatttaaaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaagtagg 20272913  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    |||| || || ||||   ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  20272912 tcttggtaaatttttaccaaaattcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaactta 20272855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7187022 - 7186942
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatga 292  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7187022 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatga 7186942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 23711580 - 23711659
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23711580 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 23711659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26505974 - 26505895
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26505974 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26505895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26508452 - 26508373
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26508452 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26508373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 27920331 - 27920410
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27920331 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 27920410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 32039065 - 32039144
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32039065 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 32039144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 571993 - 571919
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  571993 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 571919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 546 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 22703258 - 22703165
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  22703258 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaaattg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgct 22703165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 306
Target Start/End: Original strand, 36734881 - 36734975
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 306  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36734881 catgaaagttttagataatgttgttagatttccaatggctttggtttgacttgaaaatgttttgtgggttttgagttatgatgaaaacactccaa 36734975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 39682909 - 39682835
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 286  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39682909 catgaaagttgtagctaattgtgttagctttccagtggcatcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 39682835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22501456 - 22501375
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 293  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22501456 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttgtagtttttgagatatgat 22501375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22509390 - 22509309
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 293  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22509390 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttgtagtttttgagatatgat 22509309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 562 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 6482899 - 6482838
Alignment:
Q  562 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 623  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  6482899 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttaattaccatttgatattgttatatctt 6482838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 562 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 6486366 - 6486305
Alignment:
Q  562 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 623  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  6486366 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttaattaccatttgatattgttatatctt 6486305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 587 - 651
Target Start/End: Original strand, 41531087 - 41531151
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgctact 651  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  41531087 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttact 41531151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 1283412 - 1283353
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1283412 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 1283353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 546 - 639
Target Start/End: Original strand, 13101597 - 13101691
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat-gttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| || |||||    
T  13101597 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgataatttttatatcttgagatgtctatgtgct 13101691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 30345074 - 30345133
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  30345074 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 30345133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 622
Target Start/End: Original strand, 43947324 - 43947408
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt-taagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 622  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  43947324 taatgtgatatatt-gtatatgcactatgtgaattatatgagatgttgtaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 43947408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 572 - 620
Target Start/End: Original strand, 24642807 - 24642855
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 620  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24642807 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 24642855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23131457 - 23131378
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  23131457 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 23131378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23133924 - 23133845
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  23133924 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 23133845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 34402089 - 34402168
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  34402089 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 34402168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Original strand, 19887294 - 19887384
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  19887294 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 19887384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 484 - 576
Target Start/End: Original strand, 23708521 - 23708609
Alignment:
Q  484 atattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |   || |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23708521 atattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtt---ta-taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23708609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 399 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24841422 - 24841377
Alignment:
Q  399 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24841422 gtactatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 24841377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 12901595 - 12901654
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  12901595 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 12901654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 24628562 - 24628621
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  24628562 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 24628621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 27379516 - 27379575
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  27379516 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 27379575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 27383562 - 27383621
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  27383562 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 27383621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 27601819 - 27601760
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  27601819 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 27601760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 24649380 - 24649334
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24649380 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgttta 24649334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 465
Target Start/End: Original strand, 34492091 - 34492141
Alignment:
Q  415 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  34492091 taaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 34492141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 391
Target Start/End: Original strand, 28031919 - 28032056
Alignment:
Q  254 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 353  Q
    |||||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| || ||| | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || |||||||||    
T  28031919 ggtttggcttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaa 28032018  T
Q  354 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaa 391  Q
    || || ||||| |||| ||| || ||| |||| |||||    
T  28032019 gtcaacccaaaccttatggattatttccaaacttcaaa 28032056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 587 - 631
Target Start/End: Original strand, 10101728 - 10101772
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 631  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10101728 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtt 10101772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16900905 - 16900841
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||||||||    
T  16900905 catgaaaattttagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgattttt 16900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16994296 - 16994232
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||||||||    
T  16994296 catgaaaattttagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgattttt 16994232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 602 - 646
Target Start/End: Original strand, 22459579 - 22459623
Alignment:
Q  602 tcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  22459579 tcatttgatgttgttatatctttagatgtttatgtgttgcctatg 22459623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24302374 - 24302220
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||| |||| | ||| ||| |||| |||||| |||| |||||| | | ||||||||||||||| |||  ||     
T  24302374 catgaaagttttagataaagatgttagctttctaatggcttcgatttaactt-aaaatgtttttaggtttt-gtgctatgatgaaaatactacaagtagg 24302277  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactt 368  Q
    ||||  || |||| |  ||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||    
T  24302276 tcttgatgcaattgtacgaaaattcagcataactatttttaagtgaacccaaaactt 24302220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24383167 - 24383131
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24383167 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatg 24383131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 34823840 - 34823776
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||  |  |||||||||||    
T  34823840 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgattttt 34823776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 224
Target Start/End: Original strand, 22497852 - 22497890
Alignment:
Q  186 tgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgta 224  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22497852 tgttccgaattaggtctgggagtcttcatgaaagttgta 22497890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Original strand, 10684735 - 10684772
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10684735 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 10684772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 20261411 - 20261374
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20261411 gatgttgattaccatttgatgttgttatattttgagat 20261374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 11232232 - 11232268
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11232232 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 11232268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 19445355 - 19445419
Alignment:
Q  160 ggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgta 224  Q
    |||||||||| || | || || ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19445355 ggaaaatcaaattgtgtgcaactttatgttccgaattaggtttggaagtctgcatgaaagttgta 19445419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 22514079 - 22514115
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22514079 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 22514115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 23760032 - 23760068
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23760032 catggaagttttagataattttgttagctttccaatg 23760068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 28776681 - 28776717
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28776681 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 28776717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 442 - 486
Target Start/End: Original strand, 43947232 - 43947276
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 486  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43947232 gttatgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattataata 43947276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 67810 - 67321
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  67810 cgagcataggaaaatccacttttatgaaattttctgttctgaattagatttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttcctatggct 67711  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 351  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  67710 ttggtttgactttaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 67611  T
Q  352 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  67610 aagttaatccaaaacttagagaataattccaaatctgaaaactagaagtactaggatttcaattaaggtgtttaagaatatttaacctatgttaagagtt 67511  T
Q  452 gatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatt 551  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  67510 gatcattggggtaggaatggatgttgaatataatattacttatgatctgtgaagttgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatt 67415  T
Q  552 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  67414 tttatatgcattatgtgaattgtataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttg-ggtgtttacgtgctgcttatg 67321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 256 - 368
Target Start/End: Original strand, 62410 - 62522
Alignment:
Q  256 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  62410 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagt 62509  T
Q  356 taatccaaaactt 368  Q
     || |||||||||    
T  62510 caaaccaaaactt 62522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Original strand, 116801 - 117032
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||  | ||||| |||     
T  116801 catgaaagtttcagataattgtgttagctttgcagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgaggaaaccattccaaggagg 116900  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| |||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||     
T  116901 tcttggtgaaattttatgaaaattctatataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaaccagaagtattaggagttt 117000  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || ||||   |||||||||||| |||||||||    
T  117001 aagtaagaggtttaagagtattaaacctatgt 117032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 231)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 646
Target Start/End: Original strand, 46580260 - 46580736
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  46580260 cgagcataggaaaatcaaattttcctgaattttctattctgaattgggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagttttccaatgact 46580359  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 351  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||             
T  46580360 ttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagttcttactgaaattttatgaaaattcagcata--------- 46580450  T
Q  352 aagttaatccaaaactta-gggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagt 450  Q
        ||||  |  ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46580451 ----taat--attactgatgggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagt 46580544  T
Q  451 tgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatat 550  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  46580545 tgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatat 46580640  T
Q  551 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46580641 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 46580736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 213 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 16999087 - 16998652
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16999087 atgaaagtagtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagagatgatgaaaatactccaaggagat 16998988  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactag------g 406  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| |       |    
T  16998987 cttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctatgttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtaccatcaccatg 16998888  T
Q  407 agttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagc 506  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16998887 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggagattgaatataatattactgatgatctgtgaagc 16998788  T
Q  507 tgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 606  Q
     |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998787 agttataatatgatttaatgttgataa----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 16998692  T
Q  607 tgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16998691 tgatgttgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatg 16998652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 212 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 13647898 - 13647492
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13647898 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 13647799  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13647798 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 13647699  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  13647698 aattaaggtgtttaagattatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgcgaagctatta 13647599  T
Q  512 ta--atatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 609  Q
    ||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13647598 taatatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttga 13647503  T
Q  610 tgttgttatat 620  Q
    |||||||||||    
T  13647502 tgttgttatat 13647492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 328 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 14273888 - 14273574
Alignment:
Q  328 tgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaag 427  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||    
T  14273888 tgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaag 14273789  T
Q  428 agtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgt 527  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14273788 agtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgt 14273689  T
Q  528 tgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaga 627  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14273688 tga----tagtaatgtaatatatttgtatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaga 14273593  T
Q  628 tgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14273592 tgtttacgtgctgcctatg 14273574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 152 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 48812554 - 48812241
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  48812554 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttccgaattaggtttggaagtcttcatgaaagttgtatataattttgttagctttccaatggct 48812455  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 351  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  48812454 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactgcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 48812355  T
Q  352 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48812354 aagttaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtt 48812255  T
Q  452 gatctttggggtag 465  Q
    | || |||||||||    
T  48812254 ggtccttggggtag 48812241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 18872816 - 18872386
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18872816 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 18872717  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  18872716 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 18872617  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  18872616 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 18872517  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  18872516 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgata 18872421  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18872420 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 18872386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 11661761 - 11661332
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||  ||     
T  11661761 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttattttttgagttatgatggaaatactccaagtagg 11661662  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  11661661 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 11661562  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  11661561 aattaatgtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-ccctggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 11661463  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11661462 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgata 11661367  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11661366 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 11661332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 14566658 - 14566228
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  14566658 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 14566559  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||      
T  14566558 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgt 14566459  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  14566458 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 14566359  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  14566358 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgata 14566263  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14566262 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 14566228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 16009034 - 16008604
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  16009034 catgaaagttgtagataattttgctagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 16008935  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  16008934 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 16008835  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  16008834 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 16008735  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||| |||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  16008734 taatataatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgata 16008639  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16008638 ttgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatg 16008604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 212 - 510
Target Start/End: Original strand, 18456044 - 18456342
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18456044 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18456143  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18456144 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 18456243  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 510  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18456244 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttaaatataatattaattataatctgtgaagctgtt 18456342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 18607943 - 18607513
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18607943 catggaagttttagatacttttgtcagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 18607844  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||  ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  18607843 tcttaaggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 18607744  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  18607743 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 18607644  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18607643 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgata 18607548  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    || |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18607547 tttttatatattgagatgtttatgtgctgcctatg 18607513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 212 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 14422441 - 14422005
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  14422441 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 14422342  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  14422341 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 14422242  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | | | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  14422241 aattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgtgaggttacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 14422142  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgat 610  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422141 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggatcatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttgat 14422046  T
Q  611 gttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgctact 651  Q
     ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  14422045 attgttatatcttgaggtgtttatgtgctgcctatgttact 14422005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Original strand, 708951 - 709204
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  708951 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 709050  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  709051 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcttaactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttc 709150  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  709151 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 709204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Original strand, 58814 - 59071
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  58814 catgaaagttttatataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 58913  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  58914 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 59013  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  59014 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 59071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Original strand, 8756792 - 8757056
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||     
T  8756792 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccgaggagg 8756891  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8756892 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 8756991  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  8756992 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 8757056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16462692 - 16462439
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16462692 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16462593  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16462592 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcatagctgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtta 16462493  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  16462492 aattaaggtgattaacagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 16462439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 14415880 - 14416112
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||| |||     
T  14415880 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtgtttgatttatgatgaaaatactccaaggagg 14415979  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14415980 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 14416079  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14416080 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14416112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Original strand, 32160598 - 32160851
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  32160598 catgaaagttgtagataattgtcttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 32160697  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32160698 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 32160797  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  32160798 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggtag 32160851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 315 - 646
Target Start/End: Original strand, 13918266 - 13918586
Alignment:
Q  315 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 414  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  13918266 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaat 13918365  T
Q  415 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataa 514  Q
    |||||| |||||||||||       || |||||| ||  | |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13918366 taaggtgtttaagagtata------atattatgatttagtgtttggg-taggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataa 13918458  T
Q  515 tatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttg 614  Q
    ||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |    
T  13918459 tatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttaattatcatttgatatcg 13918554  T
Q  615 ttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13918555 ttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 13918586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Original strand, 14191484 - 14191735
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  14191484 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactta--gtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14191581  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  14191582 tcttagtgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactataagttc 14191681  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  14191682 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 14191735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Original strand, 30820652 - 30820910
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  30820652 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaataatttttggtttttaagatatgataaaaatactccaaggaga 30820751  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30820752 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagataatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 30820851  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  30820852 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatg 30820910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Original strand, 47975307 - 47975560
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  47975307 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatgtttgagatatgatgaaaatgctccaaggagg 47975406  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  47975407 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtactatgagttc 47975506  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  47975507 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttcgtccttggggtag 47975560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 492
Target Start/End: Original strand, 16550400 - 16550679
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16550400 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16550499  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16550500 tcttagtgaaatcttatgaaaattgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 16550599  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 492  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  16550600 aattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgttccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 16550679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16615262 - 16614983
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16615262 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16615163  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16615162 tcttagtgaaatcttatgaaaattgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 16615063  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 492  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  16615062 aattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgttccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 16614983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Original strand, 14188690 - 14188941
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  14188690 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactta--gtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14188787  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  14188788 tctttgtgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactattagttc 14188887  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  14188888 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 14188941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 212 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15214155 - 15213917
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15214155 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15214056  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15214055 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 15213956  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagt 450  Q
    || || ||| ||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  15213955 aattagggtgtttaagagtatgtaatttatgttgtgagt 15213917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 212 - 457
Target Start/End: Original strand, 17070689 - 17070934
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17070689 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttgttttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 17070788  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17070789 tcttattgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaattctcaaaactagaagtactatgagttc 17070888  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17070889 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttgatctt 17070934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 13745172 - 13745404
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  13745172 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 13745271  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13745272 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 13745371  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13745372 aattaaggtgtttcagagtatttaacctatgtt 13745404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 316 - 646
Target Start/End: Original strand, 25926993 - 25927309
Alignment:
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  25926993 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 25927092  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 515  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | |  ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25927093 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtc-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 25927185  T
Q  516 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 615  Q
    |||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  25927186 atgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagt---tgttgattatcatttgatattgt 25927278  T
Q  616 tatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25927279 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 25927309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 44374602 - 44374370
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44374602 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 44374503  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44374502 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttc 44374403  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44374402 aaatagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 44374370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 44383467 - 44383235
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44383467 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 44383368  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44383367 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttc 44383268  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44383267 aaatagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 44383235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 46386483 - 46386715
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || | | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  46386483 catgaaagttgtagatagttgagttagctttccagtggctttggtttgaagtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggagg 46386582  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46386583 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 46386682  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  46386683 aactatggtgtttaagagtatttaacctatgtt 46386715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 47094736 - 47094491
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  47094736 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 47094637  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  47094636 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagtagtactatgatttc 47094537  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47094536 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 47094491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12371931 - 12371699
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||| |||     
T  12371931 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgcgatatggtaaaaatactccaaggagg 12371832  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12371831 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 12371732  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  12371731 aactaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 12371699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 12465656 - 12465888
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  12465656 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 12465755  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  12465756 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgacttc 12465855  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || | | |||||||||||||||| ||||||    
T  12465856 aattaggatgtttaagagtatttaacttatgtt 12465888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15167631 - 15167403
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  15167631 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 15167532  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  15167531 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaactagaagtattatgagttc 15167432  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||    
T  15167431 aattaaggtgtttaagagtatttaaccta 15167403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 212 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 13408428 - 13408170
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  13408428 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaattctccaagtagg 13408329  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13408328 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 13408229  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgg 471  Q
    || |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  13408228 aattaagttttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgat-tttgggataggaatgg 13408170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 212 - 467
Target Start/End: Original strand, 17505400 - 17505655
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  17505400 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 17505499  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  17505500 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 17505599  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 467  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  17505600 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 17505655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 212 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 17547814 - 17547559
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  17547814 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggagg 17547715  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  17547714 tcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 17547615  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 467  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  17547614 aattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 17547559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Original strand, 36685645 - 36685904
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  36685645 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 36685744  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36685745 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcgtaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 36685844  T
Q  412 aactaaggt-atttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || |||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  36685845 aattaagatgttttaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatg 36685904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Original strand, 832419 - 832676
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  832419 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 832518  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  832519 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 832618  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  832619 aattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 832676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Original strand, 1197599 - 1197856
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1197599 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 1197698  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  1197699 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttc 1197798  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1197799 aattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 1197856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 212 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 38828717 - 38828304
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||     
T  38828717 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggagg 38828618  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  38828617 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 38828518  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| | ||| || || || | ||| | ||||||| |  ||||| || ||||  ||| ||    
T  38828517 aattaaggtgtttaagagtatttaacccacgttgtgagttgatcctcgggttatgagtgaatgtttattataatactgttgatgttcagtgagtctgata 38828418  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgt-gaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 610  Q
    ||| |||| || |||||    | || | | ||  || ||||| | ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38828417 taagatga-ttgatgtt----gttaatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tgttgattatcatttgat 38828324  T
Q  611 gttgttatatcttgagatgt 630  Q
     || ||||||||||||||||    
T  38828323 attattatatcttgagatgt 38828304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Original strand, 13699285 - 13699549
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13699285 catgaaagctttagataattgtgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 13699384  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
     ||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||     
T  13699385 ccttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccatttctaagttaatctgaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttt 13699484  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  13699485 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttt-ggataggaatggaagttg 13699549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 212 - 457
Target Start/End: Original strand, 40555139 - 40555384
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||      
T  40555139 catgaaagttttagataattttgttaactttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttgatttttgagatatgatgtaaatactccaaggaag 40555238  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40555239 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 40555338  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||    
T  40555339 aattaaggtgtttaagtgtatttaacccatattgtgagttgatctt 40555384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11067124 - 11066892
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||     
T  11067124 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccatggagg 11067025  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  11067024 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgatttc 11066925  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11066924 aactagggtgtttaagagtatttaacttatgtt 11066892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 14928728 - 14928960
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||| |||     
T  14928728 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcagtttgactagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagt 14928827  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  14928828 acttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagttt 14928927  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || ||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  14928928 aattaaagtgtttaaaagtatctaacctatgtt 14928960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 15352194 - 15352426
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||| |||     
T  15352194 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcagtttgactagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagt 15352293  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15352294 acttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagttt 15352393  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || ||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  15352394 aattaatgtgtttaaaagtatctaacctatgtt 15352426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19282748 - 19282516
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  | || | | |  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  19282748 catgaaagttgtagataattgtgttagctttttagtggctttgagttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 19282649  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19282648 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaaatagaagtactatgagttc 19282549  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19282548 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19282516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 29004478 - 29004214
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||     
T  29004478 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcaagggagg 29004379  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    || ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| |   || |||||||||||||||| ||||||    
T  29004378 tcctagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccgtttccaagttaatcgaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtactatgagttc 29004279  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 476  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || || |||||||| |||||    
T  29004278 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctttggttaggaatgaaggtt 29004214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 33001570 - 33001338
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33001570 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttaacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 33001471  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33001470 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttc 33001371  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33001370 aattaaggtgtttaagagaatttaacctatgtt 33001338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 216 - 470
Target Start/End: Original strand, 12755106 - 12755359
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12755106 aaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttgactagaaaatgagttttagattttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 12755205  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
     ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||||| |||||| |||||||| |    
T  12755206 ggtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaggtactatgagttcaatt 12755305  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  12755306 aaggtgtttaagagtatttgacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 12755359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 148074 - 147704
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | | |||||||||  ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  148074 catgaaagttgtagataattctgttagctttacaatggctttggtttgactctaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 147975  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  147974 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 147875  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  147874 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgaattgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 147775  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttta 586  Q
    ||||||||||| |||||    |  |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  147774 taatatgatttgatgtt----gtgagtaatgagatatatttgtataagcattatgtggattatatgagatgttta 147704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 10896390 - 10896618
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  10896390 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 10896489  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  10896490 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttc 10896589  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||    
T  10896590 aattaagctgtttaagagtatttaaccta 10896618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 13147868 - 13148100
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   | |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13147868 catgaaagttgtagataattgagttagctttccattggatttggtttgacgtgaaaatcattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 13147967  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  13147968 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactacaagtattatgagatc 13148067  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13148068 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13148100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Original strand, 32433985 - 32434221
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||  |||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||      
T  32433985 catgaaagttgtagataattgagctagtgttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaag 32434084  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32434085 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttaatgaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 32434184  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  32434185 aactagggtgtttaagagtatttaatctatgttatga 32434221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 34957827 - 34957579
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||     
T  34957827 catgaaagttgtagataattttgttagctttcaaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagatatgattaaaatactccaagtagg 34957728  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||   ||||||||||||||| || ||||||    
T  34957727 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaaggtaatccaaaacttatgggataattccaaggatcaaaactagaagtattatgagttc 34957628  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttgg 460  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34957627 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttatgagttgatccttgg 34957579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Original strand, 8851555 - 8851786
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||     
T  8851555 catgaaagttgtagataattgagttaggtttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttctggagatatgatgaaaatactccaaggagg 8851654  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8851655 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 8851754  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  8851755 aattaaggggtttaagattatttaacctatgt 8851786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 4325712 - 4325448
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  4325712 catgaatgttgtagataattgcgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagaagg 4325613  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4325612 tcttaatgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgcgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 4325513  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  4325512 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 4325448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Original strand, 9177524 - 9177726
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    |||||    
T  9177524 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttttaacatgatttaatgttga----tagta 9177619  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| | || ||||| | |||||    
T  9177620 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattattatatttggatatgttaatgtgct 9177719  T
Q  640 gcctatg 646  Q
    || ||||    
T  9177720 gcatatg 9177726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 457 - 646
Target Start/End: Original strand, 1858707 - 1858892
Alignment:
Q  457 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat 556  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||    
T  1858707 ttggggtaggaatgtgggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctattataatatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtat 1858802  T
Q  557 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1858803 atgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 1858892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 216 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 48743955 - 48743727
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  48743955 aaagttttagataattttgttagcttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagaactt 48743856  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  48743855 agtgaaatcttataaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagatgtactatgagttcaatt 48743756  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  48743755 aaggtgtttaggagtatttaacatatgtt 48743727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Original strand, 37727323 - 37727580
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | | |||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||     
T  37727323 catgaaagttgtatataattttgttagctttccagtggctttggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggagg 37727422  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||    
T  37727423 tcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccatcaaaactagaagtactatgagttc 37727522  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  37727523 aatcaaggtgtttaagagtttttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 37727580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 32301838 - 32301613
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  32301838 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 32301739  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  32301738 tcttaatgaaattttatgaaaatacagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactataagtactaggagttt 32301639  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  32301638 aattaaggggtttaagagtatttaac 32301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 212 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 32771984 - 32771760
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||   ||     
T  32771984 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaataatccaggtagg 32771885  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  32771884 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 32771785  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaa 436  Q
    || |||||| |||||||||||||||    
T  32771784 aattaaggtgtttaagagtatttaa 32771760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 212 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16580316 - 16580091
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |  ||||||| |||||||| ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||     
T  16580316 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggcgttagtttgacatgaaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggagg 16580217  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16580216 tcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 16580117  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||    
T  16580116 aattaaggggtttaacagtatttaac 16580091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 216 - 448
Target Start/End: Original strand, 14153372 - 14153603
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14153372 aaagttgtagataattttgttagctttacaatggctttggtttgacttgaaaataatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 14153471  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| |  |  |||||| |||||||| |    
T  14153472 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgtactatgagttcaatt 14153570  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14153571 aaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 14153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 440 - 641
Target Start/End: Original strand, 17017326 - 17017523
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  17017326 atgttatgagttgatccttggggtagggatggaggttgaatatagtattactaatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----ta 17017421  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| | |||||    
T  17017422 atgtaatatatttgtatatgcattatatgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatgttattatatctggatatgttaatgtgct 17017521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 216 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14259004 - 14258783
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | | |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||  || ||||    
T  14259004 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgctttgacatgaaaatgaactttggttcttgagatatgatgaaaggactccaagtaggtctt 14258905  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  14258904 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatt 14258805  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  14258804 aaggggtttaagagtatttaac 14258783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20586008 - 20585780
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||  || | | |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  20586008 catgaaagttgtagataattgagttagctttcccgtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttcttgaggtatgatgaaaatactccaaggagg 20585909  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20585908 t----gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaattagaagtactatgagttc 20585813  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20585812 aactagggtgtttaagagtatttaacttatgtt 20585780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Original strand, 17060282 - 17060485
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  17060282 atgttatgagttgatccttggggtagaaacggaggttgaatataatattactgatgttctatgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagta 17060377  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgc 638  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17060378 atgtcaaatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgaagttgattatcgtttgatattgttatattttgagatgtttatgtgc 17060477  T
Q  639 tgcctatg 646  Q
    ||| ||||    
T  17060478 tgcatatg 17060485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 212 - 416
Target Start/End: Original strand, 12323326 - 12323530
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||   | | | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||     
T  12323326 catgaaagttgtagataattgagttagctttccgggggctttggtttgacgtgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatacttgaaggagg 12323425  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12323426 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagttc 12323525  T
Q  412 aacta 416  Q
    |||||    
T  12323526 aacta 12323530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 282 - 442
Target Start/End: Original strand, 15119761 - 15119921
Alignment:
Q  282 ttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattca 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15119761 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaatattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 15119860  T
Q  382 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15119861 aaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 15119921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20619942 - 20619714
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  | ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  20619942 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtagcttcggtgtgacgtgaaaaagatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 20619843  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||     
T  20619842 tcttaataaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccataacttatggaataattccaaaactcaaaattagaagtattaggatttt 20619743  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||    
T  20619742 aattaaggggtttaagagtatttaaccta 20619714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 12127559 - 12127792
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt-ggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 310  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||   || | || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  12127559 catgaaagtagtagataattgagttagctatcacgtggcttctgtttgacgtgaaaatgattttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcagggag 12127658  T
Q  311 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
     | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12127659 gtattagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaagttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 12127758  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12127759 caaatagggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 12127792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 212 - 393
Target Start/End: Original strand, 29052551 - 29052732
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  29052551 catgaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 29052650  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 393  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  29052651 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 29052732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 255 - 437
Target Start/End: Original strand, 16585390 - 16585572
Alignment:
Q  255 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 354  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16585390 gtttgacatgaaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 16585489  T
Q  355 ttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  16585490 ttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 16585572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 24270378 - 24270609
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24270378 catgaaagttttagataattgtgttagctttcaaatggaattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 24270477  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| || | |||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| |  ||||||    
T  24270478 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaagtcaaccgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattgtgagttc 24270576  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24270577 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24270609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 513 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 32301476 - 32301347
Alignment:
Q  513 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 612  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301476 aatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatctttaagttgatgttgattatcatttgatgt 32301381  T
Q  613 tgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32301380 tgttatatcttgagatgtttacgtgttgcctatg 32301347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 39292133 - 39292364
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  39292133 catgaaaattttagataattttgttagctttccattgactttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 39292232  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| | ||  ||||||||| ||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  39292233 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaaatcaactcaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 39292331  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39292332 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 39292364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 212 - 471
Target Start/End: Original strand, 13864791 - 13865040
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  13864791 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttgggttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgaggaaaatactccaaggagg 13864890  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||   ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13864891 tcttagtgaaatcttagaaaaattcagtacaaccttttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaagtagaagtactatgagttc 13864990  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgg 471  Q
    ||         |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13864991 aa---------ttaagagtatttaatccatgttatgagttgatc-ttgggataggaatgg 13865040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Original strand, 16460717 - 16460826
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16460717 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 16460816  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  16460817 gctgcctatg 16460826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 288 - 444
Target Start/End: Original strand, 13745672 - 13745828
Alignment:
Q  288 tatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacct 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  13745672 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatagccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaataattccaaacct 13745771  T
Q  388 caaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13745772 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13745828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 18875242 - 18875474
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   | |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||      
T  18875242 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggatttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggatg 18875341  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||  ||| |   || ||||||||||||||||||||  |||||||     
T  18875342 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaatccaaaacttgtggattgtctccaaacctcaaaactagaagtaacaggagttt 18875441  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18875442 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 18875474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 212 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15720405 - 15720250
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||     
T  15720405 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaggtatgataaaaatactccaaggagg 15720306  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 367  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15720305 tcttagcgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 15720250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 291 - 437
Target Start/End: Original strand, 16460407 - 16460553
Alignment:
Q  291 gatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaa 390  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16460407 gatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaa 16460506  T
Q  391 aactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  ||||| | ||||||||    
T  16460507 aactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatattatttaac 16460553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 14258619 - 14258510
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14258619 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 14258520  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  14258519 gctgcctatg 14258510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 16579927 - 16579818
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579927 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtttttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 16579828  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  16579827 gctgcctatg 16579818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Original strand, 16585736 - 16585845
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16585736 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtttttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 16585835  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  16585836 gctgcctatg 16585845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 43277139 - 43277372
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||     
T  43277139 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcaagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaagg 43277238  T
Q  312 tcttagtgaaatttt-ttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||||| || ||  ||||||||| ||| |   || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43277239 tcttagtgaaattttatcaaaaattccgcataactatttctaggtcaactcaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 43277338  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
     || |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  43277339 taattaaggggtttaagagtatttaacatatgtt 43277372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 4691292 - 4691523
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||     
T  4691292 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggagtcggtttgacttgaaaataatttttggtttttgatttatgatgaaaatactccaaggagg 4691391  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||  | |  |||||| |||||     
T  4691392 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagtta 4691490  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4691491 aattaaggtgtttaagagtatttaaccaatgtt 4691523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 446 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 16996477 - 16996284
Alignment:
Q  446 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 545  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    |||||| |    
T  16996477 tgagttgacccttaggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taatgtga 16996382  T
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgccta 644  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16996381 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaa-atgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgccta 16996284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 20487710 - 20487601
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  20487710 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatgtcttgagatatttatgt 20487611  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  20487610 gctgcctatg 20487601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 14161251 - 14161482
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  ||     
T  14161251 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccattggctttggtttgacttgaaaatcatttttggtttttgaggtttgataaaaatactccaagaagg 14161350  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  14161351 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 14161449  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14161450 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 14161482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 48213341 - 48213572
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  48213341 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccattcgctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagg 48213440  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| || | |||||||| ||| |   || |||| ||||| | |   |||||| ||||||    
T  48213441 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaagtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc-atgtgtactatgagttc 48213539  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48213540 aattaaggtgtttaagaatatttaacctatgtt 48213572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Original strand, 10501373 - 10501484
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 634  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10501373 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttat 10501472  T
Q  635 gtgctgcctatg 646  Q
    ||| ||||||||    
T  10501473 gtgttgcctatg 10501484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Original strand, 15978452 - 15978682
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||     
T  15978452 catgaaagttttagataattgtgttagctttccactgactttggcttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggagg 15978551  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||  || ||| ||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15978552 tctcggtaaaactttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggggtt- 15978650  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || ||||   |||||||| | |||||||||||    
T  15978651 aattaagaggtttaagagcacttaacctatgt 15978682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 442 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 42462209 - 42462009
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 541  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| || |  ||||| ||  |||  ||| |||||||| |||| |||||    | |||||||    
T  42462209 gttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttgatgttcaatgagtctgatataatataatttgatgtt----gttagtaat 42462114  T
Q  542 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgc 641  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  42462113 gtgatatagttgtatattcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttgc 42462014  T
Q  642 ctatg 646  Q
    |||||    
T  42462013 ctatg 42462009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 460 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 48991422 - 48991266
Alignment:
Q  460 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatg 559  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| | ||||| |||||||||    
T  48991422 gggtaggaatagaggttgaatacaatattgatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaat-tgatata-ttgtatatg 48991329  T
Q  560 cattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 622  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  48991328 cattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatct 48991266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Original strand, 8514142 - 8514377
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| | |  | | ||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||     
T  8514142 catgaaagttgtagataattgtgttagatttcgagttgctttggtttgacttgaaaaagaattttgggttttgaattatgatgaaaatactccaaggagg 8514241  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  8514242 tcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtcttaaaacttcaaatcttg-tgtactatgagttc 8514340  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8514341 aattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttatga 8514377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 21538585 - 21538816
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||| |||     
T  21538585 catgaaagttttagataattttgttagttttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttaaattttgagttatgatgaaaacactccaaggagg 21538684  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||| || ||||||||||  || |  ||| |||| |||||||| |  ||||||  |||||    
T  21538685 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataatcatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactattagttc 21538783  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21538784 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 21538816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 25942093 - 25941862
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||     
T  25942093 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggagg 25941994  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||| || || ||||| |||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  25941993 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcatgataatttctaggtcaacccaaatcttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 25941895  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25941894 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 25941862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Original strand, 14157054 - 14157165
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 634  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14157054 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttat 14157153  T
Q  635 gtgctgcctatg 646  Q
    ||| || |||||    
T  14157154 gtgttgtctatg 14157165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 440 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 16092019 - 16091844
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    | || ||    
T  16092019 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttatactatgaattattgtt----gttaata 16091924  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 620  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||    
T  16091923 atgttacatatttgtatacgcattatgtggattatatatgatgattaag-tgttgttgattatcatttgatattattatat 16091844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 38519543 - 38519432
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 634  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  38519543 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattgtataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttat 38519444  T
Q  635 gtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||    
T  38519443 gtgctgcctatg 38519432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3287646 - 3287489
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | || | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  3287646 catgacagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaagaagg 3287547  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  3287546 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 3287489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 446 - 646
Target Start/End: Original strand, 130680 - 130878
Alignment:
Q  446 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgt-tataatatgatttaatgttgatagctagtaatgta 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || |  ||||| || ||||   ||| ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||     
T  130680 tgagttgatccttggggtaggaatggtggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtttgtatataatatgatttgatgtt-at---tagtaatgtg 130775  T
Q  545 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 643  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  130776 atatagttgtatatgcattatgtggattatataaggtgtttaagttgatgattgattattatttgatattgttatatcttgagatgtttctgtgctgcct 130875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 223 - 443
Target Start/End: Original strand, 3192700 - 3192920
Alignment:
Q  223 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 322  Q
    ||||||||| |||||| ||| || || | | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||    
T  3192700 tagataattgtgttagttttgcagtgtctttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaa 3192799  T
Q  323 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 422  Q
    |||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| |   |  ||| |||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||   |    
T  3192800 ttttatgaaaattgtgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgatttgtttctaaacttcaaaactagaagtattatgagtttaattaagaggt 3192899  T
Q  423 ttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3192900 ttaagagtatttaacctatgt 3192920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 440 - 642
Target Start/End: Original strand, 11768777 - 11768977
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||  ||||||||||||| | |||| |||    ||    
T  11768777 atgttatgagtcgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgtttatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttag----ta 11768872  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg--attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 637  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||    
T  11768873 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaaatattatttgatattgttatatcttgagatgattatgtg 11768972  T
Q  638 ctgcc 642  Q
    |||||    
T  11768973 ctgcc 11768977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 312 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13894651 - 13894519
Alignment:
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13894651 tcttagtgaaatcttattaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 13894552  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13894551 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13894519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 458 - 646
Target Start/End: Original strand, 11525440 - 11525625
Alignment:
Q  458 tggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 557  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||| |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||| | ||||| ||   ||||||| | ||||||| |||||    
T  11525440 tggggtaggaatgaaggtggattataataatgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatatgatgtt-at---tagtaatttgatatattggtata 11525535  T
Q  558 tgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11525536 tgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgattgattattatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgctgcctatg 11525625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 444
Target Start/End: Original strand, 20252751 - 20252969
Alignment:
Q  225 gataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatt 324  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20252751 gataattgtattagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtaaaatt 20252850  T
Q  325 ttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtattt 424  Q
    ||  |||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| ||    |||||| |||||||| |||| | |||    
T  20252851 ttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactatgagttcaattaagatgttt 20252949  T
Q  425 aagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20252950 aagagtatttaacctatgtt 20252969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Original strand, 9743477 - 9743706
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || || | | ||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  9743477 catgaaagttgtagataattgttttagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgattttgtctttttaagttatgatgaaaatactccaaggagg 9743576  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| | ||| || |  |||||| ||||||    
T  9743577 tcttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttg-tgtactatgagttc 9743675  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    || |||||  |||||| ||||||||||||||    
T  9743676 aattaaggcgtttaagcgtatttaacctatg 9743706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 1856796 - 1856915
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1856796 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 1856895  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  1856896 tcttagtgaatttttatgaa 1856915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 440 - 596
Target Start/End: Original strand, 9725518 - 9725670
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| || ||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||    ||    
T  9725518 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttgttag----ta 9725613  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgtt 596  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9725614 atgtgatatagttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgtt 9725670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 23664519 - 23664638
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  23664519 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23664618  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  23664619 tcttagtgaatttttatgaa 23664638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Original strand, 9033204 - 9033407
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| || |  | ||| || ||||  ||  |||||| |||||| |||||| ||     ||    
T  9033204 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttggttatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatgtgatttgatgttgttaa----ta 9033299  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgc 638  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |||     
T  9033300 atgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgcattattatttgatattgttatatcctgagatatttatgtgt 9033399  T
Q  639 tgcctatg 646  Q
    ||||||||    
T  9033400 tgcctatg 9033407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 223 - 369
Target Start/End: Original strand, 18080125 - 18080271
Alignment:
Q  223 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 322  Q
    ||||||||| |||||||||| || || | | | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18080125 tagataattgtgttagctttacagtggctttgatttgacttgaaaatgatttttggtttttgacttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 18080224  T
Q  323 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    |||  ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  18080225 tttaatgaaaattccgcataactatttctatgtcaacccaaaactta 18080271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 561 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 15720140 - 15720055
Alignment:
Q  561 attatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15720140 attaagtgaattagataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcatatg 15720055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 479 - 584
Target Start/End: Original strand, 2529951 - 2530052
Alignment:
Q  479 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataa 578  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2529951 atataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtgatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaa 2530046  T
Q  579 gatgtt 584  Q
    ||||||    
T  2530047 gatgtt 2530052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11310025 - 11309853
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||    || || ||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |     
T  11310025 cgagcttaggaaaatcaacttttctggaatttcctgtttcgaattgtcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccattggct 11309926  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatt 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||    
T  11309925 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaataccccaagggaatcttagcgaaatt 11309853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 513 - 622
Target Start/End: Original strand, 14929152 - 14929257
Alignment:
Q  513 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 612  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14929152 aatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 14929247  T
Q  613 tgttatatct 622  Q
    |||| |||||    
T  14929248 tgttgtatct 14929257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 513 - 622
Target Start/End: Original strand, 15352618 - 15352723
Alignment:
Q  513 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 612  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15352618 aatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 15352713  T
Q  613 tgttatatct 622  Q
    |||| |||||    
T  15352714 tgttgtatct 15352723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 20619552 - 20619440
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20619552 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 20619453  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     ||| ||||||||    
T  20619452 tgtgttgcctatg 20619440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11303843 - 11303724
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  11303843 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttaatttgactcgaaattgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 11303744  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  11303743 tcttagtgaatttttatgaa 11303724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 13917969 - 13918088
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13917969 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgattattggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 13918068  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  13918069 tcttagtgaatttttatgaa 13918088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29801025 - 29800906
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||     
T  29801025 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggagg 29800926  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  29800925 tcttagtgaatttttatgaa 29800906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 572 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 8940383 - 8940309
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940383 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 8940309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11091170 - 11091080
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagcttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  11091170 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaagtttgggagtcttcatgaaagttgtagatatggttgttagcttt 11091080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13897902 - 13897808
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13897902 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattattagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 13897808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 216 - 444
Target Start/End: Original strand, 15576233 - 15576458
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||  || | ||    
T  15576233 aaagttgtagataatt--gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatttttggtttttgagttatcataaaaatgctccaagaaggtttt 15576330  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |   ||||| |||||||| |    
T  15576331 agtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tctactatgagttcaatt 15576429  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  15576430 aaggtgtttaagggtatttaacttatgtt 15576458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 440 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 14045010 - 14044922
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt 528  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14045010 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatgttaatgatgatctgtgaagctgttatactatgatttaatgtt 14044922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 440 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 14355040 - 14354952
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt 528  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14355040 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatgttaatgatgatctgtgaagctgttatactatgatttaatgtt 14354952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 440 - 621
Target Start/End: Original strand, 15008357 - 15008533
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||| | || | ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    | || ||    
T  15008357 atgttatgagttgaaccttcgagtatgaatggaggttgtatatgatattaatgataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgtt----gttaata 15008452  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  15008453 atgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 15008533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 323 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 28720005 - 28719885
Alignment:
Q  323 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 422  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||   |    
T  28720005 ttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcaaaactatgagtactaggagtttaattaagaggt 28719906  T
Q  423 ttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  28719905 ttaaaagtatttaacctatgt 28719885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 16108255 - 16108374
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||   | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  16108255 catgaaagttgtagataattttgttacctttttaatggatttggtttggcttgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16108354  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  16108355 tcttagtgaatttttatgaa 16108374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 25926696 - 25926815
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25926696 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25926795  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  25926796 tcttagtgaatttttatgaa 25926815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29797206 - 29797087
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||     
T  29797206 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctctaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggagg 29797107  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  29797106 tcttagtgaatttttatgaa 29797087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 339 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20487972 - 20487874
Alignment:
Q  339 cataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  20487972 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactaggagtactaggtgtttaattaaggggtttaacagtatttaac 20487874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 440 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 14036460 - 14036387
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata 513  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14036460 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctgttata 14036387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 440 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 14346490 - 14346417
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata 513  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14346490 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctgttata 14346417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 296
Target Start/End: Original strand, 44190645 - 44190729
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 296  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44190645 catgaaagttgtagataattgcgttagcttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 44190729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 32126086 - 32125967
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  32126086 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 32125987  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  32125986 tcttagtgaatttttatgaa 32125967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41523512 - 41523394
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  41523512 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 41523413  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  41523412 cttagtgaatttttatgaa 41523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41525974 - 41525856
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  41525974 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 41525875  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  41525874 cttagtgaatttttatgaa 41525856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 460 - 632
Target Start/End: Original strand, 1867874 - 1868040
Alignment:
Q  460 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatg 559  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    | || |||||| |||||||||||||||    
T  1867874 gggtaggaatggaggttatatatgatattaatgatgatctgtgaagct-ttttaagatgatttgatgtt----gttaataatgtgatatatttgtatatg 1867968  T
Q  560 cattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||| || || |||| |||  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  1867969 cattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgca-ttgatattgttatatcatgagctgttt 1868040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 15376280 - 15376359
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15376280 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 15376359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18431307 - 18431188
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||| ||  ||     
T  18431307 catgaaagttgtagataattgtgttatctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttaggtgttatgatgaaaatactcaaagtagg 18431208  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  18431207 tcttagtgaatttttatgaa 18431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 20384690 - 20384769
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20384690 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 20384769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 546 - 639
Target Start/End: Original strand, 837317 - 837410
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  837317 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgct 837410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 546 - 639
Target Start/End: Original strand, 1202497 - 1202590
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  1202497 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgct 1202590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 546 - 639
Target Start/End: Original strand, 16109474 - 16109567
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||    
T  16109474 tatatttgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgctatatcttgagatgtctatgtgct 16109567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24702823 - 24702705
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  24702823 atgaaatttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 24702724  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24702723 cttagtgaatttttatgaa 24702705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24705270 - 24705152
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  24705270 atgaaatttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 24705171  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  24705170 cttagtgaatttttatgaa 24705152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 546 - 646
Target Start/End: Original strand, 833321 - 833421
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgccta 644  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  833321 tatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgtctatgtgctaccta 833419  T
Q  645 tg 646  Q
    ||    
T  833420 tg 833421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 546 - 646
Target Start/End: Original strand, 1198501 - 1198601
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgccta 644  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  1198501 tatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgtctatgtgctaccta 1198599  T
Q  645 tg 646  Q
    ||    
T  1198600 tg 1198601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 572 - 632
Target Start/End: Original strand, 38898181 - 38898241
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38898181 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctagagatgttt 38898241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 46473714 - 46473562
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    | ||||||||| |||||||| ||||   ||| ||| |||||||||||||||||||   |     
T  46473714 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatagttttggtttgactagaaaatgaattttacatttggaggtatgatgaaaatactccaagcggg 46473615  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaa 364  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | || ||||||||| |||||    
T  46473614 tcttagtaaaactttatgaaaattcagcataattattcctaagttaaaccaaa 46473562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27217456 - 27217377
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27217456 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 27217377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 456917 - 456843
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  456917 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcggttggacttgaaaatgaattttggtttatgag 456843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Original strand, 11392866 - 11392940
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11392866 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 11392940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37539064 - 37538970
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  37539064 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgtctttggtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttattatgaaaacactccaa 37538970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 562 - 623
Target Start/End: Original strand, 10896687 - 10896748
Alignment:
Q  562 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 623  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10896687 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 10896748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 562 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 15167346 - 15167285
Alignment:
Q  562 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 623  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15167346 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 15167285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 8563987 - 8564218
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||   |  || |||  |||| ||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||   |     
T  8563987 catgaaagttttagataattgtgttagcttttcaatggttttcgtgtgatgtgaagatgatttttagattttaagttatgatgaaaatactccaagtggg 8564086  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || | ||  |  ||| ||||  ||||| | |  |||||| || |||    
T  8564087 tcttggtaaaactttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaacccaaagctaatggtttgtttccaaactccaaaaattg-tgtactatgatttc 8564185  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8564186 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 8564218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 14105863 - 14105927
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||    
T  14105863 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgattttt 14105927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 331
Target Start/End: Original strand, 14948693 - 14948808
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  || || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14948693 aaagttgtagataattttgttagccttccaatggctttagtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 14948792  T
Q  316 agtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||| |||| ||||    
T  14948793 agtgaatttttatgaa 14948808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16233116 - 16233042
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 286  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16233116 catggaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 16233042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13869941 - 13869864
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  13869941 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtg--gtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 13869864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 296
Target Start/End: Original strand, 39431624 - 39431707
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| | || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39431624 catgaaagttgtagataattgtgttaacttttcagtgactttggcttgacttggaaatgatttttgg-ttttgagatatgatgaa 39431707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16410650 - 16410575
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16410650 aaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggcttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 16410575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 553 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 18203965 - 18203887
Alignment:
Q  553 gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18203965 gtatatgcattgtgtggattatatatgatgattaagt-gttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 18203887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 45170089 - 45170148
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45170089 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 45170148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 291
Target Start/End: Original strand, 26355549 - 26355627
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26355549 atgaaagttgtagataattgtgtaagccttccagtggcgtctgtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26355627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 291
Target Start/End: Original strand, 26358001 - 26358079
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26358001 atgaaagttgtagataattgtgtaagccttccagtggcgtctgtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26358079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 590 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 8468833 - 8468777
Alignment:
Q  590 tgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  8468833 tgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcctatg 8468777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 10001004 - 10001068
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||||||||    
T  10001004 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgattttt 10001068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 572 - 620
Target Start/End: Original strand, 15081900 - 15081948
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 620  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15081900 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 15081948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15720256 - 15720200
Alignment:
Q  388 caaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15720256 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgtt 15720200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3136869 - 3136715
Alignment:
Q  293 tgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaa 392  Q
    ||||||||||||||  || |||| || |||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||| ||  |  ||| |||| ||||||    
T  3136869 tgaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttaagaaaattaagcataactgtttccaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacatcaaaa 3136770  T
Q  393 ctagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || | ||||||| ||||| || || | | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3136769 cttg-agtactaagagtttaattaggatgtttaagagtgtttaacctatgatatga 3136715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Original strand, 14270032 - 14270087
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  14270032 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcctatg 14270087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 18279426 - 18279367
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  18279426 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatg 18279367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 18283389 - 18283330
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  18283389 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatg 18283330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20488036 - 20487973
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttt 275  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||    
T  20488036 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgccggtttgactttaaaatgatttt 20487973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 378
Target Start/End: Original strand, 1857092 - 1857154
Alignment:
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 378  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1857092 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 1857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 621
Target Start/End: Original strand, 2280021 - 2280155
Alignment:
Q  484 atattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atg 582  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  2280021 atatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtt---ta-taatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaata 2280116  T
Q  583 tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    ||| || || ||||||||  |||||||| || |||||||    
T  2280117 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 2280155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 33130 - 33071
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  33130 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 33071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 70848 - 70907
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  70848 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 70907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 74957 - 75016
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  74957 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 75016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 12704742 - 12704801
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  12704742 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 12704801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 12714887 - 12714828
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  12714887 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 12714828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 12718691 - 12718632
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  12718691 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 12718632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 12723602 - 12723543
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  12723602 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 12723543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 16907284 - 16907343
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  16907284 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 16907343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 39722289 - 39722230
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  39722289 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 39722230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 13892742 - 13892661
Alignment:
Q  557 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| || |||||    
T  13892742 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgagatgtctatgtgct 13892661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 26292418 - 26292372
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26292418 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgttta 26292372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 48273636 - 48273550
Alignment:
Q  445 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 531  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  | ||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  48273636 atgagttggtctttggggtaggaatggtagctgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgat 48273550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 621
Target Start/End: Original strand, 12255657 - 12255827
Alignment:
Q  447 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaat 546  Q
    |||||||  |||||||||| |||| || ||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || |||||| |   || |||||| ||    
T  12255657 gagttgaattttggggtagtaatgaagattgtataatatattaatgatgatctatgaagttgttataagatga-ttgatgttgtt---ta-taatgtgat 12255751  T
Q  547 atatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    ||| ||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||| || || ||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  12255752 ataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatc 12255827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16066103 - 16065970
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||| |||| || | | | |||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||||||||||| |||||||  ||     
T  16066103 catgaaagtattagataaagttgttagatttctaacggctttggtttgactttaaaataatttttagattttgtgttatgatgaaaacactccaagtagg 16066004  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataact 345  Q
    |||| ||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  16066003 tcttggtgcaattttacaaaaattcagcataact 16065970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 538 - 621
Target Start/End: Original strand, 20220142 - 20220222
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |   ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  20220142 taatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttga---gatgttgatttgcatttgatattgttatatc 20220222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 399 - 444
Target Start/End: Original strand, 21675491 - 21675536
Alignment:
Q  399 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21675491 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 21675536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12191981 - 12191849
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||| ||  ||| |||||||  ||     
T  12191981 catgaaagttttagataattctgttaactttccattggctttggtttgacttgaaaatattttgtggattttgagttatcatataaacactccaagtagg 12191882  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataac 344  Q
    |||| |   ||||||  ||||||||||||||||    
T  12191881 tcttggaagaattttacgaaaattcagcataac 12191849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #204
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 606 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 15116580 - 15116540
Alignment:
Q  606 ttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15116580 ttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatg 15116540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #205
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 587 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 16114264 - 16114220
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 631  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16114264 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtt 16114220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #206
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 587 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 16117417 - 16117373
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 631  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16117417 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtt 16117373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #207
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21660659 - 21660587
Alignment:
Q  226 ataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 298  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | | |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  21660659 ataattatgttatctttccaatggcgttggtttgacatgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaa 21660587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #208
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28720105 - 28720041
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    | |||||||||| ||||||||||||    
T  28720105 catgaaagttttagataattttattagctttccaattggtttggtttgacttaaaaatgattttt 28720041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #209
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 603 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 15113046 - 15113003
Alignment:
Q  603 catttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15113046 catttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgttgcctatg 15113003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #210
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 227
Target Start/End: Original strand, 16379749 - 16379820
Alignment:
Q  156 cataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagat 227  Q
    ||||||||||| || |||| ||  | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16379749 cataggaaaatgaatttttctgccactttatgttttgaattagatttgggagtcttcatgaaagtcgtagat 16379820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #211
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18628161 - 18628098
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttt 275  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | || |||| || |||||||||||||    
T  18628161 catgaaagttgtagataactgtgttagctttccagtggcgtccgttttacctgaaaatgatttt 18628098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #212
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18640867 - 18640804
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttt 275  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | ||||||| || | |||||||||||    
T  18640867 catgaaagttgtagataactgtgttagctttccagtggcgtcggttttacctaaaaatgatttt 18640804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #213
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Original strand, 15760758 - 15760848
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  15760758 catgaaagttataaataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 15760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #214
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 557 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 34957488 - 34957407
Alignment:
Q  557 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| || |||||    
T  34957488 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtagg-gttgactatcatttgatattgtcatattttgagatgtctatgtgct 34957407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #215
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 432
Target Start/End: Original strand, 1858644 - 1858689
Alignment:
Q  387 tcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtat 432  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  1858644 tcaaaactagaagttctacgagttcaattaaggtgtttaagagtat 1858689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 11303439 - 11303402
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11303439 gatgttgattaccatttgatgttgttatattttgagat 11303402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #217
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Original strand, 16108659 - 16108696
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16108659 gatgttgattaccgtttgatgttgttatatcttgagat 16108696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #218
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19194807 - 19194774
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttcca 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19194807 catgaaagttttagataattttgttagctttcca 19194774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #219
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Original strand, 23664923 - 23664960
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23664923 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 23664960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #220
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 29004133 - 29004057
Alignment:
Q  562 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||    
T  29004133 ttatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgactatcatttggtattgtcatattttgagatgtttatgtgct 29004057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #221
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 29796800 - 29796763
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29796800 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 29796763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #222
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 29800619 - 29800582
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29800619 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 29800582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #223
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 126055 - 125991
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||| ||||    
T  126055 catgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagtttt 125991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #224
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7822103 - 7822067
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7822103 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 7822067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #225
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7829414 - 7829378
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7829414 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 7829378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #226
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11287066 - 11287002
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||| |||  |||||||||||    
T  11287066 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgattttt 11287002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #227
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16383208 - 16383172
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16383208 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatg 16383172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #228
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 27102531 - 27102567
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27102531 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 27102567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #229
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 27109879 - 27109915
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27109879 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 27109915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #230
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27175795 - 27175759
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27175795 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 27175759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #231
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 38784623 - 38784659
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38784623 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 38784659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 649 - 219
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  649 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaagg 550  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  549 tcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 450  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  449 aattaaggtgtttaagagcatttaacccgtgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgtta 350  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  349 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatttgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 254  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  253 ttgttatatcttgatatgtttacgtgttgcctatg 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 127)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 6766317 - 6765888
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  6766317 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacttttgtttgacttaaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaag 6766218  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6766217 tcttggtaaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttc 6766118  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  6766117 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggtggaatataatattgctgttgatctgtgaagctgtta 6766018  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    | |||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6766017 t-atatgatttaatgttga----tagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgttgattattatttgatg 6765923  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  6765922 ttgttatatcttgagatgtttaagtgccgcctatg 6765888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 216 - 636
Target Start/End: Original strand, 30138564 - 30138979
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  30138564 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtttt 30138663  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||||||  || | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  30138664 agtgaaccttat-gaaaattcagcataaccgtttctaagttaacccaaaatttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 30138762  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 515  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  30138763 aaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 30138862  T
Q  516 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 615  Q
    |||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30138863 atgatttaatgtt----cgtagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgt 30138958  T
Q  616 tatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30138959 tatatcttgagatgtttacgt 30138979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 212 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 29448494 - 29448078
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  || | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  29448494 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatattatgaaaatactccaaggagg 29448395  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29448394 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtagtatgagttc 29448295  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29448294 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggatgaatactatattaatgatgatttgtgaagttgtta 29448195  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||||    || ||| || || |||||||||||||||||  |||||||  || ||||||| || || ||||||||  ||||||||     
T  29448194 taatatgatttgatgttga----taataaggtgatgtatttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgata 29448099  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||||||||| |||| |||||    
T  29448098 ttgttatatcatgagctgttt 29448078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 212 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 22412662 - 22412365
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  22412662 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttattttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 22412563  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22412562 tcttagtgaaattttatgaaagttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 22412463  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 510  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22412462 aattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaattataatctgtgaagctgtt 22412365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 212 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 18419068 - 18418770
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18419068 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 18418969  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18418968 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataatcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 18418869  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 510  Q
    || ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18418868 aattaaagtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaattataacctgtgaagctgtt 18418770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Original strand, 37598513 - 37598943
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  37598513 catgaaagttgtaaataattttgttagatttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 37598612  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || | ||||| ||  ||||||||||||| || || |||| |    
T  37598613 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggacaattccaaggctcaaaactagaattaatatgagtgc 37598712  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  37598713 aattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 37598812  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  37598813 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgata 37598908  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37598909 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 37598943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 42961033 - 42960602
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  42961033 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatggtttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 42960934  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  42960933 tcttcgggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 42960834  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgat-ctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 510  Q
    || ||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | |    
T  42960833 aattaaggtgcttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagat 42960734  T
Q  511 ataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 610  Q
    |||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42960733 ataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgat 42960638  T
Q  611 gttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
     |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  42960637 attgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatg 42960602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Original strand, 28370652 - 28371082
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  28370652 catgaaagttgtagataattttgttagctttccagtggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 28370751  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||      
T  28370752 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgt 28370851  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  28370852 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 28370951  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||| | |||||    | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  28370952 taatatgatctgatgtt----gttagtaatgagatatatttgcatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgata 28371047  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28371048 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 28371082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Original strand, 24277002 - 24277266
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24277002 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24277101  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24277102 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttc 24277201  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  24277202 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 24277266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 24385211 - 24384947
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24385211 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24385112  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24385111 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttc 24385012  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  24385011 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 24384947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 216 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 17813048 - 17812795
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17813048 aaagttgtagataatttttttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 17812949  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  17812948 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgaattcaatt 17812849  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  17812848 aaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 17812795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 263513 - 263260
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  263513 catgaaagttatagataattgtgttagctttccgatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacgccaaggagg 263414  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  263413 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 263314  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  263313 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 263260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 216 - 465
Target Start/End: Original strand, 33472964 - 33473213
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33472964 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 33473063  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  33473064 agtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaatt 33473163  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  33473164 aaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 33473213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 32607721 - 32607953
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  32607721 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaag 32607820  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  32607821 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagctaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttc 32607920  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  32607921 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 32607953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 36460626 - 36460368
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  36460626 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 36460527  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36460526 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 36460427  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| || | ||||||| ||||||    
T  36460426 aattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaatg 36460368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 441
Target Start/End: Original strand, 21399400 - 21399628
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  21399400 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgactt-aaaatgattttcagtttttgagatatgataaaaatactccaaggagg 21399498  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21399499 ttttagtgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21399598  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 441  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21399599 aattaaggtgtttaagagtatttaacctat 21399628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17011382 - 17011102
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  17011382 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttcagatatgatgaaaatactccaaggagg 17011283  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  17011282 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacttcaaaactaaaagtactatgagttc 17011183  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 492  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||   |||  |||||||  |||||||||||||    
T  17011182 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttgggggtagaaacgaggttgtttataatattaatg 17011102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 41875989 - 41876221
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  41875989 catgaaagttgtagataattttgttagatttccaatgactctggtttggcatgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 41876088  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  41876089 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaatcttagggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagtta 41876188  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41876189 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 41876221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26762057 - 26761827
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  26762057 catgaaagttgtagataaatgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaactgatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 26761958  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26761957 tcttagtgaaattttatgaacattcaacataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 26761858  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26761857 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 26761827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 17875655 - 17875410
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||     
T  17875655 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccgaggagg 17875556  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17875555 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 17875456  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    || |||||| |||||||||||||||||  | || ||||||||||||    
T  17875455 aattaaggtgtttaagagtatttaacccctattgtgagttgatctt 17875410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 20197982 - 20198216
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttg--agatatgatgaaaatactccaatga 309  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  20197982 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttttagatatgatgaaaatactccaagga 20198081  T
Q  310 gatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagt 409  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20198082 ggtcttagtgacattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactaggagt 20198181  T
Q  410 tcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | || |||||  | |||||||||||||||||||||    
T  20198182 ttaattaaggggtataagagtatttaacctatgtt 20198216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 212 - 574
Target Start/End: Original strand, 38145134 - 38145492
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  38145134 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 38145233  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  38145234 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatacgagtgc 38145333  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |   |||  | | ||    
T  38145334 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgactgagtcagata 38145433  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattat 574  Q
    |||||| |||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38145434 taatataatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattat 38145492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20566210 - 20565978
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  ||| || || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20566210 catgaaagttgtagataattgagttaaattttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 20566111  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20566110 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaattactatgagttc 20566011  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20566010 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20565978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19921289 - 19921058
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  19921289 catgaaagttgtagatgattgagttagctttccagtggttt-ggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaaa 19921191  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19921190 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaaccttaaaactagaagtactatgagttc 19921091  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19921090 aactagggtgtttaagagtatttaacatatgtt 19921058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 27868971 - 27869203
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27868971 catgaaagttgtagataattctgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 27869070  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||    
T  27869071 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaacatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttc 27869170  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27869171 aattaaggtgtttgagagtatttaacctatgtt 27869203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Original strand, 8833603 - 8833824
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||     
T  8833603 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttt--------gagatatgatgaaaatactccaaggagg 8833694  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8833695 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 8833794  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
     | |||| | |||||||||||||||||||||    
T  8833795 -attaagttgtttaagagtatttaacctatg 8833824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 31456454 - 31456196
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31456454 catgaaagttgtagataattgagttaactttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 31456355  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||     
T  31456354 tcttagtgaaatcttgggaaaattaagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaaaaattccaaccctcaaaactagaaatactatgagttt 31456255  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||    
T  31456254 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatattgtgagtcgacccttggggtaggaatg 31456196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Original strand, 21557440 - 21557699
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||      
T  21557440 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttggcttttaagatatgatgaaaatactccaaggatg 21557539  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  21557540 tcttagtgaaatcttacgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactataagttc 21557639  T
Q  412 aactaaggtattt-aagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || |||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  21557640 aattaaggtgtttaaagagtatttaaactatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatg 21557699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22750597 - 22750372
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  |      
T  22750597 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcatg---ttgacttgaaaataacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaag 22750501  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  22750500 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttc 22750401  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||    
T  22750400 aattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22750372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19511843 - 19511614
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||  ||     
T  19511843 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtagg 19511744  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaactagaagtactaggagtt 410  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | || || ||    
T  19511743 tcttagtggaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagcattatgaatt 19511644  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19511643 caattaaggtgtttaagagtatttaaccta 19511614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 234 - 442
Target Start/End: Original strand, 33895300 - 33895508
Alignment:
Q  234 gttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaa 333  Q
    |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||    
T  33895300 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattgtgaaaa 33895399  T
Q  334 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 433  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||    
T  33895400 ttcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatagaataaatccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 33895499  T
Q  434 taacctatg 442  Q
    |||||||||    
T  33895500 taacctatg 33895508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 212 - 508
Target Start/End: Original strand, 22758286 - 22758583
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttg-agatatgatgaaaatactccaatgag 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||| |  |||    
T  22758286 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagcttgacttgaaaatgatttttggtttttttagttatgatggaaatactctagggag 22758385  T
Q  311 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
     |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  22758386 gtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagcactatgagtt 22758485  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 508  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||  |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  22758486 caattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggataacaatgaaagttgtataagatattaaggatgatatgtgaagctg 22758583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 212 - 367
Target Start/End: Original strand, 40917369 - 40917524
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||     
T  40917369 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactcaaaggagg 40917468  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40917469 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 40917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 212 - 450
Target Start/End: Original strand, 21554775 - 21555013
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||     
T  21554775 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttt-ggtttttaagatatgatgaaaatactccaagtagg 21554873  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21554874 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtctaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactacgagttc 21554973  T
Q  412 aactaaggtattt-aagagtatttaacctatgttatgagt 450  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  21554974 aattaaggtgtttaaagagtatttaacccatgttgtgagt 21555013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16063141 - 16062910
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16063141 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16063042  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||  || |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  16063041 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 16062943  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16062942 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 16062910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 442 - 642
Target Start/End: Original strand, 25576716 - 25576911
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 541  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    ||||    
T  25576716 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattacagatgttcagtgagtctgatataatatgattttatgttgatag----taat 25576811  T
Q  542 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgc 641  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25576812 gtgatatagttgtatatgcatgatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatta-ttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgc 25576910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 213 - 444
Target Start/End: Original strand, 36509181 - 36509405
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||| |||| |||||| || ||||||||||||| || | | |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  36509181 atgagagttttagatatttatgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaa--------ggtttttgagatatgatgaaaatgctccaaggaggt 36509272  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36509273 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttta 36509372  T
Q  413 actaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  36509373 attaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 36509405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 23470064 - 23469863
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||    ||    
T  23470064 atgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagtctgttataatatgatttgatgttgttag----ta 23469969  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||    
T  23469968 atgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat-atggtatatcttgagatgtttatgtgct 23469870  T
Q  640 gcctatg 646  Q
    |||||||    
T  23469869 gcctatg 23469863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Original strand, 22107386 - 22107495
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22107386 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaggt 22107485  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  22107486 gctgcctatg 22107495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22336976 - 22336748
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  22336976 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 22336877  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||      
T  22336876 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtga 22336777  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||    
T  22336776 aattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22336748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 444
Target Start/End: Original strand, 8504266 - 8504496
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  8504266 atgaaagttgtagataattatgttagctttcctgtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggt 8504365  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   |  |||| ||||| || |  |||||| || ||||    
T  8504366 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtcttcaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattca 8504464  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8504465 attaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 8504496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 442 - 642
Target Start/End: Original strand, 25574330 - 25574525
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 541  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    ||||    
T  25574330 gttatgagttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatag----taat 25574425  T
Q  542 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgc 641  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25574426 gtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatta-ttgaaatagttatatcttgagatgtttatgtgctgc 25574524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 442 - 642
Target Start/End: Original strand, 25575523 - 25575718
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 541  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    ||||    
T  25575523 gttatgagttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatag----taat 25575618  T
Q  542 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgc 641  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25575619 gtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatta-ttgaaatagttatatcttgagatgtttatgtgctgc 25575717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 16605000 - 16605231
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16605000 catgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatggtttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 16605099  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||  ||||||    
T  16605100 tcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttataagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttc 16605198  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16605199 aattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 16605231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22340514 - 22340286
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  22340514 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaagagttatgatgaaaatactccaagtagg 22340415  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||      
T  22340414 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttataggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtga 22340315  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||    
T  22340314 aattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22340286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18744305 - 18744074
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  18744305 catgaaagttatagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18744206  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  | |||| ||||||    
T  18744205 tcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttc 18744107  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18744106 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18744074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 14026204 - 14026435
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||  |||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  14026204 catgaaagttttagataattatgttatatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 14026303  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||| || ||||||| || ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||     
T  14026304 tcttagtgaaattttatgaaaatcccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacatatggattgtctccaaacttcaaatcttg-tgtactatgagttg 14026402  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14026403 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14026435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 440 - 633
Target Start/End: Original strand, 26740505 - 26740693
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||     |    
T  26740505 atgttgtgagttgatccttggggtaggagtggaggttgattataatgttactgatgttctgtgaatttgttattacatgatttaatgttgataga----a 26740600  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  26740601 atgtgatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatccttagatgttta 26740693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 339
Target Start/End: Original strand, 24617319 - 24617446
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  24617319 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 24617418  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 339  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  24617419 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24617446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 339
Target Start/End: Original strand, 24713550 - 24713677
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  24713550 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 24713649  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 339  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  24713650 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24713677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 339
Target Start/End: Original strand, 24746578 - 24746705
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  24746578 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 24746677  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 339  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  24746678 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24746705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 446 - 646
Target Start/End: Original strand, 26732698 - 26732893
Alignment:
Q  446 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 545  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||     ||||| |    
T  26732698 tgagttgatccttggggtaagaatggaggttgattataatgttactgatgttctgtgaatatgttattacatgatttaatgttgataga----aatgtga 26732793  T
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctat 645  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |  ||||||||    
T  26732794 tatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaag-tgtcgttgattattatttgatattgttatatcctgagatgtttatgcactgcctat 26732892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 322
Target Start/End: Original strand, 43243054 - 43243164
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43243054 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgattttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 43243153  T
Q  312 tcttagtgaaa 322  Q
    ||||| |||||    
T  43243154 tcttaatgaaa 43243164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 23199788 - 23199942
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||     
T  23199788 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcccatggctttggtttgacttgaaaat---ttttggtttctgagttatgatgaaaatactccaaggagg 23199884  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  23199885 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 23199942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 1627777 - 1628008
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | || | | |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| || |||     
T  1627777 catgaaagttttagataattgtgttatctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttaacttttgagttatgatgaaaatactcgaaggagg 1627876  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  1627877 tcttaatgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 1627975  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1627976 aattaacgtgtttaagagtatttaacctatgtt 1628008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 37804469 - 37804588
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  37804469 catgaaagttgtagataatgttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 37804568  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  37804569 tcttagtgaatttttatgaa 37804588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 339
Target Start/End: Original strand, 24668593 - 24668720
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||     
T  24668593 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggagg 24668692  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 339  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  24668693 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24668720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 339
Target Start/End: Original strand, 24738362 - 24738489
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||     
T  24738362 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggagg 24738461  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 339  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  24738462 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24738489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 339
Target Start/End: Original strand, 24751131 - 24751258
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||     
T  24751131 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggagg 24751230  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagc 339  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  24751231 tcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24751258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Original strand, 21328073 - 21328276
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata-atatgatttaatgttgatagctagt 538  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||| ||||  ||||| |||||||   || |||| | ||||||| ||||| |||   | |    
T  21328073 atgttatgagttgatccatgggggaggaatggaggtttattatagtattgttgatgttctgtgagtttgctatatacatgatttgatgtt-ata---aat 21328168  T
Q  539 aatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgc 638  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||||  ||||    
T  21328169 aatgtgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgctatatctgaatatgtttttgtgc 21328268  T
Q  639 tgcctatg 646  Q
    ||||||||    
T  21328269 tgcctatg 21328276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 562 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 22336711 - 22336627
Alignment:
Q  562 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22336711 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 22336627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 562 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 22340249 - 22340165
Alignment:
Q  562 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22340249 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 22340165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 28901576 - 28901346
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  |      
T  28901576 catgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaag 28901477  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| || || |||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  28901476 tcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagttt 28901378  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || |||    ||  ||||||||||||||||||    
T  28901377 aattaaaaggttggagagtatttaacctatgt 28901346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 28937971 - 28937741
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  |      
T  28937971 catgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaag 28937872  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| || || |||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  28937871 tcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagttt 28937773  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || |||    ||  ||||||||||||||||||    
T  28937772 aattaaaaggttggagagtatttaacctatgt 28937741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 282 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22111185 - 22111024
Alignment:
Q  282 ttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattca 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||     
T  22111185 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctcc 22111086  T
Q  382 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||| ||||| || |  |||||  |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22111085 aaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttctattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22111024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17909123 - 17908966
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||     
T  17909123 catgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggagg 17909024  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  17909023 ttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtctctaagtcaacccaaacctta 17908966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Original strand, 33895607 - 33895706
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33895607 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttg----------tttgatattgttgtatcttgagatgtttacgt 33895696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Original strand, 21809531 - 21809642
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21809531 tagtaatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgttta 21809629  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     || |||||||||    
T  21809630 tgttctgcctatg 21809642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 371 - 470
Target Start/End: Original strand, 12122077 - 12122175
Alignment:
Q  371 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  12122077 ggaataattctaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 12122175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 551 - 646
Target Start/End: Original strand, 21731426 - 21731522
Alignment:
Q  551 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  21731426 ttgtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgtttatgttctgcctatg 21731522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29351521 - 29351402
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||| ||  |||     
T  29351521 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggagg 29351422  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  29351421 tcttagtgaatttttatgaa 29351402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 10732508 - 10732626
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||| |    
T  10732508 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggaggt 10732607  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  10732608 cttagtgaatttttatgaa 10732626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 546 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 10816562 - 10816462
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgccta 644  Q
    |||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  10816562 tatatttgcaaatgcattatgtggagttatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgctaccta 10816464  T
Q  645 tg 646  Q
    ||    
T  10816463 tg 10816462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 182 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20909637 - 20909528
Alignment:
Q  182 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 281  Q
    |||||||| |||||||| ||| || ||   |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909637 tttctgttttgaattagcttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 20909538  T
Q  282 ttgagatatg 291  Q
     |||| ||||    
T  20909537 atgagttatg 20909528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 264335 - 264414
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  264335 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtgccgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 264414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 579 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 18356323 - 18356256
Alignment:
Q  579 gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18356323 gatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 18356256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23065109 - 23065030
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  23065109 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 23065030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 549 - 632
Target Start/End: Original strand, 27988892 - 27988978
Alignment:
Q  549 atttgtatatgcatt-atgtgaattatataagatgtttaa--gttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  27988892 atttgtatatgcattgatgtgaattatacaagatgtttaaatgttgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagctgttt 27988978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29346575 - 29346456
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||| ||  |||     
T  29346575 catgaaagttgtagataattgcgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggagg 29346476  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  29346475 tcttagtgaatttttatgaa 29346456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29349048 - 29348929
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||| ||  |||     
T  29349048 catgaaagttgtagataattgcgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggagg 29348949  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  29348948 tcttagtgaatttttatgaa 29348929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 546 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 23538588 - 23538495
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  23538588 tatatttgaaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatgatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgct 23538495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 42244933 - 42245051
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||  || |    
T  42244933 atgaaagttgtagataattttattagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggt 42245032  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  42245033 cttagtgaatttttatgaa 42245051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 562 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 22750325 - 22750264
Alignment:
Q  562 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 623  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22750325 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 22750264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 533 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 15796594 - 15796479
Alignment:
Q  533 gctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatg-t 630  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| || |    
T  15796594 gctaataatgtgatataattgtatatacagtatgcgaattataagagatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgctatatcatgagctgtt 15796495  T
Q  631 ttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||| ||||||||||||    
T  15796494 ttatgtgctgcctatg 15796479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 445 - 576
Target Start/End: Original strand, 18318942 - 18319068
Alignment:
Q  445 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgta 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||     || |||     
T  18318942 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgacgacctgtgaagctgttataacatgattcaatgttgtta-----tattgtg 18319036  T
Q  545 atatatttgtatatgcattatgtgaattatat 576  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18319037 atataattgtatatgcattaattgaattatat 18319068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 440 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 20572149 - 20572025
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata-atatgatttaatgttgatagctagt 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||| |||||||  ||| || | | ||||||| |||||    | ||||    
T  20572149 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgattttactattgttgatgttctgtgagtctgctaaatacatgatttgatgtt----gttagt 20572054  T
Q  539 aatgtaatatatttgtatatgcattatgt 567  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20572053 aatgtaatatagttgtatatgcattatgt 20572025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 579 - 646
Target Start/End: Original strand, 20910910 - 20910977
Alignment:
Q  579 gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20910910 gatgtataagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 20910977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 39245731 - 39245652
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  39245731 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaattattttcggtttatgagttatg 39245652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 562 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 19511577 - 19511516
Alignment:
Q  562 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 623  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  19511577 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatatcgttatatctt 19511516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 182 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 38620061 - 38619952
Alignment:
Q  182 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 281  Q
    |||||||| ||||||||  || || || | |||||||||||||||||||| |||||| ||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38620061 tttctgttttgaattagcctttggtgtatacatgaaagttgtagataattgtgttagattttcagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggttt 38619962  T
Q  282 ttgagatatg 291  Q
     |||| ||||    
T  38619961 atgagttatg 38619952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 10753387 - 10753328
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10753387 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacatgttgcctatg 10753328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 31479026 - 31478801
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||  |||||| | |||||||||| ||||  |||||| | ||||||  ||||||||||||||| || | ||     
T  31479026 catgaaagttttagataaagatgttagctttataatgactttggtttgacttaaaaagaatttttagattttgatttatgatgaaaatactacagt-agg 31478928  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||| ||  |||||  || ||  |  ||| ||| ||||||||| | |||||||||||||     
T  31478927 tcttggtgaaattttacgaaaattcagcataaccatttttaagtgaactcaaaagctatggtttggttccaaaactcaaaacttg-agtactaggagttt 31478829  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacct 439  Q
    || || | | ||||||||||||||||||    
T  31478828 aattatgatgtttaagagtatttaacct 31478801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11993 - 11903
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  11993 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 11903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25426267 - 25426177
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  25426267 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 25426177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 30614069 - 30613937
Alignment:
Q  311 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   |  |||  ||||| || |  |||||| |||||    
T  30614069 atcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctttaaaattcaaagcttg-tgtactatgagtt 30613971  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30613970 gaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 30613937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 39363979 - 39363900
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  39363979 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 39363900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13938503 - 13938457
Alignment:
Q  182 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagata 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13938503 tttctgttccgaattaggtttgggcgtcttcatgaaagttgtagata 13938457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Original strand, 35791744 - 35791834
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||| |||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  35791744 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgttcaaataatttttagaacttgagatatgattaaattact 35791834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 302
Target Start/End: Original strand, 21074229 - 21074318
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  21074229 atgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21074318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 399 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 26749583 - 26749534
Alignment:
Q  399 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26749583 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 26749534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 30612109 - 30611977
Alignment:
Q  311 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| ||||| || |||||| ||| ||| |   || |||  |||||||| |  |||||| |||||    
T  30612109 atcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttgtaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaaacttgt-gtactatgagtt 30612011  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30612010 gaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 30611977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 22367114 - 22367178
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  22367114 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 22367178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 15236863 - 15236922
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  15236863 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 15236922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 19472803 - 19472862
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  19472803 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 19472862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 20295870 - 20295811
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  20295870 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 20295811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 221
Target Start/End: Original strand, 25582095 - 25582130
Alignment:
Q  186 tgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25582095 tgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagtt 25582130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 40723670 - 40723729
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40723670 agttgttgttgattatcatttaatattgatatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 40723729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 632
Target Start/End: Original strand, 22178172 - 22178266
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  22178172 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttt 22178266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7424967 - 7424886
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgat 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   ||||||||||||    
T  7424967 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 7424886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 593 - 646
Target Start/End: Original strand, 15236924 - 15236977
Alignment:
Q  593 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  15236924 tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 15236977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 510
Target Start/End: Original strand, 20765993 - 20766058
Alignment:
Q  445 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 510  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20765993 atgagttggtctttggggttggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgtt 20766058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 27183188 - 27183252
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  27183188 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 27183252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 43444028 - 43444092
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  43444028 catgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 43444092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7528518 - 7528427
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 303  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||| || ||||| || | | |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7528518 catgaaagttttagacaattgagttggcattccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactc 7528427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19499518 - 19499487
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499518 catgaaagttgtagataattttgttagctttc 19499487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9776761 - 9776699
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattt 274  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | | |||||||||| |||| |||||    
T  9776761 catgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggattt 9776699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11342280 - 11342190
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  11342280 catgaaagttgtagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 11342190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Original strand, 18778625 - 18778715
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||| || |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  18778625 catgaaagttgtagataattttgttagatttctaatggctttggttttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18778715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 9776550 - 9776513
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9776550 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 9776513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 1168811 - 1168875
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||| |||  |||||||||||    
T  1168811 catgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttggcttccaaatgattttt 1168875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 1220363 - 1220427
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  1220363 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgattttt 1220427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 21933262 - 21933298
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21933262 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 21933298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 21939432 - 21939468
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21939432 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 21939468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23506593 - 23506529
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||| |  |||||||||||    
T  23506593 catgaaagttttagataattatgttagttttctaatgactttggtttgacgtccaaatgattttt 23506529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23908735 - 23908687
Alignment:
Q  180 attttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagata 228  Q
    ||||||| |||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23908735 attttctattcctaattaggttttggtgtcttcatgaaagttgtagata 23908687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 35581430 - 35581394
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35581430 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 35581394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 36990658 - 36990694
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36990658 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 36990694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 16229 - 15802
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16229 catgaaagttttagataactttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16130  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||    
T  16129 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaaatactataagttc 16030  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16029 aattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattggtgatgatctgtgaagctgtta 15930  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||    || |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15929 taa---catataatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 15837  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15836 ttgttatatcttgagatgtttacgtgttacctatg 15802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 220 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 105560 - 105140
Alignment:
Q  220 ttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  105560 ttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtctaagtg 105461  T
Q  320 aaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaagg 419  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  105460 aaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaag 105361  T
Q  420 tatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatga 519  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  105360 tgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctatgaagctg-tataatatga 105263  T
Q  520 tttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttata 619  Q
    ||| |||||    | ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  105262 tttgatgtt----gttagtaatgtgatatatttgtatatgcattttttgaattatataagatgtttaatttgatgttaattatcatttgatattgttata 105167  T
Q  620 tcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  105166 tcttgagatgtttacgtgctgcctatg 105140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 212 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 162940 - 162647
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||     
T  162940 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaagaagg 162841  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  162840 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacatatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 162741  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaag 505  Q
    || |||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  162740 aattaaggtgtttaagagtatttaattcatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaag 162647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 95006 - 94927
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  95006 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 94927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 274
Target Start/End: Original strand, 17202 - 17261
Alignment:
Q  215 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattt 274  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||| | | |||||||||| ||||||||||    
T  17202 gaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgattt 17261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 260
Target Start/End: Original strand, 154871 - 154919
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttga 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||    
T  154871 catgaaagttttagataattttgttagctttataatgacgttggtttga 154919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 905 - 477
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  905 catgaaagttgtagataattttgttagcttacgaatgactttggtttgacttgaaactgatatttcgtttttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 806  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  805 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttc 706  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  705 aattaaggtgtttaagattatttaacccatgttatgagttgatc-ttggagtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctatgaagctg-ta 608  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||| |||| |||||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  607 taatataatttgatgtt----gttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatgttaattatcatttgata 512  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  511 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctccctatg 477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 165)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Original strand, 15817154 - 15817582
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  15817154 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgataatactccaagaagg 15817253  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||    
T  15817254 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaactagaagtattatgaggtc 15817353  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15817354 aattaagttgtttaagattatttaacccatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgtgaagctg-ta 15817451  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||    | |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  15817452 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgtggtatatttgaatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttaattatcatttgata 15817547  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15817548 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcatatg 15817582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Original strand, 14979018 - 14979448
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  14979018 catgaaagttgtagataattaagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatgtttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 14979117  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14979118 tcttggtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaatttaatccaaaacttatagaataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 14979217  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  14979218 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcattggggtagggatggaggttgaatataacattactgaggatctgtgaagctgtta 14979317  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14979318 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 14979413  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||    
T  14979414 ttgttatatctcaagatgtttaagtgatgcctatg 14979448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 212 - 633
Target Start/End: Original strand, 25619353 - 25619770
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||     
T  25619353 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatggaaatagtccaaggagg 25619452  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||    
T  25619453 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtaccatgagttc 25619552  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||    
T  25619553 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcattggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgatctgtgatgttgtta 25619652  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25619653 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatttttaagttgatgttgattatcatttgatg 25619748  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  25619749 ttgttatatctcaagatgttta 25619770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 212 - 620
Target Start/End: Original strand, 20556489 - 20556893
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  20556489 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 20556588  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||     
T  20556589 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaaatactatgagtta 20556688  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||    
T  20556689 aattaaggtgttaaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttcgggtaggaatgagggttgaatataatattactgatgatatgagaagctatta 20556788  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20556789 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatg 20556884  T
Q  612 ttgttatat 620  Q
    |||||||||    
T  20556885 ttgttatat 20556893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 152 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 27851719 - 27851394
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  27851719 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttttgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggat 27851620  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 351  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  27851619 ttggtttcacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttct 27851520  T
Q  352 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 451  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  27851519 aagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtc 27851420  T
Q  452 gatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || | |||||||||||||||||||||    
T  27851419 gaccattggggtaggaatggaggttg 27851394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 152 - 477
Target Start/End: Original strand, 20733783 - 20734107
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  20733783 cgagcattggaaaatcaatttttctggaattttctattctgaattaggtttgggagtattcatgaaagttttagataattttgttagctttccaatggct 20733882  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 351  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  20733883 ttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa-tctatgaaaattcagcataactgtttct 20733981  T
Q  352 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 451  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20733982 aagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtc 20734081  T
Q  452 gatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || | |||||||||||||| ||||||    
T  20734082 gacccttggggtaggaatgaaggttg 20734107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 4477314 - 4476884
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||     
T  4477314 catgaaagttgtagataatttcgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttatgagttatgatgaaaatactccaagtagg 4477215  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  4477214 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 4477115  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||    ||||| |  ||||  | ||||    
T  4477114 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtaccgttgatgttgagtgagtcagtta 4477015  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||| |||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  4477014 taatataatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgata 4476919  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4476918 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 4476884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28948000 - 28947768
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  28948000 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 28947901  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  28947900 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 28947801  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28947800 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 28947768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 18658862 - 18658598
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||     
T  18658862 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaaatatgataaaaatactccgaggagg 18658763  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18658762 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 18658663  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  18658662 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 18658598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23956518 - 23956265
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  23956518 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 23956419  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23956418 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttt 23956319  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  23956318 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 23956265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 317 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 23415262 - 23414944
Alignment:
Q  317 gtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 416  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  23415262 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatta 23415163  T
Q  417 aggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataata 516  Q
    |||| ||||||| |||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23415162 aggtgtttaagaatata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataata 23415070  T
Q  517 tgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgtt 616  Q
    ||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23415069 tgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 23414974  T
Q  617 atatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23414973 atatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 23414944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 212 - 492
Target Start/End: Original strand, 15173851 - 15174130
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15173851 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgagg 15173950  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15173951 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 15174050  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 492  Q
    || |||  | |||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  15174051 aattaaattgtttaagggtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 15174130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 198 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18928393 - 18928149
Alignment:
Q  198 ggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaa 297  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18928393 ggtttgggtgtatacatgaaagttgtagagaattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagatatgatgaaa 18928294  T
Q  298 atactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactaga 397  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18928293 atactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattcaaaaactcaaaactaga 18928194  T
Q  398 agtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18928193 agtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtattttacctatg 18928149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 315 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 27557022 - 27556702
Alignment:
Q  315 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 414  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||| ||||||| ||| ||||||||     
T  27557022 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagttctatgagttcaat 27556923  T
Q  415 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataa 514  Q
    |||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27556922 taaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataa 27556830  T
Q  515 tatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttg 614  Q
    ||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27556829 tatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgatcatcatttgatgttg 27556734  T
Q  615 ttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  27556733 ttatatattgagatgtttacgtgtcgcctatg 27556702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 23838655 - 23838234
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |      
T  23838655 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtatg 23838556  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||| |||  || | |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||| |    
T  23838555 tcttagggaaatcttaagaaaattcagcacaaccattaccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgc 23838456  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| |||         ||||| || || |||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||| | |  ||||  | | ||    
T  23838455 aattaaggtgttt---------taacccattttgtgagttgacccttgaggtaggaatggaggttgattatagtactgttgaggttgagtgagtcagata 23838365  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||| |||    |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23838364 taatatgatttgatgttgttag----taatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgata 23838269  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23838268 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 23838234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Original strand, 5834131 - 5834366
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  5834131 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 5834230  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5834231 tcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-taatccaaaacatagggaataattctaaatctcaaaactagaagtactaggagttc 5834329  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5834330 aattaaggtgactaagagtatttaacctatgttatga 5834366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 392 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 25755196 - 25754972
Alignment:
Q  392 actagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaat 491  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  25755196 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgtgggttgaatataatattact 25755097  T
Q  492 gatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 591  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25755096 gatgatctttgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattttataagatgtttaagttg 25755001  T
Q  592 atgttgattatcatttgatgttgttatat 620  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25755000 atgttgattatgatttgatgttgttatat 25754972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 611396 - 611139
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  611396 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 611297  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  611296 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaattactatgagttc 611197  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  611196 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 611139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Original strand, 19825885 - 19826142
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  19825885 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgaatttgttttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 19825984  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19825985 tcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatcggataattccaaaccttaaaactagaagtactatgagttc 19826084  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || |||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  19826085 aattaaggtgtttaagagtatttaaattatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 19826142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 7827628 - 7827396
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | || | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  7827628 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagaagg 7827529  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7827528 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttc 7827429  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7827428 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 7827396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 19655625 - 19655857
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  19655625 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 19655724  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19655725 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 19655824  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19655825 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19655857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20177401 - 20177166
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  20177401 catgaaagttttagacaattttgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 20177302  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20177301 tcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-caatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactataagtactaggagttc 20177203  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20177202 aattaaggtgtctaagagtatttaacctatgttatga 20177166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 23491567 - 23491799
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||     
T  23491567 catggaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggagg 23491666  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  23491667 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagttt 23491766  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23491767 aattaaggtgtttaagagtatctaacatatgtt 23491799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 23497165 - 23497397
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||     
T  23497165 catggaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggagg 23497264  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  23497265 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagttt 23497364  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23497365 aattaaggtgtttaagagtatctaacatatgtt 23497397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 216 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18709151 - 18708923
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || |    
T  18709151 aaagttgtagatcattgagttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcat 18709052  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18709051 agtgaaatctaatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaact 18708952  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18708951 agggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18708923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Original strand, 22158590 - 22158825
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  22158590 catgaaagttttagacaattttgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 22158689  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22158690 tcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-aaatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactaaaagtactaggagttc 22158788  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  22158789 aattaaggtgactaagagtatttaacctatgttatga 22158825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 212 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13765002 - 13764730
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||       || ||||||||||||||||||| |||     
T  13765002 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttg-------agttatgatgaaaatactccaaggagg 13764910  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  13764909 tcttaatgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtta 13764810  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 492  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| ||| || ||||  |||||||||||||    
T  13764809 aattaaggtgttttagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggtagaaat-gaagttgtttataatattaatg 13764730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 17318518 - 17318750
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  17318518 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 17318617  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17318618 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaggtaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 17318717  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17318718 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17318750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 216 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18703216 - 18702988
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || |    
T  18703216 aaagttgtagattattgagttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcat 18703117  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  18703116 agtgaaatctaatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 18703017  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18703016 agggtttttaagagtatttaacctatgtt 18702988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 23150663 - 23150894
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||     
T  23150663 catgaaagttgtagataattgagttagcttttcaatggctttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaagtagg 23150762  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23150763 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttc 23150862  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23150863 aact-aggtgtttaagagtatttaacctatgtt 23150894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Original strand, 25601673 - 25601904
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  25601673 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgcgttatgatgaaaatactccaaggagg 25601772  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||     
T  25601773 ttttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaataagagttt 25601872  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25601873 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 25601904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 212 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 1254413 - 1254215
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||     
T  1254413 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 1254314  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1254313 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 1254215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 440 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 33443307 - 33443122
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  33443307 atgttatgagttgatccttagggtaggaatggaggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 33443212  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33443211 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagt---tgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 33443122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 457
Target Start/End: Original strand, 29847899 - 29848146
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  29847899 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgaatttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 29847998  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaa--ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagt 409  Q
    ||||| |||||| || ||||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29847999 tcttaatgaaatcttatgaaaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagt 29848098  T
Q  410 tcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  29848099 tcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatctt 29848146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 212 - 431
Target Start/End: Original strand, 15891107 - 15891326
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15891107 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 15891206  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||    
T  15891207 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctaaaaactagaagtactatgatttc 15891306  T
Q  412 aactaaggtatttaagagta 431  Q
    || || ||| ||||||||||    
T  15891307 aattagggtgtttaagagta 15891326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 212 - 438
Target Start/End: Original strand, 8767659 - 8767885
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||     
T  8767659 catgaaagttgtagatacttttgttagctttccaatggctttggtttgacatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaagtactccaaggagg 8767758  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  8767759 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 8767858  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacc 438  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||    
T  8767859 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 8767885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 212 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25347782 - 25347556
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25347782 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttaacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25347683  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||    
T  25347682 tcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtgccatgagttc 25347583  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacc 438  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||    
T  25347582 aattaaggtgtttgagagtatttaacc 25347556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 437
Target Start/End: Original strand, 19773105 - 19773330
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||   |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  19773105 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggtttttgtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 19773204  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19773205 tcttagtgaaattttatgaaaatttagcataactgtttttaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 19773304  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  19773305 aattaaggggtttaagagtatttaac 19773330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 437
Target Start/End: Original strand, 15705007 - 15705232
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||     
T  15705007 catgaaaattgtagataattgagttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacctcaagtagg 15705106  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15705107 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 15705206  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  15705207 aattaaggggtttaagagtatttaac 15705232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 31734362 - 31734132
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| ||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31734362 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatattagattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 31734263  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31734262 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtact--gagttc 31734165  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31734164 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 31734132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20183219 - 20182984
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  20183219 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 20183120  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| || |||||||||||| |||||     
T  20183119 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctc-aagctagaagtactatgagttt 20183021  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20183020 aattaaggtgtttaagagtatttaacctttgttatga 20182984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Original strand, 22152772 - 22153007
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  22152772 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 22152871  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| || |||||||||||| |||||     
T  22152872 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctc-aagctagaagtactatgagttt 22152970  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22152971 aattaaggtgtttaagagtatttaacctttgttatga 22153007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 212 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23655995 - 23655804
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23655995 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgccttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23655896  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtact 403  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23655895 tcttagtaaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagtact 23655804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 27125872 - 27126105
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt-ggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 310  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  ||||||  |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||    
T  27125872 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggcttttgtttgaggtgaaaatgattttttggttcttgagatacgatgaaaatactttaaaaag 27125971  T
Q  311 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27125972 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaagaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 27126071  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27126072 caactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 27126105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 212 - 455
Target Start/End: Original strand, 16133066 - 16133309
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  16133066 catgaaagttgtagaaaattttgttagctttccaatgtcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 16133165  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||| |  |  ||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||| || ||||||| |   || |||||||||||||||| ||||||    
T  16133166 tcttagtgaattcataggaaaattcagcataaccatttccaagttaatcggaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtactatgagttc 16133265  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 455  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16133266 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 16133309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 216 - 455
Target Start/End: Original strand, 19443681 - 19443919
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||    
T  19443681 aaagttgtagaaaattt-gttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgaagaaaatactccacgtaggtctt 19443779  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| || ||||||| | | || |||||||||||||||| |||||||| |    
T  19443780 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatcgaaaacttatgggataattccagaactaaaaactagaagtactatgagttcaatt 19443879  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 455  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19443880 aaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 19443919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 392 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 25753026 - 25752838
Alignment:
Q  392 actagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaat 491  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  25753026 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattact 25752927  T
Q  492 gatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 584  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25752926 gatgatctatgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 25752838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 212 - 438
Target Start/End: Original strand, 8759913 - 8760138
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  8759913 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctgtggattgacatgaaaataatttt-ggtttttgagatattatgaaaatactccaaggagg 8760011  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  8760012 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttc 8760111  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacc 438  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||    
T  8760112 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 8760138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 216 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 940 - 755
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  940 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttttacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 841  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagta 401  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  840 agtgaaatcttatgaaaattcagtataattgtttctaagttaatctaaaatttatggaataattccaaagctcaaaactagaagta 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 182 - 440
Target Start/End: Original strand, 27317919 - 27318179
Alignment:
Q  182 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagcttt--ccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggt 279  Q
    |||||||| ||||||||  || |||||   ||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||| || | | | |||||| |||||| ||||||||||    
T  27317919 tttctgttttgaattagcctttggagtaaacatgaaagttgtagataattgagttagctatatccagtggctttgatttgacgtgaaaaggatttttggt 27318018  T
Q  280 ttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatt 379  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  27318019 tcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaattcaaaactagaggaataatt 27318118  T
Q  380 caaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  27318119 caaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatatggtgtttaagagtatttaaccta 27318179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Original strand, 34296664 - 34296923
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgtt-agctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 310  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| | | | || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  34296664 catgaaagttgtagatatttttttttagcttcccaaaggctttggcttcacttgaaaatgatttttggtttttgggatatgatgaaaatactccaaggag 34296763  T
Q  311 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
     |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  34296764 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaaggactatgagtt 34296863  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
     || || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| || | ||||||| ||||||    
T  34296864 taattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaatg 34296923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 440 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 20224205 - 20224018
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  20224205 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagta 20224110  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 631  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  20224109 atgtaatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 20224018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 440 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 22118189 - 22118002
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  22118189 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagta 22118094  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 631  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  22118093 atgtaatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 22118002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 18453444 - 18453242
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||| ||||||||| |||||| |||    ||    
T  18453444 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatactactgttgatgttcagtgagtctgatattatatgatttgatgttgttag----ta 18453349  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18453348 atgtgatatagttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgattttgttatatcttgagatgtttatgtgct 18453249  T
Q  640 gcctatg 646  Q
    |||||||    
T  18453248 gcctatg 18453242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 212 - 386
Target Start/End: Original strand, 31022093 - 31022267
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  31022093 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggaga 31022192  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacc 386  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31022193 tcttagtgaaattttatgaaaattcactaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacc 31022267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 18455468 - 18455699
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  18455468 catgaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagg 18455567  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || | | ||||| ||||||    
T  18455568 ttttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgta-tactatgagttc 18455666  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18455667 aattaaggtctttaagagtatttaacctatgtt 18455699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 25921385 - 25921154
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25921385 catgaaagttttagataattgtgttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 25921286  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| | | |   || |||| |||||  | |  |||||| ||||||    
T  25921285 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttc 25921187  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25921186 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 25921154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 212 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 25807788 - 25807602
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  25807788 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttgtcgtgaaaattatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 25807689  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaa 398  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||    
T  25807688 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaa 25807602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 216 - 448
Target Start/End: Original strand, 20411072 - 20411303
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||| || | | |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20411072 aaagttgtagacaattgtgttagcattccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttggtttttgaggtatgatgaaaatactccaaggagatctt 20411171  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| || |||||||| |    
T  20411172 agtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttg-tgtaatatgagttcaatt 20411270  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20411271 aagttgtttaagagtatttaacctatgttatga 20411303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Original strand, 19773494 - 19773603
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19773494 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttcttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 19773593  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||| ||||    
T  19773594 gctgcatatg 19773603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 513 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 22806120 - 22805992
Alignment:
Q  513 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 612  Q
    ||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  22806120 aatatgatttaatgttgatgg----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-agttgttgttgattatcatttgatat 22806026  T
Q  613 tgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22806025 tgttatatcttgtgatgtttacgtgctgcctatg 22805992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 32259502 - 32259272
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  32259502 catgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 32259403  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| || || || |  |||||| ||||||    
T  32259402 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttc-aagcttg-tgtactatgagttc 32259305  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32259304 aattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 32259272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 216 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29044962 - 29044809
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  29044962 aaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatctt 29044863  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  29044862 agtgaaatgttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactta 29044809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 538 - 646
Target Start/End: Original strand, 28103851 - 28103959
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 637  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28103851 taatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattatataagttgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttataccttgagatgtttacgtg 28103950  T
Q  638 ctgcctatg 646  Q
    |||||||||    
T  28103951 ctgcctatg 28103959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 7430179 - 7430069
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7430179 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 7430080  T
Q  312 tcttagtgaaa 322  Q
    ||||| |||||    
T  7430079 tcttaatgaaa 7430069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 34141023 - 34141178
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| | || | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  34141023 catgaaagttttagataatt--gttagctttctagtggcgttggtatgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaaga 34141120  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  34141121 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactta 34141178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 34153639 - 34153794
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| | || | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  34153639 catgaaagttttagataatt--gttagctttctagtggcgttggtatgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaaga 34153736  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  34153737 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactta 34153794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 537 - 634
Target Start/End: Original strand, 15705395 - 15705492
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 634  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15705395 gtaatgtaatatatttgtttatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 15705492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18585274 - 18585117
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  18585274 catgaatgttttagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18585175  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  18585174 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaactta 18585117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22556905 - 22556676
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | |||| | ||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  ||     
T  22556905 catgaaacttgtagataattgtgtttgatttctagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaacatactccaagaagg 22556806  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||  |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22556805 tcttagtgaaattttatgaaaattttgcataaccatttctaggtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacatcaaaactagaagtactaggagttt 22556706  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 441  Q
     | |||||  ||||||||||||||||||||    
T  22556705 cattaaggggtttaagagtatttaacctat 22556676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 215 - 443
Target Start/End: Original strand, 17857091 - 17857319
Alignment:
Q  215 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 314  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  17857091 gaaagttttagataattgtgttagatttccaatggctttggtatgacttgaaaatgatttttagattttgggttatgatgaaaacactccaaggaggtct 17857190  T
Q  315 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 414  Q
    | |||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||| ||||||| ||||||| ||||| || ||     
T  17857191 tggtgaaattttatgaaaattccggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaacgagaagtattaggaatttaat 17857290  T
Q  415 taaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17857291 taagaggtttaagagtatttaacctatgt 17857319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18398574 - 18398343
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||     
T  18398574 catgaaagttttagataattgtgttagctttctattggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccagggagg 18398475  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||  || |   || |||| |||||||| |  || ||| ||| ||    
T  18398474 tcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaaacttg-tgttctatgagctc 18398376  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18398375 aattaaggtgtttaagagtatttaacttatgtt 18398343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 440 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 18696749 - 18696609
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    | || ||    
T  18696749 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttatcatatgatttaatgtt----gttaata 18696654  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 584  Q
    |||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  18696653 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt 18696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 13285364 - 13285136
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| | || | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||     
T  13285364 catgaaaattttagataattatgttagctttctagtggctttagttttacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaacactccaaggagg 13285265  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  13285264 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagccaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 13285166  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 441  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13285165 atttaaggtgtttaagagtatttaacctat 13285136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12942785 - 12942666
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  12942785 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 12942686  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  12942685 tcttagtgaatttttatgaa 12942666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 440 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 18706568 - 18706391
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggg-gtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagt 538  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    | || |    
T  18706568 atgttatgagttgatccttggttgtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgtt----gttaat 18706473  T
Q  539 aatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || | |||||| |  |||||| ||||||||||    
T  18706472 aatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatt-tgctttgatattgttatatc 18706391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 20136840 - 20136730
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 634  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20136840 tagttatgtgatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 20136742  T
Q  635 gtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||    
T  20136741 gtgctgcctatg 20136730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Original strand, 22196029 - 22196139
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 634  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22196029 tagttatgtgatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 22196127  T
Q  635 gtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||    
T  22196128 gtgctgcctatg 22196139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 28288903 - 28289022
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  28288903 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggttggactcgaaaatgagttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggagg 28289002  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  28289003 tcttagtgaatttttatgaa 28289022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 322
Target Start/End: Original strand, 14594021 - 14594131
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14594021 catgaaagttgtagataattttgttagctttccgatggctttggtttgatttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 14594120  T
Q  312 tcttagtgaaa 322  Q
    ||||| |||||    
T  14594121 tcttaatgaaa 14594131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 212 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22806405 - 22806276
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  22806405 catgaaatttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtagg 22806306  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcat 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22806305 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcat 22806276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 480 - 625
Target Start/End: Original strand, 18896215 - 18896354
Alignment:
Q  480 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 579  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||    |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18896215 tataatattactgatgatctgtgaatctgttataaaa-gatttaatgttgttag----taatgggatataattgtatatgcattatgtgaattatataag 18896309  T
Q  580 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 625  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  18896310 atgtttaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 18896354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23415560 - 23415441
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23415560 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttgttgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23415461  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  23415460 tcttagtgaatttttatgaa 23415441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 480 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 19362646 - 19362507
Alignment:
Q  480 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 579  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19362646 tataatattactgatgatctgtgaaactgttataa-atgatttaatgttgttag----taatgtgatataattttatatgcattatgtgaattatttaag 19362552  T
Q  580 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 625  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  19362551 atgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 19362507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Original strand, 27330368 - 27330488
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27330368 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 27330467  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaa 332  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  27330468 tcttagtgaaatcttatgaaa 27330488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Original strand, 27391108 - 27391228
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27391108 catgaaagttgtagataattgagttagttttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 27391207  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaa 332  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  27391208 tcttagtgaaatcttatgaaa 27391228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 535 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 20182962 - 20182854
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 634  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  20182962 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttat 20182865  T
Q  635 gtgctgcctat 645  Q
    |||||||||||    
T  20182864 gtgctgcctat 20182854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 535 - 645
Target Start/End: Original strand, 22153029 - 22153137
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 634  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  22153029 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttat 22153126  T
Q  635 gtgctgcctat 645  Q
    |||||||||||    
T  22153127 gtgctgcctat 22153137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 545 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 23539130 - 23539032
Alignment:
Q  545 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcct 643  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23539130 atatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtatatgtgctgcct 23539032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 216 - 331
Target Start/End: Original strand, 19858493 - 19858608
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | || | |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  19858493 aaagttgtagataattgtgttagctttctagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaaggagatctt 19858592  T
Q  316 agtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||| |||| ||||    
T  19858593 agtgaatttttatgaa 19858608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Original strand, 15938622 - 15938857
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||| | ||| || | ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||  ||     
T  15938622 catgaaagttatagatgaattttttggttttccaatggctttggtttgacttgaaaattatttttatcttttgagttatgatgaaaatactctaagtagg 15938721  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||  |||||| | | |||  |||||||||    
T  15938722 tcttggtgaaattttacgaaaatttagcataactatttttaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaaattcaaaaattg-agtgttaggagttc 15938820  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  15938821 aattaaggtgtttaagggtatttaacctatgatatga 15938857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 16493317 - 16493206
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16493317 tagtaatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgttta 16493219  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     || |||||||||    
T  16493218 tgttctgcctatg 16493206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27557318 - 27557199
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||      
T  27557318 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtggatttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggatg 27557219  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  27557218 tcttagtgaatttttatgaa 27557199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 23221521 - 23221288
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||    |     
T  23221521 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatttttttggtttgacttgaaaatgatatttagatttggagttatgatgaaaatactccatgtggg 23221422  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | || |||||||||  |||| |||| ||  |  ||| |||| |||||| | | |||| ||||||||     
T  23221421 tcttagtaaaactttatgaaaattcagcataatttttcctaagttaaatcaaaccttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagttt 23221323  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttat 446  Q
    || |||| | |||||||||||| |||||| |||||    
T  23221322 aattaagatgtttaagagtattaaacctaggttat 23221288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33862388 - 33862270
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  33862388 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 33862289  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  33862288 cttagtgaatttttatgaa 33862270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 1540478 - 1540597
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | | ||||||| |||||||||  | | ||||||||||||||||||| |||     
T  1540478 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtgtggcataaaaatgagttttggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggagg 1540577  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  1540578 tcttagtgaatttttatgaa 1540597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 331
Target Start/End: Original strand, 15891979 - 15892094
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||    | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15891979 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggcttttgttttgtgttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 15892078  T
Q  316 agtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||||| ||||    
T  15892079 agtgaaattttatgaa 15892094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 538 - 632
Target Start/End: Original strand, 18177624 - 18177719
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  18177624 taatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18177719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 538 - 632
Target Start/End: Original strand, 18199368 - 18199463
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  18199368 taatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18199463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 538 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 18204247 - 18204152
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  18204247 taatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18204152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Original strand, 18334159 - 18334238
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18334159 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 18334238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24423142 - 24423063
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24423142 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 24423063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 538 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 23076900 - 23076806
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  23076900 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttt 23076806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 538 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 23538978 - 23538884
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  23538978 taatgtgatatagttgtatatgcgttatgtgaatgatatatgatgtttaggttgatgttgattgtcatttgatattgttatatcatgagctgttt 23538884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 35057160 - 35057066
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35057160 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgttttatggattttgagttatgatgaaaacactccaa 35057066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33864873 - 33864794
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33864873 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 33864794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Original strand, 2290747 - 2290821
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2290747 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 2290821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8055625 - 8055551
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8055625 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 8055551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 17883065 - 17883183
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | |||||| | | ||  |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  17883065 atgaaagttgtagataatttctttagctttccaatggctttggtttggcgttaatttgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 17883164  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  17883165 cttagtgaatttttatgaa 17883183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 291
Target Start/End: Original strand, 26924015 - 26924093
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26924015 atgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26924093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 535 - 631
Target Start/End: Original strand, 23528056 - 23528150
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 631  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||  |||||| |||||||||||||    
T  23528056 tagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagtcgatgttgatcgtcctttga--ttgttacatcttgagatgtt 23528150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 546 - 630
Target Start/End: Original strand, 29416865 - 29416949
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 630  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29416865 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 29416949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22782822 - 22782743
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  22782822 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccactggcgtcagtttgacttgaaaatgatatttggtttatgagttatg 22782743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12742908 - 12742794
Alignment:
Q  217 aagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctta 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  || ||   | ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  12742908 aagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtgtggagtaaaattgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctta 12742809  T
Q  317 gtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||| |||| ||||    
T  12742808 gtgaatttttatgaa 12742794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 538 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 35008318 - 35008224
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  35008318 taatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttgatattattatatctggatatgttt 35008224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 576
Target Start/End: Original strand, 16448435 - 16448561
Alignment:
Q  445 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgta 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||     || |||     
T  16448435 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgatggtctatgaagttgttataacatgattcaatgttgtta-----tattgtg 16448529  T
Q  545 atatatttgtatatgcattatgtgaattatat 576  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16448530 atataattgtatatgcattaattgaattatat 16448561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 16760318 - 16760259
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16760318 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 16760259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19234741 - 19234658
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatga 295  Q
    ||||| |||| |||| |||| |||||| ||| || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19234741 catgatagttttagacaattgtgttagattttcattggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatga 19234658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 22949131 - 22949072
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22949131 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 22949072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 22953087 - 22953028
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22953087 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 22953028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 23871575 - 23871516
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23871575 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 23871516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 23875531 - 23875472
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23875531 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 23875472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25175198 - 25175112
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||    
T  25175198 aaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagatattgagatatgattaaattact 25175112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Original strand, 27654616 - 27654706
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  27654616 catgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 27654706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 587 - 637
Target Start/End: Original strand, 31477893 - 31477943
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 637  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31477893 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtg 31477943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 371 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16135591 - 16135519
Alignment:
Q  371 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  16135591 ggaatatttccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 16135519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 594 - 646
Target Start/End: Original strand, 18955853 - 18955905
Alignment:
Q  594 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18955853 gttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 18955905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 15875498 - 15875443
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  15875498 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcatatg 15875443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16135699 - 16135613
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaat 299  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  16135699 catgaaagttttagttaattttgttagctttccaatggctttggtttaactt-aaaatgatttttatattttgagatatgatgtaaat 16135613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 486
Target Start/End: Original strand, 20078033 - 20078079
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 486  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20078033 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataata 20078079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31163622 - 31163536
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 298  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  31163622 catgaaggttttagataattatgttatatttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaa 31163536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 546 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 25738540 - 25738448
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| || |||||    
T  25738540 tatatttgcaaatgcattatgtggattatgaatgatgtttaagttga-gttgattattaattgatattgtcatatcttgagatgtctatgtgct 25738448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 442
Target Start/End: Original strand, 22523388 - 22523594
Alignment:
Q  235 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 334  Q
    ||||||||| |||| | | | |||| ||| || ||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||  ||  || |||| ||||||||||  ||||||    
T  22523388 ttagctttctaatggctttgttttggcttaaagatgatttttaggttttgagttatggtgaaaatactaaaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaat 22523487  T
Q  335 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaagg-tatttaagagtatt 433  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || ||| || ||| ||  |  |   ||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  22523488 tcagcataactatttttaagtgaacccataagttatggtttggtcgcaaacctcaaaacttg-agtactaggagtttaa-taaggatgtttaagagtatt 22523585  T
Q  434 taacctatg 442  Q
    |||||||||    
T  22523586 taacctatg 22523594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 11566885 - 11566826
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  11566885 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 11566826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 14472294 - 14472235
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  14472294 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 14472235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 18917349 - 18917408
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  18917349 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 18917408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 19870613 - 19870554
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  19870613 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 19870554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 22862969 - 22862910
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  22862969 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 22862910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 23395091 - 23395032
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  23395091 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 23395032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 23989943 - 23989884
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  23989943 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 23989884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 298
Target Start/End: Original strand, 3007508 - 3007594
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 298  Q
    |||||| ||| |||||||||  |||| |||| ||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  3007508 catgaaggttttagataattaggttatcttttcaatggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaa 3007594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 7429990 - 7429909
Alignment:
Q  557 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| ||||| || |||||    
T  7429990 atgcattatgtgaattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatgtgct 7429909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 480 - 576
Target Start/End: Original strand, 8227409 - 8227501
Alignment:
Q  480 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||| |   || |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8227409 tataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt---ta-taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 8227501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 8243884 - 8243838
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8243884 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgttta 8243838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 633
Target Start/End: Original strand, 12618927 - 12618973
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12618927 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgttta 12618973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Original strand, 16826387 - 16826477
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  16826387 catgaaagttgtagacaattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 16826477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Original strand, 21776115 - 21776205
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||   |||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  21776115 catgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21776205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 369
Target Start/End: Original strand, 31161878 - 31162012
Alignment:
Q  235 ttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaat 334  Q
    ||||| |||||||||| | | |||||| | |||||||||||| | ||||||| |||| |||||| |||||||  || |||| | ||||||||  | ||||    
T  31161878 ttagcattccaatgactttgatttgacatcaaaatgatttttagattttgagttatgttgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaagtaaat 31161977  T
Q  335 tcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    | ||||| ||| |||| |||| || ||||||||||    
T  31161978 ttagcatgactatttccaagtcaacccaaaactta 31162012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 479 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 18456938 - 18456846
Alignment:
Q  479 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||| ||     || ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18456938 atataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtta-----tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18456846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 606 - 646
Target Start/End: Original strand, 17377818 - 17377858
Alignment:
Q  606 ttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17377818 ttgatgttgtcatatcttgagatgtttacgtgctgcatatg 17377858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 355
Target Start/End: Original strand, 32277441 - 32277541
Alignment:
Q  255 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaag 354  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| || ||| | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || ||||||||||    
T  32277441 gtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaag 32277540  T
Q  355 t 355  Q
    |    
T  32277541 t 32277541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1555617 - 1555527
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  1555617 catgaaagttttaaataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 1555527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 557 - 639
Target Start/End: Original strand, 14594210 - 14594291
Alignment:
Q  557 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| ||||| || |||||    
T  14594210 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatgtgct 14594291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 479 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 25644545 - 25644495
Alignment:
Q  479 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 529  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  25644545 atatgatattaatgatgatctgtgaagctgatatatgatgatttgatgttg 25644495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 593 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 1644725 - 1644672
Alignment:
Q  593 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||  |||||||    
T  1644725 tgttgattatcatttgatattgttatattctgagatgtttatgtgtcgcctatg 1644672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 12942393 - 12942356
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  12942393 gatgttgattaccatttgatgttgttatattttgagat 12942356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 483
Target Start/End: Original strand, 17229776 - 17229817
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 483  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17229776 gttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 17229817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19609670 - 19609621
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgac 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||    
T  19609670 catgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgac 19609621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10488061 - 10488025
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10488061 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 10488025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16240386 - 16240322
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  16240386 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 16240322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 16377267 - 16377303
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16377267 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 16377303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 16384591 - 16384627
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16384591 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 16384627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 22226588 - 22226652
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  22226588 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 22226652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25904565 - 25904501
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  25904565 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 25904501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 33315095 - 33315131
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33315095 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 33315131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 212 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 672 - 269
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||     
T  672 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagttttttagatatgatgaaaatagtccaaggagg 573  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  572 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 473  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || ||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  472 aattaaggt-gttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctttta 374  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  373 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagctgatgttgattatgatttgatg 278  T
Q  612 ttgttatat 620  Q
    |||||||||    
T  277 ttgttatat 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 109)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Original strand, 13881012 - 13881442
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||   | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| |||     
T  13881012 catgaaagttgtagataattgagttagctttacagtggttttggtttgacttggaaatgatttttagtttttgtgatatgatgaaattagtccaaggagg 13881111  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  13881112 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactaaaagtaatatgagttc 13881211  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  13881212 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgatctgtgaagctgtta 13881311  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13881312 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 13881407  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||    
T  13881408 ttgttatatctcaagatgtttatgtgatgcctatg 13881442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 212 - 614
Target Start/End: Original strand, 22130461 - 22130858
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22130461 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggaattggtttgatttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 22130560  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22130561 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataatcttttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 22130660  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  22130661 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaagttgaatataatattactgatgatctgtgaagctacta 22130760  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22130761 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg-tgattatgatttgatg 22130855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 212 - 620
Target Start/End: Original strand, 45574448 - 45574841
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  45574448 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 45574547  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| |||||||           |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45574548 tcttggtgaaat-----------tcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtgctatgagttc 45574636  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  45574637 aattaaggtgtttaagcgtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctatta 45574736  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45574737 taatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatg 45574832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 28313004 - 28312574
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  ||     
T  28313004 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtagg 28312905  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  28312904 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 28312805  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  28312804 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagccagata 28312705  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||      ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28312704 taatatgatttgatgtt----tttagtaatgagatatatttgtatatacattatgtggattttataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgata 28312609  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28312608 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgtctatg 28312574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Original strand, 20437623 - 20438054
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  20437623 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 20437722  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  || ||||||||||||| || |||| |    
T  20437723 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggcttaaaactagaagtaatatgagtgc 20437822  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | | | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  20437823 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgaggttacccttggggtaggaatggaggttgactatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 20437922  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgat 610  Q
    ||||||||||| ||| |    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20437923 taatatgatttgatgct----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttgat 20438018  T
Q  611 gttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
     ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20438019 attgttatatcttgaggtgtttatgtgctgcctatg 20438054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Original strand, 21180721 - 21180985
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21180721 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21180820  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||||||||||||||| ||||||    
T  21180821 tcttagtgaaattttatgaaatttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaattcttaaaactagaagtactatgagttc 21180920  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  21180921 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgat-tttgggataggaatggaagttg 21180985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Original strand, 24815248 - 24815512
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24815248 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24815347  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  24815348 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattctaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 24815447  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  24815448 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 24815512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 212 - 457
Target Start/End: Original strand, 44822518 - 44822763
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44822518 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 44822617  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  44822618 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttacgggataattccaaacctcaaaactagaagtaatatgagttc 44822717  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44822718 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 44822763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Original strand, 27653081 - 27653283
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  27653081 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgagaagcagttataatatgatttaatgttgatag----ta 27653176  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27653177 atgtattatatttgtatatgcattatgagaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtgct 27653276  T
Q  640 gcctatg 646  Q
    |||||||    
T  27653277 gcctatg 27653283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 21239691 - 21239923
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21239691 catgaaagttttagataatttggttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21239790  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21239791 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21239890  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  21239891 aattaaggtgtttaagaatttttaacctatgtt 21239923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 212 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 50001130 - 50000883
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  50001130 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 50001031  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcc-aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50001030 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaaacttatgagataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 50000931  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatcttt 458  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  50000930 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtcttt 50000883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 7052451 - 7052684
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  7052451 catgaaagttttagataattttgttaactttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 7052550  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  7052551 tattagtgaaattttatgaaaattctgcataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 7052650  T
Q  412 aactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  7052651 aattaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 7052684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 469
Target Start/End: Original strand, 20031286 - 20031543
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||     
T  20031286 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgtttttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcaatggagg 20031385  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20031386 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttc 20031485  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaat 469  Q
    || |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  20031486 aattaaggtgtttaggagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaat 20031543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Original strand, 46198121 - 46198374
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  46198121 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccggtgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 46198220  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46198221 tcttaatgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 46198320  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  46198321 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtgagttggtccttggggtag 46198374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20588335 - 20588103
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20588335 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttggtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaga 20588236  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20588235 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 20588136  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20588135 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20588103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20592873 - 20592641
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20592873 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttggtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaga 20592774  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20592773 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 20592674  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20592673 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20592641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Original strand, 8276388 - 8276652
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8276388 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 8276487  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||    
T  8276488 tcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagtactataggttc 8276587  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  8276588 aattaaggcgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 8276652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 220 - 444
Target Start/End: Original strand, 14238016 - 14238240
Alignment:
Q  220 ttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtg 319  Q
    |||||||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14238016 ttgtagataattgtgttagcttttcagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtg 14238115  T
Q  320 aaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaagg 419  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  14238116 aaattttatgaaaattcagcataactgtttctgagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaagg 14238215  T
Q  420 tatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  14238216 tgtttaagagtatctaacctatgtt 14238240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 212 - 630
Target Start/End: Original strand, 2332606 - 2333019
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |  |||     
T  2332606 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatggaaatactctagggagg 2332705  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2332706 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 2332805  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |  || || ||||| | ||||||| |   |||| || ||||  ||| ||    
T  2332806 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctcgggttttgagtgaaggtttattataatactgtcgatgttcagtgagtctgata 2332905  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgt-gaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 610  Q
    ||| || | || |||||    | || | | ||  || ||||| | ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2332906 taagat-aattgatgtt----gttaatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tgttgattatcatttgat 2332999  T
Q  611 gttgttatatcttgagatgt 630  Q
     |||||||||||||||||||    
T  2333000 attgttatatcttgagatgt 2333019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Original strand, 7792248 - 7792512
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  7792248 catgaaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttgaattgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 7792347  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||    
T  7792348 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatgtgagttc 7792447  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  7792448 aattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgtgatttgatc-ttgggataggaatggaagttg 7792512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 38887483 - 38887716
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  38887483 catgaaagttgtagataattttgttagctttcgaatggctttggtttgatttgaaaatgatttttgatttttgaggtatgatgaaaatactccaaagagg 38887582  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  38887583 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattacaaaactcaaaactagaagtactaggagttt 38887682  T
Q  412 aactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  38887683 aattaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 38887716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 19676367 - 19676143
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   |  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  19676367 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttagttggacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 19676268  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19676267 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 19676168  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaa 436  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||    
T  19676167 aactagggtgtttaagagtatttaa 19676143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 216 - 444
Target Start/End: Original strand, 41227104 - 41227332
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  41227104 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgcgaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 41227203  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41227204 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaact 41227303  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||    
T  41227304 aggatgtttaagagtatttaacctatgtt 41227332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 42912706 - 42912482
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  42912706 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 42912607  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  42912606 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttc 42912507  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaa 436  Q
    || || ||| |||||||||||||||    
T  42912506 aattagggtgtttaagagtatttaa 42912482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 216 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 51082868 - 51082640
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  51082868 aaagttgtagataattgtattatctttccagtggcgtaggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 51082769  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  51082768 agtgaaattttaagaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaatt 51082669  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  51082668 aaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 51082640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 213 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 51323930 - 51323699
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  51323930 atgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggt 51323831  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  51323830 cttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaattcaaaacttatggaataactccaaaccttaaaactagaagtactatgagttca 51323731  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  51323730 attaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 51323699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 21046445 - 21046677
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  21046445 catgaaagttgtagataattgagttaggtttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaataatccaaagagg 21046544  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  21046545 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgggttc 21046644  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21046645 aattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 21046677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Original strand, 29764030 - 29764287
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  29764030 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggatttggtttaacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 29764129  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaa----aacctcaaaactagaagtactagga 407  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |    |||||||||||||||||||||| ||    
T  29764130 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatga 29764229  T
Q  408 gttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  29764230 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 29764287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 16401324 - 16401060
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  16401324 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgacttttagtgtttgagatatgatcaaaatactccaaggagg 16401225  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16401224 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcaaaatcgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 16401125  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  16401124 aattaaggtgtttaatagtatttaacccatgttttgagttgatc-ttgggacaggaatggaggttg 16401060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 20634030 - 20634263
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20634030 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 20634129  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  20634130 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaacttggagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 20634229  T
Q  412 aactaag-gtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  20634230 aattaagagggtttaagagtatttaacctatgtt 20634263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 4596241 - 4596473
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4596241 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 4596340  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||   ||||    
T  4596341 tcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtaatataggttc 4596440  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  4596441 aactagggtgcttaagagtatttaacctatgtt 4596473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12710544 - 12710312
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  12710544 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggcgttggtttgacttacaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 12710445  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12710444 tcttagtgaaaatttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccgaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 12710345  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12710344 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 12710312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 16058710 - 16058942
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16058710 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttgacgagaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 16058809  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16058810 ttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 16058909  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  16058910 aactagggtgtttaagattatttaagctatgtt 16058942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 216 - 444
Target Start/End: Original strand, 41225851 - 41226079
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | || |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  41225851 aaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggattgacgagaaaatgatttttagttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtctt 41225950  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41225951 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaact 41226050  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||    
T  41226051 aggatgtttaagagtatttaacctatgtt 41226079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 45496602 - 45496369
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  45496602 catgaaaattttagataattgtgttagctttctaatgactttagttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 45496503  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||     
T  45496502 tcttggtgaaattttatgaaaactcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaataatttcaaacctccaaactagaagtactctgagttt 45496403  T
Q  412 aactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  45496402 aattaaggggatttaagagtatttaacctatgtt 45496369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 297011 - 296715
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||| |||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  297011 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttgatttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 296912  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||    
T  296911 tcttagcgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttc 296812  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 508  Q
    || |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  296811 aattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtgtgaagctg 296715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 22350244 - 22349980
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| |||||||||| |  |||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22350244 catgaaatttgtagataactgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatcatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 22350145  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22350144 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactacgagttc 22350045  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| |||||||||||| |||  |||||  ||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  22350044 aattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 22349980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 212 - 438
Target Start/End: Original strand, 23194947 - 23195173
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||| | |||     
T  23194947 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttaacttgaaaatgacttttagtgtttgagttatgataaaaatactcctaagagg 23195046  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  23195047 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaactagaagtaccatgagttc 23195146  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacc 438  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||    
T  23195147 aattaaggtgtttgagagtatttaacc 23195173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 215 - 470
Target Start/End: Original strand, 38057050 - 38057304
Alignment:
Q  215 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || | |  |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | |    
T  38057050 gaaagttttagataattttgttagctttctagtggctttcgtttaacttgcaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagggggtat 38057149  T
Q  315 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 414  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  38057150 tagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatacaaaacttatgggattattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtacaat 38057249  T
Q  415 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  38057250 taaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttaatc-ttgggataggaatg 38057304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 442 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 22124545 - 22124345
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 541  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  22124545 gttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgactatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 22124450  T
Q  542 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgc 641  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22124449 gtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgc 22124350  T
Q  642 ctatg 646  Q
    |||||    
T  22124349 ctatg 22124345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Original strand, 52940736 - 52940937
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||    
T  52940736 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattataatattactgatgttcagtgactctgatataatatgatttgatgttgttag----ta 52940831  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  52940832 atgtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttggtattgttatatcttgagatg-ttatgtgct 52940930  T
Q  640 gcctatg 646  Q
    |||||||    
T  52940931 gcctatg 52940937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Original strand, 14792958 - 14793193
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  14792958 catgaaagttgtacataattgtgttagctttccagtgactttggttggacttgaaaatgatttttggttttagagttatgatgaaaatactccaaggagg 14793057  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  14793058 tcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 14793156  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14793157 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 14793193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 22823803 - 22824034
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22823803 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 22823902  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  22823903 tcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 22824001  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22824002 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 22824034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 50544507 - 50544276
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  50544507 catgaaagttgtagataattgtgttagctttcgggtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 50544408  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||  ||||| || |  |||||| ||||||    
T  50544407 ttttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaatttcaaagcttg-tgtactatgagttc 50544309  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50544308 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 50544276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 442 - 646
Target Start/End: Original strand, 21043142 - 21043342
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 541  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  21043142 gttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 21043237  T
Q  542 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgc 641  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21043238 gagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatttttattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgc 21043337  T
Q  642 ctatg 646  Q
    |||||    
T  21043338 ctatg 21043342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 1643249 - 1643020
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||     
T  1643249 catgaaagttttagataattgtgttaactttccaatggctttagtttgacttgaa--tgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggagg 1643152  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||| |  |||||| ||||||    
T  1643151 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttc 1643053  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1643052 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 1643020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 39060752 - 39060520
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaa-tgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 310  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  39060752 catgaaagttttagataattgtgttagctttccaagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggag 39060653  T
Q  311 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
     ||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || ||||  |||| || |  |||||| |||||    
T  39060652 gtcttagtgaaattttatgaaaatttcgtataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaactccaaagcttg-tgtactatgagtt 39060554  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  39060553 caattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 39060520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 441 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 20958369 - 20958168
Alignment:
Q  441 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 540  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| | || ||||  ||||| || ||||  ||| ||||||||| ||| |||||| |||    |||    
T  20958369 tgttatgagttgatccttggtgtaagaatgaaggttgattgtagtattgttgatgttcagtgagtctgatataatatgttttgatgttgttag----taa 20958274  T
Q  541 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctg 640  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20958273 tgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtcatatcttgagatgtttatgtgctg 20958174  T
Q  641 cctatg 646  Q
    ||||||    
T  20958173 cctatg 20958168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16372407 - 16372178
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  16372407 catggaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 16372308  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacct-caaaactagaagtactaggagtt 410  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  || ||||| || ||||| || ||||     
T  16372307 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctacaaaaataaaagtaatatgagtg 16372208  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||    
T  16372207 aaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 16372178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 48603621 - 48603512
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  48603621 gtaatgtaatatatttgtatatacattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttagatcttgagatgtttacgt 48603522  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  48603521 gctgcctatg 48603512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 24720090 - 24720321
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  |||     
T  24720090 catgaaagttgtagataattgagttagccttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatacttcatggagg 24720189  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  | |||| ||||||    
T  24720190 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttc 24720288  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24720289 agttaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24720321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 44892103 - 44891869
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  44892103 catgaaagttgtagataattttgttagatttcccgtggctttggtttgccttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaga 44892004  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| || | | ||||| |||| |    
T  44892003 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaatcttgta-tactatgagtac 44891905  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  44891904 aattaaggtgtttaagagta-ttaacctatgttatga 44891869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Original strand, 41781542 - 41781649
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  41781542 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag--gttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaaatgtttatgt 41781639  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  41781640 gctgcctatg 41781649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 9784739 - 9784896
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  9784739 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaga 9784838  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    |||| |||||||||| | |||||||  ||||||| | || |||| || ||||||||||    
T  9784839 tcttggtgaaattttataaaaattccacataactatctccaagtcaacccaaaactta 9784896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 17902158 - 17902389
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| | |     
T  17902158 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttggcttgacttgaaaatgatttttggttttcaagttatgatgaaaatactccaaggtgg 17902257  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||  ||||| | |   |||||| ||||||    
T  17902258 tcttgatgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaagc-atgtgtactatgagttc 17902356  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17902357 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17902389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 442 - 646
Target Start/End: Original strand, 21533735 - 21533933
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 541  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||  | |||| | ||||||||||||||||||     |||    
T  21533735 gttatgagttgatccttggg-taggaatggaggttgattataatattactaatgttctgtgaatttattattacatgatttaatgttgataga----aat 21533829  T
Q  542 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgc 641  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| ||||| || ||||    
T  21533830 gtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatcctaagaagtttatgtactgc 21533928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 457 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 14800779 - 14800589
Alignment:
Q  457 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatat----tt 552  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||   ||||| || ||||||    ||    
T  14800779 ttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgtta---agtaacgtgatatatatagtt 14800683  T
Q  553 gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  14800682 gtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgctgcatatg 14800589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 457 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 14809653 - 14809463
Alignment:
Q  457 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatat----tt 552  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||   ||||| || ||||||    ||    
T  14809653 ttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgtta---agtaacgtgatatatatagtt 14809557  T
Q  553 gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  14809556 gtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgctgcatatg 14809463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 440 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 20346066 - 20345973
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 533  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346066 atgttatgagttaatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctttgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 20345973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18121260 - 18121029
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||   | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  18121260 catgaaagttgtagataattgagttagctttctagtggatttggttggacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 18121161  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |  |  | |||| || |||    
T  18121160 tcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgcactatgaattc 18121062  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18121061 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18121029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21659800 - 21659689
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21659800 catgaaagtcttagataattttgttagctttccaatggcttcggtttggcatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21659701  T
Q  312 tcttagtgaaat 323  Q
    ||||||||||||    
T  21659700 tcttagtgaaat 21659689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 289 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 294624 - 294396
Alignment:
Q  289 atgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta-ggga--------ataatt 379  Q
    |||||| |||||||||||  |  |||||||||||| || |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||    
T  294624 atgatggaaatactccaagtatgtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataatt 294525  T
Q  380 caaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaa 479  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| | |||| |    
T  294524 ccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgta 294425  T
Q  480 tataatattaatgatgatctgtgaagctg 508  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  294424 taggatattaatgatgatctgtgatgctg 294396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13227459 - 13227340
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||  ||     
T  13227459 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtagg 13227360  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  13227359 tcttagtgaatttttatgaa 13227340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 562 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 16372141 - 16372057
Alignment:
Q  562 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16372141 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 16372057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 262 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6833820 - 6833713
Alignment:
Q  262 ttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcc 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||| || ||    
T  6833820 ttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgaataactatttctaagtcaaccc 6833721  T
Q  362 aaaactta 369  Q
    ||||||||    
T  6833720 aaaactta 6833713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16656023 - 16655793
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  |      
T  16656023 catgaaagttttagataattttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaag 16655924  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| || || |||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  16655923 tcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagttt 16655825  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || |||    ||  ||||||||||||||||||    
T  16655824 aattaaaaggttggagagtatttaacctatgt 16655793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29535647 - 29535528
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||  ||     
T  29535647 catgaaaattttagataattttgttagctttccaatggctttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtagg 29535548  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  29535547 tcttagtgaatttttatgaa 29535528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16362513 - 16362395
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  16362513 atgaaagttgtagataatttcgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 16362414  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  16362413 cttagtgaatttttatgaa 16362395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21841361 - 21841243
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  21841361 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 21841262  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  21841261 cttagtgaatttttatgaa 21841243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 21922859 - 21922977
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  21922859 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 21922958  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  21922959 cttagtgaatttttatgaa 21922977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Original strand, 10812765 - 10812877
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  10812765 catgaaagtcgtagataattgtgttagctttccagtgcctttggtttgacttagaaatgatttttggtctttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 10812864  T
Q  312 tcttagtgaaatt 324  Q
    |||||| ||||||    
T  10812865 tcttagcgaaatt 10812877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41373066 - 41372948
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| | | ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  41373066 atgaaagttgtagataattttgttagatttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 41372967  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  41372966 cttagtgaatttttatgaa 41372948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 442 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 47190861 - 47190707
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgat-ctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 540  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| | | | ||  ||| ||||| ||||||| |||||| |||    |||    
T  47190861 gttataagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtctgatataa-atgatttgatgttgttag----taa 47190767  T
Q  541 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 600  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47190766 tgtgatatagttgtatatgcattatgtaaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 47190707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 538 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 48520679 - 48520586
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 631  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  48520679 taatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttgtttattatttgatattgttatatc-tgagatgtt 48520586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 548 - 646
Target Start/End: Original strand, 635944 - 636043
Alignment:
Q  548 tatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  635944 tatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgatgattgaatattatttgacattgttatatcttgaaatatttatgtgctgcctatg 636043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13989461 - 13989382
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13989461 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 13989382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 446 - 573
Target Start/End: Original strand, 16093748 - 16093871
Alignment:
Q  446 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 545  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    |  |||||| |    
T  16093748 tgagttgatccttggggtagaattggagattgaatataatgttagtgatgatctgtgaagctgttataagatgattgaatgttga----ttttaatgtga 16093843  T
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtgaatta 573  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  16093844 tatatttgtatatacattacatgaatta 16093871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 546 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 32649871 - 32649778
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  32649871 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgct 32649778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 545 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 16381346 - 16381256
Alignment:
Q  545 atatatttgtatatgcatt-atgtgaattatataagatgtttaa--gttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  16381346 atatatttgtatatgcattgatgtgaattatacaatatgtttaaatgttgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 16381256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 535 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 20329181 - 20329118
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttg 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20329181 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgttttaagttgatgttg 20329118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 536 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 11945626 - 11945564
Alignment:
Q  536 agtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 598  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11945626 agtaatgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagttgctgttga 11945564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 440 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 26065201 - 26065045
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| ||| | ||   || ||    
T  26065201 atgttatgagtttatccttggggtaggaatggatgttgtatatgatgttaatgataatctgtgaagttgttataagaggatttgatg-tcat---taata 26065106  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 600  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||| || || ||||||||    
T  26065105 atgtgatatatttgtatatgtattacttgaattatatatgatctttgagatgttgttgatt 26065045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 447 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 16758906 - 16758780
Alignment:
Q  447 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaat 546  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |   || |||||| ||    
T  16758906 gagttgaaccttggggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgttgttgtt---ta-taatgtgat 16758811  T
Q  547 atatttgtatatgcattatgtgaattatata 577  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  16758810 ataattgtatatgcattacttgaattatata 16758780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 321
Target Start/End: Original strand, 23593301 - 23593409
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||   | |||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||| |    
T  23593301 atgaaagtcgtagataatttagttatctttccaatggctttggtttggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaattactccaaggaggt 23593400  T
Q  313 cttagtgaa 321  Q
    |||||||||    
T  23593401 cttagtgaa 23593409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 1925212 - 1925271
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1925212 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 1925271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 20924226 - 20924285
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20924226 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 20924285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 23819381 - 23819440
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23819381 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 23819440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 557 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 29534697 - 29534615
Alignment:
Q  557 atgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||    
T  29534697 atgcattatgtggaattttatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatatcgttatatcttgagatgtctatgtgct 29534615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 621
Target Start/End: Original strand, 35260939 - 35261114
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||||    | || ||    
T  35260939 atgttatgagttgaacattggggtagtaatggagattgtatatgatattaacgataatatgtgaagttgttataagatgatttgatgtt----gttaata 35261034  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    |||| || || ||||||||||||||  |||||||| || | |||||| |   ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  35261035 atgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttga---gatgttgatttgcatttgatattgttatatc 35261114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 43543243 - 43543188
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43543243 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatg 43543188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Original strand, 21474653 - 21474727
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 286  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21474653 catgaaagttgtagatacttgtgttagccttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 21474727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 592 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 51326906 - 51326852
Alignment:
Q  592 atgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  51326906 atgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaggtgctgtctatg 51326852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22366617 - 22366527
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  ||||||||||| |   |||||||||||| ||| ||||    
T  22366617 catgaaagttgtagaaaattttgttagctttctaatgactttggtttgacatcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22366527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 1010746 - 1010687
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  1010746 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 1010687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 603 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 12271657 - 12271614
Alignment:
Q  603 catttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12271657 catttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatg 12271614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 20228892 - 20228951
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  20228892 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 20228951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 298
Target Start/End: Original strand, 20708730 - 20708805
Alignment:
Q  223 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaa 298  Q
    |||||||||||| || |||||||||| | | |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  20708730 tagataattttgctatctttccaatggcgttggtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaa 20708805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 21407378 - 21407319
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  21407378 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 21407319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 538 - 621
Target Start/End: Original strand, 41049988 - 41050070
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  41049988 taatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 41050070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 538 - 621
Target Start/End: Original strand, 50614068 - 50614151
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  50614068 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 50614151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 538 - 621
Target Start/End: Original strand, 50621896 - 50621979
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  50621896 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 50621979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 48520830 - 48520787
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 483  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  48520830 atgttataagttgatcattggggtaggaatggaggttgattata 48520787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 50686781 - 50686698
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  50686781 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatc 50686698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 52639564 - 52639505
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  52639564 agttgttgttgattatcattcgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 52639505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 581 - 646
Target Start/End: Original strand, 20454548 - 20454614
Alignment:
Q  581 tgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatg-tttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| || |||| ||||||||||||    
T  20454548 tgttgaagttgatgttgattgtcatttgatattgttataccatgagctgttttatgtgctgcctatg 20454614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 439 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 42697150 - 42697112
Alignment:
Q  439 tatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42697150 tatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaagttg 42697112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 16375541 - 16375601
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttg-atgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  16375541 agttgttgttgattatcatttgaatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 16375601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17003999 - 17003963
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17003999 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 17003963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 21650889 - 21650953
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  21650889 catgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgattttt 21650953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 217 - 643
Target Start/End: Original strand, 1510 - 1932
Alignment:
Q  217 aagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaa-tgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||| || | | ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  1510 aagttgtagataattgagttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccatggaggtctt 1609  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1610 agtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaacccccaaaactagaagtactatgagttcaatt 1709  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 515  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  1710 aaggt-tttaagattatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaaaatgttataat 1808  T
Q  516 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 615  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1809 atgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgatgt 1904  T
Q  616 tatatcttgagatgtttacgtgctgcct 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1905 tatatcttgagatgtttacgtgctgcct 1932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27956 - 27724
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | |||     
T  27956 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttagtttgaattgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaataattccaggagg 27857  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  27856 tcttactgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtac 27757  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27756 aattaaggtgtttaagagtatttaatctatgtt 27724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 211 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12221
Alignment:
Q  211 tcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 310  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  12626 tcatgaaagttgtagataattgagttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgaagaaaatagtccaaggag 12527  T
Q  311 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
     |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  12526 gtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagtt 12427  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 510  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  12426 caattaatgtgtttaagagtatttaacccattttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaatctatt 12327  T
Q  511 ataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 610  Q
    |||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12326 ataatatggtttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgatgttgattatgatttgat 12231  T
Q  611 gttgttatat 620  Q
    ||||||||||    
T  12230 gttgttatat 12221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 234 - 646
Target Start/End: Original strand, 169415 - 169810
Alignment:
Q  234 gttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaa 333  Q
    |||||||||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| || ||||||    
T  169415 gttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaa 169514  T
Q  334 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 433  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||             ||||||| ||||    
T  169515 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggag-------------tttaagaatatt 169601  T
Q  434 taacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 533  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |       
T  169602 taacctatattataagttgatccttgggataggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtaaagctgttataatatgatttaatattta--- 169698  T
Q  534 ctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169699 -taataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 169797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 213 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 143268 - 143038
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||   |  ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |    
T  143268 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggttttagtttgacatgaaaagaatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggt 143169  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  143168 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttta 143069  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  143068 attaaggggtttaagagtatttaacctatgt 143038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 142753 - 142641
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  142753 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 142654  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     ||||||||||||    
T  142653 tgtgctgcctatg 142641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 152 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 11413 - 11100
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |     
T  11413 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctattctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattgtgttatctttccagtggct 11314  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 351  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11313 ttggtttgacttgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttct 11214  T
Q  352 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11213 aagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtt 11114  T
Q  452 gatctttggggtag 465  Q
    | || |||||||||    
T  11113 ggtccttggggtag 11100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 213 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 82641 - 82235
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  82641 atgaaagttgtagataattaagttagctttccaattgttttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggt 82542  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  82541 cttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaattcaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtattatgagttca 82442  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttat 512  Q
    | ||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  82441 attaaggt-gttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggttggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattgt 82343  T
Q  513 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat----atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttg 608  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  82342 aatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttg 82247  T
Q  609 atgttgttatat 620  Q
    ||||||||||||    
T  82246 atgttgttatat 82235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 593 - 646
Target Start/End: Original strand, 80424 - 80477
Alignment:
Q  593 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  80424 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatg 80477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 152 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 4813 - 4568
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4813 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggca 4714  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttct 351  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4713 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 4614  T
Q  352 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactaga 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4613 aagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactaga 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11833 - 11679
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11833 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggca 11734  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11733 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 11679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Original strand, 9352 - 9781
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  9352 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactggaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 9451  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  9452 tcttagtgaaatcttatgataattcagcacaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtac 9551  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  9552 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 9651  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  9652 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattgtatggattatataagatgtttaag-tgatgttgattatcatttgata 9746  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  9747 ttgttatatcttgagatgtctatgtgctgcctatg 9781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 111143 - 110713
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  111143 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 111044  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  111043 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 110944  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  110943 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 110844  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  110843 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgata 110748  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  110747 ttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 110713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 21737 - 21484
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21737 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttaacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21638  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21637 tcttagtgaaatcttatgaaaatccagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 21538  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  21537 aattaaggtgtttaagagtatttcacctatgttgtgagttggtccttggggtag 21484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 146388 - 146156
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| || | | |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  146388 catgaaagttgtagataattgagtttgctttccagtggctttggtttgacgtgaaaaggatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 146289  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  146288 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagaataacagtttctaagttaatccaaaacatatgtaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 146189  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || | | ||||||||||||||| |||||||    
T  146188 aattaggatgtttaagagtatttaatctatgtt 146156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 212 - 438
Target Start/End: Original strand, 123956 - 124182
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  123956 catgaaagttgtagataattttgttagcattccaatggctttgaattgacatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaatgagg 124055  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  124056 tgttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 124155  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacc 438  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||    
T  124156 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 124182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 182; Significance: 5e-98; HSPs: 5)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 212 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 133406 - 132976
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||  ||     
T  133406 catgaaagttttagataattttgttagcttttcaatggctttggtttgacttttaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaagtagg 133307  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  133306 tcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccattttcaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 133207  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || ||||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |  ||||  | | ||    
T  133206 aattaagaggtttaagtgtatttaactcatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattataatactattgatgttgagtgagtcagata 133107  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 611  Q
    ||||||||||| |||||    | |||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  133106 taatatgatttgatgtt----gttagtaataagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgata 133011  T
Q  612 ttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  133010 ttgttatatcttgaaatgtttatgtgctgcatatg 132976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 223 - 483
Target Start/End: Original strand, 133571 - 133831
Alignment:
Q  223 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||  || |||||| ||||    
T  133571 tagataattttgttagctttccaatggctttagtttgactttaaaatgattttttgtttaggagttatgttgaaaatactccaagtaggtcttagggaaa 133670  T
Q  323 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 422  Q
    | || ||||| ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| |||||||| || |||| ||| |||||| |    
T  133671 tcttatgaaatttcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgcaattaaggtgt 133770  T
Q  423 ttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 483  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  133771 ttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 133831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 265 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29761 - 29582
Alignment:
Q  265 aaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaa 364  Q
    |||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29761 aaaatgatttttggtttagtagttatgatgaaaatactacaaggaatacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 29662  T
Q  365 acttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29661 acttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaagagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 29582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33894 - 33803
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 303  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  33894 catggaagttttagataattttgttagatttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactc 33803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 513 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 29390 - 29285
Alignment:
Q  513 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 612  Q
    ||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  29390 aatatgatttactgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaagta---------tttaagatgatgttgattatcatttgatat 29304  T
Q  613 tgttatatcttgagatgtt 631  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  29303 tgttatatcttgatatgtt 29285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Original strand, 10843 - 11073
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10843 catgaaagttgtagataattgtgttaactttccagtggctttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 10942  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10943 tcttagtgaaattttatgaaaattcagaataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 11042  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11043 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 11073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 312 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17315 - 17223
Alignment:
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtacta 404  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  17315 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattttaaatctcaaaactagaagtacta 17223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 170; Significance: 7e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Original strand, 19040 - 19304
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19040 catgaaagttttagataattttgttagctttacaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaga 19139  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19140 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 19239  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  19240 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 170; Significance: 7e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Original strand, 9943 - 10145
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  9943 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----ta 10038  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10039 atgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagatgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 10138  T
Q  640 gcctatg 646  Q
    |||||||    
T  10139 gcctatg 10145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 462 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 36420 - 36240
Alignment:
Q  462 gtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgca 561  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||  ||  ||||||||||||| |||||| |||    |||||| ||||| |||||||||||    
T  36420 gtaggaatggaggttgattataatactattgatgttcagtgagtctaatataatatgatttgatgttgttag----taatgtgatatagttgtatatgca 36325  T
Q  562 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36324 ttatgtggattatataagatgtttaagttgtcgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatg 36240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30560 - 30496
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  30560 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 30496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 176448 - 176195
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  176448 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttgacgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 176349  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  176348 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 176249  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  176248 aattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 176195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 212 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 169095 - 168846
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  169095 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactctggtttgacgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 168996  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  168995 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 168896  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggg 461  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  168895 aattaaggagtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggg 168846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 216 - 469
Target Start/End: Original strand, 152610 - 152863
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  152610 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatatttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 152709  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  152710 agtgaaattttatgaaaattcagcaaaactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaatt 152809  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaat 469  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||| |||||||    
T  152810 aaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtaagttgatccttgggttaggaat 152863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 212 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 77343 - 77098
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | | |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  77343 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttgatttgacgtggaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 77244  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  77243 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataagcgtttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtacaatgagttc 77144  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  77143 aattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttgatctt 77098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 557 - 639
Target Start/End: Original strand, 163071 - 163152
Alignment:
Q  557 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||| |||| ||||||||| || |||||    
T  163071 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgtagattatcatttggtattgtcatattttgagatgtctatgtgct 163152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Original strand, 3338 - 3591
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3338 catgaaagttgtcaataattgtgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttttctgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 3437  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3438 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 3537  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||    
T  3538 aattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagttggcccttggggtag 3591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 75 - 1
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 286  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  75 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgag 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8656 - 8592
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  | |||||||||    
T  8656 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgattttt 8592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Original strand, 24456 - 24658
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  24456 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgcaaagctgttataatatgatttaatgttgatag----ta 24551  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  24552 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaaatgtttaagtgtt 24651  T
Q  640 gcctatg 646  Q
    |||||||    
T  24652 gcctatg 24658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38465 - 38429
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38465 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatg 38429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 212 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 6114 - 5835
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||     
T  6114 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 6015  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6014 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 5915  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 492  Q
    || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  5914 aattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 212 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 3362 - 3117
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3362 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgacttttgtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 3263  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  3262 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 3163  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    || |||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  3162 aattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgcgagttgatctt 3117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 4)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 216 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 6069 - 5828
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6069 aaagttgtagataattgtgttagctttccattggatttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtctt 5970  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5969 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttcaaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 5870  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5869 aaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 5828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 7179 - 7409
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||| |||||||||||| |||     
T  7179 catgaaagttttatataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataattttttgtttta-agttatgataaaaatactccaaggagg 7277  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||| |   || |||  |||||  | |  |||||| |||||     
T  7278 tcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaagtttg-tgtactatgagtta 7376  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7377 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 7409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 578 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 3385 - 3317
Alignment:
Q  578 agatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  3385 agatgtttcagttgatgttgattgtcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgttgcctatg 3317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 3438 - 3395
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 483  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  3438 atgttatgagttgatccttagggtaggaatggaggttgattata 3395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 212 - 441
Target Start/End: Original strand, 64465 - 64694
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  64465 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagaagg 64564  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  64565 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttgtggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 64664  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 441  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||    
T  64665 aattaaggtgtttaagagtagttaacctat 64694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 316 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 31502 - 31183
Alignment:
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||||| |    
T  31502 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaatccttaaaactagaagttctatgagttcaatt 31403  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 515  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||| | ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  31402 aaggtgtttaagagtata------ataatataatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatttgtgaagctattataat 31310  T
Q  516 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 615  Q
    |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  31309 atgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgtttattatcatttgatattgt 31214  T
Q  616 tatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31213 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 31183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31799 - 31680
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||  || | | || || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31799 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccggtggctttgggtttacatgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 31700  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  31699 tcttagtgaatttttatgaa 31680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21911 - 21679
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  21911 catgaaagttgttgataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 21812  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21811 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 21712  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21711 aattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 21679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 28764 - 28996
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  28764 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 28863  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28864 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 28963  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28964 aattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgtt 28996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10091 - 9997
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10091 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgattttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaa 9997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 78720 - 78488
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  78720 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 78621  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78620 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 78521  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  78520 aactaaggtgttaaagagtatttaacctatgtt 78488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 440 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 22540 - 22361
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||    
T  22540 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttga----tagta 22445  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  22444 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 22361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 653 - 395
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  653 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttcacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 554  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  553 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactttgagttc 454  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||| | || | ||||||||||||||    
T  453 aattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttttgattcgacccttggggtaggaatg 395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 646
Target Start/End: Original strand, 1279 - 1353
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1279 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctggctatg 1353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 2123 - 2493
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  2123 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactataaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 2222  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||   || ||||||| ||  |||||||||||||||| || |||| |    
T  2223 tcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgc 2322  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 511  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  2323 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 2422  T
Q  512 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttta 586  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2423 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttta 2493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 2994 - 2702
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  2994 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 2895  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2894 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aagcttatgggataattccaaagctcaaaactagaaatactacgagttc 2796  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaag 505  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||  |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  2795 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttttataggatattaaggatgatctgtgaag 2702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 373 - 605
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||     
T  373 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcatcggtttgacttgaaaaagtattttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaggagg 472  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  473 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactcgaagtactaggagttt 572  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  573 aattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 216 - 442
Target Start/End: Original strand, 5680 - 5906
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  5680 aaagatgtagataattgtgttagattttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtctt 5779  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5780 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatt 5879  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  5880 aaggtgtttaagagtatcaaacctatg 5906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 36025 - 36084
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36025 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 36084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 153; Significance: 9e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 5109 - 5341
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5109 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgtttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 5208  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5209 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 5308  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5309 aactagggtgtttaagagtatttaaactatgtt 5341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 216 - 468
Target Start/End: Original strand, 6077 - 6330
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6077 aaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgaaatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 6176  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6177 agtgaaatcttataaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagatcaaaactagaagtactatgagttcaatt 6276  T
Q  416 aagg-tatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaa 468  Q
    | || | |||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  6277 agggttttttaagagtatttaacttatgttgtgagtagacccttggggtaggaa 6330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0672 (Bit Score: 153; Significance: 9e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0672
Description:

Target: scaffold0672; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 216 - 444
Target Start/End: Original strand, 7956 - 8184
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7956 aaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 8055  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8056 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 8155  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| |||| || ||||||||| |||||    
T  8156 aaggtgtttatgattatttaacccatgtt 8184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 153; Significance: 9e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 4690 - 4433
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4690 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 4591  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaa----aacctcaaaactagaagtactagga 407  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |    |||||||||||||||||||||| ||    
T  4590 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatga 4491  T
Q  408 gttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  4490 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 153; Significance: 9e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 4690 - 4433
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4690 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 4591  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaa----aacctcaaaactagaagtactagga 407  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |    |||||||||||||||||||||| ||    
T  4590 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatga 4491  T
Q  408 gttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  4490 gttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 572 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 15131 - 15069
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 634  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15131 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 15069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 212 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 8720 - 8478
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||      
T  8720 catgaaagttgtagataattatgttagctttccagtggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtgtttgatatatgatgaaaatactccaaggaag 8621  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8620 tcttggtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactacaagtactatgagttc 8521  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgat 454  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8520 aattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgat 8478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 150; Significance: 6e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 212 - 437
Target Start/End: Original strand, 5722 - 5947
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  5722 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 5821  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5822 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 5921  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||    
T  5922 aattaaggggtttaacagtatttaac 5947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Original strand, 6111 - 6220
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6111 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgt 6210  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  6211 gctgcctatg 6220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 6)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 212 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 23225 - 22929
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||     
T  23225 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggagg 23126  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23125 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacatccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtactatgagttc 23026  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 508  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  23025 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctg 22929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 212 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 33995 - 33791
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |  | |||||||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||     
T  33995 catgaaagttgtagataattgagttagcattccagtagcttcggtttgacgtgaaaataaattttggttctcgagatatgatgaaaatactccaaggagg 33896  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33895 tcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttc 33796  T
Q  412 aacta 416  Q
    |||||    
T  33795 aacta 33791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 212 - 438
Target Start/End: Original strand, 17653 - 17879
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |  ||      
T  17653 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctagggatg 17752  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  17753 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacagccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 17852  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacc 438  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||    
T  17853 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 17879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 212 - 401
Target Start/End: Original strand, 22575 - 22765
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactcca-atgag 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |   |||    
T  22575 catgaaagttgtagataattttgttagcattccaatgactttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctaggggag 22674  T
Q  311 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagta 401  Q
     |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22675 gtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagta 22765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 440 - 642
Target Start/End: Original strand, 55543 - 55742
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||  ||||||||||||| | |||| |||    ||    
T  55543 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttag----ta 55638  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgc 638  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  55639 atgtgatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgc 55738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 312 - 438
Target Start/End: Original strand, 23386 - 23512
Alignment:
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  23386 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 23485  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacc 438  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||    
T  23486 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 23512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 14982 - 15214
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  14982 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 15081  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15082 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 15181  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15182 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 15214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 24040 - 24272
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24040 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 24139  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24140 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 24239  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24240 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1766 (Bit Score: 148; Significance: 9e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold1766
Description:

Target: scaffold1766; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 234 - 525
Target Start/End: Original strand, 1112 - 1390
Alignment:
Q  234 gttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaa 333  Q
    |||||||||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| || ||||||    
T  1112 gttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaa 1211  T
Q  334 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatt 433  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||             ||||||| ||||    
T  1212 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggag-------------tttaagaatatt 1298  T
Q  434 taacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaat 525  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1299 taacctatattataagttgatccttgggataggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtaaagctgttataatatgatttaat 1390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 148; Significance: 9e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 213 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 58403 - 58172
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  58403 atgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatctgatgaaaatactccaaggagat 58304  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  58303 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcataagcgtttctaagttaatccaaaacataaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttca 58204  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  58203 actagggtgtttaagagtatttaacctgtgtt 58172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 68557 - 68438
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||   |     
T  68557 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttatcttttgagatatgatggaaatactccaagttgg 68458  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  68457 tcttagtgaatttttatgaa 68438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1360 - 1130
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||| || | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  1360 catgaaagttgtagataattgagtaagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggata 1261  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1260 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc 1161  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    || |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  1160 aattaagatggttaagagtatttaacctatg 1130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 6215 - 6279
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  6215 catgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgattttt 6279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 212 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 6681 - 6407
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  6681 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatgacttcggtttgaattgaaaattagttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 6582  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6581 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataatcatttataagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 6482  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 486  Q
    || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||| | ||||| |||||||    
T  6481 aattagggtgtttaagagtgtttaacctatgttatgagtagatccttagggtagaaatgcaagttgattataata 6407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 443 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 796 - 658
Alignment:
Q  443 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatg 542  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    | || |||||    
T  796 ttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgtt----gttaataatg 701  T
Q  543 taatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 585  Q
    | |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  700 tgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 441 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 25367 - 25213
Alignment:
Q  441 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 540  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||     || |||    
T  25367 tgttgtgagttgatccttggggtagaaatgaaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataagacgatttgatgttg-----taataa 25273  T
Q  541 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 600  Q
    ||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  25272 tgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatt 25213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16362
Alignment:
Q  281 tttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattc 380  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||    
T  16524 tttgagttatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattttctc 16425  T
Q  381 aaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
     |||| |||||  |  | |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16424 caaacttcaaagat-catgtactatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 16362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 316 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 39631 - 39312
Alignment:
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||| | ||| |||||||| |    
T  39631 agtgaaatcttaagaaaattcaggataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaatttctatgagttcaatt 39532  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 515  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  39531 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactattataat 39439  T
Q  516 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 615  Q
    |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  39438 atgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgt 39343  T
Q  616 tatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  39342 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 39312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21417 - 21285
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21417 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21318  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataac 344  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21317 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataac 21285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 42348 - 42271
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatat 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||| || | | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42348 atgaaagttgtagataattgtgttatctatccagtggctttggtttgacatgaaaataatttttggtgtttgagatat 42271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 39855 - 39809
Alignment:
Q  285 agatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  39855 agatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaacttttatgaa 39809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 212 - 470
Target Start/End: Original strand, 159346 - 159603
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  159346 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagg 159445  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  159446 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattcaaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 159545  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    || ||||||  ||||||||||| |||  |||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  159546 aattaaggtgattaagagtattcaactcatgttgagagttgatc-ttgggataggaatg 159603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Original strand, 3186 - 3388
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||    
T  3186 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatattactgatgatctgtgaagctgttataatatcatttaatgttgatag----ta 3281  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  | |||| |||| |||||    
T  3282 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatgttgattatcatttaatgttgttatataataagatatttaagtgct 3381  T
Q  640 gcctatg 646  Q
    |||||||    
T  3382 gcctatg 3388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 6984 - 7213
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatc-ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgag 310  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  6984 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggcttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatattatgaaaatactccaagtag 7083  T
Q  311 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7084 atcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 7183  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
     || |||||  |||||||||||||||||||    
T  7184 taattaaggggtttaagagtatttaaccta 7213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Original strand, 7438 - 7550
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  7438 tagtaatgtgatatatttgtgtatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgatatatcttgagatgttta 7537  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     ||||||||||||    
T  7538 tgtgctgcctatg 7550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 465
Target Start/End: Original strand, 11903 - 12156
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| |||     
T  11903 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgaattattatgaaaatactccaaggagg 12002  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12003 tcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataactgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 12102  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  12103 aattaaggtgtttaagagtaattaacctatgttgtgagtttgtccttggggtag 12156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 145; Significance: 6e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 863 - 1095
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | | || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  863 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggctttggattgacgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 962  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  963 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttc 1062  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1063 aattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 1095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 145; Significance: 6e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 39755 - 39523
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39755 catgaaagttttagataatttttttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 39656  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  39655 gcttagtgaaatcttatgaaaattcaggataatcgtttctatgttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgatttc 39556  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || | | |||||||||||||||||||||||    
T  39555 aattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 39523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 143; Significance: 9e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 217 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1558 - 1332
Alignment:
Q  217 aagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctta 316  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||    
T  1558 aagttgtagataattgagttagctttccagtgactttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgggatatgatgaaaatactccaagtaggtctta 1459  T
Q  317 gtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 416  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1458 gtgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatta 1359  T
Q  417 aggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  1358 aggggtttaagagtatttaacctatgt 1332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 1110 - 998
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  1110 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattcttatatcttgagatgttta 1011  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     ||| ||||||||    
T  1010 tgtgttgcctatg 998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 143; Significance: 9e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Original strand, 5063 - 5293
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||     
T  5063 catgaaagttgtagataactgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaagaagg 5162  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5163 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagttctaggggttc 5262  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5263 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 5293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 143; Significance: 9e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 216 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 7627 - 7401
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  7627 aaagatgtagataattgtgttagattttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtctt 7528  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7527 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatt 7428  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  7427 aaggtgtttaagagtatcaaacctatg 7401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 212 - 322
Target Start/End: Original strand, 10313 - 10423
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  10313 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggagg 10412  T
Q  312 tcttagtgaaa 322  Q
    |||||||||||    
T  10413 tcttagtgaaa 10423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11267 - 11219
Alignment:
Q  396 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11267 gaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 11219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 143; Significance: 9e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 316 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 17952 - 17633
Alignment:
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| |||| ||| |||||||| |    
T  17952 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtttatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactataagttctatgagttcaatt 17853  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 515  Q
    ||| | |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  17852 aagatgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactattataat 17760  T
Q  516 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 615  Q
    |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17759 atgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgaattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgt 17664  T
Q  616 tatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17663 tatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 17633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 214 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18247 - 18130
Alignment:
Q  214 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatc 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18247 tgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcttttgtttgacatgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtc 18148  T
Q  314 ttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  18147 ttagtgaatttttatgaa 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 143; Significance: 9e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 182 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 9741 - 9479
Alignment:
Q  182 tttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttt 281  Q
    |||||||| |||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9741 tttctgttttgaattgggttttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgaattttagttt 9642  T
Q  282 ttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattca 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||||     
T  9641 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattaagcataactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaattcc 9542  T
Q  382 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9541 aaggctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 9479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 143; Significance: 9e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 215 - 465
Target Start/End: Original strand, 70227 - 70477
Alignment:
Q  215 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 314  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  70227 gaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 70326  T
Q  315 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 414  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||     
T  70327 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgagataattccaaaactcaaaactagaagtactataagttcaat 70426  T
Q  415 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 465  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  70427 taaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttggtccttggggtag 70477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 212 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 72067 - 71935
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  72067 catgaaagttgtagataattgagttagctttccaattgctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggagg 71968  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataac 344  Q
    |||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  71967 tcttagtgaaaccttatgaaaattcaggataac 71935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 212 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 6455 - 6191
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||     
T  6455 catgaaagttttagataattttgttagctttgcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaaaactccaagtagg 6356  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6355 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 6256  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 477  Q
    || |||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  6255 aattaaggtgtttaagagtttttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 6191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 821 - 589
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |  || | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  821 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttccgtggcttttgtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 722  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  721 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaaggtagtccaatatttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtcc 622  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  621 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 213 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 16419 - 16175
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||| |    
T  16419 atgaaagttttagatacttttgctagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgcgatatgatgaaaatactttaaggaggt 16320  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16319 cttagtgaaatcttatgaatattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataattctcaacctcaaaactagaagtactatgagttca 16220  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16219 atgaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 16175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 212 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 13602 - 13357
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  13602 catgaaagttttagatatttttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggagg 13503  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |  |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13502 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttc 13403  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13402 aattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 13357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 223 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 8881 - 8686
Alignment:
Q  223 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8881 tagatatttttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 8782  T
Q  323 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaag 418  Q
    | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |  |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8781 tcttgtgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaag 8686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21389 - 21157
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21389 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttggaaatgatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 21290  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21289 tcttagtgaaatcttaagaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattttaattctcaaaactagaagtactatgagttc 21190  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21189 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 21157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 572 - 646
Target Start/End: Original strand, 15225 - 15299
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15225 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 15299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 440 - 632
Target Start/End: Original strand, 19505 - 19693
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||| ||| || |||||| |||||||||     ||    
T  19505 atgttatgagttaatcattggggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctgatattatgtgatttgatgttgataa----ta 19600  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga-tgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  19601 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagattttttaagttgatgttgattattgtttgacattgttatat-ttgagatgttt 19693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 22187 - 22419
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||     
T  22187 catgaaaattgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttcacgtgaaaattatttttggttattgagatatgatgaaaatgctccaaggagg 22286  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22287 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagttc 22386  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22387 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 216 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 29384 - 29124
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | |  ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  29384 aaagttttagataattttgtaagctttcgaatggctttagtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaatactccacggaggtctt 29285  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| || ||||||| |   || ||||||||||||| || |||||||| |    
T  29284 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtattatgagttcaatt 29185  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 476  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  29184 aaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtt 29124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 216 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 34849 - 34589
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | |  ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  34849 aaagttttagataattttgtaagctttcgaatggctttagtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaatactccacggaggtctt 34750  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| || ||||||| |   || ||||||||||||| || |||||||| |    
T  34749 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtattatgagttcaatt 34650  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 476  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  34649 aaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtt 34589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 212 - 492
Target Start/End: Original strand, 22165 - 22444
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||   |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  22165 catgaaagttgtagataattgtgttaactttccagtggattttgtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgacatatgatgaaaatactccaaggagg 22264  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  22265 tcttagtgaaatcttatgaagattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctaaaaactagaagtattatgagttc 22364  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 492  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  22365 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 22444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 480 - 625
Target Start/End: Original strand, 16818 - 16957
Alignment:
Q  480 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 579  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16818 tataatattactgatgatctgtgaatctgttataa-attagttaatgtt----gttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataag 16912  T
Q  580 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 625  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  16913 atgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 16957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 480 - 625
Target Start/End: Original strand, 25978 - 26117
Alignment:
Q  480 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 579  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25978 tataatattacttatgatctgtgaatctgttataa-attatttaatgttgttag----taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataag 26072  T
Q  580 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 625  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  26073 atgttcaagttgttgttgattgtc-cttgatattgttatatcttga 26117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 952 - 767
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  952 cgagcataggaaaatcaacttttctggatttctctgttctgaattaggtttaggaatcttcatcaaagttgtagataattttgttagctttccaatgact 853  T
Q  252 tcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattca 337  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  852 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgacattttatgaaaattca 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 6949 - 7013
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  6949 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgattttt 7013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 212 - 437
Target Start/End: Original strand, 13061 - 13286
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  13061 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtgtgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 13160  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13161 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagttt 13260  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  13261 aattaaggggtttaagagtatttaac 13286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Original strand, 8046 - 8277
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||   | |||||||||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||| ||||  |      
T  8046 catgaaaattttagataattttgttagccttcctatggatttggtttgacttaaaaatgatgtttagatttagagatatgatggaattaccccaagcaag 8145  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  8146 tcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaactcaatccaaaacttatggaatatttccaaaactcaaaactagaaatactaggagttt 8245  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || ||||   |||||||||||||||| |||||    
T  8246 aattaagaggtttaagagtatttaacgtatgt 8277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 537 - 591
Target Start/End: Original strand, 13450 - 13502
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 591  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13450 gtaatgtaatatatttgtat--gcattatctgaattatataagatgtttaagttg 13502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 216 - 413
Target Start/End: Original strand, 106603 - 106800
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  106603 aaagttgtagataattgagttagctttccagtgaaattggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtctt 106702  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaa 413  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106703 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 106800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 535 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 11316 - 11209
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 634  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  11316 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatttggattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttat 11218  T
Q  635 gtgctgcct 643  Q
    |||||||||    
T  11217 gtgctgcct 11209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 535 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 22416 - 22309
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 634  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  22416 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatatggattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttat 22318  T
Q  635 gtgctgcct 643  Q
    |||||||||    
T  22317 gtgctgcct 22309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 213 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 7539 - 7295
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  7539 atgaaagttttagataattgtgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggt 7440  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7439 cttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 7340  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    | |||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||    
T  7339 attaaggtgtttaagagtatttaatccatgatgtgagttgatctt 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 1741 - 1509
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  1741 catgaaagttttagataattttgttagctttacaatggctttggtttaacttgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggagg 1642  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  1641 tcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccaattctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaacaagaagtactatgagttc 1542  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1541 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 1509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 172 - 4
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  172 catgaaagttttagataattttgttatctttccaatggctttggtttaactggaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggagg 73  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattc 380  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  72 tcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccaattctatgttaatccaaaacttatgggataattc 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 213 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 8712 - 8468
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  8712 atgaaagttgtagataattgcgttagctttccagtgtctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggt 8613  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8612 gttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 8513  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 457  Q
    | |||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  8512 attaaggtgtttaaaagtatttaatccatgttgtgagttgatctt 8468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 315 - 646
Target Start/End: Original strand, 19951 - 20271
Alignment:
Q  315 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 414  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  19951 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaat 20050  T
Q  415 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataa 514  Q
    |||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | |  ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20051 taaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgta-ggggtaggaatgtggattgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataa 20143  T
Q  515 tatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttg 614  Q
    ||||||||| |||||||||    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  20144 tatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttttatatgcactatgtgaattatatataatgtttaagttgttgttgattagcatttgatattg 20239  T
Q  615 ttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  20240 ttaaatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 20271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 440 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 17764 - 17564
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| | |||| | |    ||    
T  17764 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagactgatataatatgatttgaagttgttgg----ta 17669  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  17668 atgtgatatagttgtatatgccttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtact 17569  T
Q  640 gccta 644  Q
    |||||    
T  17568 gccta 17564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 19655 - 19774
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  19655 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccattggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 19754  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  19755 tcttagtgaatttttatgaa 19774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 135; Significance: 5e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 254 - 444
Target Start/End: Original strand, 7823 - 8013
Alignment:
Q  254 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 353  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7823 ggttttacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 7922  T
Q  354 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7923 gttaatccaaaacttaaggaataattccaaacttcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 8013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 10877 - 10636
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || |  | | ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10877 catgaaagttgtagataattgtgttagcttttcagtagctttggtttcacttgaaaattatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagagg 10778  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgttt-ctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10777 acttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagtt 10678  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttg 452  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10677 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 10636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 974 - 740
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||     
T  974 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtgggtttggtttgacttgaaaatgatttttggtttctgagttatgatgaaaatact-caatgagg 876  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| ||    ||||||  | |||    
T  875 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactataaattc 777  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  776 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 6480 - 6246
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||     
T  6480 catgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtgggtttggtttgacttgaaaatgatttttggtttctgagttatgatgaaaatact-caatgagg 6382  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| ||    ||||||  | |||    
T  6381 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactataaattc 6283  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6282 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 6246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4076 - 3843
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  4076 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctctggtttgacttgaaaatgacttttggtatttgagatatgatgaaaatactccatggaga 3977  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  3976 tcttagtgaaattttatgaaaatttagtttaacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactggaagtactaggagttt 3877  T
Q  412 aactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || ||| ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  3876 aattaagggggttttagagtatttaacctatgtt 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 216 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11811 - 11583
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||| ||| ||||    
T  11811 aaagttgtagataattaagttagctttccattggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttattatcaaaatactccaaggaggtctt 11712  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    || ||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  11711 agcgaaatcttatgaaaattcagcacagccgtttctaagttaatccaaaacctagggaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaatt 11612  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11611 acggtgtttaagagtatttgacctatgtt 11583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 223 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 7778 - 7557
Alignment:
Q  223 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   | | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  7778 tagataattttgttagctttccaatggttttgatttgacttgaaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtcaaa 7679  T
Q  323 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 422  Q
    | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  7678 tcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaagctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgt 7579  T
Q  423 ttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||  |||||||||||||||||    
T  7578 ttattagtatttaacctatgtt 7557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13948 - 13877
Alignment:
Q  156 cataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagat 227  Q
    |||||||||||||| |||| ||  | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13948 cataggaaaatcaatttttctgccactttatgttccgaattaggtttggaagtcttcatgaaagttgtagat 13877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 7169 - 6944
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || | | |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||     
T  7169 catgaaagttgtagataattgagttagctctccagtggctttggtttgacgtaaaaatgatttttggttcttgatatatgatgaaaatactccaagtagg 7070  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  7069 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaagagttt 6970  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  6969 aattaaggggtttaagagtatttaac 6944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 537 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 6780 - 6684
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6780 gtaatgtaatatatttgtatatgtagtatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 3926 - 3701
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||     
T  3926 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccattagagtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagg 3827  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  3826 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaggactaggagttt 3727  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    || |||||  ||||| | ||||||||    
T  3726 aattaaggggtttaacaatatttaac 3701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21724 - 21499
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||   | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     
T  21724 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtagg 21625  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  21624 tcttggtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattaggagttt 21525  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  21524 aattaaggggtttaagagtatttaac 21499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 21335 - 21226
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  21335 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgt 21236  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  21235 gctgcctatg 21226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 169094 - 168861
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  169094 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaga 168995  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  168994 tcttagtgaaattttatgaaaatttagtataacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctctaaactggaagtactaggagttt 168895  T
Q  412 aactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || ||| ||  ||| |||||||||||| ||||||    
T  168894 aattaagggggttttagagtatttaacttatgtt 168861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 546 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 146345 - 146252
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  146345 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgct 146252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21308 - 21083
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| |||||| |||||  ||||| |||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21308 catgaaaattgtaggtaattgagttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtaga 21209  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21208 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 21109  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    || |||||  ||||| ||||||||||    
T  21108 aattaaggggtttaatagtatttaac 21083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 20919 - 20810
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20919 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 20820  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  20819 gctgcctatg 20810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 216 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 126400 - 126179
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |  | | ||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  126400 aaagttgtagataattgagttagctttccagttgctttggtttaacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctt 126301  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  126300 agtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaatt 126201  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  126200 aaggggtttaagagtatttaac 126179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 126124 - 126015
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  126124 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 126025  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    ||||||||||    
T  126024 gctgcctatg 126015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 33109 - 32874
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||   | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  33109 catgaaagttgtagataattgtgttagatttcttgtggatttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 33010  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  33009 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactttttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 32911  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32910 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 32874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 30268 - 30036
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  30268 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgtcgtaggtttgactagaaaatgatttttgatttaggagttatgatgaaaatactacaaggagt 30169  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  30168 acttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaggaaataattccaaacctcaagactagaagtaataggagttt 30069  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  30068 aattaaggtgtttaagagtatctaacttatgtt 30036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 535 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 29844 - 29747
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatattt-gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 631  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  29844 tagtaatgtaatatattttgtatgtgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctggatatgtt 29747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 214 - 470
Target Start/End: Original strand, 35969 - 36224
Alignment:
Q  214 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatc 313  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  35969 tgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttctggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtt 36068  T
Q  314 ttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaa 413  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36069 ttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaa 36168  T
Q  414 ctaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
     |||||| ||||||||||||  ||  |||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  36169 ttaaggtgtttaagagtattcgactcatgttgagagttgatc-ttgggataggaatg 36224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 7875 - 7643
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  7875 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaaagatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaagg 7776  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  7775 tctttgtgtaattttatgaaaattcagcataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 7676  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |  |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7675 agttaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 7643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14506 - 14274
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  14506 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaaagatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaagg 14407  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14406 tctttgtgtaattttatgaaaattcagcataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 14307  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |  |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14306 agttaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 14274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 26582 - 26358
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  26582 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactagaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtagg 26483  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  26482 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttc 26383  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaa 436  Q
    || |||||| |||||||||||||||    
T  26382 aattaaggtgtttaagagtatttaa 26358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 212 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 27964 - 27740
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  27964 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactagaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtagg 27865  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  27864 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttc 27765  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaa 436  Q
    || |||||| |||||||||||||||    
T  27764 aattaaggtgtttaagagtatttaa 27740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 214 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 51612 - 51355
Alignment:
Q  214 tgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatc 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || ||    
T  51612 tgaaagttttagataattttgttagctttccagtggatttggtctgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatcaaaatactccaagtaggtc 51513  T
Q  314 ttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaa 413  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  51512 ttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttaaa 51413  T
Q  414 ctaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgga 472  Q
     |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  51412 ataaggtgtttaagagtatttaatcaatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatgga 51355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 221 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 67315 - 67187
Alignment:
Q  221 tgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  67315 tgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtga 67216  T
Q  321 aattttttgaaaattcagcataactgttt 349  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  67215 aattttatgaaaattcagcataaccgttt 67187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 440
Target Start/End: Original strand, 10325 - 10554
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  10325 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtagctttggtttaacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 10424  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10425 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaacgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 10524  T
Q  412 aactaa-ggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
    || ||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  10525 aattaagggggtttatgagtatttaaccta 10554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Original strand, 19919 - 19983
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  19919 catgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggtttgaagtccaaatgattttt 19983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 120566 - 120341
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  |||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||  ||     
T  120566 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacgcgaaaatgatttttttttcttgagatatgatgaaaatacttcaagtagg 120467  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  120466 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttt 120367  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaac 437  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  120366 aattaaggggtttaagagtatttaac 120341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 212 - 404
Target Start/End: Original strand, 29593 - 29785
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  29593 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttgatttgacttgaaaatcatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 29692  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtacta 404  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29693 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtacta 29785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 538 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 120176 - 120068
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 637  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  120176 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaactatatcagatgtttaagttattgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtg 120077  T
Q  638 ctgcctatg 646  Q
     ||||||||    
T  120076 ttgcctatg 120068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 12932 - 13164
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||   | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||     
T  12932 catgaaagttgtagataattgagttagatttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgttgaaaatactccaaggagg 13031  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13032 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccatttttaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactaaaagtactatgagttc 13131  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13132 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 7601 - 7491
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  7601 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt--gatgttta 7504  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     ||||||||||||    
T  7503 tgtgctgcctatg 7491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 14720 - 14610
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  14720 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatctt--gatgttta 14623  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     ||||||||||||    
T  14622 tgtgctgcctatg 14610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 382 - 444
Target Start/End: Original strand, 19369 - 19431
Alignment:
Q  382 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19369 aaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 378 - 610
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  378 catgaaagttttagataattttgatagctttccaatggttttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 477  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  478 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagtta 577  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  578 aattaaggtgtttaagagaatttaatctatgtt 610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 5682 - 5914
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  5682 catgaaagttttagataattttgatagctttccaatggttttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggagg 5781  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  5782 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagtta 5881  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  5882 aattaaggtgtttaagagaatttaatctatgtt 5914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 1591 - 1480
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||   | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1591 catgaaagttgtagataattgtgctagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 1492  T
Q  312 tcttagtgaaat 323  Q
    ||||||||||||    
T  1491 tcttagtgaaat 1480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 248
Target Start/End: Original strand, 11401 - 11437
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11401 catgaaagttttagataattttgttagctttccaatg 11437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 265 - 441
Target Start/End: Original strand, 8752 - 8928
Alignment:
Q  265 aaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaa 364  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8752 aaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 8851  T
Q  365 acttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 441  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  8852 acttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaactat 8928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 2220 - 1988
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  2220 catgaaaattgtagataaatgagttagctttccagtgactttagtttgacgtgaaaataatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 2121  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||| || ||||||    
T  2120 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcatacctcaaaactagaagtattatgagttc 2021  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
     | || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2020 tattagggtatttaagggtatttaacctatgtt 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5565 - 5413
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||     
T  5565 catgaaagttgtagataattaagttagctttccactgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactctaaggagg 5466  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaa 364  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5465 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 5413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 356 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5229 - 5141
Alignment:
Q  356 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5229 taatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 5141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 224 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 138419 - 138135
Alignment:
Q  224 agataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaat 323  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||     
T  138419 agataatttagttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttcgtgaaac 138320  T
Q  324 tttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatt 423  Q
     || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  138319 cttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgtgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtt 138220  T
Q  424 taagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 508  Q
    || |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  138219 tacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatttgtgaagctg 138135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 443 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 286 - 121
Alignment:
Q  443 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatg 542  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  286 ttatgagttgaaccttgggataggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatag----taatg 191  T
Q  543 taatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  190 taatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatgt 121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 262 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8123 - 7941
Alignment:
Q  262 ttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcc 361  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8123 ttgaaaatgatttttgactcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatcc 8024  T
Q  362 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8023 aaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 7941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 302 - 413
Target Start/End: Original strand, 8152 - 8263
Alignment:
Q  302 tccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagta 401  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||     
T  8152 tccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtt 8251  T
Q  402 ctaggagttcaa 413  Q
    ||| ||||||||    
T  8252 ctatgagttcaa 8263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 212 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 861 - 632
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || |  | | |||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||     
T  861 catgaaagttgtagataattgagttagcttttcagttgctttggtttgacgtgaaaatgaattttggttctcgagatatgataaaaatactccaaggagg 762  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  761 tcttagtgaaatcttaggaaaattcaacataaccgtttctaagttaattcaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttc 662  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 441  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  661 aactagggggtttaagagtatttaacctat 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 442 - 646
Target Start/End: Original strand, 621 - 821
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 541  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || || |  ||| |||||| |||| | ||||||||||    ||||    
T  621 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtaagcctgatataatgtgatctgatgttgatag----taat 716  T
Q  542 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgc 641  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  717 gtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcttttgatattgttatatcttgagatgtttatatgctgc 816  T
Q  642 ctatg 646  Q
    |||||    
T  817 ctatg 821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 212 - 411
Target Start/End: Original strand, 23600 - 23799
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  23600 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttaaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 23699  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23700 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataagcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 23799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 440 - 631
Target Start/End: Original strand, 4555 - 4742
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    |||||    
T  4555 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatacaatattactgatgatctgtgaagttgttataatatgatttaatgatga----tagta 4650  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||| || |||||    
T  4651 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttgaaatgtttaagttgttgatgattatcatatgatattattatatctggatatgtt 4742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 293 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22633 - 22482
Alignment:
Q  293 tgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaa 392  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22633 tgaaaatactccaaggaggtcgtagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaa 22534  T
Q  393 ctagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22533 ctagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 22482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22684 - 22627
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaat 269  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  22684 catgaaaattgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaat 22627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 440 - 603
Target Start/End: Original strand, 2285 - 2444
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  2285 atgttatgagttggtccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgtcctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 2380  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatc 603  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2381 atttaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgtagttgattatc 2444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 1367 - 1135
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  1367 catgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 1268  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1267 tcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 1168  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1167 aattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 1135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Original strand, 65377 - 65612
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  65377 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaaggagttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagg 65476  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| | | |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  65477 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 65575  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  65576 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 65612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 535 - 644
Target Start/End: Original strand, 75778 - 75887
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 634  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  75778 tagtaatgtgataaaattgtatttgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 75877  T
Q  635 gtgctgccta 644  Q
    ||||||||||    
T  75878 gtgctgccta 75887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 486
Target Start/End: Original strand, 75686 - 75733
Alignment:
Q  439 tatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 486  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  75686 tatgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataata 75733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 186901 - 187133
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  186901 catgaaagttgtagataattgtgttagttttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 187000  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  187001 tcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 187100  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  187101 aattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 187133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 440 - 622
Target Start/End: Original strand, 13979 - 14158
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||    
T  13979 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttga----tagta 14074  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  14075 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 14158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 216 - 444
Target Start/End: Original strand, 66432 - 66660
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||    
T  66432 aaagttttagataattgtgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtctt 66531  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || || | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  66532 agtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaagcttcaaaactagaagtactaggagttcaatt 66631  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  66632 aaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 66660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 480 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 332537 - 332380
Alignment:
Q  480 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 579  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  332537 tataatattactgatgttctatgaatctgttatattatgattttatgttgaaag----taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattataaatt 332442  T
Q  580 atgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcc 642  Q
    |||||||||||||||||| | ||| | ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  332441 atgtttaagttgatgttgaaatatta-ttgatattg-tatatcttgagatgttgatgtgctgcc 332380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 460 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 10715 - 10533
Alignment:
Q  460 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt-aatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 558  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     |||||| ||||| |||||||     
T  10715 gggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgtgaagctgt-ataatatgattttaatgttgatat----taatgtgatataattgtatac 10621  T
Q  559 gcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  10620 gcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttacatctagagatgtttatgtgttgcctatg 10533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Original strand, 18026 - 18228
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||    || | |||||    
T  18026 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgat----attgttagta 18121  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18122 atgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgtttattatcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgct 18221  T
Q  640 gcctatg 646  Q
    |||||||    
T  18222 gcctatg 18228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 341 - 106
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||    
T  341 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactgtaaggaga 242  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| || || | |||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  241 tcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaggtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 143  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  142 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 256 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 11257 - 11101
Alignment:
Q  256 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  11257 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgatatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagt 11158  T
Q  356 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11157 taatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 11101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 479 - 508
Target Start/End: Original strand, 15513 - 15542
Alignment:
Q  479 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15513 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 15542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 254 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 12948 - 12748
Alignment:
Q  254 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 353  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||||    
T  12948 ggttttacttgaaaatgatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaa 12849  T
Q  354 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttga 453  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||  |||||  |||||||    
T  12848 gttaatccaaaacttatggaataattccaatccataaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttga 12749  T
Q  454 t 454  Q
    |    
T  12748 t 12748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 213 - 443
Target Start/End: Original strand, 747 - 977
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |  |    
T  747 atgaaagttttaattaattttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaattaccccaagcaagt 846  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 412  Q
    ||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  847 cttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatacaaaacttatagaatatttccaaacctcgaaactagaagtactaggagttta 946  T
Q  413 actaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    | ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  947 attaagaggtttaagagtatttaacctatgt 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 8476 - 8240
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggttttt-gagatatgatgaaaatactccaatgag 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  8476 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttgaattgacttgaaaatgatttttggttttttgagttatgatgaaaatactccaaggag 8377  T
Q  311 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 410  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| || ||    
T  8376 gtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgaatt 8278  T
Q  411 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8277 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 8240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 440 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 3857 - 3701
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  3857 atgttatgagttgatccttgaggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagta 3762  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 600  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3761 atgtaatatatttgtatatgtattatgtggattatataagatgtttaagtgaatgttgatt 3701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 440 - 623
Target Start/End: Original strand, 520 - 699
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt-aatgttgatagctagt 538  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||     |    
T  520 atgttacgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatataaatgatgatctatgaagttgt-ataatatgattttaatgttgatat----t 614  T
Q  539 aatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 623  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  615 aatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 300 - 441
Target Start/End: Original strand, 9711 - 9851
Alignment:
Q  300 actccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaag 399  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9711 actccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaag 9810  T
Q  400 tactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 441  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9811 tactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctat 9851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 38417 - 38338
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38417 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 38338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Original strand, 18050 - 18285
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  18050 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaatcatgttttgtttttgagttatgatgaaaatactccaagcagg 18149  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| || ||||||    
T  18150 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttc 18248  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18249 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 18285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 62374 - 62139
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||  || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  62374 catgaaagttgtagataactgtgttagatttcccgtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggagg 62275  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| || |||    
T  62274 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactacttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattc 62176  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  62175 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 62139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 279
Target Start/End: Original strand, 39305 - 39372
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggt 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39305 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 39372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 216 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 56628 - 56397
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||   | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  56628 aaagttgtagataattgtgttagctttccattggttttggtttaacttgcaaatgatttttggttttggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 56529  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| |||||||| |    
T  56528 agtaaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaatt 56430  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  56429 aaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 56397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26171 - 25940
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||     
T  26171 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaattatttttagtttttgagctatgatgaaaataccccaaggagg 26072  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| | |||     |  || | |||||||| |  |||||| ||||||    
T  26071 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactgatggatcgtcttcaatcttcaaaacttg-tgtactatgagttc 25973  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25972 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 25940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 316 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21193 - 21040
Alignment:
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21193 agtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 21094  T
Q  416 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  21093 aagggttttaagagcatttaacctatgttgtgagtttatc-ttgggataggaatg 21040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 440 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 85807 - 85605
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt-aatgttgatagctagt 538  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||| ||||| ||||     |    
T  85807 atgttacgagttgatccttggggtaggaatggaggttggatatgatattaatgatgatccgcgaagctat-ataatatgattttaatgtcgatat----t 85713  T
Q  539 aatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgc 638  Q
    ||||| ||||| | ||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  85712 aatgtgatataatcgtatacgcattacatgaattatatatgatgcttaagttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgc 85613  T
Q  639 tgcctatg 646  Q
    ||||||||    
T  85612 tgcctatg 85605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 10356 - 10135
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  10356 catgaaagttttagaaaattgtgttagatttcaagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 10257  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||          |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10256 tcttagtgaa-ttttatgaaaagtccgc----------ctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 10168  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  10167 aattaaggggtttgagagtatttaacctatgtt 10135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18820 - 18589
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||      
T  18820 catgaaagttgtagatatttgtgttagctttccagtgactttggtttgacttgataatggtttttgtttttcgagttatgatgaaaatactccaaggaag 18721  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  18720 tcttagagaaatcttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 18622  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18621 aattaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 18589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28559 - 28495
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | | |||||||| |  |||||||||||    
T  28559 catgaaagttgtagataatttttttagttttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttt 28495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8162 - 7931
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||| || ||| ||||  |      
T  8162 catgaaaattttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttgtagattttgagatatgatggaattaccccaagaaag 8063  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || | |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8062 tcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacatatgaaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 7963  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || ||||   ||| ||| ||||||||||||||    
T  7962 aattaagaggtttgagaatatttaacctatgt 7931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 550 - 645
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15125
Alignment:
Q  550 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctat 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15030 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctat 15125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 2065 - 1954
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 634  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  2065 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttat 1966  T
Q  635 gtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||    
T  1965 gtgctgcctatg 1954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34916 - 34689
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  34916 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttagttatgatgaaaatactccaaggagg 34817  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||    || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  34816 tcttagtgaaattttatgaaaataccgcataactatttcta----aacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttc 34722  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34721 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 34689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 212 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2543 - 2403
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  2543 catgaaagttgtagataattttgttag-tttccaatggctttggttagacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactacaaagagg 2445  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 353  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2444 tcttagtgaagttttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 473 - 414
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  473 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 35913 - 36144
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||| || ||      
T  35913 catgaaagttttagataattttgctagctttccaatgacttcagttttacttgaaaatgattttttgctttttagttatgatgaaaatactcaaaggatg 36012  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||||||||| | | |   || |||| ||||| || |  ||||||||||||     
T  36013 tcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttctaagtcaactcaaaacttatgtattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactaggagttt 36111  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36112 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 36144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Original strand, 11603 - 11833
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||  ||||  ||     
T  11603 catgaaagttctagataatttagttagctttccaatgggtttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaacccaagcagg 11702  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| || || |||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11703 tcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 11802  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || ||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  11803 aattaagaggtttaagagt-tttaacctatgt 11833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 8202 - 8091
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 634  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8202 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttat 8103  T
Q  635 gtgctgcctatg 646  Q
    ||| ||| ||||    
T  8102 gtgttgcatatg 8091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8614 - 8495
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  8614 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaataatccaaggagg 8515  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  8514 tcttagtgaatttttatgaa 8495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 440 - 632
Target Start/End: Original strand, 206383 - 206570
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||| ||| |||    ||    
T  206383 atgttatgaggtgatccttggtgtaggaacagaggttgattataatattactgatgttctatgaatatgttataacatgatttaatattgttag----ta 206478  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  206479 atgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatacaagatgattaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 206570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 442 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 906 - 707
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 541  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  906 gttatgagatgacccttggggtagga-tggaggttgattataatactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 812  T
Q  542 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgc 641  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  811 gtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttcatgatgtgatatcttgagatgtttatgtgttgc 712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 440 - 577
Target Start/End: Original strand, 60573 - 60706
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    | || |     
T  60573 atgttatgagttgaaccttggggtaggaatggagattgtatatgatattaatgataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgtt----gttaatt 60668  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 577  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  60669 atgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatata 60706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 142870 - 142823
Alignment:
Q  181 ttttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagata 228  Q
    |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  142870 ttttctgttcagaattaggatttggtgtcttcatgaaagttgtagata 142823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 86; Significance: 9e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 158 - 1
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||     
T  158 catgaaagttgtagataattgagttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatggaaatagtccaaggagg 59  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  58 tcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaactta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 86; Significance: 9e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 537 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 1021 - 912
Alignment:
Q  537 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 636  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  1021 gtaatgtaatatatttatatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgt 922  T
Q  637 gctgcctatg 646  Q
    |||| |||||    
T  921 gctgtctatg 912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 212 - 355
Target Start/End: Original strand, 1030 - 1173
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  1030 catgaaagttttagataatttttttatctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtagg 1129  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 355  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  1130 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagt 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 374 - 470
Target Start/End: Original strand, 1373 - 1468
Alignment:
Q  374 ataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 470  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1373 ataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 1468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Original strand, 11614 - 11844
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||   | ||||| | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| | |     
T  11614 catgaaagtttaagataattgtgttagctttccagtggatttggtttaatttgaaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaaggcgg 11713  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| || ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11714 tcttggtaaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 11813  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || ||| |   |||||||||||||||||||||    
T  11814 aattaa-gaggttaagagtatttaacctatgt 11844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 446 - 646
Target Start/End: Original strand, 221072 - 221267
Alignment:
Q  446 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 545  Q
    |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| |||||| |||||| |||||| |||    |||||| |    
T  221072 tgagttgacccttcgggtaggaatagaggttgattatagtagtgttgatgttcagtgagtctgatataatttgatttgatgttgttag----taatgtga 221167  T
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctat 645  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  221168 tatagttgtatatgcattatgtggattatataagac-tttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctat 221266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 189460 - 189519
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  189460 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 189519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold2015
Description:

Target: scaffold2015; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 212 - 322
Target Start/End: Original strand, 79 - 189
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  79 catgaaagtcgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaga 178  T
Q  312 tcttagtgaaa 322  Q
     |||| |||||    
T  179 acttaatgaaa 189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 7251 - 7408
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  7251 catgaatgttttagataattgtgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagg 7350  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  7351 tcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaactta 7408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14542 - 14424
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  || ||   | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  14542 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttagtgtggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 14443  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  14442 cttagtgaatttttatgaa 14424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 356
Target Start/End: Original strand, 2449 - 2593
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  2449 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagttgctttgatttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggagg 2548  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtt 356  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2549 tcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagtt 2593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 354 - 444
Target Start/End: Original strand, 3059 - 3149
Alignment:
Q  354 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3059 gttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 3149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Original strand, 24459 - 24579
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24459 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaga 24558  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaa 332  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  24559 tcttagtgaaattttatgaaa 24579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 399 - 448
Target Start/End: Original strand, 24586 - 24635
Alignment:
Q  399 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24586 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 24635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Original strand, 2176 - 2406
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||   | |||||| ||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  ||     
T  2176 catgaaagttttagataatttagttagatttccaatggttttggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagtagg 2275  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| || || |||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  2276 tcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaactaggagttt 2375  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || ||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  2376 aattaagaggtttaagagt-tttaacctatgt 2406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 443
Target Start/End: Original strand, 10431 - 10661
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||   | |||||| ||| |||||||||| | | |||||||||||| || || ||| ||||  ||     
T  10431 catgaaagttttagataatttagttagatttccaatggttttggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagtagg 10530  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    |||| || || |||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  10531 tcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaactaggagttt 10630  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 443  Q
    || ||||   ||| ||||| ||||||||||||    
T  10631 aattaagaggtttgagagt-tttaacctatgt 10661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 317 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 33469 - 33334
Alignment:
Q  317 gtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 416  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  33469 gtgaaatcttatgaaaattcagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagcactatgagttcaatta 33370  T
Q  417 aggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttg 452  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33369 aggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 33334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 215 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33764 - 33648
Alignment:
Q  215 gaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatct 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  33764 gaaagttgtagataattgtgttagctttccagtgactttggtttgacttgaaaatgagttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccgaggaggtct 33665  T
Q  315 tagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  33664 tagtgaatttttatgaa 33648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 632
Target Start/End: Original strand, 18190 - 18284
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  18190 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttt 18284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 440 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 2956 - 2849
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  2956 atgttatgaattgatccttggggtaggaatggaggttgaatacaatattaatgatgacctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 2861  T
Q  540 atgtaatatatt 551  Q
    ||||||||||||    
T  2860 atgtaatatatt 2849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 441 - 621
Target Start/End: Original strand, 15959 - 16136
Alignment:
Q  441 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 540  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   | || |||    
T  15959 tgttatgagttgaacctttgggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg---gtta-taa 16054  T
Q  541 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  16055 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 16136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 441 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 13391 - 13213
Alignment:
Q  441 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 540  Q
    ||||||||||| | | ||||||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   | || |||    
T  13391 tgttatgagttaaaccttggggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg---gtta-taa 13296  T
Q  541 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga--tgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||   |||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  13295 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 13213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 567 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 2802 - 2737
Alignment:
Q  567 tgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  2802 tgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttt 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 440 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 8389 - 8296
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 533  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389 atgttatgagttaatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctttgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 8296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 4039 - 3927
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-aagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  4039 tagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttggtaatgttatatcttgagatgttta 3940  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     ||||||||||||    
T  3939 tgtgctgcctatg 3927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 3128 - 3016
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3128 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 3029  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     ||||| ||||||    
T  3028 tgtgctacctatg 3016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3619 - 3500
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||     
T  3619 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgacgaaaataatccaaggagg 3520  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  3519 tcttagtgaatttttatgaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 3178
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3215 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 3178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 440 - 642
Target Start/End: Original strand, 29282 - 29481
Alignment:
Q  440 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 539  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||| |  ||||  ||  ||| ||||||||| | |||| |||    ||    
T  29282 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattgttaatgttaagtgagtctaatatgatatgatttgaggttgttag----ta 29377  T
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgc 638  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29378 atgtgatatatttgcatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagaagtttatgtgc 29477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 152 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1451 - 1361
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagcttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  1451 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagatatggttgttagcttt 1361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 8016 - 8173
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||     
T  8016 catgaaaactgtagataattgtgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgaagaaaataccacaaggagg 8115  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| || ||||||||||    
T  8116 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttcttagtcaacccaaaactta 8173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 369
Target Start/End: Original strand, 18526 - 18679
Alignment:
Q  216 aaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| || || | ||||||||||| ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  18526 aaagtcgtagacaattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgactcgaatataatttttggtttttgatttatgatgaaaatacttcaaggaggtctt 18625  T
Q  316 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  18626 agtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaagtcaaaccaaaactta 18679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 212 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 32899 - 32671
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||||| | | |||| |||||||||| || ||| ||||  |      
T  32899 catgaaagttttagataattttgttatctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttctagatttttagatatgatggaattaccccaagcaag 32800  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||  | || |||| |||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  32799 tcttgataaatttttatgaaaatt-agcataatcgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 32701  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctat 441  Q
    || ||||   ||  ||||||||||||||||    
T  32700 aattaagaagttggagagtatttaacctat 32671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 212 - 444
Target Start/End: Original strand, 11743 - 11974
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | | |||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |     
T  11743 catgaaagttgtagataattgtgttagatttccagtggctttggttttggttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaggggg 11842  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || || | |||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  ||| || ||||||    
T  11843 tcttagtgaaattttatgaaaatttcacataactatttctaggtcaaccgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttc 11941  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11942 aattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 11974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 10334 - 10223
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 634  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  10334 tagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgatgattattatttgatattgttacatcttgagatgtttat 10235  T
Q  635 gtgctgcctatg 646  Q
    ||||||| ||||    
T  10234 gtgctgcttatg 10223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 10411 - 10358
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatg 495  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| || ||||||    
T  10411 gttatgagttgatccttggtgtaggaatagaggttgattataatgtttatgatg 10358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13150 - 13060
Alignment:
Q  152 cgagcataggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagataattttgttagcttt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  13150 cgagcataggaaaatcaacttttctggaattgtctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagatatggttgttagcttt 13060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 369
Target Start/End: Original strand, 20470 - 20627
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||   | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||  ||     
T  20470 catgaaagttttagataattgtgttagtgttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgacggaaatactccaagtagg 20569  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 369  Q
    |||| | ||||||||  | ||| | ||||||||| |||| |||| || || |||||||    
T  20570 tcttggagaaattttaaggaaacttagcataactatttccaagtcaacccgaaactta 20627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 321
Target Start/End: Original strand, 16384 - 16493
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  16384 catgaaagttttagataattttgttagatttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtagg 16483  T
Q  312 tcttagtgaa 321  Q
    ||||||||||    
T  16484 tcttagtgaa 16493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 444
Target Start/End: Original strand, 16525 - 16598
Alignment:
Q  371 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||  ||||| | |||||||||||||||    
T  16525 ggaataattcaaaacctcaaaactataagtactaggaatttaattaagggttttaaaaatatttaacctatgtt 16598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Original strand, 2620 - 2732
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  2620 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacatggatatatcttgagatgttta 2719  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     |||||| |||||    
T  2720 tgtgctgactatg 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 359 - 440
Target Start/End: Original strand, 2377 - 2458
Alignment:
Q  359 tccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 440  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  2377 tccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaaccta 2458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 442
Target Start/End: Original strand, 13168 - 13402
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt-ggtttt---tgagatatgatgaaaatactccaat 307  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||| ||| |||| |   |||| ||||||||||| |||| ||     
T  13168 catgaaagttttagataattgtgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatatttaggttgtgagtgagttatgatgaaaacactcgaag 13267  T
Q  308 gagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactagga 407  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |  | | |||| ||||||||| ||||| || ||    
T  13268 gaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgttcccaaacttcaaaactataagtattacga 13367  T
Q  408 gttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 442  Q
    ||| || ||||   |||||||||||||||| ||||    
T  13368 gtttaattaagaggtttaagagtatttaacatatg 13402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 651
Target Start/End: Original strand, 6889 - 6968
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgctact 651  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6889 tatatatgatgtttaagttgatgttgagtatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttact 6968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21343 - 21225
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  21343 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 21244  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  21243 cttagtgaatttttatgaa 21225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 646
Target Start/End: Original strand, 53825 - 53899
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53825 tatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 53899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 538 - 621
Target Start/End: Original strand, 128922 - 129005
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  128922 taatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 129005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 445 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 116673 - 116608
Alignment:
Q  445 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 510  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  116673 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgtt 116608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 535 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 30503 - 30391
Alignment:
Q  535 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  30503 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgttgattgattattatttgacattgttatgtcttgagatgttta 30404  T
Q  634 cgtgctgcctatg 646  Q
     ||| ||||||||    
T  30403 tgtgatgcctatg 30391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 223 - 350
Target Start/End: Original strand, 7784 - 7911
Alignment:
Q  223 tagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaa 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||| || |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7784 tagataattgtgttagctttccagtggctttggtttgaattaaaaatgatttttggtttgagagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 7883  T
Q  323 ttttttgaaaattcagcataactgtttc 350  Q
    ||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  7884 ttttacgaaaattccgcataactatttc 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 693 - 626
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  693 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 540 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 8000 - 7894
Alignment:
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgc 638  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||     
T  8000 atgtaatatatttgtgtatggattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttgcttattatttgatattgttatatc-tgagatgtttatgtgt 7902  T
Q  639 tgcctatg 646  Q
    ||||||||    
T  7901 tgcctatg 7894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 538 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 191 - 101
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  191 taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgatgatgtttatcatttgatattgttatatcttgagat 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 572 - 645
Target Start/End: Original strand, 4256 - 4329
Alignment:
Q  572 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctat 645  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4256 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttgcctat 4329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 480 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 58037 - 57898
Alignment:
Q  480 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 579  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| |||    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  58037 tataatattactgatgatctgttaaactgttataa-attatttaatgttgttag----taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatttaaa 57943  T
Q  580 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 625  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  57942 atgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 57898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 540 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 1868 - 1785
Alignment:
Q  540 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattat-ataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 622  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1868 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattattataaggagtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 1785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 442 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 1964 - 1928
Alignment:
Q  442 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttga 478  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1964 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttga 1928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 576 - 646
Target Start/End: Original strand, 6932 - 7002
Alignment:
Q  576 taagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6932 taagttgtttaagttgatgttgattatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgactatg 7002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9696 - 9606
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  9696 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatact 9606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 538 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 6203 - 6116
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 625  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6203 taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgaggatgtttatcatttgatattgttatatcttga 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6542 - 6423
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| || |||     
T  6542 catgaaagttgcagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtgtgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgcaaatactcaaaggagg 6443  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||| |||| |||| ||||    
T  6442 tcttaatgaatttttatgaa 6423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 168 - 53
Alignment:
Q  217 aagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaa-tgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatctt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | | |||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  168 aagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctt 69  T
Q  316 agtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||| |||| ||||    
T  68 agtgaatttttatgaa 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13988 - 13909
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13988 catgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggaatcggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgagttatg 13909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 40995 - 40916
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatg 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40995 catgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcatcggtttgacttgaaaatgattttcggtttttgagttatg 40916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37949 - 37886
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttt 275  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  ||||||||||    
T  37949 catgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgatttt 37886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11885 - 11766
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    | || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||     
T  11885 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttagagtaaacatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagg 11786  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaa 331  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  11785 tcttagtgaatttttatgaa 11766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 65611 - 65670
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  65611 agttgttgttgattatcgtttgatattgttatatcctgagatgtttacgtgtcgcctatg 65670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 61695 - 61754
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  61695 agttgttgttgattatcattagatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 61754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 80738 - 80679
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  80738 agttgttgttgattatcatttaatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 80679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9836 - 9718
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||   | ||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  9836 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttggagtaaaaattatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggt 9737  T
Q  313 cttagtgaaattttttgaa 331  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  9736 cttagtgaatttttatgaa 9718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 546 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 48487 - 48394
Alignment:
Q  546 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  48487 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgct 48394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 54036 - 53972
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  54036 catgaaagttttagataattatgttaactttctaatggctttggtttgactttcaaatgattttt 53972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0956 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0956
Description:

Target: scaffold0956; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 296
Target Start/End: Original strand, 2319 - 2403
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 296  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2319 catgaaagttgtagataattgcgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 296
Target Start/End: Original strand, 174544 - 174628
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 296  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  174544 catgaaagttgtagataattgcgttagccttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatatatgatgaa 174628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 593 - 646
Target Start/End: Original strand, 207591 - 207644
Alignment:
Q  593 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||    
T  207591 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgtcgcctatg 207644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 441 - 529
Target Start/End: Original strand, 27526 - 27614
Alignment:
Q  441 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 529  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27526 tgttatgagttgaaccttggggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 27614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 479 - 621
Target Start/End: Original strand, 27646 - 27785
Alignment:
Q  479 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataa 578  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   | || |||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||      
T  27646 atatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg---gtta-taatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgt 27741  T
Q  579 g-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    | |||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  27742 gaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 27785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 418 - 359
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  418 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 11584 - 11643
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11584 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 32743 - 32802
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32743 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 32802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 36169 - 36228
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36169 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatg 36228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 538 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 97175 - 97092
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  97175 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 97092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 538 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 106453 - 106370
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 621  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  106453 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 106370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1109 - 874
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaga 311  Q
    |||||||||| || |||||| |||||| |||  |||||  |  ||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||   |     
T  1109 catgaaagttttatataattgtgttagatttataatgattttagtttgacttgaaaatgatttttatattttaagttatgatgaaaatactccaagtggg 1010  T
Q  312 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 411  Q
    ||||||  ||| |||   |||||||||||||||  ||||| ||| || ||||| |||| ||  |  ||| ||||  |||||||  | |||||  ||||||    
T  1009 tcttaggaaaactttacaaaaattcagcataaccatttcttagtcaacccaaagcttatggtttgtttccaaactccaaaact-tatgtactttgagttc 911  T
Q  412 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 448  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  910 aattaaggtgtttaagggtatttaacctatgatatga 874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Original strand, 12089 - 12157
Alignment:
Q  158 taggaaaatcaacttttttggaattttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtaga 226  Q
    ||||||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12089 taggaaaatcaacttttctaccactttcttttctgaattaggtttgggagtattcatgaaagttgtaga 12157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 14170 - 14229
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  14170 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttacgtgtcgcctatg 14229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 58802 - 58861
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  58802 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatg 58861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 134805 - 134770
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134805 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 134770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 137274 - 137239
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  137274 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 137239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 139743 - 139708
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139743 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 139708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 142212 - 142177
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142212 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 142177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 144681 - 144646
Alignment:
Q  213 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144681 atgaaagttgtagataattttgttagctttccaatg 144646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 2422 - 2364
Alignment:
Q  386 ctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  2422 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgtt 2364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 3958 - 4017
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  3958 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 4017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Original strand, 5184 - 5243
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  5184 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 5243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 587 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 12445 - 12386
Alignment:
Q  587 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  12445 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatg 12386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1405 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1405
Description:

Target: scaffold1405; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1252 - 1214
Alignment:
Q  186 tgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgta 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1252 tgttctgaattaggtttggaagtcttcatgaaagttgta 1214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 632
Target Start/End: Original strand, 6235 - 6329
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  6235 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttt 6329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 38486 - 38392
Alignment:
Q  538 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 632  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || |||||| |  |||||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  38486 taatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttt 38392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 591 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 1620 - 1583
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 628  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1620 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 1583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 958 - 894
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||| || |||||||||||    
T  958 catgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtgcaaatgattttt 894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 444
Target Start/End: Original strand, 1 - 49
Alignment:
Q  396 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 444  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1 gaagtgctatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1000 - 936
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  1000 catgaaagttttagataattgtgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttt 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1043 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1043
Description:

Target: scaffold1043; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 228
Target Start/End: Original strand, 856 - 903
Alignment:
Q  181 ttttctgttctgaattaggtttgggagtcttcatgaaagttgtagata 228  Q
    |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  856 ttttctgttcagaattaggatttggtgtcttcatgaaagttgtagata 903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17278 - 17163
Alignment:
Q  254 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 353  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||  || | ||| | ||| |||  |||||||| ||| || |||||||||    
T  17278 ggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaagaaggttttaataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttctaa 17179  T
Q  354 gttaatccaaaactta 369  Q
    || || ||||| ||||    
T  17178 gtcaacccaaacctta 17163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 303
Target Start/End: Original strand, 35026 - 35117
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactc 303  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||| || ||||| || | | |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35026 catgaaagttttagagaattgagttggcattccattggccttggtttgacttgaaaataatattttgtttttgagttatgaagaaaatactc 35117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 646
Target Start/End: Original strand, 36036 - 36091
Alignment:
Q  591 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatg 646  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  36036 gatgttgattattttttgatgttcttatatcttgaggtgtttaagtgctgcatatg 36091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 557 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 209073 - 208992
Alignment:
Q  557 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgct 639  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| ||||| || |||||    
T  209073 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgtctatgtgct 208992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 1465 - 1416
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgac 261  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||    
T  1465 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgac 1416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 592 - 633
Target Start/End: Original strand, 10858 - 10899
Alignment:
Q  592 atgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 633  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10858 atgttgagtattatttgatgttgttatatcttgaggtgttta 10899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 479 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 11688 - 11659
Alignment:
Q  479 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11688 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 11659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 630
Target Start/End: Original strand, 16541 - 16613
Alignment:
Q  557 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 630  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  16541 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 16613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18295 - 18231
Alignment:
Q  212 catgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgacatcggtttgacttgaaaatgattttt 276  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  |  |||||||||||    
T  18295 catgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgaggtccaaatgattttt 18231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University